Apis florea (little honeybee): 100872837
Help
Entry
100872837 CDS
T09140
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase Ubr3 isoform X2
KO
K11978
E3 ubiquitin-protein ligase UBR3 [EC:
2.3.2.27
]
Organism
aflr
Apis florea (little honeybee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aflr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
aflr04121
]
100872837
Enzymes [BR:
aflr01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
100872837
Ubiquitin system [BR:
aflr04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Single Ring-finger type E3
UBR box proteins
100872837
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PRT6_C
zf-UBR
zf-RING_2
Nexin_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100872837
NCBI-ProteinID:
XP_012350445
EnsemblRapid:
LOC100872837
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1954 aa
AA seq
DB search
MLTDMEVVENSLVRGSSLLERFPGSFHTRNTQKGILQGVPAGFGELAKPGREYSSSSEDT
ATRSKDSGILAVRGQSFTMSGLCTDILRKSYTAAHIHAECSNLAHDSGCPPSLTKLLDEL
LNPSKDIGDRETINWCKWLIASGNTPEKFAKIVRMYDNATTCGLVWTPNFVAYRCRTCGI
SPCMSLCTECFKKGNHYGHDFNMFLSQAGGACDCGDASVMKESGFCDRHGPKAAVDTSAA
PSNLMCVAEAMMPRIILRLIQHLRENCTVGRRNYEAAIQDADEYLTMLIDFNKMGALMRH
VMTSALTNPQKYRNLMDPTVSTGEPEYDSYCQDSNEIYQNAVRSLPNPEPPDEYKECASL
QEHLQHTTFLEELMFWTVAYQFPQKLVCLLLNMLPDPEYKEALTRAFVLHYSRVSMMLER
STDPDTLSNRVVHVSVQLFSNESLALKMVDQLKLLHVMVIALKYMMSKILIQNTLHDPDK
NFHYVVDCERQVMKEHCYWPIVSDLNNVLSHKPIAVRFMSDDTLLEMWFDFLSMFQGMNV
NQREVNQHVEYESNTYYAAFSAELEASAYPMWALVSHLRGPESAVLTRRVLSFCLTALQD
WLDAINFTHPNVSDSLQVSFHLPLHRYFAVFMCQAVRQQGATLNDLLPPTDMLHLLMMHP
LRVQVAFYEILNGLWVRNGLQIKGQIMTYIQCNFCNSMVDADLYLLQVCATKLQPDIFLK
TIVKKFLVKQELSLCLYRTSQNEYMDGKHDMPMLESFLTFLAILLNVRTNLGLSDPEMSR
LEMVTLLSMGDKTHSQLMELMPERSGSTQNRDFESVLADVAVYRAPNLEASGNMQQGMYG
PKPRLVWEELFDPLHVLLRAAQRGDFQMAMDRFTEYVKQSGKLKNSAIPWPPFRHPAPVS
PAYDDPRIVLRSRVFHAMILIILYKSVYGHNISEHVMALTIYLLEMAVITAEIPDKSMNP
LCHYTSDESSRIMKDMDLDSWYKTDDLSENLRTVIPKVILVQESESSSSDSDFEWEIQGE
MTEVGTSLMINDATDEGSLEVLALPPLDTISNDTGLQVAMNASLPVLPQVNDFVSQPALP
PAPQRPAVMAGNEIVAATTMYSRLSNSNVTTTEIVPSTSSSHKHFKRRETQGGSLQSQTI
KVDESIITLLLKLHSQLSGIPDSYNPEQSAMSDNEASSSSTIEPIESRIGDGPFFIANLL
NKITNLDPMCKEAINEARNKLWPSMQESEDKQREKEDREREERRRRAKERQQKLMAEFAN
KRKQFMEKAMETDGAGVSGMDWDQKDNATKLTSKKEYDCVICSQSSPSTEDNPMGLVVLV
QGTSVIGHERQQPDRLILPTSDEDPPIPKCDTRGAYFDRRMDAMDRHFDTVSLLLSINLG
WEGGVYVQTCGHHLHLDCLLPYIKSLGHQQRQLSLAVDSGEYLCPLCRQLANCFLPLSPQ
LGKRGTIVRSPYVPFPTILPEINNLLKEVQRNSSTKRTFLSEAMRKAVQDMTRCTNSKCQ
QQHSYKSLFAFITSIARTNFEIELVQRGGSLCILPPTTIPLRPKRDCIVALLDVLAKNAR
LCMFWPVQHTWQQLSGLPAESATPLALTLHEEEVPLLLRDPTALLIQFILLLPLHLDQTY
FSSVVKVIYNLLYYQVIVQISGGLTQAERNTFLRRECNDRGSISSETILCKIIEYFNNSS
LYHSDTVLYDPSTSSCTPYARDKMHSIEQQIQFMCLPFLRIAALLRYHLYEEPLPLIKTP
QVEFARLVYYLELVTESMDWNMFNSAVALNWQDNDTSASVPRMWCDQFLAFLNRSDAGRY
LIMEQHISWQVPKLLSLPREYEKIFTYYHGRQCRQGHSIPQEISICLLCGAIVCLKQNRK
QWNVCEVVQHSIDCGGGTGIYLVVTSTYIVVIRGQRVCLWGSLYLDDFEEEDRDLKRGKP
LYLNQDRYQLLEQQWLAHRFDHTKKTWVWHRDIL
NT seq
5865 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcactgatatggaggttgttgagaattctttagtccgcggatcgtctctacttgaa
