Aliarcobacter cibarius: ACBT_0028
Help
Entry
ACBT_0028 CDS
T06760
Name
(GenBank) RND family efflux system, inner membrane transporter, AcrB family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
acib
Aliarcobacter cibarius
Pathway
acib01501
beta-Lactam resistance
acib01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
acib00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
ACBT_0028
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
ACBT_0028
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
acib02000
]
ACBT_0028
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
acib01504
]
ACBT_0028
Transporters [BR:
acib02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
ACBT_0028
Antimicrobial resistance genes [BR:
acib01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
ACBT_0028
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKJ26030
UniProt:
A0A7L5JLN8
LinkDB
All DBs
Position
complement(26031..29150)
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MIAKFFIFRPIFAWVISLIIMISGVISLYILPIEQYPDIVPPQININASYSGADAKTVEN
SVTQIIEQQLTGLDGMLYFSSSSSSSGNSRIKITFSQEVDADIAQVQVQNKVNQILSRLP
EDVQRQGVRVFKSQSDFLMMASIYDSNNLADKTDISDFLVSNLQDSISRIEGVGDVQVYG
GQYAMRIWLDPYKLEKYNLIPKDIENAINAQNSQASAGRLGAMPTVDNQQLSVTVTARSM
FQSVPEFENIVLKSNLDGSSVKIKDVARVEIGAQNYNNVTALNGYPSSGISIQLASGANA
VATSNRVKEFLKEAENILPEGYKIAYPRDTTHFIKASINEVVKTLIEAIILVILVMFLFL
KNLRATIIPAIAVPVVLLGTFAILNIFGYTINTLTMFALVLAIGLLVDDAIVVVENVERN
MSEKGLDAREATILSMNEVTGALIGITTVLSVVFLPMAFFSGSTGIIYRQFSITIISSMI
LSVIVALTLTPALCATILKPHKEKTSGFIFWFDTKFENFTQKYKNLVQKTLIVPKRWVMF
YLIIVISSAYIFIKLPTSFLPKEDQGSLMVQYTLPVGAVASRTVDVADIVRDYFMTEESA
ALNTIFTISGFSSRSSGQNVGTAYVSLKNWDFRDKNNHVDKISQRATKAFNDPNSKYFVR
DARVFTINPSVIQGLGSSDGFEFQLLASSNLSREELREAKDKIIEEATKNPKINSVRADG
TEESPQLKISYDTNKALALGINLKDIDTTLSAAWGGTYVNDYIDKTRIKRVYIQGDAPFR
TAPEDLYKWKVRNSNGSMTPFSEFSSFSWVYSPEELTRFNGFMSYEIQGSAAAGISSGDA
MNEMDKISTNVNSGLMHAYSGASYQEKLASNQSLILYSISILVVFLCLAALYESWSVPFS
VLLVVPLGVFGAVLSIYFRDLSNDVYFQVALLAVMGLASKNAILIVEFINSAYKDGMNLI
EAAITGAKLRLRPIVMTSLAFIAGIIPLAISSGAGANSRIAIGTAILGGTISATILAIFF
VPLFFVIIKKIFSKEVKNV
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgctaagttttttatttttcgtccaatttttgcttgggtaatttcgcttattatt
atgataagtggagttataagtctctatattttaccaattgagcaataccctgatattgtt
ccacctcagataaatataaatgcttcttattcaggagcagatgctaaaactgttgaaaat
agtgtaactcaaataatagaacaacaattaactggacttgatggcatgctatatttttct
tctagttctagttcatcaggaaattcaagaataaaaataacttttagtcaagaagtagat
gctgatattgcacaagttcaagttcaaaataaagtaaatcaaatcctatcaagacttcct
gaagatgtgcaaagacaaggagtaagagtatttaaatctcaaagtgactttttgatgatg
gcaagtatttatgattcaaataatcttgctgataaaacagatattagtgactttttagta
agtaaccttcaagatagtatttcaaggattgaaggtgttggagatgttcaagtttatggt
