Aphidius gifuensis: 122856730
Help
Entry
122856730 CDS
T07796
Name
(RefSeq) ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47
KO
K11857
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 [EC:
3.4.19.12
]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
agif01002
]
122856730
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
agif04121
]
122856730
Enzymes [BR:
agif01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.19 Omega peptidases
3.4.19.12 ubiquitinyl hydrolase 1
122856730
Peptidases and inhibitors [BR:
agif01002
]
Cysteine peptidases
Family C19: ubiquitin-specific protease family
122856730
Ubiquitin system [BR:
agif04121
]
Deubiquitinating enzyme (DUB)
Ubiquitin-specific proteases (UBPs)
UBP/USP
122856730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UCH
USP47_C
UCH_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122856730
NCBI-ProteinID:
XP_044014451
LinkDB
All DBs
Position
LG5:complement(1945560..1952717)
Genome browser
AA seq
1556 aa
AA seq
DB search
MVVEASDESLDPIDNYQIIPSLSGANSYSNSIITVLVKDIATVPVRVLTKKCLVSLECEV
SLICQLISWLQKENRPVSDCKICLNNTDLYYSSGKKLADYNLNIDTNKQSKLGIAYKFCD
DVNEQPLFKSPKFIELKVSDKTNGLIAFTLPYKFIITPESTIDELTNNILNLSYTELLEK
YQATSHIILKFRHSSTIINDDNKIPNNEKFKNLKFNFYSKKNEFIEIINIQIINKTTNTI
IDNEKSIKSFDNNDVIKKFYDDEFDQCIESVKNGCASEYPIPIDEYNTTTTTKNDNKQWS
SNDYTVTLNNTNYDVDSDSLFDKIEEIKTIGQNNYDDTNNTTNNYHNDKTINNINNNNNS
NNNNNDDYINNNNNNSSNIYVGLVNQAMTCYLNSLLQALYMTPEFRNALYNWEYIDGPEK
DEAKSIPYQLQKLFLNLQTSDKNSVKTTSLTKSFGWDSTDAWHQHDIQELCRVMFDALEQ
KFKNTKQSDLINRLYEGKMIDYVKCLECKTIKSREDTFLDIPLPVRPFGCNVAYNDVQEA
LRAFVQPETLDGVNQYNCEKCNKKTDAHKGLKFKKFPYLLTLHLKRFDFDYNTFQRIKLN
DKVSFPDKLNLNSFVIDDNSDTQELIINEEDAGVGVKCDEPSTSDLNNIDELLTTPTTKT
ITSSSVLTTTTPPPSPPSSPVTIPQPPTITTTTTTNNEQDDDEGIDMSNGPSTSSTHSQD
NDRCHVKGPYNYELYAIMIHSGSASGGHYYAYIKDFKTNEWLCFNDQEVTSITQNDIQKT
FGGGPTRTFYSGYYGSSINAYMLMYRQIDSERNAVPMTVDNFPPHIKELLKKIKIEEQDN
KLFYDRPKPSLCSARVSVVHPIDNTLKMKKMYFFENETLKGSVERVYKEFNLDNIVDIEQ
CRLVSWDSKKEYIKRSYDEPDDDKISEILESDAVGGNNKNGYHEMLLEIRDKNEKFKYYS
PDAFKTTIYIVDNEKYDIIDGPFHGRALFNVKIGEFKKDLADEYSMDIDNMICAVILKTH
FDSVKILEDDKDDLRDQGFIYDLHGKIILMQNDNNKHQLDINKLAKLATDIDNTIYLKIN
LPDMSKEKLDEMNIKLIDEHKNHDDEYNYYFNNSKKCIDSGDNNSCNNIINNNKDTNGSV
VAGGTTTTTTTTTATATNEIDELQEQSNSEDSSQSDSDRTLVGKLSENDDDDDDDGDDDD
STDNQYSNKEKNFEKELLNIELKKYFKVIKKVNDKNGNTYLKLFVDRRLKIHVFKLQIEK
YLGISNNSFKFDAEDNDYINDINYSHKYDDDRIYSKIDNNSIINIVLLRILGINEIKIKL
HQLYLNTTSSTDSNFQLLFDIIVTKDMTIKQLKNTIVNDMKSKMNTDITVDKIRLRKKIH
QIPSKVYFNHQVLSDICLNSPIDIIFQELDGFEQVTNDKQVLVIVKCYSGVEYGQQYQEI
