Apilactobacillus apisilvae: MOO46_05860
Help
Entry
MOO46_05860 CDS
T08479
Name
(GenBank) IS3 family transposase
Organism
aapi
Apilactobacillus apisilvae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
rve
rve_2
HTH_21
rve_3
HTH_23
DUF1492
DDE_Tnp_IS240
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQS84769
LinkDB
All DBs
Position
1142448..1143299
Genome browser
AA seq
283 aa
AA seq
DB search
MVNQATIKLIDTFTSKIPLVRICQYLNISRSTYYYHKTHAAHFNLSQIEQEIQQLCIKTK
FLYGYRKIHALINKHLKCSVSKVQRIMAKYNWGCRIKRKRSHRPGNPFKQFDNIINRDWN
ISLPNRKLTTDITYIPCGNKMLYLSTIMDSFNSEIIAHKISNHPNTQLALDTLNQLGYLS
GAIIHSDQGSTYTSREFFELARKKGAIRSMSRKGTPADNAIIESFHSSLKTEMIYTQAKP
KGLADTIRCVNNYIKFWNNTRILTKLGNQSPVEYRKSVAQLNN
NT seq
852 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtaaatcaagctactattaaattaatcgatactttcacatccaaaatacctttagtt
aggatttgtcagtatctcaatatatctagaagtacctattactatcataaaacacatgca
gctcattttaatttaagtcagattgaacaggagattcaacaactatgtataaaaacaaag
tttttatatggttatcgtaaaattcatgcactaattaataagcacttaaaatgcagtgtt
agtaaagttcaaagaattatggctaaatacaattgggggtgtcgtattaaacgtaaaaga
tctcatcgacctggtaatccgttcaaacaatttgataatataatcaatcgtgattggaac
attagtttaccaaatcgtaaattaaccactgatatcacttatattccttgcggaaataaa
atgttgtacctctctacaattatggatagttttaattcggaaattattgctcataaaatt
tctaatcatccaaatacccaattggcattagatacactaaatcaattaggctatttaagt
ggtgctatcattcatagtgatcagggttctacttatacttcgcgtgaattttttgaatta
gcacgcaaaaaaggcgccatcagaagtatgtcccgtaaagggacgccagctgataacgcc
atcattgaatcatttcactcaagcctaaagactgaaatgatatacacacaagctaaacca
aaaggtttagcagataccattaggtgtgtgaataattatatcaaattttggaataataca
cgaatattaacaaaattaggcaaccaatcacctgtagagtacaggaaatcagttgcccaa
ttaaataattag
DBGET
integrated database retrieval system