Aliiglaciecola sp. LCG003: QR722_09315 Help Entry QR722_09315       CDS       T09143                                  Name (GenBank) endo-1,4-beta-xylanase Organism alii  Aliiglaciecola sp. LCG003 SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  Glyco_hydro_10 Cadherin Mann_GBD_bact Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  WJG11206 LinkDB All DBs Position complement(2185059..2188229) Genome browser AA seq 1056 aa AA seqDB search MQKTNRLTWLYLNFLILLMPSFVLAKWVNVEQNVTVSSTLPAFDRVNRQYISVVEISNQG ETAIAGPLRLIVIDATIPLSNLTGITEQGLPYLEMSADTIQPDQSVSVQLNFELQRKRLS FTANLQQDNPNAGVYAQAEGGDASVLVMLGGAFNVIEGDPSYVTISETDTNAPSDDSRVI ELNVTFPQAGSYEMYARVRVGPNGANDDSFYAPDALGANNGWVSVNSISGFIVPGEVGYE PGVNVVGGGSSATEVWKWMRLSDPIYTVPDNELLQTFRFGGREDGLDIDKFAFAPQGVLF TIEELENGLPGQVIPPPPPFVPEGPPMADGQDKFVGGVCCGRQRPNFEAYFNQVTPENAG KWGSAEPVRDSFNWTELDEAYNLAKNNGYLYKHHVLIWGNQQPAWITDLPVQEQLEEILE WMNAINQRYAAIDFIEVVNEFDNDPPDSENNGPGYIDALRLYQPATTTELISYFEQQGLS NADAILKAAEYDWIINSFQMARRIFPASTRLMINEYSVINTATRTDKMIELVDLLQQRNL IDDVGFQGHAFSTTGPNQAMQDNLDRLAAQTGLDLYVTELDIDGATDLIQLLDYQRIFPL FWEHPAVKGITLWGYLPGHWRENQGAILAQENGAEKPALVWLRGYVRGLLPQIINPGLLE VEPGTAVGTSVATLSSIAYDGNPHAPNEQISWSILGGSGDSLFAIDQYSGQITVTGSLNP ALHNLYIQVKAGQYTSTLLNLQILVPGDELEPIVIEYNFYNDVEGWRGDYGTPSTVGYDG ANLAVILIPDWSVSSQNYIKEISATDLTNATLEYQFNVTQAQVDGGLTVQAYVQTGAPNY SRIYAAVETPVAGTNTIVFNPVDNDASDLQIIERIAFQLNGVPTEGELDNVLLERVRITI PVTVPPSNIVEYDFVSSAEGWRGDYGTDATVGHDPDNEAAVMLPNGVSNGHNYIKEISAT DFTNSTVQYTLSVSQQLADSGMTVQGYIQTGAPNYTRIYGGLETLSSGANVFTFSAQDNA NGDIAIIERVCLQINGEFSGVDAQEVLLDNVTISFP NT seq 3171 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcaaaaaacaaacagactcacctggctatatttgaattttctaatactgttaatgccg tcatttgtgttggctaaatgggtaaacgttgaacagaatgtaactgttagttctaccctc ccagcatttgatcgtgttaatcgtcaatacatatctgtagtagaaattagtaatcaaggt gaaaccgctatcgctgggccccttcgcttgatagtcattgacgcaactatacccttatca aatttaaccggtatcactgaacagggcttgccgtatttagagatgtcggcagatactatc cagcctgaccaaagcgtctctgtacagctcaatttcgagttacaacgtaaacgtctttct tttactgccaacctgcaacaagataatcccaatgccggtgtgtatgctcaggcggaaggc ggtgacgccagcgttttggttatgcttggtggcgcttttaacgttatagaaggagatcct agttacgtcaccatatcggaaactgatactaatgctccaagtgatgattccagagtgatc gagctaaatgtgacctttccgcaagcgggtagctatgaaatgtatgccagagtccgcgta ggccctaatggagcaaatgatgatagcttttatgcccctgatgccttaggtgcaaataat ggttgggtatcggtaaatagcatctctggctttatcgttcctggtgaagtgggttatgaa ccaggcgtaaatgtggtaggtggcgggtcatccgccaccgaggtgtggaagtggatgcga ttaagtgatccaatctatacggttcctgacaatgaattgctacaaacatttcgttttggc