Arcobacter venerupis: AVENP_2982
Help
Entry
AVENP_2982 CDS
T06858
Name
(GenBank) RND family efflux system, inner membrane transporter, AcrB family
KO
K18138
multidrug efflux pump
Organism
avp
Arcobacter venerupis
Pathway
avp01501
beta-Lactam resistance
avp01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
avp00001
]
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01501 beta-Lactam resistance
AVENP_2982
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
AVENP_2982
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
avp02000
]
AVENP_2982
01504 Antimicrobial resistance genes [BR:
avp01504
]
AVENP_2982
Transporters [BR:
avp02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
AVENP_2982
Antimicrobial resistance genes [BR:
avp01504
]
Gene sets
Multipdrug resistance modules
Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:
M00718
]
AVENP_2982
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF68457
LinkDB
All DBs
Position
3020030..3023197
Genome browser
AA seq
1055 aa
AA seq
DB search
MIARFFINHPIFAWVISLLIMLIGILSIKNLPVEQYPDIAPPTINIQATYSGASAKSIEN
SITQIIEQELTGLDGLLYFSSTSQTGTSSINVVFEKGIDPDIAQVKVNNKIQQVLPRLPE
DVRREGVTVTKSQDDFLMILSIYDESNKSNESDISDYLISNIKDGLSRVEGVGGIELFGA
EYAMRVWIDPKKLKSYNLMPSDINSAILIQNAQVSAGSIGARPQIQEQELNADVVSRNKL
ENVKEFENIVIKSNKNGANVLLSDVAKVELGSNDYSFISKNNGFQASGIGIKLSAGSNAV
NTAKKVKEYLSSFEDSLPSGYKISYPYDTTIFIEESIKEVVKTLFEAIFLVVVVMFVFLN
SWRATIIPAIAVPVVLLGTFAILNFLGFSINSLTLFAMVLSIGLLVDDAIVVVENVERNM
REKNLCAKEATIISMNEITSALIGVATVLSVVFLPMIFFSGSTGIIYKQFAVTIISSMVL
SVIVALTLSPAICATFLKPHNPNKKKSGLIFWFNKKFDNLAKKYKRGVFKFVNSPIKSLA
AYMVIIVVSILFFIKLPTGFLPSEDQGDLMIQFTLPAGASATRSENVEKIIRNYFLNEEK
SNVNSIFSIVGFTFTGNGQNGGMGFIELKNWNQRDGIENKADAIANRAMITFTDNNSKYF
IRDAEVFVMNSASVPGLGNTDGFEFQLQAGSKMTREDLLLAKNSLLETVSLSELIEGGRV
EGTEETPQLKLDYDKKKIFSLGLSYDDIDNTLNTAWAGSYVNDFIDKSRVKRVYVQADAQ
YRAKPEDIYQWSVRNNENEMVSFEEFTNISWQPTEKSLTRYNGLASYLFQGKASYGVSSG
VAMDEMEKLAKTNNPDTRYSWSGLSYQEKLAGGQAIYLYILSLIVIFLCLAALYESWSIP
LSVLLAVPLGIIGAVLAVYFRGLNNDVYFQVALLTTIGLVAKNAILIVEFVESSYKKGES
LVSSAVEGATLRFRPIIMTSLAFIAGIIPLALSTGAGANSRISIGTGIIGGTLTATILAI
FYVPLLFILIKKIFTPQSEQAKLVRKKEQKGIENV
NT seq
3168 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagctcgtttttttattaatcaccctatttttgcttgggttatatctttacttata
atgctaataggaatactttctattaaaaatttacctgtagaacaatatccagatattgct
ccaccaacaattaatatccaagcaacctactcaggtgcatcagctaaatctattgaaaat
agtattactcaaatcattgaacaagaattaacagggttagatggtttattatatttttct
tcaactagtcaaacaggaacttcaagtataaatgttgtatttgaaaagggaatagatcca
gatattgcacaagttaaagtaaacaataaaatacaacaagtactgccaaggcttcctgaa
gatgttagaagagaaggagttactgttacaaaatcacaagatgattttcttatgatactt
agtatatacgatgaatcaaataaatctaatgaaagtgatatatcagattatttaattagt
aatataaaagatggtctttcaagagttgaaggagttggaggaattgaactttttggggca
