Apilactobacillus apisilvae: MOO46_04680
Help
Entry
MOO46_04680 CDS
T08479
Name
(GenBank) IS3 family transposase
Organism
aapi
Apilactobacillus apisilvae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
rve
HTH_28
HTH_21
rve_2
rve_3
HTH_29
DNA_ligase_A_M
DUF6262
HTH_Tnp_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQS84551
LinkDB
All DBs
Position
complement(909671..911011)
Genome browser
AA seq
446 aa
AA seq
DB search
MTKFSFELKKKIIKEYFSTGMGSTSLAKKYNIKSRTSVLNWIHMYNAFGIKGLVVRQPSK
VYSGDYKRKVLHWMHTNHSSYPETALFFNISAPSTILAWERRLETKGLIGLYTNRGPKKM
KSNNIELKLLNKSLKDKLDYYLINYRYEQIKQDHGSIINHIKKLINLFKRFSISFILKSI
GISRSYYYRHLKENDKDIKLKKMITQIKHFNPNYGYRRVTLALINNNVVVNHKKVLRLMK
TLNLTTNSYNRKRRKYNSYIGKVGHIAKNRIHRKFKTDRPYQKLTTDVSEFRYGNQDINH
RVYLSPIMDLFSDEILKFSISEHPTVDFTIKPIKALIKALPNLKYRTTIHSDQGFQYQNN
KWQKLLKDNHIFQSMSRKGTCLDNAQMESFFHIMKIEIMSNHYETKSSLIKAMKKWIKYY
NNCRIKTKLGGKAPKEYRKLYLLENK
NT seq
1341 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaatttagttttgaattaaagaaaaagataattaaagaatatttttcaacagga
atgggttccactagtcttgctaaaaaatataatattaagagtagaacatctgtgttaaat
tggattcatatgtataatgccttcggcattaaaggattagttgtcaggcaaccaagcaaa
gtatattctggagattataaacgaaaagtgctgcattggatgcacactaaccacagttcg
tatccagaaacagcacttttcttcaacatatctgccccgagcacaatccttgcttgggag
cgaagattggagactaaaggcctaattggattatacactaatcgtggccctaaaaaaatg
aaatcaaataatattgaacttaaattacttaataaatctttaaaggacaaacttgattat
tatctaattaattatcgttatgaacaaataaaacaagatcatggatctattattaatcat
ataaagaaattaattaatttgtttaaaagattttctatatcattcattttaaagagtatt
ggtataagtagaagctactattatcgtcatttaaaagaaaatgataaagatattaaatta
aaaaagatgattactcaaatcaaacattttaatccaaactatggttatagacgtgtaacc
ttggctttgattaataacaacgtagttgttaaccataaaaaagttttaagattaatgaaa
acgttaaacttaacaactaatagctataatagaaaaagaagaaaatataattcttatatt
ggcaaagttggacatatagctaaaaatagaattcacagaaaatttaagactgatcgtcca
tatcaaaaattaacaactgatgtcagtgaatttaggtatggtaatcaagatataaatcat
agagtttatttatcacccattatggatttattttcagatgaaatattaaaattttctatt
agcgaacatccaactgttgactttactattaagccaataaaagccttgattaaggcatta
cccaatttgaaatatagaactaccattcatagcgaccaaggttttcagtatcaaaataat
aagtggcaaaagcttttaaaggataatcatatatttcaatctatgtcccgtaaagggaca
tgtctagataatgcacaaatggaatcattctttcatatcatgaaaatagaaattatgagt
aatcattatgaaacaaagtcttcattaattaaagcgatgaaaaaatggattaaatattat
aataattgtagaattaaaacaaaactaggaggtaaagctccgaaagaatatcggaaactt
tacctcctagaaaataaatag
DBGET
integrated database retrieval system
