Nostoc sp. PCC 7120: alr7129
Help
Entry
alr7129 CDS
T00069
Name
(GenBank) WD-repeat protein
Organism
ana
Nostoc sp. PCC 7120
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
WD40
ANAPC4_WD40
NBCH_WD40
Nup160
NB-ARC
PROPPIN
RMC1_N
NACHT
DUF1513
eIF2A
WD40_like
TibC_1st
AAA_16
Pentapeptide_4
Pentapeptide
AAA_22
AAA
Ge1_WD40
ATPase_2
ArsA_ATPase
nSTAND3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAB78213
CyanoBase:
alr7129
UniProt:
Q8YL09
LinkDB
All DBs
Position
pCC7120alpha:124768..128337
Genome browser
AA seq
1189 aa
AA seq
DB search
MTVEEAIALVEQLLSGTRLTKVQEIVFRQCWAGQTYSDIALESDYDLGYIKDVGSELWRS
LSQALGEKVTKKNLYTVLKRAAKQNSINPSSSLQLPSLANYTDWGEAIDVSQFYGRTHDL
ATLSRWVLQDNCRVVSLLGMGGIGKTALSVKLAQQLQGQFEYVIWRSLRHAPSFSDKLTE
CIKILSNQQVTTLPASSHEQITYLIEYLRKSRCLLILDNFDTLLQDGKRAGSYRQGYEPY
GELLWRLGETQHQSCVLITSREKPAQIAALEGDGLPVRTLALSGLEVAAGQTILTLKGLS
GSEDQTRQLVECYGGNPLALKIAATSIRDLHEGSIANFLSEGTTVFQGIGHLLEDQFQRL
STLEQQLMYWLAINREKVSSTKLQTAFTSPLSKPKLIETLESLRWRSLIESNTGQFTQQP
VVMEYVTDSLVEQVCQEIITESPQYLLTHALMQVQAKDYIRDSQINLIVCPILKQLQITL
GSVHQLDLKLGRLIRKLQSKVIETVGYGGGNLLNLLAQLDTDLTGYDFSGLDMRECDLRT
VNLHAVNFTQTTFRDCVFAATFGGITSVAFSRDGCQLATSDTSGVINIWDVNNGKQLFNC
QEHNSWIWDVAFSSVAPVLASCGQDHTIKLWNTTTGECFNTLHGHTSIVTSVAFSPEGKL
LASSSYDHSVKVWDLDTGECLQTFLGHDACVWSVVFHPVGQILATAGEDNTIKLWELQSG
CCLKTLQGHQHWVKTIAFNSGGRILASGSFDQNVKLWDIHTGKCVMTLQGHTGVVTSVAF
NPKDNLLLSGSYDQSVKVWDRKTGRCLDTLKKHTNRIWSVAFHPQGHLFVSGGDDHAAKI
WELGTGQCIKTFQGHSNATYTIAHNWEHSLLASGHEDQTIKLWDLNLHSPHKSNVNTHPF
RILQGHSNRVFSVVFSSTGQLLASGSADRTIKLWSPHTGQCLHTLHGHGSWVWAIAFSLD
DKLLASGSYDHTVKIWDVSSGQCLQTLQGHPGSVLAVAFSCDGKTLFSSGYEKLVKQWDV
ETGYCLQTWEADSNRVWAVAVSRDNQYLATGGDDSVVRLWDIGKGVCVRTFSGHTSQVIC
ILFTKDGRRMISSSSDRTIKIWNVSTGECLATLQAHDHWVWSLYLTPDEKTLLSSSWDET
IKCWNISTGECWQTLRPARPYEGMIINEVVGLSQAQIATLKALGALEVN
NT seq
3570 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacggttgaagaagcgatcgctctagtcgagcaattattatcaggaacacgcttaaca
aaagttcaagagattgtgtttcgccagtgttgggcagggcaaacgtactcagacattgct
ttagagtcagattacgaccttggttatatcaaagatgttggctcagaactgtggagatcg
ctgtctcaagctttaggtgaaaaagtcacaaaaaagaatttatacacagttctcaagcga
gctgctaaacaaaatagcattaatccatcctcatccttacagttgccctctttggcaaac
tacacagactggggagaagcaattgacgtttcccagttttacggacgtactcatgactta
gcaaccctgagtcgatgggttttacaagataactgtcgtgtagtctcgctgctaggaatg
ggaggtataggtaaaactgcactctcggtgaagctagcacaacagttacaaggacaattc
gagtatgtgatttggcgatcgctacgccacgcaccttcttttagtgacaagctgaccgaa
tgtatcaaaattctgtctaatcaacaagttacaacattacctgcttcctctcatgaacaa
attacttatttaatcgaatatctgcgtaaatctcgctgcttgctaattctggacaatttt
gacaccctattgcaggacggtaaacgggcaggtagttaccgtcagggctatgaaccttat
ggtgaactgttgtggcgcttaggagaaacgcaacatcaaagctgtgtcctgattaccagt
cgggaaaaacctgcccaaattgccgcccttgaaggagacggtttaccagttcggactttg
gctttatcagggttagaagtcgcagccgggcaaacaattttgacactcaaagggctatca
