Candidatus Annandia pinicola: GFK87_00101
Help
Entry
GFK87_00101 CDS
T07601
Symbol
rlmN
Name
(GenBank) Dual-specificity RNA methyltransferase RlmN
KO
K06941
23S rRNA (adenine2503-C2)-methyltransferase [EC:
2.1.1.192
]
Organism
apin
Candidatus Annandia pinicola
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
apin00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
apin03009
]
GFK87_00101 (rlmN)
Enzymes [BR:
apin01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.192 23S rRNA (adenine2503-C2)-methyltransferase
GFK87_00101 (rlmN)
Ribosome biogenesis [BR:
apin03009
]
Prokaryotic type
rRNA modification factors
23S rRNA modification factors
GFK87_00101 (rlmN)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RlmN_N
Radical_SAM
Radical_SAM_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UDG80330
LinkDB
All DBs
Position
102830..103906
Genome browser
AA seq
358 aa
AA seq
DB search
MDINLKKINILNLDEKKLKEIIESIGEKKFRFKQIMKWIYHNFCDNFDNMSNISINLKKK
LKKKLEIKLPVIQNILYSKDGTIKYILNFNKQIIETIYIPEINRKTICISSQVGCILNCK
FCATGKQGFKRNLKVSEIIGQIWCISKMLYNINPKKKITNIVIMGMGEPLLNVVNVINSI
KIMLNNYCLNIKKNKITLSTSGIIPAFKKIYEIINIPLAFSLHASNNELRNSLMPINIKY
NIESCLSEINKYIKLSKSNKIKFTIEYIMLNNINDNIYNAYQLIKLLKNIPSKINLIPFN
KIPNTKYESSPKNKIYKFAQILKKNGLITTIRKLHGNDINAACGQLSGNIINKIKNNI
NT seq
1077 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatataaatttaaaaaaaattaatatcttaaatcttgatgaaaaaaaattaaaagaa
attattgaatctatcggtgaaaaaaaatttcgttttaaacaaataatgaaatggatatat
cataatttttgcgataattttgataatatgagtaatataagtataaatttaaaaaaaaaa
ttaaaaaaaaaattagaaattaaattacctgtaatacaaaatatattatattccaaagat
ggaactataaaatatatattaaattttaataaacaaattattgaaacaatttatatacct
gaaattaatagaaaaacaatttgtatttcatctcaagttggttgtattctaaattgtaaa
ttttgtgctacaggaaaacaagggtttaaaagaaatttaaaagtttcagaaattatagga
caaatttggtgtatatctaaaatgttatataatataaatcctaaaaaaaaaattactaac
atagtaattatgggtatgggagaaccattattaaatgtagttaatgtaattaattcaata
aaaattatgttaaataactattgtttaaatataaaaaaaaataaaattactttatcaact
tctggaattattcctgcttttaaaaaaatttatgaaattataaatataccattagctttt
tctttacatgcttctaataatgaattaagaaattctttaatgccaataaatataaaatat
aatatagaatcttgtttatcagaaataaataaatatattaaattatcaaaatctaataaa
attaaatttacaatagaatatataatgttaaataatataaatgataatatttataatgct
tatcaattaattaaattattaaaaaatataccaagtaaaataaacttaattccttttaat
aaaatacctaatacaaaatatgaaagtagtcctaaaaataaaatatataaatttgctcaa
atattaaaaaaaaacggattaattactactataagaaaactacatggaaatgatataaat
gcagcatgtgggcaattatcaggaaatattataaataaaattaaaaataatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
