Aquimarina sp. AD10: D1816_04655
Help
Entry
D1816_04655 CDS
T05712
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
aqd
Aquimarina sp. AD10
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5018
LRR_4
LRR_8
DUF4971
LRR_1
DUF6242
Cadherin-like
DUF1616
DUF916
LRR_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXT59675
UniProt:
A0A3A9VDT6
LinkDB
All DBs
Position
1102543..1104096
Genome browser
AA seq
517 aa
AA seq
DB search
MRRLELESRDIFSKSAFILLFLSVLLTSCSSGGDDTSGEELKSSDKRITSFLLATANNAT
LSQNITGTINEDNKTIDLVVPFGISLTSLAPSITISDKAQISPDSGMPRNFASPVTFTVT
AEDGTEATYTVTITNAQNSEKRITAFSFTVDMNPSVKEDIDGTIDESNKTITLNVPFGAA
ITALIPTIELSDGASSTPSSNTAIDFSSAVNFEVSAQDNSTTSYTVTVTRNESDYATLRA
IYDANPGNTLSWDFNNLDISTYEGVNSENDRVTALTLTAKGLTVLPSQIGDLSMLSLLYL
QNNGIESIPAEISNLSQTLTQFLLSNNPLKSIPTQIGTLTNLEFLDLFNTDITTIPSTIG
NLNNLISLNLSQNFDLTGLPSEIGNLDNLTRLSLIGANYPIPTEIGNLSNLTFLNLSNAD
LSSFPTQVLGLTDLTELYLSGNTIATVPTGIGNLTNLSKLFLDSNSLTSLPTQIANLSNL
TELNITNNTSLISIPQVICDLADADTTINKDAATSCM
NT seq
1554 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggagacttgaattggaatcaagagatatattctctaagtcagctttcatactatta
tttttatctgtattgcttacatcttgtagtagtggcggagatgatactagtggagaagaa
ttaaaaagtagtgataaaaggataacgagctttttattagctacggcgaacaatgccacc
ttgagtcaaaatattacgggaacaataaatgaagataataagactattgatctggtagtt
ccatttggaattagtttaacgtctttagctcctagtattacgatatctgataaagctcag
atttctccagatagtggtatgccaaggaattttgcttctccagttacgtttacagtaacc
gcagaagacggaaccgaagcaacgtatactgttacaataacgaatgcacaaaattctgaa
aaaagaattacagcgttctcatttacagtagacatgaatccttctgttaaagaagatata
gatggtacgatagatgaaagtaataaaactataactttaaatgtgccattcggtgctgcg
ataacggcacttattccaacaatcgaattatcagacggtgcatcctctactccatcatca
aatacggcaatagatttttcgtctgcagtaaactttgaagttagtgctcaggataatagt
acaacaagttatacagttactgttacgagaaacgaatcagattatgcaacgttaagggct
atatatgatgctaatcctggtaatacattaagttgggattttaataatttagacattagc
acctatgaaggcgtaaattctgaaaatgatagagttactgcattgacacttactgctaaa
ggacttactgttcttccttcgcaaataggagatttatcaatgttaagtttattgtatttg
caaaataacggtatagagtccattcctgcagaaattagtaatttatcgcaaacattaact
caattccttctaagtaataaccctttaaaatctataccaactcagataggaacactaacc
aatctagaatttttagatttatttaatacggatattactacgataccttcaactattggt
aatctaaataatcttattagtttaaatttaagtcagaattttgatcttacaggtttacca
tctgaaataggtaacttagataatcttacacgattaagtttaataggagctaattatcct
ataccaacagaaattggtaatttaagtaatcttacgttcttaaatctatccaatgcagac
ttaagttcttttccaacacaagtactagggcttacagatcttacagagctgtatttgtct
ggaaataccattgcaacggtaccaactggaattggaaacctaacgaacttatcaaaacta
ttcttagatagtaattcattgacttctttacctacgcagattgctaacttatcaaatctt
acagaactaaatattacaaataatacatctttaataagtataccgcaagttatttgtgat
ttagcagacgctgataccactatcaataaagatgcagcaaccagttgtatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system