aggtttcccggaagttttcatacgagaaacacgcaaaaaggtattctgcaaggtgttccc
gcgggatttggcgagctggcgaagccaggacgtgaatactcgtcatcctcggaggatacc
gcaacacgtagcaaagacagtggtatcctcgctgtgcgaggtcaatctttcacaatgtct
ggcttatgcactgatatattaaggaaaagttatacagctgctcatatacatgcagaatgt
agcaatttggctcatgacagtggctgtccaccatctcttactaaattattggatgaactg
ttaaatcctagtaaagatattggtgatagagaaaccataaattggtgtaaatggttaata
gctagtggtaatacaccagaaaaatttgctaaaatagtgagaatgtatgataatgctaca
acttgtggattagtttggacacctaattttgttgcatatcgttgtcgtacatgtggtatt
tcaccatgtatgtctttatgtacagaatgttttaaaaaaggcaatcattatggccatgac
tttaatatgtttttaagtcaagcaggaggtgcatgtgattgtggtgatgcatctgttatg
aaagaatcaggattttgtgataggcatggaccaaaagcagctgttgatacatcagctgct
ccttcaaatttaatgtgtgtagcagaagcaatgatgcctagaataattcttcgtcttata
caacatttacgtgaaaattgtacggtgggtcgacgaaattatgaagctgcaatacaagat
gcagatgaatatttaacaatgctcattgattttaataaaatgggtgcattaatgaggcat
gttatgacatcagctttaactaatccacaaaaatataggaatcttatggatcctactgta
tcaactggagaaccagaatatgatagttattgtcaagatagtaatgaaatatatcaaaat
gcagtaagatcattacccaatccagaaccacctgatgaatataaagaatgtgcatcatta
caagaacatttacaacataccacttttttagaagaattaatgttttggacagtggcttat
caatttccacagaaattagtctgcttgctattaaatatgttaccagatccagaatataaa
gaagcactcactcgagcatttgttttacattacagtagagtttcaatgatgcttgaacgt
tcaacagatcctgatactttgagcaatagagtagttcatgtcagtgtacagctattcagt
aatgaaagtttagcattaaaaatggtagatcaattaaagttgttgcatgttatggtgata
gcgttaaagtatatgatgagtaaaatattgattcaaaatactttacatgatccagacaaa
aattttcattatgtagtagattgtgaacgtcaagtgatgaaggaacattgttattggcct
attgtatcagatttaaacaacgttctttcacacaaacctatagctgtcagatttatgagt
gatgatacacttttagaaatgtggtttgattttctatctatgtttcaaggaatgaacgtg
aatcaacgagaagtaaatcaacatgttgaatatgaatctaatacatactatgcagcattt
agtgcagaattagaagctagtgcatatccaatgtgggctctagtttctcatttacgtggt
ccagaaagtgcagttcttactcgtagagtattatcattttgtcttactgcattgcaagat
tggttagatgctataaattttactcatccaaatgtgagtgatagtttacaagtatctttt
catcttccattgcatcgatattttgctgtatttatgtgccaagctgtgcgtcaacaaggg
gctacactcaatgatttgttacctcctacagacatgttacatcttttaatgatgcatcct
ttacgagttcaggttgctttttatgaaattttaaatggattatgggtgcgaaatggtctt
caaataaaaggtcaaattatgacatacatacaatgcaacttttgtaattcaatggtagat
gcagatctttatttacttcaagtctgtgcaacaaagctacaaccagatatttttctaaaa
acaattgttaaaaaattccttgtgaaacaagagttgagcctttgtttatacagaacatct
caaaatgaatatatggatggaaaacatgatatgcctatgttagaaagttttttaacattt
ttagcaatattacttaatgttcgaacaaatttaggtttatctgatcctgaaatgtctcgt
ttagaaatggttactttattatctatgggagataaaactcatagtcaattaatggaatta
atgccagaacgttctggtagtacccaaaatagagattttgaatctgtattggctgatgtt
gcagtgtatagggcacctaatcttgaagctagtggaaatatgcaacaaggaatgtatgga
ccaaaacctcgtttagtctgggaagaattatttgaccctttgcatgttttgctaagagca
gctcaaagaggagattttcaaatggcaatggatcgttttactgaatatgtgaaacaatca
ggaaaattaaaaaatagtgcaattccatggccaccatttaggcatcctgctcctgtttca
cctgcatatgatgatccacgaatcgtacttcgatctagagtttttcatgctatgatttta
ataattttatataaatctgtatatggacataacatatcagagcatgttatggcattgact
atttatttattagaaatggcagtaattactgcagaaattcctgataaatctatgaatcct
ttgtgtcattatactagtgatgaatcatctcgtataatgaaagacatggatttagatagt
tggtataaaactgatgatttgtctgaaaatttgagaacagtaatacctaaagtaatctta