gaatatgcaatgagagtttggatagatcctaaaaaactaaaatcttataatttaatgcct
tctgatattaatagtgcaatactaatacaaaatgcacaagtatccgcaggaagtattggt
gcaagacctcaaatccaagagcaagaattaaacgcagatgtggtatcaagaaataagtta
gaaaatgtaaaagagtttgaaaatattgttataaaaagtaataaaaatggagcaaatgtt
cttttatccgatgtagcaaaagttgaattaggaagtaatgattactcctttatatcaaag
aataatggttttcaagcaagtggtataggaataaaattatctgctggttcgaatgcagta
aatactgcaaaaaaagttaaagaatatctatcttcatttgaagattctttaccaagtggc
tacaaaatttcatatccatatgatacaactatttttattgaagaatctataaaagaagtt
gtaaaaacactttttgaagcaatatttttagtagttgttgtaatgtttgtttttttaaat
agttggagagcaactataattcctgctattgctgtgcctgttgtattacttggaacattt
gctattttaaattttttaggattttctataaactctttaaccttgtttgcgatggtatta
tctattggtttattagttgatgatgccattgttgtagttgaaaatgttgaaagaaatatg
agagaaaagaatctttgtgcaaaagaagcaacaattatttctatgaatgaaataacaagt
gcattaattggtgttgctactgttctttctgttgtatttttgcctatgatattttttagt
ggttcaacgggaatcatctataaacaatttgcagttacgattatctcttcaatggtttta
tctgtaattgtggcattaactttatctcctgctatttgtgcaacatttttaaaacctcat
aatccaaataaaaaaaagagtggtctcattttttggttcaataagaaatttgataattta
gcaaaaaaatataaaagaggtgtttttaaatttgtaaatagtcctataaagtcacttgct
gcttatatggtaataatagttgtaagtattttattttttataaaattacctacaggattc
ttaccatcagaagatcaaggtgatttaatgattcaatttacacttccagcaggtgctagt
gcaacacgttctgaaaatgttgaaaaaataataagaaattattttttaaatgaagaaaaa
agtaatgttaactctattttttctattgttggatttacatttactgggaatggacaaaat
ggaggaatgggatttatagagttaaaaaattggaatcaaagagatggtatagaaaataaa
gcagatgccattgcaaatagagcaatgataacttttacagataataactcaaaatatttt
ataagagatgcagaagtgtttgtaatgaattcagcttctgttccagggcttggaaataca
gatggttttgaatttcaactacaagctggttcaaaaatgacaagggaagatttactctta
gcaaaaaattctttattagagacagtaagtttaagtgagttaatagaaggaggaagagtt
gagggaacagaagaaactccacaattaaaacttgattatgataaaaaaaagatattttca
ttaggactatcttatgatgatattgataatacactaaatacagcttgggccggttcctat
gttaatgattttattgataaatcaagagttaaaagagtttatgtacaagcagatgcacaa
tatagagctaaacctgaagatatatatcaatggagtgttagaaataatgaaaatgaaatg
gtatcttttgaagaatttactaatatatcatggcaaccaactgaaaaatcactaacacga
tataacggcttggcctcttatttgtttcaagggaaagctagttatggagtaagttcaggg
gttgcaatggatgaaatggaaaaattagcaaaaaccaataatccagatactagatattca
tggagtggattatcttatcaagagaagctagcaggtggccaagctatttatttatatata
ttatctttaatagtaatatttttatgtttagccgctttatatgaaagttggagcatccct
ctttctgtactgttagctgtaccattaggaattattggtgcggttttagcagtttatttt
agaggattaaataatgatgtatatttccaagttgctcttttgacaactattgggcttgtt
gcaaaaaatgcaatattaattgttgaatttgttgaaagttcatataaaaaaggagaatct
ttagtttcatccgcagtagaaggggcaactttaagatttagacctataattatgacttct
ttagcttttattgcaggtattattcctttggcattatcaacgggagctggagcaaatagt
agaatttcaataggtactggaattattggaggaacactaacagcaactattttagcaata
ttttatgttccacttttatttattttgattaaaaaaatatttacaccccaaagcgaacaa
gcgaagcttgtaagaaaaaaagagcaaaaaggtatagaaaatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