ggacaatatgctatgagaatatggttagacccatataaacttgaaaaatataatttaatt
ccaaaagatattgaaaatgctataaatgctcaaaattctcaagcaagtgcaggaagactt
ggagcaatgccaacagttgataatcaacaactatctgtaacagtaacagctagaagtatg
ttccaatctgtgcctgaatttgaaaatattgttctaaaatcaaatttagatggaagtagt
gtaaaaataaaagatgtagcaagagttgaaataggtgctcaaaactacaataatgttaca
gcattaaatggttacccatcttctggtatatctattcaacttgcaagtggagcaaatgct
gttgcaacttcaaatagagtaaaagagtttctaaaagaagctgaaaacatactacctgag
ggttataaaattgcctatcctagagatacaactcatttcataaaagcatcaataaatgaa
gttgtaaaaactttaattgaagcaattattcttgtaattcttgtaatgtttttattttta
aaaaatctaagagccacaataattcctgcaattgcagtacctgttgttcttttaggaact
tttgcaattttaaatatatttggttacacaataaacactcttactatgtttgctttagtt
ttagccataggacttttggttgatgatgctattgttgtcgttgaaaatgttgaaagaaat
atgagtgaaaaaggtttagatgcaagagaagcaactattctttcaatgaatgaggtaaca
ggtgcactaataggaataacaactgttttatctgtagtatttttacctatggcatttttt
agtggatcaacaggaataatttacagacaattttcaattacaattatttcatctatgatt
ttatctgtaattgttgctcttactttaactcctgctttatgtgcaactattttaaaacct
cataaagaaaaaactagtggttttatcttctggtttgatactaaatttgagaacttcaca
caaaaatataaaaatctagttcaaaaaactttaatcgtaccaaaaagatgggtaatgttc
tatctaataatagttatatcttctgcatatatatttataaaacttccaactagcttttta
ccaaaagaggatcaaggaagtttaatggttcaatatacccttcctgttggagcagttgct
tcaagaactgttgatgtagcagatattgttagagactattttatgacagaagagagtgct
gctttaaatactatatttacaatttctgggtttagtagtagaagtagtggacaaaatgtt
ggaactgcttatgtatcattaaagaattgggattttagagataaaaataaccatgttgat
aaaataagtcaaagagccacaaaagcttttaatgacccaaacagtaaatatttcgtaaga
gatgctagagtatttactataaatcctagtgttattcaaggtttaggttcaagcgatggt
ttcgaatttcaattacttgctagttcaaatctatcaagagaagagttaagagaagcaaaa
gataaaataatcgaagaagctactaaaaatccaaaaataaactctgttagagccgatgga
acagaagaatctcctcaactaaaaatatcttatgatacaaataaagctttagctttaggg
attaatctaaaagatatagatacaacacttagtgctgcttggggtggaacttatgttaat
gactatattgataaaactagaataaaaagagtttatattcaaggtgatgcgccatttaga
acagctcctgaagatttgtataaatggaaagttagaaacagcaatggttcaatgactcca
tttagtgaatttagctctttttcttgggtttattctccagaagaacttactagatttaac
ggtttcatgtcttatgaaattcaaggaagtgctgcggctggaattagttctggggatgct
atgaatgaaatggataaaatatcaactaatgtaaatagtggactaatgcatgcatatagt
ggagcttcataccaagaaaaacttgcaagtaatcaaagtttgattttatactctatttct
attttagttgtatttttatgccttgctgcactttatgaaagttggagtgtacctttctct
gttcttttagtagtacctttaggagtttttggagctgttttaagtatatattttagagat
ttaagtaacgatgtatatttccaagttgctctcttagcagttatgggacttgcttcaaaa
aatgcaattttgattgttgaatttataaatagtgcatataaagatggtatgaatttaatt
gaagctgcaattactggagcaaaattaagattaagaccaattgttatgacttctttagca
tttattgcaggaatcattcctcttgctatatcctcaggagctggagcaaatagtagaatt
gcaattggaacagcaattttaggtggaactataagtgctaccatacttgctatatttttt
gtaccattattctttgtaataattaaaaagatattttcaaaagaggtgaaaaatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system