KEGG   ORTHOLOGY: K19124
Entry
K19124                      KO                                     
Symbol
casC, cse4
Name
CRISPR system Cascade subunit CasC
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system
    K19124  casC, cse4; CRISPR system Cascade subunit CasC
Prokaryotic defense system [BR:ko02048]
 CRISPR-Cas system
  Type I CRISPR-Cas system
   Subtype I-E factors
    K19124  casC, cse4; CRISPR system Cascade subunit CasC
Genes
ECO: b2758(casC)
ECJ: JW2728(ygcJ)
ECD: ECDH10B_2926(ygcJ)
EBW: BWG_2494(ygcJ)
ECOK: ECMDS42_2263(ygcJ)
ECOC: C3026_15160
ECE: Z4067
ECS: ECs_3612(casC)
ECF: ECH74115_4011(cse4)
ETW: ECSP_3706
ELX: CDCO157_3372
EOI: ECO111_3482
EOJ: ECO26_3827
ECOO: ECRM13514_3612(cse4)
ECOH: ECRM13516_3478(cse4)
ESL: O3K_05740
ESO: O3O_19910
ESM: O3M_05785
ECK: EC55989_3031
EOK: G2583_3406(ygcJ)
ELR: ECO55CA74_16220
ELH: ETEC_2949
ECW: EcE24377A_3060(cse4)
EUN: UMNK88_3437
ECOA: APECO78_17390
ECX: EcHS_A2897(cse4)
ECM: EcSMS35_2886(cse4)
ECY: ECSE_3013
ECR: ECIAI1_2861
EUM: ECUMN_3085
ELO: EC042_2953
ECL: EcolC_0954
EKO: EKO11_1011
EKF: KO11_09185(cse4)
EDH: EcDH1_0930
EDJ: ECDH1ME8569_2668(ygcJ)
ELW: ECW_m2965(cse4)
ELL: WFL_14475(cse4)
ECOL: LY180_14010
EFE: EFER_0305(ygcJ)
ESZ: FEM44_03680(cas7e) FEM44_05335(cas7e)
STY: STY3068
STT: t2842
SEX: STBHUCCB_29920
SENT: TY21A_14365
STM: STM2941(yghJ)
SEO: STM14_3545(yghJ)
SEV: STMMW_29041
SEY: SL1344_2920(yghJ)
SEM: STMDT12_C29910
SEJ: STMUK_2930(yghJ)
SEB: STM474_3082(yghJ)
SEF: UMN798_3193
SETU: STU288_14865
SETC: CFSAN001921_02370
SENR: STMDT2_28411
SEND: DT104_29391
SENI: CY43_15345
SEEN: SE451236_20800
SPT: SPA2797
SEK: SSPA2608
SEI: SPC_2985(yghJ)
SEC: SCH_2873(yghJ)
SEH: SeHA_C3135(cse4)
SHB: SU5_03422
SENH: CFSAN002069_17565
SEEH: SEEH1578_00710
SEE: SNSL254_A3151(cse4)
SENN: SN31241_40390
SEW: SeSA_A3095(cse4)
SEA: SeAg_B3069(cse4)
SENS: Q786_14175
SED: SeD_A3252(cse4)
SEG: SG2844(yghJ)
SEL: SPUL_2940
SEGA: SPUCDC_2926
SET: SEN2780(yghJ)
SENA: AU38_14120
SENO: AU37_14130
SENV: AU39_14130
SENQ: AU40_15895
SENL: IY59_14725
SEEC: CFSAN002050_21020
SEEB: SEEB0189_005450
SEEP: I137_14000
SENB: BN855_29910(cse4)
SENE: IA1_14095
SENC: SEET0819_21540
SBG: SBG_2556
SBZ: A464_2963
SBV: N643_12505
SALZ: EOS98_04790(cas7e)
SSN: SSON_2907(yghJ)
SBO: SBO_2762(yghJ)
ESA: ESA_02835
CSK: ES15_2921(cse4)
CSZ: CSSP291_13480
CDM: AFK67_05210
CSI: P262_04219
CMJ: AFK66_022635
CTU: CTU_10470
KPU: KP1_3167(cse4)
KPP: A79E_2164
KPZ: KPNIH27_20280
KPY: KPNIH31_20315
KPT: VK055_0383(cas7)
KPR: KPR_4121
KPX: PMK1_04445(casC)
KPNK: BN49_1001