gttcaagaatcagaatcaagtagctcagatagtgactttgaatgggaaattcaaggtgaa
atgactgaggttggaacttcactcatgataaatgatgcaacagatgaaggttctttagaa
gttttagctcttccacctttagatactattagtaatgatactggattacaagttgctatg
aatgcttctttacctgttttacctcaagtaaatgactttgttagtcaaccagcattacca
ccagcacctcaacgacctgctgttatggctggtaatgaaatagttgctgcaacaacaatg
tactcgagactgagtaattctaatgtaacaacgacagaaattgttccatctacatcaagt
tcacataaacattttaaaagaagagaaactcagggtggatcattacaatcacaaactata
aaagtagatgagagtataatcacgttattattaaaattgcactcacaattatcaggtatt
ccagatagttataatcctgaacagagtgcaatgtcggataatgaagctagtagtagttca
actatagaacctatagaatcgcgaattggtgatggcccattctttattgcgaatctattg
aacaagataacaaacttggatcctatgtgcaaagaagctataaatgaagctaggaacaaa
ttatggccaagtatgcaagaaagtgaagataaacaacgagagaaagaagatcgcgaaaga
gaagaaagacgaagacgagcaaaagaaagacagcaaaaattaatggctgaatttgctaat
aaacgaaagcaatttatggaaaaagcaatggaaacagatggagcaggagtatctggtatg
gattgggatcaaaaagataatgcaacaaaattaactagcaaaaaggaatatgattgtgtt
atttgcagtcaaagtagtcctagtactgaagataatcctatgggtcttgttgtattagtt
caaggaacaagtgtcattggccatgaacgtcaacaaccagatagactaattttacctaca
tctgatgaagatccgcctataccaaagtgtgatacacgcggtgcctattttgatcgtaga
atggatgcaatggatcgacattttgatactgtctcgttgctgttatctattaatttaggt
tgggaaggtggagtatatgttcaaacgtgtggtcaccatttacatttagattgtttgttg
ccatatataaagtctcttggtcatcaacaaagacagctttctcttgctgtagatagtggc
gaatatttatgtccactttgtcgacagttagcaaattgttttcttccactttctccgcaa
ttaggaaaacgtggaacaattgtacgatctccctatgttccttttcctacaatacttccg
gagataaataatcttttaaaagaagtacaacgaaattcatcaacgaaacgaacattttta
tctgaagcaatgcgtaaagcagtacaagatatgacaaggtgcacaaattctaaatgtcaa
caacaacatagttacaaaagtttgtttgcttttataacttctatagcacgaactaatttt
gaaattgaactcgttcaacgtggcggatcgttgtgtattcttccacctactacaatacct
ttaagaccaaaacgtgattgtattgttgcacttcttgatgttcttgcaaaaaatgcacgt
ctatgtatgttttggccagtacaacatacatggcaacaattatctgggctgcctgcagaa
tcagcaactccacttgctctaacactacacgaagaagaagttcctttacttcttagagat
ccaactgctcttcttatacaatttatattattacttcctttgcatttggatcaaacatat
ttctctagcgtagtaaaagtaatttataacttattgtactatcaagttatagtacaaata
agcggtggtctcacacaagcagaaagaaatacatttttaaggagggaatgtaatgatcgc
ggttctatatcttcagaaacaatactctgcaaaatcattgaatatttcaataacagttca
ctctaccattcagatactgttttatatgatccatccacttcgtcatgtacaccatatgca
cgagataaaatgcacagtatcgaacaacagattcaatttatgtgtttaccatttttacga
atagctgcattgcttcgttatcatttgtatgaggaaccattacctttaattaaaacacca
caagttgaatttgcaagattagtatattacttagaattagttacagaaagtatggattgg
aatatgtttaattctgctgtagctttgaattggcaagataatgacactagtgcatcagta
cctcgtatgtggtgtgatcaatttcttgcatttttaaatcgaagcgatgcaggcaggtat
ttaattatggagcagcatatatcatggcaggtgcccaagttacttagtcttccaagggaa
tatgaaaaaatttttacgtattatcatggacgacaatgtcgtcaaggtcattcaatacca
caggagattagtatttgtttattatgtggtgccattgtttgtttaaaacaaaatcgcaaa
caatggaatgtatgcgaagttgttcaacattcaattgactgtggaggtggaactggtata
tatctggtagtaacatcaacttatattgttgtaattcgaggtcaacgtgtttgtttatgg
ggatctttatatctcgatgatttcgaggaagaagatagagatttgaaacgtggaaaacct
ctttacctaaatcaagataggtatcaattattagaacagcaatggttagcacataggttt
gatcatacaaaaaaaacatgggtatggcatcgtgacatactgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
