Arcobacter nitrofigilis: Arnit_0813
Help
Entry
Arnit_0813 CDS
T01235
Name
(GenBank) transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
ant
Arcobacter nitrofigilis
Pathway
ant01501
beta-Lactam resistance
ant01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ant00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
Arnit_0813
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Arnit_0813
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ant02000
]
Arnit_0813
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
ant01504
]
Arnit_0813
Transporters [BR:
ant02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
Arnit_0813
Antimicrobial resistance genes [BR:
ant01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
Arnit_0813
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF
Patched
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADG92477
UniProt:
D5V2P5
LinkDB
All DBs
Position
805034..808171
Genome browser
AA seq
1045 aa
AA seq
DB search
MIARFFINHPIFAWVISLLIMLLGLLSIKNLPVEQYPDIAPPTINIQATYAGATAKTIEN
SITQLIEEELTGLDGLLYFSSTSQTGSSSINVVFEKGVDPDIAQVKVNNKIQQVLPRLPE
DVRKEGVSVVKSQDDFLMILSIHDESGKSSENDISDYLITNIKDGLSRINGVGGVELFGS
EYAMRVWIDPKKLKSYNLMPSDINNAILKQNAQVSAGSIGARPQVKGQELNADVVSRSKL
ENAKEFENIVIKSNKNGADVLLKDVAKVVLGSNDYSFISKNNGYQASGIGVKLSSGANAV
DVAKRVREYLSSFENSLPSGYIISYPYDTTIFIEESIKEVVKTLFEAVFLVVVVMFVFLN
SWRATIIPAIAVPVVLLGTFAILNFLGFTINSLTMFAMVLSIGLLVDDAIVVVENVERNM
REKKLCAKEATIIAMDEITSALIGVATVLSVVFLPMIFFTGSTGIIYKQFAVTIISSMVL
SVVVALTLSPAICATFLKPHNPNKKSNDVLDWFNRKFTNLTKKYKSGIFKFINAPMRSLV
AYIAIIAVSILFFIKLPTGFISPEDQGDLMIQFTLPAGASTTRSENTEKIIRDYFLTEEK
SNINSIFSIVGFTFSGNGQNGGLGFVELKNWDQRAGIENSADSIANRAMMKFTDNKSKYF
IRDAQVFVMNPSSVPGLGNTDGFEFQLQAGAKMTRDDLSVAKDSLLKKINSNKLIVNARV
EGTEETPKLKLDYDKKKIFSLGLSYDDIDNTLNTAWAGSYVNDFIDKSRIKRVYVQADAK
YRSKPEDLYQWNVRNNENKMVSFEEFTNISWKKSEKSLTRYNGLASYLIQGEAASGISSG
VAMDEMERLVKLNNKDTKYAWSGLSYQERLSSGQAIYLYALSLVVIFLCLAALYESWSIP
FSVLLAVPLGVVGAVIAVYFRGLNNDIYFQVALLTTIGLVSKNAILIVEFVENAYKKGES
LTVAAVEGATLRFRPIIMTSLAFIAGIIPLAISTGAGANSRISIGTGIIGGTLTATLLVI
FYVPLLFILIKKVFEKKEKKGTKDV
NT seq
3138 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagctcgtttttttattaatcatcctatttttgcatgggtaatatctttacttata
atgttattaggactactttctataaaaaatttaccagtagaacagtatccagatattgct
cctccaacaattaatattcaagcaacatacgctggagcaacagctaaaactattgaaaat
agtatcactcaacttatagaagaagaattaactggattagatggattgttgtatttttct
tcaactagtcaaacaggaagttcaagtataaatgttgtatttgaaaagggtgtagatcca
gatattgcccaagttaaagtaaataataagattcaacaagtactaccaagacttccagaa
gatgttagaaaagaaggggttagtgttgtaaaatcacaagatgattttcttatgatactt
agtatccatgatgaatcaggaaaatcaagtgaaaatgatatttcagattatttaatcacc
aatataaaagatggactttctagaataaatggtgttggtggagttgaactttttggttca