KVA: Kvar_0942
KOE: A225_4680
KQV: B8P98_12005(cas7e)
KAR: LGL98_05060(cas7e)
KGR: JJJ10_05855(cas7e)
KLM: BWI76_22735
RON: TE10_22465
CRO: ROD_30481
CYO: CD187_05035(cas7e)
CFQ: C2U38_20000(cas7e)
CIB: HF677_004850(cas7e)
EBT: EBL_c30660
KCO: BWI95_03650
LEH: C3F35_16490(cas7e)
AHN: NCTC12129_03756
ASUB: NLZ15_05750(cas7e)
METY: MRY16398_10400
IZH: FEM41_00195(cas7e)
PROD: PCO85_20485(cas7e)
SERA: Ser39006_005065(cas7e)
SERQ: CWC46_05065(cas7e)
PCC: PCC21_003740
PCV: BCS7_01855
PWA: Pecwa_0400
PPAR: A8F97_16430
PEC: W5S_0412
PWS: A7983_10015
PPOA: BJK05_18580
PBRA: B5S52_19980
PPUJ: E2566_02095(cas7e)
PARI: I2D83_20065(cas7e)
PAQU: DMB82_0001760(cas7e)
PVZ: OA04_04140(casC)
PPAV: LOZ86_19935(cas7e)
PPOO: LW347_02145(cas7e)
PCAC: OI450_02525(cas7e)
DZE: Dd1591_0908
DDC: Dd586_0351
DZC: W909_01835
CED: LH89_10320
DFN: CVE23_01935(cas7e)
DDQ: DDI_3191
DAQ: DAQ1742_00449
DIC: Dpoa569_003596(cas7e)
DLC: O1Q98_09565(cas7e)
DDA: Dd703_3588
EAM: EAMY_2817(ygcJ)
EAY: EAM_0765
EPY: EpC_08100(cse4)
EPR: EPYR_00855(ygcJ)
ERJ: EJP617_02870(cse4)
MINT: C7M51_00063(casC)
MTHI: C7M52_02651(casC)
PLU: plu0748
PLUM: A4R40_03735
PAY: PAU_00709
PTT: VY86_03915
PAKH: B0X70_04210
PLUI: CE143_04140(cas7e)
PHAU: PH4a_00615(cas7e)
XBO: XBJ1_3752
XBV: XBW1_4259
XNE: XNC1_3720
XNM: XNC2_3575
XDO: XDD1_0595
XPO: XPG1_0518
XGR: QL128_02945(cas7e)
ETE: ETEE_2630
EDW: QY76_16250
EDL: AAZ33_04145(cas7e)
EHO: A9798_03775
LPV: HYN51_03150(cas7e)
PRAG: EKN56_10345(cas7e)
LRI: NCTC12151_00613
VCO: VC0395_A2674(cse)
VCR: VC395_0325
VHR: AL538_00325(cas7e)
VGA: BSQ33_17925
VSR: Vspart_03913(casC)
PPR: PBPRC0037
SCOT: HBA18_15025(cas7e)
SPRO: N7E60_16980(cas7e)
PRP: M062_06750
PMY: Pmen_3758
PPSE: BN5_0770
PBM: CL52_18050
AVN: Avin_17200
AVL: AvCA_17200
AVD: AvCA6_17200
ACX: Achr_14830 Achr_14890 Achr_790
PPHA: BVH74_05375
SCHK: GII14_19575(cas7e)
SPSR: EGC80_19920(cas7e)
THAT: H3N35_02240(cas7e)
TVD: SG34_027135(cas7e)
PSEN: PNC201_20240(casC)
PVB: J5X90_23200(cas7e)
PFLI: CTT31_22085(cas7e)
AMC: MADE_1014400
HMI: soil367_17145(cas7e)
PIN: Ping_1589
CEB: B0D95_06085
STAW: NCG89_16305(cas7e)
MTHD: A3224_03155
MII: BTJ40_18115(cas7e)
MCEL: LPW13_11280(cas7e)
KIM: G3T16_03675(cas7e)
MCA: MCA0933
MDN: JT25_007535
MDH: AYM39_06425
MKO: MKLM6_1303
METL: U737_02360(cas7e)
MPAD: KEF85_14995(cas7e)
MMOT: QZJ86_02070(cas7e)
MAH: MEALZ_3716
MBUR: EQU24_20285(cas7e)
MMAI: sS8_4540
MSZE: MSZNOR_2250(casC)
MMOB: F6R98_00790(cas7e)
MOZ: MoryE10_22530
MISZ: MishRS11D_33100
MESL: KKZ03_17515(cas7e)
MEIY: MIN45_P2349
MCAU: MIT9_P2185 MIT9_P2614
