Acinetobacter baumannii SDF: ABSDF1362
Help
Entry
ABSDF1362 CDS
T00660
Name
(GenBank) putative bifunctional protein [Includes: lytic murein transglycosylase C, membrane-bound (MtlD); cell wall hydrolase]
Organism
abm
Acinetobacter baumannii SDF
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
SLT
SLT_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAP00708
UniProt:
B0VKV8
LinkDB
All DBs
Position
1259983..1263198
Genome browser
AA seq
1071 aa
AA seq
DB search
MYKLTTFVWQPSAASLFKITVLSSALAALGITTGCSSTPQSAKTSKTKQVSGAGYLDASS
LNSLEDLLSATDMRAVEGDRLLILKHGDVWKRMAVGFKMDLNHWDPRIEAQRSWFISRQP
YLDRLSARASRYLYHTVKEAERRGLPTELALLPVIESSYDPAATSSAAAAGLWQFIPSTG
RIYGLQQTGMYDGRRDVVESTRAAYEFLGSLYNQFGSWELALAAYNAGPGRIQQAINRNQ
AAGLPTDYWSLKLPQETMNYVPRFLAVAQIIKNPRAYGVSLPPIANRPHFREVTLSAPLS
LNEIASVTGLSRAELYALNPGYRGETVDPASPMRILIPADISPSVDNKLKGMKAGGSSGW
WASVTSPSKPTTTTSTSVTVRTTPSTPAQPVRPSTPAKTSSSSVTVKTATPRGSDALAAF
AASADVPSAPRIPVAVTPAANIKPVRTEPPISATEREKILAAVRAEGEKETVDQALEPQA
TQAEKDQVVAELKALAPQGTEIVDPYDGKIKLTAIQTSQSVAEQQGKEVSKGFAYPKTLA
EDATLANSEDAQRNKDKPYIKTDTDVVVVQPKGKRSTYTVQPGDTLAVIAMKNGVNWRDV
AKWNQIDPEKTLFVGTSLYLYDAKPQEAETTAKSAAKPDVYVVQANDSLTGVANQFNLSV
KQLAEYNDLSVTDGLFVGQKLQLKEPKGNRAAKVEPKAIQASTRRITTKSYTVKRGEYLK
LIADRYALSNQELADLTPGLSAGSNLIVGQKINVPAKEITVDEVDDSKASGKYEKLAAGP
SYKTESYKVQRGDTLSSIATKSKISLAELAELNNLKANSHVQLGQTLKVPAGASVPDQYV
VQSGDSLNAIAAKYNLQTSYLADLNGLSRTAGLRTGQRLKLTGEVETTSKVSAKNTKEET
PETYTVKSGDSLGNIANRYHLQLDYLAALNGLSRNSNVRVGQRLKLTGDLPTVETAKTDT
AKSSPKAVVAGKNTEKYTVKAGESLNAIASRAGISVRELAEMNALKANANLQRGQNIVIP
KTVVEYKVKRGDTLIGLASKYGLETTLLAELNNLTPSTQLRIGDIIKVPNL
NT seq
3216 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaactaaccacatttgtgtggcagccatctgcagcatcattattcaaaattaca
gtccttagctctgctttagctgcgttgggtattacaacaggctgttcttcgactccgcaa
tctgcaaaaacctcgaaaacaaaacaggtgagtggagcaggctatcttgatgcaagcagt
ctgaactctttagaagacttactttcagcaacagatatgcgtgctgtagagggcgaccgt
ttacttattttaaaacacggtgatgtctggaagcgtatggccgtaggcttcaaaatggac
ctcaatcattgggatccacgtattgaagcgcagcgtagttggtttatctcacgtcagccc
taccttgaccgcttaagtgctcgcgcaagtcgttatttatatcatactgttaaagaagca
gaacgccgtggtcttccaaccgaacttgcattattaccagtgattgaaagttcatatgac
ccagctgcaacaagtagtgcggcggcggcgggtttatggcaatttattcctagtactggt
cgtatttatggtttacaacaaacgggtatgtacgacggacgccgtgatgttgtggaatct
actcgtgctgcctatgagtttttaggaagcttatataaccagttcggttcatgggaatta
gctttggctgcttataacgctggtccgggtcgtattcaacaggcgattaaccgaaatcag
gctgctggtttgccaacagactattggtcactaaaattaccgcaagaaaccatgaactat
gttccgcgtttcttggctgttgcacaaattattaaaaacccacgcgcttatggggtttcg
