Arachis ipaensis: 107610465
Help
Entry
107610465 CDS
T04301
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At5g56310-like
Organism
aip
Arachis ipaensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
Eplus_motif
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107610465
NCBI-ProteinID:
XP_016168005
LinkDB
All DBs
Position
B01:114544935..114547957
Genome browser
AA seq
562 aa
AA seq
DB search
MEERRKGGQTRSKGSLPASGSSSRSFQQRVFSLLQRCNSLNILLQIHTQLILNSLSYKNN
FIFKLLSLYVSYGHLHNAHTLFSTLHKPTTPLWNQIIRAHARTPAAPFKSVECYNRMVAS
GSEPDGFTYSFLLSACARGGLVGEGEQVHCKVLVKGYCYNVFVETSLVNFYAVCGGVGKA
RYVFDEMNQRSVASWNSMLAGYVRCGDFDGARRVFDEMPCRNVVSWTTMVAGCARGGKCK
QALSLFGEMSRAGVELDQVALVAALTACAELGDLKLGRWIHWYVEQRFVVRNNEQPSLRL
SNALIHMYASCGIIDDAYRVFINMPRKSTVSWTSIIMAFAKQGLGKEALDLFKAMLSDGV
GVNEIRPDEVTFIGVLCACSHAGFVDEGRQIFASMKHTWGIHPRIEHYGCMVDLLSRAGF
LDEAQGLIETMPLKPNDVLWGALLGGCRIHKNSELASGVANKVVAELNVNQAAGYLVLLS
NIYAFAKRWQDVVAMRQKMIEMGVKKPPGRSVVQINGVLHNFVAGDVTHKHSYYIYETLH
EITKQANWEDYEPDITEVLVDA
NT seq
1689 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggaacgaaggaaaggtggacagacgagaagcaagggttcccttcccgccagtgga
agcagcagtagaagctttcagcagcgtgtgttctcccttttgcaacgatgcaacagcctc
aacattctcctccaaatccacacccaactaatcctcaactccctctcttacaagaacaac
ttcatcttcaagctcctctctttatacgtctcctacggccacctccacaatgcccacacc
ctcttctccactctccacaaacccaccacccccctctggaaccagatcatcagggcccat
gcccgaaccccagcagctcctttcaaatctgtggagtgctacaatcgcatggtggcttct
gggtcggagcctgatgggttcacgtactcgttccttctgagcgcgtgcgcacgtggtggg
ttggttggggaaggggaacaggtgcattgcaaggttttggtcaaagggtattgctacaat
gtgtttgtggagacaagtttggtgaatttctatgcggtgtgcggtggtgttgggaaagca
cgttacgtgtttgatgaaatgaatcagagaagtgttgctagctggaactctatgcttgct
gggtatgttaggtgtggtgattttgatggggccagaagggttttcgatgagatgccttgt
aggaatgttgtgtcttggaccaccatggttgccggatgcgctcgtggcggcaagtgcaag
caggctttgtcgttgtttggtgagatgagtagggcgggtgtggaattggaccaggtggcg
ctggtggctgccttgacagcatgcgctgagttgggggatctaaagttgggaagatggata
cattggtatgttgaacagagatttgttgtgaggaacaatgagcagccttcattgcgtttg
agcaatgcactcattcatatgtatgccagttgtggaatcattgatgatgcttacagagtg
tttatcaatatgccgcggaaaagcactgtgtcttggactagcatcatcatggcttttgcg
aaacaaggccttggaaaggaagcgcttgatctttttaaggctatgcttagtgatggtgtt
ggtgtaaatgaaataagaccagatgaagtaaccttcattggagtgctttgtgcttgcagc
catgctgggtttgtagacgaaggacgccagatttttgcatctatgaaacatacttgggga
atccacccaaggattgagcactatggatgcatggttgatctcttgagccgtgctggtttc
ttagatgaagcacagggacttatcgaaaccatgcctttaaaaccaaatgatgtgctatgg
ggtgcccttcttgggggttgtcgaatacacaagaactcagaactagcatcgggagtggca
aacaaggtagtagccgagctcaacgtcaaccaagccgcaggctatcttgtcctcttgtca
aacatatatgcttttgccaaaaggtggcaggatgtagttgctatgagacaaaaaatgatt
gagatgggtgttaaaaagcctccgggcagaagtgttgtgcaaattaatggagttctgcat
aactttgtggctggtgacgtgacgcataagcattcttattatatctatgaaaccctccat
gagatcaccaaacaagccaattgggaagactatgaaccagacataacagaggtcttagtt
gatgcttag
DBGET
integrated database retrieval system