gaatatgcaatgagagtttggatagatcccaaaaaacttaaatcttataatctaatgcct
tctgatattaataatgcaattttaaaacaaaatgcacaagtatctgcaggaagtattgga
gcaagaccacaggtaaaaggtcaagagttaaatgcagatgttgtatcaagaagtaaatta
gaaaatgcaaaagagtttgaaaatattgtaataaaaagtaataaaaatggtgcagatgtt
cttttaaaagatgttgcaaaagttgtattaggtagtaatgattactcttttatatcaaaa
aataatggatatcaagcaagtggtataggtgtaaaattatcttctggtgcaaatgctgtt
gatgtagcaaaaagagttagagaatatttatcatcatttgaaaactctttaccaagtgga
tacataatttcatatccatatgatacaactatttttattgaagaatctataaaagaagtt
gtaaaaacactatttgaagctgtgtttttggtagttgttgtaatgtttgtttttcttaat
agttggcgagcaactataatccctgctattgcagtacctgtggtactgcttggtaccttt
gctattttgaattttttaggatttacaataaactctttaactatgtttgcaatggtatta
tccataggtttattagttgatgatgctattgttgttgttgaaaatgtagaaaggaatatg
agagaaaaaaagctttgtgcaaaagaagcaactattatagcaatggatgaaatcacgagt
gctttaattggagttgcaactgtactttctgtagtatttttaccaatgatattttttaca
ggttctactggaattatatataaacaatttgcagttacaattatatcttcaatggtttta
tcagttgttgtagcattgacactatctcctgccatttgtgctacctttttaaaacctcat
aatccaaataaaaagagtaatgatgtacttgattggtttaatagaaaattcactaattta
acaaaaaaatataaatcaggaatttttaaatttattaatgctcctatgagatcacttgtt
gcttatattgcaataatagctgtaagtattttattttttataaaattgcctacgggattt
atatcacctgaagatcaaggtgatttgatgattcaatttacccttccagctggtgcaagt
acaacacgttctgaaaatactgaaaaaataataagagattattttttaacagaagaaaaa
agtaatataaattctattttttcaattgttggttttaccttttcaggaaatggacaaaat
gggggattaggatttgttgagttaaaaaattgggatcaaagagctggtatagaaaatagt
gcagattccattgctaatagagcaatgatgaagtttacagataataagtcaaaatatttt
ataagagatgcacaagtatttgtaatgaatccatcttctgttcctggtttaggtaataca
gatggctttgaatttcaattgcaagctggtgctaaaatgacaagagatgatttatcagta
gcaaaagattctttattaaaaaaaataaattcaaataaattgatagtaaatgcaagagtt
gaaggaactgaagagacaccaaaattaaaacttgattatgataagaaaaaaatcttttca
ttgggattatcttatgatgatattgataataccctaaatacagcttgggcaggttcttat
gttaatgattttattgataaatcaagaataaaaagagtctatgtacaagctgatgcaaaa
tatcgatctaaacctgaagatttatatcaatggaatgttagaaataatgaaaataaaatg
gtctcttttgaagagtttactaatatctcttggaaaaaatctgagaaatcattgacaaga
tataatggcttagcttcttatttaattcaaggtgaagctgcttctggcataagttctgga
gttgcaatggatgagatggaaagattagtaaaacttaataataaagatactaaatatgca
tggagtggcttatcttatcaagaaagattgtcaagcggtcaagctatatatttatacgca
ttatctttagttgttatatttttatgtttagctgctttatatgagagttggagtattcct
ttttctgttttattagctgtacccttaggagttgttggagccgttattgcagtatatttt
agaggattaaacaatgatatatattttcaagtggcacttttaacaacaattggattggtc
tctaaaaatgcaatattgatagttgagtttgttgaaaatgcttataaaaaaggtgaatca
ttaacagttgcagcagttgaaggagcaactttgagatttagaccaataattatgacttca
ttagcttttattgctggtattattcctttagcaatttcaacaggggcaggagcaaatagt
aggatttcaataggtacaggaattattggtggtacattaacagccacactcttagtaata
ttttatgttcctcttttattcattttaataaaaaaagtatttgaaaaaaaagagaaaaaa
gggacaaaagatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