CZA: CYCME_2155
TSE: THMIRHAS_17860
TSB: HMY34_15640(cas7e)
TLC: RCF98_02090(cas7e)
NWA: Nwat_1401
ALV: Alvin_0651
ATEP: Atep_23440
TVI: Thivi_0459 Thivi_1076
MPUR: MARPU_07390
NTT: TAO_1712
TSY: THSYN_14325
TTP: E6P07_10980(cas7e)
TBOG: LT988_05110(cas7e)
TLR: Thiosp_02480(casC_1) Thiosp_03482(casC_2)
TFRI: Thiofri_02424(casC)
AEH: Mlg_0952
HHK: HH1059_07240
HHC: M911_01390
HAZ: A9404_08085
GHL: GM160_08045(cas7e)
TBN: TBH_C1504
EPS: L0Y14_13240(cas7e)
TTC: FOKN1_2815
CSA: Csal_0229
HAK: KO116_04134
HAM: HALO4333
HALO: BWR19_18125
HBE: BEI_3528(casC)
HPIS: P1P91_02460(cas7e)
HALK: CUU95_04740(cas7e)
HOL: HORIV_61720
KMA: B9H00_06475
SAJS: QO259_15970(cas7e)
ALCA: ASALC70_00278(casC)
MMW: Mmwyl1_3545
NIK: F5I99_01695(cas7e)
EEI: NX720_12480(cas7e)
EMP: EZMO1_3783
GAP: GAPWK_2360
SOK: D0B54_08900(cas7e)
SINI: GT972_11610(cas7e)
GPB: HDN1F_07610
VFF: VITFI_CDS0401
CVC: BKX93_19895
CHRI: DK842_14505(cas7e)
CHRB: DK843_20065(cas7e)
PSE: NH8B_0692
AMAH: DLM_2392
JES: JHS3_15450
AQL: BXU06_04410
MAER: DAI18_12500(cas7e)
RSC: RCFBP_11060
RSN: RSPO_c01086
RSG: JK151_17200(cas7e)
BYI: BYI23_B012700
BUE: BRPE67_BCDS16510
LMIR: NCTC12852_00244
TCAR: U0034_23835(cas7e)
BGM: CAL15_21615
PIG: EGT29_03870(cas7e)
PACR: FXN63_18885(cas7e)
CKE: B5M06_08950
CSER: CCO03_06695
HPSE: HPF_16010(casC)
CBAA: SRAA_1198(cas7)
CBAB: SMCB_1597
RGE: RGE_06860(cse4)
ROI: N4261_17350(cas7e)
IDC: LRM40_02500(cas7e) LRM40_19425(cas7e)
JAG: GJA_3178
JAB: VN23_00705
SUTT: SUTMEG_16380
TTW: LCC91_08365(cas7e)
NST: Nstercoris_01453
NLC: EBAPG3_008190(cas7e)
DOE: DENOEST_0916
NIM: W01_09240(casC)
NARC: NTG6680_1121(casC)
SULF: CAP31_12635
ABRE: pbN1_19780(cas7)
RBH: B4966_14740
QAU: KI612_17780(cas7e)
AZD: CDA09_21040(cas7e)
TMZ: Tmz1t_2231
TCL: Tchl_1799
ACOM: CEW83_06420(cas7e)
ZPA: C3497_14080(cas7e)
APP: CAP2UW1_2252
BEB: AEM42_05775
KMN: HW532_21065(cas7e)
BOS: BSY19_4793
MNO: Mnod_5412
MEE: DA075_08065(cas7e)
MTEA: DK419_15610(cas7e)
MIND: mvi_16040
RLAC: QMO75_03035(cas7e)
FIL: BN1229_v1_2363
FIY: BN1229_v1_3552
NOH: G5V57_09460(cas7e) G5V57_21905(cas7e)
PSTG: E8M01_22900(cas7e)
DSH: Dshi_3217(cse3)
CON: TQ29_02855
PABY: Ga0080574_TMP2621
RBL: B6K69_16110
PKD: F8A10_12750(cas7e)
PAEX: JHW48_15705(cas7e)
RHM: B5V46_07730
DAA: AKL17_3p0043
GEH: HYN69_12325(cas7e)
HML: HmaOT1_18365(cas7e)
MON: G8E03_16975(cas7e)
PGV: SL003B_2842
CMAG: CBW24_14135
ZMP: Zymop_1012
SECH: B18_17925
SHAN: PPZ50_06650(cas7e)
HGN: E6W36_14920(cas7e) E6W36_14925
GOH: B932_0093
GTI: FXF46_10005(cas7e)
GBE: GbCGDNIH1_1378 GbCGDNIH1_1695
