Abrus precatorius (Indian licorice): 113867225
Help
Entry
113867225 CDS
T07330
Name
(RefSeq) NF-X1-type zinc finger protein NFXL1-like
KO
K12236
transcriptional repressor NF-X1
Organism
aprc
Abrus precatorius (Indian licorice)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aprc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
aprc03000
]
113867225
04121 Ubiquitin system [BR:
aprc04121
]
113867225
Transcription factors [BR:
aprc03000
]
Eukaryotic type
Zinc finger
Other zinc fingers
113867225
Ubiquitin system [BR:
aprc04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Single Ring-finger type E3
NFX1 proteins
113867225
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
zf-NF-X1
R3H
NCBP3
RNA_bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113867225
NCBI-ProteinID:
XP_027358186
UniProt:
A0A8B8LP81
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MSLQHRRARRDWLRVPSQGATRQEWVPRGSAASTTVLQPSNLHLNHNANVDASSSNHGVA
VASRVTPHRSNHGNHSMERDKGRSENHEGKGLEFRDSSLPQLVQEIQEKLMKGTVECMIC
YDMVRRSAPVWSCSSCYSIFHLNCIKKWARTPTSVDLSAEKNQGFNWRCPGCQSVQLMSS
KEIRYLCFCGKRIDPPSDLYLTPHSCGEPCGKSLERKLLVAEGNKDDLCPHVCVLQCHPG
PCPHCKAFAPPRLCPCGKKMVTTRCSDLQSVLTCGQCCDMLLECGRHHCEHICHVGPCDP
CQVLVNASCFCSKMMEVIPCGDMAVKGEIEAEDGVFSCGSNCGKKLSCGNHICSEICHPG
SCGECAFLPSQVKTCCCGKKRLENERWSCLDSVPTCSQVCGKLLCCGMHHCKEPCHVGEC
PPCLVLVSQKCRCGSTSRNVECYKTIMESGKFTCEKPCGRKKNCGRHRCSERCCPLSNSN
NSFNGDWNPHFCSMPCGKKLRCGQHMCESLCHTGHCPPCLETIFTDLTCACGRTSIPPPL
PCGTPLPSCQLPCSVPQPCGHSGSHSCHFGDCPPCSVPVAKECIGGHVVLRNIPCGSKDI
RCNNPCGKTRQCGLHACGRICHPPPCDNLSGVVQGFLAPCGQTCRAPRTSCQHMCMAPCH
PSSPCPNTRCEFPVMITCSCGRITTNVPCDAGGSNNNYTVDAIHEVSIIQKLPVPLHPVD
ANGQKVPLGQRKLMCDDECAKLERKRVIADAFDITASSLDSLHFGDNSANELLFDFIRRD
LKWVLAVEERCKILVLGKSRGTTHGLKFHVFCPMPKDKRDAVRLIAERWKLAVKSAGWEP
KRFIVISVTPKSKAPSHVIGVQGTTTLNAPLPPTFDPLVDMDPQLVVSFPDLPSDADIRA
LVLRFGGECELVWLNDKNALAVFHDPARAATAMRRLDHGTVYQGAVLFAPDVGTSATSSV
TNAWGGALLALKVNPSKKAMVQDSSWKGDSQGDEEWSSGSANLLPSVRKKEAPIIGSLNR
WNVLDQE
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcttgcaacatcggagagcgagaagggattggttaagggttccatcacaaggtgct
actcgtcaagaatgggttcctagagggagtgcagcatccactactgttttacagccatca
aatttgcatttaaatcacaatgctaatgttgatgcaagttcttccaatcatggggtggcc
gttgcttcgcgggtgactccccataggagcaatcatgggaatcatagtatggaaagggat
aaagggaggagtgagaatcacgaggggaaggggttggaatttagagactctagtttgcct
caattggtgcaagagattcaggagaagcttatgaaaggtactgtggaatgcatgatttgc
tatgacatggtccggaggtcggcaccagtttggtcttgctccagctgctactctatcttt
cacttgaactgcatcaaaaaatgggctcggacgcccacctcggttgatttgtctgcggag
aagaatcaagggtttaattggcggtgtcctggttgtcagtctgtgcagcttatgtcctca
aaggagattaggtatctttgtttttgtggaaagaggatagaccctccatctgatttatat
