Trichormus variabilis: Ava_4474
Help
Entry
Ava_4474 CDS
T00277
Name
(GenBank) NADH dehydrogenase subunit M
KO
K05575
NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4 [EC:
7.1.1.2
]
Organism
ava
Trichormus variabilis
Pathway
ava00190
Oxidative phosphorylation
ava01100
Metabolic pathways
Module
ava_M00145
NAD(P)H:quinone oxidoreductase, chloroplasts and cyanobacteria
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ava00001
]
09100 Metabolism
09102 Energy metabolism
00190 Oxidative phosphorylation
Ava_4474
Enzymes [BR:
ava01000
]
7. Translocases
7.1 Catalysing the translocation of protons
7.1.1 Linked to oxidoreductase reactions
7.1.1.2 NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
Ava_4474
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Proton_antipo_M
Oxidored_q5_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABA24072
CyanoBase:
Ava_4474
UniProt:
Q3M4L4
LinkDB
All DBs
Position
5601055..5602557
Genome browser
AA seq
500 aa
AA seq
DB search
MLSVLIFAPLLGALLIGIFPSGINGRISRNVALISASVTFLWSVILASQFQTGEVNQQFS
EFLPWIDSLGLSYNLGVDGLSLPLLVLNGLLTAIAIYSSDESLQRPKFYYSLILVLSTGV
AGAFLAQDLLLFFLFYELELIPLYLLIAIWGGARRGYAATKFLIYTAFSGILILASFLGL
VWLSGSGSFALSTLNAQSLPLATQLLLLAGILVGFGIKMPLVPFHTWLPDAHVEASTPIS
VLLAGVLLKLGTYGLLRFGMNLLPTAWNYLAPWLAVWAVVSVLYGSSCAIAQTDMKKMVA
YSSIGHMGYVLLAAAAATPLSTLGAVMQMISHGLISALLFLLVGVVYKKAGSRDLDVLRG
LLNPERGMPVIGTLMIVGVMASAGTPGMVGFISEFIIFRGSFAVFPVQTLLSMIGTGLTA
VYFLILVNKAFFGRLSAQVMNLPRIYWSDRAPAFILAVLIVIFGIQPSWLARWTEPTITA
MFSVEGTVATVSLDKVKGKS
NT seq
1503 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttagtgtcttgatctttgccccattattgggtgcgctgctaattggtatattcccg
tctggtattaatgggagaatttcccgtaatgtggcattgatttctgccagtgtaactttt
ctgtggtcggtgatactagctagccagtttcaaacaggagaagttaaccagcagtttagt
gagttcttaccttggatagattccttaggattgagttataatcttggtgtggatggtcta
tctttgccgttgctggtgttgaatggattattaactgccattgccatttacagcagcgat
gaatccttgcaacgtcctaagttttattattcattgatattggtgttgagtactggggta
gcaggagcctttctggcgcaagatttactgctattcttcttgttttatgaactagaactc
attcccctgtatctcttaattgctatttggggtggtgccagacggggttatgcagctacg
aaattcttgatttacactgctttttcaggaattttgattttagccagtttcttgggcttg
gtttggttgagtggatctggtagctttgcactatcaaccttaaatgctcagtctctacct
ttagcaactcaactgctacttctagcggggattttagtaggtttcggcatcaaaatgccc
ttagttccttttcatacttggttaccagatgcacacgttgaagcctctacaccgatttct
gtgttgctggctggtgtgctgttgaagttgggaacttatggcttattgcgatttggcatg
aacttgttaccaacagcctggaattatttagcaccttggttggcggtttgggcagtggtg
agtgtgttgtatggttcgtcatgtgcgatcgcgcaaacagacatgaaaaaaatggtagcc
tacagttcaataggacatatgggctatgtgttgttagcggcggcggcggctacaccatta
agcaccttgggtgctgttatgcagatgattagccacggtttaatttcggcactgctgttt
ttgttggtgggggttgtgtataaaaaagcaggtagccgcgatttagatgtactccgaggt
ttgttgaacccagaacggggtatgcctgtaattggtactttgatgattgtcggcgtgatg
gctagcgccggaactccggggatggtgggatttatctccgaatttattatatttcggggt
tcctttgcggtttttccagtgcaaaccctgttgtcgatgattggcactgggttaacggcg
gtttacttcttaattctcgttaataaagcattttttgggcgcttatcggcccaggttatg
aatttaccacggatttattggagcgatcgcgctcctgcttttatcttagcggtgctaatt
gtgatttttggtatccaaccttcttggttagcccgttggactgaacctaccattacagct
atgtttagtgttgaaggtacggtggcaacagtctctttagataaagtaaagggtaaaagt
taa
DBGET
integrated database retrieval system