Arcobacter suis: ASUIS_1170
Help
Entry
ASUIS_1170 CDS
T06792
Name
(GenBank) RND family efflux system, membrane fusion protein (S2P/M50 domain)
KO
K16922
putative peptide zinc metalloprotease protein
Organism
asui
Arcobacter suis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
asui00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
asui01002
]
ASUIS_1170
Peptidases and inhibitors [BR:
asui01002
]
Metallo peptidases
Family M50: S2P protease family
ASUIS_1170
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M50
Biotin_lipoyl_2
HlyD_D23
HlyD_3
Biotin_lipoyl
Methyltransf_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXX89658
LinkDB
All DBs
Position
1202121..1204235
Genome browser
AA seq
704 aa
AA seq
DB search
MPEQEILLPKIRDDLKLIETSVSEDGSKRWLLFDPIQNKYFNIGIDTFELISNWQSDIEI
DEFLRILEDKNYDIEKESLQTFVDFLINNNLILCEKPKDTQRMVNILRKSKQNIFKWLIH
NYLFIRIPLLKPDKWLEDNKNKINFLYSKLWQNIVLVLGFIGIVFVLRDWENFISTFMYL
FSKEGFFYYFLSLVFVKSMHELGHAFTAKRLGCKVPTMGVAFLVLFPVLYTDTTNAWKLK
SKYQRLQIVLGGIKVELYLALIATFLWSFAPIGIFKSILFIIATTSWISSLLINISPFLR
FDGYYILSDITDSKNLQPRSFAMAKWFIRKNILGLEEEKPEILVKEKENFFIIYAILTWI
YRLFLFLGIALLVYYFAFKVLGIILFLVEIVWFILLPVYNELKIWWSKKDMVKFNTKNKI
SLFLVVFLLFLIFIPWNSSIKMPAIIESKNYFEYYSAEDGYIEEIYFSNGQNVKKDQLLL
KIKSPEIEYKIAQIQEEIESLNFEINKQAGFKENLDKRFILEENLLKKINELEGLEKINK
KFEVKADFDGKIYFYDVFKINQWISKKAPIFVLYDNLNYRIVGFCNENDFKLLKENSNSK
FIFTSGDLKDIHQKVTNISKFSIPYLEFPELSSDFGGEIATRKDLDKRLKTEQAYYKITV
DLEENNLDLKNRKTGVLVTQGESMSLISRIAKKTISVLIRESEF
NT seq
2115 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctgaacaagagattttattaccaaaaattagggatgatttaaaactaatagagact
tctgtaagtgaagatggttctaaaagatggcttttatttgatcctattcaaaataaatat
tttaatattggaattgatacttttgaattaatttcaaattggcaaagtgatattgaaata
gatgaatttcttagaatattagaagataaaaattatgatattgaaaaagaatctttacaa
acttttgttgattttttaataaataataatttgattttatgtgaaaaacccaaagacaca
caaagaatggtaaatattcttagaaagtcaaaacaaaatatatttaaatggttaattcat
aattatttatttataagaattcctctattaaaacctgataaatggctagaagataataaa
aataaaatcaattttttatattcaaaactttggcaaaatatagttttggttttaggattt
attggaattgtttttgtattaagagattgggaaaattttatttcaacttttatgtatctt
ttttctaaagagggatttttttactattttttatctttagtttttgtaaaaagtatgcat
gaattaggtcatgcttttacagcaaaaagattaggctgtaaagtgcctaccatgggagtt
gcatttttagttttatttcctgttttatacacagatacaacaaatgcttggaaattaaaa
tcaaaatatcaaagattacaaatagtccttggtggaataaaagttgagttatatttagct
ttaatagctacttttttatggtcatttgctcctattggaatatttaaaagtatattattt
attattgcaaccacaagttggattagttctttacttataaatattagtccatttttacgg
tttgatggatattatattttatcagatattacagatagcaaaaacttacaacctcgttca
tttgcaatggctaaatggttcattagaaaaaatattttaggtttagaagaagaaaaacca
gaaatattagtaaaagaaaaagagaatttttttattatttatgccatattaacttggatt
tatagattatttttatttttaggaatagctttattagtatattattttgcttttaaagtt
ttaggaataattttatttttagttgaaatagtttggtttattttattgccagtatataat
gaattaaaaatatggtggagcaaaaaagatatggttaaatttaatacaaaaaataaaatc
tctttatttttagttgtttttttactatttttaatatttattccttggaatagcagtatt
aaaatgcccgcaataatagaatcaaagaattattttgagtactattcagccgaagatggt
tatattgaagaaatatatttttcaaatggtcaaaatgtaaaaaaagaccaacttttatta
aaaataaaatctccagaaatagagtataaaatagctcaaattcaagaagaaatagagtca
ttaaactttgagataaataaacaagcaggtttcaaagaaaacctagacaaaagatttatt
ttagaagagaatttattgaaaaaaataaatgaattagaaggtttagaaaaaattaataaa
aaatttgaagtaaaagcggattttgatggaaaaatatatttttatgatgtattcaaaata
aatcaatggattagcaaaaaagccccaatttttgttttatatgataatttaaattataga
atagttggtttttgtaatgaaaatgattttaaacttttaaaagaaaattcaaatagcaaa
tttattttcacttcaggagatttaaaagatattcatcaaaaagttacgaatatttcaaaa
ttttcaattccatatttagaatttcctgagttatcttctgattttggtggagaaattgca
actagaaaagatttagataaaagattaaaaacagaacaagcttattataaaatcactgtt
gatttagaagaaaataatttggatttaaaaaatagaaaaacaggtgttttagtaactcaa
ggagaatcaatgagtttgatttcaagaattgctaaaaaaacaatttctgttttaataaga
gagagtgaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system