ttgactccccattcatgtggagaaccgtgtgggaagtctcttgagagaaagttgctggtt
gctgaagggaataaggatgatctttgcccccatgtttgtgtcttgcaatgccatccgggt
ccatgccctcattgtaaagcatttgcccctccacgtttgtgcccttgtgggaagaaaatg
gttaccacccgttgctctgatctgcagtctgttcttacttgtggtcaatgttgtgatatg
cttcttgaatgtgggcgtcatcactgtgaacacatttgtcatgtgggtccttgtgatcct
tgtcaggttctagtcaatgcctcttgcttttgcagtaaaatgatggaggttattccttgt
ggtgatatggctgtaaagggtgaaattgaagcggaagatggtgtattttcttgtggttcc
aattgtggaaagaaacttagctgcggtaatcatatctgtagtgaaatttgccatccagga
agttgtggggaatgtgcatttttaccaagccaggttaaaacatgttgttgtgggaaaaaa
aggttggagaatgaacgttggagttgtttggattcagtacctacatgctctcaagtctgt
ggcaagctcctttgttgtgggatgcatcattgtaaagagccctgtcacgttggggaatgt
ccaccttgtttggttctagtttcacagaagtgtcgatgtgggtctacttctcgaaatgtg
gagtgctataagactataatggagagtggaaaatttacatgtgaaaagccttgtggaaga
aaaaagaattgtggaaggcaccgatgcagtgaaaggtgttgtccactttcaaattcaaat
aatagttttaatggggattggaatcctcatttttgttccatgccatgtggaaagaagcta
agatgtggccaacatatgtgtgaatctttgtgtcacactggtcattgtccaccttgtctt
gaaacaatcttcactgatttgacttgtgcttgtggaaggacttcaatccctcctcctcta
ccttgtggtacaccacttccctcatgtcagcttccatgttcagttcctcagccatgtgga
cattcaggctcacatagttgtcattttggagattgccctccttgttcagtgcccgtagca
aaagaatgtatcggtgggcatgtggttctcaggaacataccttgtggttctaaggatatt
agatgtaataatccttgtgggaagactagacaatgtggtttacatgcatgtggcagaata
tgtcaccccccaccatgtgataatttatctggtgttgtacaaggtttccttgcaccatgt
ggccaaacatgtcgtgctccaaggacaagctgtcagcatatgtgtatggctccatgtcac
ccttcatcgccatgtccaaatacaagatgtgaattccctgttatgattacttgttcttgt
ggccggattacaacaaatgttccttgtgatgctggtggtagcaataacaattatactgtc
gatgccatacatgaagtttccattattcaaaagttgcctgtgccacttcatccagttgat
gcaaatggccaaaaagttccccttggacaaagaaagttgatgtgtgatgatgaatgtgct
aagttggagcgtaaaagggttattgctgatgcttttgacattactgcttcaagtctggat
tccctccattttggtgacaactccgctaatgaattgctttttgattttattagacgtgat
ctaaaatgggttttagctgttgaggagagatgcaagattttagtgcttggcaagagcaga
ggaactacacatggtttaaaattccacgtcttttgtcctatgccaaaggataaaagagat
gcagtgaggttgattgctgaaagatggaagcttgcagtgaaatctgccggttgggagcca
aagcgatttatcgttatctctgttaccccaaaatcaaaggccccatctcatgtgataggg
gttcagggtaccacaactttaaatgctccccttcctcctacatttgatcctttggtagat
atggacccgcagcttgttgtctcatttccagacttaccaagtgatgctgatattcgagcc
ttggtgttgaggtttggtggtgagtgtgagcttgtttggttgaatgacaagaatgccttg
gctgtttttcatgatcctgcccgagctgcaactgcaatgaggaggttggatcatggaaca
gtttatcagggagctgttttgtttgccccagatgttgggacatcggcgacatcttcagtt
accaatgcctggggaggagcactgctggcactgaaagttaacccgtcaaaaaaggctatg
gttcaagactctagttggaagggagattctcagggtgatgaagaatggtcaagtggttct
gctaatctgctaccatctgttaggaagaaagaagcacctataattggttctttaaatcgt
tggaatgtcttagaccaggaatag
DBGET
integrated database retrieval system