VLSSPQATIEELTEKVAELSSISPENLEFTKGRWPMGQRNRQLEWTSIAIGNDIPELYDG
AVIYYRDTAEKSKQPFIKTKREIADSTETARDNRNSSASTYRRREHPLRIYVNDRE
NT seq
4671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgttgaagcatctgatgaatcacttgatccaattgataattatcagataatacca
tcattatcaggagcgaatagttattcaaattctataataacagtattggtcaaggatata
gcaacagtaccagtaagagtattaacaaaaaaatgtctagtatcattagaatgtgaagta
tcattgatttgtcaattaatatcatggttacaaaaagaaaatcgtccagtaagtgattgc
aaaatttgcttgaataatactgatttatattattcatctggtaaaaaattagctgattat
aatttaaatattgatacaaataaacaatcaaaattaggtattgcatataaattttgtgat
gatgttaatgaacaaccattatttaaatcaccaaaatttattgaattaaaagtatctgat
aaaacaaatggtttaatagcatttacactaccatataaatttataataacaccagaatca
acaattgatgaattaacaaataatatactcaacttaagctacactgaattactagaaaaa
tatcaggcaacatcacatataatattaaaattccgtcattcatccaccatcataaatgat
gataataaaataccaaataatgaaaaatttaaaaatttaaaatttaatttttattcaaaa
aaaaatgaatttattgaaataataaatatacaaataataaataaaacaactaatacaata
attgataatgaaaaaagtataaaatcttttgataataatgatgttattaaaaaattttat
gatgatgaatttgatcagtgtattgaatcagttaaaaatggttgtgcaagtgaatatcca
attccaatagatgaatataatacaacaacaacaacaaaaaatgataataaacaatggtca
tcaaatgattatacagtgacattaaataatacaaattatgatgtagattctgatagttta
tttgacaaaattgaagaaataaaaacaattggtcaaaataattatgatgatacaaataat
acaacaaataattatcacaatgataaaacaataaataatattaacaacaacaacaacagc
aacaacaacaacaatgatgattatattaataataataacaacaattcatcaaatatttat
gttggtcttgttaatcaagcaatgacatgttatttaaatagtttattacaagcattatat
atgacacctgaatttcgtaatgcactatataattgggaatatattgatggaccagaaaaa
gatgaagctaaaagtataccatatcaattacaaaaattatttttaaatttacaaacatca
gataaaaattcagttaaaacaacatcattaacaaaaagttttggttgggattcaactgat
gcatggcatcaacatgatatacaagaattatgtcgtgttatgtttgatgcattagaacaa
aaatttaaaaatacaaaacaatctgatttaattaatcgtctttatgaaggtaaaatgatt
gattatgttaaatgtttagaatgtaaaacaattaaaagtcgtgaagatacatttttagat
ataccattaccagttagaccatttggttgtaatgttgcatataatgatgtacaagaagca
ttacgtgcatttgtacaaccagaaacacttgatggtgttaatcaatataattgtgaaaaa
tgtaataaaaaaactgatgcacataaaggtttaaaatttaaaaaatttccatatttatta
acattacatttaaaacgttttgattttgattataatacatttcaacgtattaaattaaat
gataaagtatcatttccagataaattaaatttaaattcatttgttattgatgataatagt
gatacacaagaattaataattaatgaagaagatgctggtgttggtgttaaatgtgatgaa
ccatcaacaagtgatttaaataatattgatgagctattaacaacaccaacaacaaaaaca
attacatcatcatcagtattgacaacaacaacaccaccaccatcaccaccatcatcacca
gtaacaataccacaaccaccaacaataacaacaacaacaacaacaaataatgaacaagat
gatgatgaaggtattgacatgtcaaatggaccatcaacatcaagtacacatagtcaagat
aatgatagatgtcatgttaaaggaccatacaattatgagctatatgcaattatgatacat
agtggttcagcatctggtggacattattatgcatatattaaagattttaaaacaaatgaa