GBH: GbCGDNIH2_1378 GbCGDNIH2_1695
GBC: GbCGDNIH3_1378 GbCGDNIH3_1695
GBS: GbCGDNIH4_1378 GbCGDNIH4_1695
ACR: Acry_1811 Acry_3317
GDI: GDI2207
GDJ: Gdia_0425
GXY: GLX_07800
APT: APA01_41060
APW: APA42C_41060
APF: APA03_41060
APU: APA07_41060
APG: APA12_41060
APQ: APA22_41060
APX: APA26_41060
APZ: APA32_41060
APER: A0U91_15915
AOY: EOV40_007490(cas7e)
RMUC: FOB66_01590(cas7e)
RMT: IAI58_22125(cas7e)
NEH: E3E11_02165(cas7e)
SWF: E3E12_03290(cas7e)
BOB: GN304_00780(cas7e)
BOMB: GT348_01850(cas7e)
EBLA: JGUZn3_21190(casC)
PARZ: DTQ13_05055(cas7e)
RAP: RHOA_5002(cas7e)
SVC: STVA_22940 STVA_23850
STEL: STAQ_18420
AZZ: DEW08_03425(cas7e)
AARE: D3093_33320(cas7e)
SROE: JL101_013315(cas7e)
RRU: Rru_A0172 Rru_A0344
RRF: F11_00860 F11_01750
RCE: RC1_3337
RPM: RSPPHO_01291 RSPPHO_02013
HYO: NNO_1913
GSU: GSU1387(cse4)
GSK: KN400_1353(cse4)
GPI: GPICK_09685
GAO: A2G06_10060
GBZ: JZM60_11010(cas7e)
GUR: Gura_0830
GLO: Glov_2477
PCA: Pcar_0959(cse4)
PACE: A6070_04045
PPD: Ppro_2340
DDS: Ddes_0926
DEF: CNY67_05510(cas7e)
DCB: C3Y92_05845(cas7e)
DDE: Dde_0862
DMS: E8L03_03335(cas7e)
DSX: GD604_14770(cas7e)
DEO: CAY53_04855
DOL: Dole_2986
DAL: Dalk_4937
DTI: Desti_4556
SFU: Sfum_2827
ACP: A2cp1_0781
ANK: AnaeK_0781
APAU: AMPC_32060
BSED: DN745_02405(cas7e)
SAQI: AXG55_02220
HYI: K2M58_01335(cas7e)
LPAA: BHS01_03850
SMC: SmuNN2025_0606
SMUT: SMUGS5_06725
STHE: T303_06235
SSR: SALIVB_1074(ygcJ)
STF: Ssal_01145(casC)
SPAT: A0O21_05665
SRAT: FY406_10315(cas7e)
STRG: SRT_06170
SCHJ: DDV21_004820(cas7e)
LDB: Ldb0871
LBU: LBUL_0796
LDE: LDBND_0800
LHH: LBH_1244(casE)
LHD: HUO_04720
LCR: LCRIS_01211(casE)
LAY: LAB52_05100
LXO: KIM322_08390
LCA: LSEI_0352
LPX: ASU28_06295
LPG: BB562_09760
LARG: LPA65_05990(cas7e)
LFE: LAF_0694
LFR: LC40_0467
LFF: LBFF_1327
LMU: LBLM1_06090
LSN: LSA_2p00320
LBN: LBUCD034_0104(casC)
LPAR: FAM21731_00952
LKO: ABN16_13110
LSUA: H3M12_03740(cas7e)
LSW: GTO87_06700(cas7e)
LAH: LA20533_05315
OSI: DLJ48_08415(cas7e)
XAK: KIMC2_16000
XAP: XA3_14100
TEY: GLW17_02295(cas7e)
TOO: C7K38_10760(cas7e)
AUN: AWM73_00835
AUI: APT62_03355
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MARC: AR505_1092
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Reference
PMID:21255106
  Authors
Perez-Rodriguez R, Haitjema C, Huang Q, Nam KH, Bernardis S, Ke A, DeLisa MP
  Title
Envelope stress is a trigger of CRISPR RNA-mediated DNA silencing in Escherichia coli.
  Journal
Mol Microbiol 79:584-99 (2011)
DOI:10.1111/j.1365-2958.2010.07482.x
  Sequence
[eco:b2758]
LinkDB

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