ggttccgaagaccaaactcgtcaattagttgagtgttacggtggtaatccactggcgttg
aaaatcgctgctacttcaattcgggatttgcatgaaggtagcattgctaatttcttaagc
gaaggtacgacagtttttcaaggcataggtcatcttctagaggatcaattccagcgactg
tctacattggaacaacaactaatgtattggttagcaattaatagagagaaagtctcttca
accaaattacaaacagcctttacatctccattgtctaagcccaagttaatcgaaacccta
gagtcattacgctggcgtagcttgatagaaagcaatactgggcagttcacacagcaacct
gtggtgatggaatatgttacagacagtttggttgagcaagtttgtcaggaaataatcacc
gaatcaccacaatacctgctcacccatgctttgatgcaagtccaagcaaaggattacatc
cgcgatagtcaaattaatctgattgtctgccctattctcaagcaattacaaataacactt
ggttctgttcatcaactagatctgaaactgggtagattgattagaaagttgcaaagtaaa
gttatagaaacagtggggtatggtggcggtaatttattaaatttattagcacaattagac
actgatttaactgggtatgacttttctggtctagatatgcgcgagtgtgatttacgcaca
gtaaacttacacgcagtcaactttacacaaacaacttttcgagattgtgtttttgctgct
acctttggtggaataactagcgtcgcttttagtcgagatggatgtcaactagctaccagt
gataccagtggcgtaattaatatttgggacgttaacaatggtaaacagttattcaattgt
caagaacataatagttggatttgggatgttgcttttagctctgtagcaccagttttagct
agttgcggtcaggatcatacaatcaaactttggaacacaactactggagaatgcttcaat
acactacatggacacactagcattgtcacatcagtagcttttagccctgaaggaaaactg
ctggctagtagcagctatgaccatagcgtgaaggtttgggatttagatacaggcgaatgt
ctacaaactttcttaggacatgatgcttgcgtttggagtgtagtttttcatcccgtagga
caaattttagccacggctggtgaagataacacaatcaagttatgggaattacaaagtgga
tgctgtctaaaaactctccaaggacatcaacactgggtaaaaacaattgctttcaattcg
ggtgggcgaatattagccagtggcagttttgatcaaaatgtcaaactatgggatatacat
actggaaagtgtgtgatgacattacagggacacacaggagttgttacctcagtcgcattc
aaccccaaagataatttacttctcagtggtagttatgaccaaagcgtgaaggtttgggat
agaaaaactggcagatgtttagatacgctcaaaaagcatacaaatcggatttggtcagtg
gcttttcacccccaagggcatttatttgtcagtggtggtgatgatcatgcagctaagatt
tgggagttaggaactggacaatgtatcaaaacctttcaagggcatagcaatgcgacttat
acaattgctcataactgggaacatagtttacttgcaagtgggcatgaagaccaaacaatc
aaactttgggatcttaatcttcattccccgcacaaatcgaatgtaaatactcaccctttt
cgcatactacaaggacacagcaatcgtgtcttttctgtagtcttcagttcaacaggacaa
ttgcttgctagtggcagtgcagaccgtactattaaactgtggagtccgcatacagggcaa
tgtttacacactttacatggtcatggtagttgggtgtgggcaattgcttttagccttgat
gataaattactcgcttctggtagctatgaccatacagtgaagatatgggatgtatcttct
gggcaatgtttgcaaactttacaaggacatccgggttctgtcctggcagttgcttttagc
tgtgatggcaaaactctcttcagtagtggttatgaaaagctagttaaacagtgggatgtg
gaaacaggttattgccttcagacttgggaagcagattctaaccgagtttgggcagttgct
gtgagtagggataatcaatatcttgctactggtggtgatgactcggtggtgcggttgtgg
gatattggcaaaggggtttgtgtgcgtacattctctggtcatactagccaggtcatctgt
attttgttcaccaaagatggcagacgcatgattagcagtagtagcgatcgcaccatcaaa
atttggaatgtctctacaggagagtgccttgctacgctacaagctcatgaccattgggtt
tggtcactctacctaaccccggacgagaaaactttgcttagtagcagttgggatgaaacc
atcaaatgttggaatatttctacaggagagtgctggcaaacattgaggccagcccgtcca
tacgaaggcatgattattaatgaggtggtaggactgagccaagcccaaatcgccacttta
aaagcgttgggggctttagaagtgaactga
DBGET
integrated database retrieval system