tggctatgttttaatgatcaagaagtaacatcaataacacaaaatgacatacaaaaaaca
tttggtggtggaccaacacgtacattttacagtggttattatggctcaagtataaatgca
tatatgcttatgtatcgtcaaattgatagtgaaagaaatgctgtaccaatgactgttgat
aattttccaccacatattaaagaattattgaaaaaaataaaaattgaagaacaagataat
aaattattttatgatagaccaaaaccatcattatgttcagcacgtgtatcagttgttcat
ccaattgataatacacttaaaatgaaaaaaatgtatttttttgaaaatgaaacattaaag
ggttcagttgaacgtgtatataaagaatttaatttagataatattgttgatattgaacag
tgtcgtcttgtaagttgggattcaaaaaaagaatatataaaacgtagttatgatgaacca
gatgatgataaaatatctgaaatattagaaagtgatgctgttggtggtaataataaaaat
ggttatcatgaaatgttacttgaaatacgtgataaaaatgaaaaatttaaatattattca
ccagatgcatttaaaacaacaatatatattgttgataatgaaaaatatgatattattgat
ggtccatttcatggacgtgcattattcaacgttaaaattggtgaatttaaaaaagactta
gctgatgaatattcaatggatattgataatatgatatgtgctgttattttaaaaacacat
tttgattcagttaaaatacttgaagatgataaagatgatttaagagatcaaggttttata
tacgatcttcatggtaaaataatattaatgcaaaatgataataataaacatcaattagat
ataaataaattggcaaagttagctactgatattgataatacaatttatttaaaaattaat
ttaccagatatgagtaaagaaaaacttgatgaaatgaatattaaattaattgatgaacat
aaaaatcatgatgatgaatataattattattttaataattcaaaaaaatgtattgattct
ggtgataataatagttgtaataatataattaataataataaagatacaaatggtagtgtt
gttgctggaggaacaacaacaacaacaacaacaacaacagcaacagcaacaaatgaaatt
gatgaattacaagaacaaagtaatagtgaagatagcagtcaaagtgattcagatagaaca
ctagttggtaaattatcagaaaatgatgatgatgatgatgatgatggtgatgatgatgat
tcaacagataatcaatattcaaataaagaaaaaaattttgaaaaagaattattaaatatt
gaattaaaaaaatacttcaaagttattaaaaaagtaaatgataaaaatggaaatacgtac
ctgaaattatttgttgatagaagattaaaaatacatgtatttaaattacaaatagaaaaa
taccttggtatatcaaataatagttttaaatttgatgctgaagataatgattatattaat
gatataaattattcacataaatatgatgatgatagaatttatagtaaaattgataataat
tcaataataaatattgtattattacgtatacttggtattaatgaaattaaaattaaatta
catcaattatatttaaatacaacatcatcaactgattcaaattttcaattattatttgat
attattgtgacaaaagatatgacaattaaacaattaaaaaatacaattgtcaatgatatg
aaatctaaaatgaatactgatataacagttgataaaataagattgagaaaaaaaattcat
caaataccatcaaaagtttattttaatcatcaagtattgagtgatatttgtctcaattca
ccaattgatattatatttcaagaattggatggttttgaacaagtcacgaatgacaaacaa
gttcttgttattgttaaatgttattctggtgttgaatatggacaacagtatcaagaaatt
gttttgtcatcaccacaagcaaccattgaagaattaactgaaaaagttgctgaattatca
agtatatcacctgaaaatttagaattcaccaagggcagatggccaatgggacaaagaaat
agacaattggaatggacaagtatagctattggtaatgatataccagaattatatgatggt
gctgttatttattacagagacacagctgaaaaatcaaaacaacctttcatcaaaacaaaa
agagaaatagctgattctactgaaacagcaagagataatcgtaattcatcagcttcaaca
tatcgtagacgtgaacatccacttagaatttatgttaatgatagagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