ggtcgagaagatggtctagatatagataagtttgcctttgcgccacaaggcgtgttgttt accattgaagagttggaaaatggtctgcctggccaagttataccccctcctcctcctttt gtgcctgaaggtcccccaatggcggacggccaagataagttcgttggtggtgtgtgttgc ggtcgtcagcggcctaattttgaagcttactttaaccaggtgacacctgaaaacgctgga aaatggggctccgctgagcccgttagagatagcttcaattggacagagcttgatgaggct tacaatttagctaaaaacaatggctacttgtataagcatcacgtgttgatctggggcaac caacaacccgcatggataaccgaccttcccgttcaagaacaactagaagagatacttgag tggatgaacgccattaaccagcgctatgctgcaatagatttcattgaggtggtaaatgaa tttgataatgatccaccagatagtgaaaataatgggcccggttatatcgatgcattaaga ctttaccaacctgccaccactactgagctgatcagttattttgagcagcaaggcttgagt aatgcagacgctatattaaaggcagcagaatatgattggataattaactcatttcaaatg gcacggcgtatcttcccagcgagtactcggctgatgataaacgaatatagtgtaattaac acggctactcgcactgacaaaatgatcgagctggtagacttgcttcaacaacgcaatcta atcgatgacgttggatttcaaggccatgcattttcaaccacgggtccaaatcaggccatg caagacaaccttgaccgcttagctgcccagacaggcttagatctgtatgtcactgaatta gacattgatggtgcaacagatctaattcaattattggattatcagcgtattttcccgcta ttttgggaacatcctgctgttaagggaattaccctttggggctatttgcctggacactgg cgggaaaatcaaggagctattttagcccaagaaaatggcgctgaaaaacccgcactagtt tggttgcgaggttatgtccgaggactacttccgcaaattattaaccctggattattagaa gttgaaccaggtacagcagtcggaacttctgttgcaactttgtcttctatagcgtacgac ggcaatcctcatgctccaaatgagcaaatcagttggtcaatcttaggaggaagcggtgat tcgttgtttgcgattgaccaatacagtggacagatcacagtaaccggaagtttgaatccg gctttacataatctatatatccaggttaaagcagggcaatacacgagtactttactgaat ttacagatattagttccaggtgatgaacttgaacccatagtgattgaatacaatttttat aacgatgttgagggttggcgaggcgattacggaaccccttcaacggtgggctatgatggt gctaatttagcagtaatcctgatccctgactggagcgtgagctcacaaaattatattaag gaaattagtgccactgacttaaccaatgccaccctcgaatatcaatttaacgttactcaa gctcaggttgatggtggcttaactgttcaagcgtatgtgcaaacaggcgctcctaactac tcgcgtatttatgccgctgttgaaacacccgtagccggaaccaatactattgtatttaat ccggtggataatgatgcatcagatttgcaaataatcgaacggatcgccttccaattgaac ggtgtacccactgaaggagagcttgataacgtgcttctagaacgtgtcaggatcaccata cccgttactgtacctccaagtaatatagttgagtatgactttgtgagcagcgcagagggc tggcggggagattatggtacagatgccacagtaggccatgatccagataatgaagccgct gtaatgctgcctaatggcgttagcaatggtcataattacataaaggaaatcagcgcgact gactttaccaatagcactgtgcaatatacgctttcagttagtcagcaactagctgatagc ggtatgacggtgcagggctatatacaaaccggtgcaccaaactatactcgaatttatggt ggcttagaaaccttatcctcaggtgccaatgtgtttactttctctgcccaagacaatgct aatggagatatagccataatagagcgtgtatgcttgcagattaatggtgaatttagtgga gtagacgcacaagaggtattgttagataacgttactattagttttccctag

DBGET integrated database retrieval system