Abyssogena phaseoliformis symbiont: CVPH_1478
Help
Entry
CVPH_1478 CDS
T07717
Symbol
mfd
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
aphf
Abyssogena phaseoliformis symbiont
Pathway
aphf03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aphf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
CVPH_1478 (mfd)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
aphf03400
]
CVPH_1478 (mfd)
Enzymes [BR:
aphf01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
CVPH_1478 (mfd)
DNA repair and recombination proteins [BR:
aphf03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
CVPH_1478 (mfd)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TRCF
DEAD
UvrB_inter
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
MFD_D3
ResIII
ERCC3_RAD25_C
RecG_dom3_C
UB2H
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBB23316
UniProt:
A0A7R6P6D3
LinkDB
All DBs
Position
1449557..1452997
Genome browser
AA seq
1146 aa
AA seq
DB search
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LLKTLN
NT seq
3441 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