ttacctccgattgcaaacagaccccatttccgtgaagtcaccttatctgcaccattatct
ttaaatgaaatcgcatcggtgacggggcttagccgtgctgagttatatgcattaaaccca
ggctatcgtggtgaaacagtagaccctgcaagtccaatgcgtattttgattccagctgat
ataagtccttcagttgataacaagttaaaagggatgaaagcaggtggaagttcaggctgg
tgggcaagtgttacttcgccgtctaaaccgaccacaacgacttcaacttcagtcacagtt
cgaactactccatcaactccagctcagccagtaagaccatcgacacctgctaaaacaagt
agcagctcggtaacggtaaaaactgcaacacctcgtggttctgatgcgctagctgctttt
gcagcgtcagctgatgtaccaagtgcaccacgtattcctgttgctgtcactccggctgca
aatatcaaacctgtgagaacggaaccaccaatttcagcaactgaacgcgagaaaatttta
gcggcagtgcgtgctgaaggggaaaaggaaacagttgatcaagctttagagcctcaagct
actcaagctgaaaaagaccaagttgttgccgagttaaaagcacttgcacctcaaggtaca
gaaattgtcgatccgtatgatggcaaaattaagttaaccgcaattcagaccagccaatct
gttgctgagcagcaaggtaaagaagtaagtaaaggttttgcttatccaaaaactttagct
gaagatgcaactcttgcaaactctgaagatgctcagcgcaataaagataagccttatatc
aagactgatacagatgttgttgttgtacagcctaaaggtaagcgtagtacttatacagta
caacctggcgatactttagcagttattgccatgaagaatggtgtgaactggcgtgatgta
gctaaatggaaccagattgaccctgaaaagactttatttgtaggaaccagtctatatctc
tatgatgctaagcctcaagaggcggaaactacggcaaaatcggcagctaaacctgatgtc
tatgttgttcaagcaaatgacagtttaacaggagtggcaaatcaatttaatttgtcagtg
aaacagctagctgaatataacgatttgtctgtaacagatggcttgtttgtagggcaaaaa
ttacagttaaaagagcctaaaggtaatcgtgctgctaaagtagaaccaaaggcaattcaa
gcaagtacacgtcgcattacaacgaagagttatactgttaaacgcggcgaatatttgaaa
ttaattgcagaccgttatgcattatctaatcaagagttggcagacctaacaccagggtta
tccgctggtagtaatttaattgtaggccaaaaaattaatgtacctgcaaaagaaatcact
gttgatgaagttgatgacagcaaggcttctggtaaatatgaaaagcttgcagcaggtcca
tcatataaaactgaaagttataaagtgcagcgtggtgatacattatcaagcattgcgacc
aagtctaaaattagcctagctgagcttgctgaactgaacaacttaaaagcgaacagtcat
gtccaactgggacaaactctaaaagttccggctggtgcatcagttcctgaccaatatgtt
gtgcagtcaggcgatagcttaaatgcaatagcagctaaatataacttacaaaccagttat
ttggctgatttgaatggtttgtcacgtactgcaggccttcgtactggtcagcgtttaaaa
ttaactggtgaagttgaaacaactagcaaagtttcggctaaaaataccaaagaggaaacg
ccagagacctacacagttaaatctggtgatagcttaggaaatatcgccaaccgctatcat
ttacagttagattacctcgctgcattgaacggtttatctcgcaacagtaatgttcgtgtt
ggtcaacgcttaaaattaacaggtgatttaccaacagtagaaacagctaaaacggatacg
gcgaaatcgtctccaaaagctgtagttgcaggaaaaaatactgaaaagtacacggttaaa
gctggtgagtcgttaaatgctattgcgagtcgtgcgggtatttcagttcgtgaacttgct
gaaatgaatgcattaaaagcaaatgccaatttacagcgtggacaaaatattgtgattcca
aaaactgtagtggaatacaaagtcaagcgtggtgataccttaattggtcttgcgagtaaa
tatggtttagaaaccactttattggcggaactcaacaacctaacaccgtcgactcaattg
cgtattggcgatatcattaaagtgcctaatttatag
DBGET
integrated database retrieval system