Arcobacter venerupis: AVENP_3149
Help
Entry
AVENP_3149 CDS
T06858
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
avp
Arcobacter venerupis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
avp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
avp02000
]
AVENP_3149
Transporters [BR:
avp02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AVENP_3149
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
Erf4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QKF68612
LinkDB
All DBs
Position
3199108..3200994
Genome browser
AA seq
628 aa
AA seq
DB search
MYKQSLFTISALAILTSSVIANEEINKNTTKLNEIIVTAKSNKSIDDISSSVTVITAEEI
ARLNATSIKDILVKQAGIIETVNSSSLAGRKSISIRGLDSSYTLILIDGKKISPTDAYIG
HSDFQYSWVPVNMIERIEIIKGPKSSIYGSQAIGGVINIITKKDTKKIYGEIDIQSGFSS
AEKGGDEENISANIGGNISDKLFMFVGANKYNRDYTVGSEITGFDHTYMEGIDNESANIK
LQYNFDDTQSIYTSYIKGEEKRELEDYPEYYNLKRDIYSIGYKKSFEKISFDIDYSKTKL
DSKYKGGSSSTMNYITKLTNDSLKAEAKVTALKYNDIVLGAETSKETHDREYPMTGQSKW
NFESKTNAYYIQDEIELGNFIFTLGGRYDDNEKYGNEFSSNIGSIYKIDDNQRLKLNYGE
GFKAPLLTQGSSGYISMGIQGNDNLKAETSKSYELAYELYGNNTTFKASVFKTDLENMIK
SEGHGTGSKYVNVDEAEAKGFELSINYDITEDHQINTNYTYVKTENKQIGKDLTYKPEHT
FNIGLTSKLAWGISSYISANYLGEQYVDEANLEKVGGYTILNTQISKELTKNLTARIGVD
NITDKDFEDANPYVLKRRLAYVGLNYKF
NT seq
1887 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtataaacaaagtctatttacaatttcagctcttgcaatacttacatcaagtgtaatt
gcaaatgaagagataaacaaaaatacaacaaagttaaatgaaataatagtaactgcaaaa
tcaaataaatcaatagatgatatttcaagttcagttacagttataacagcagaagaaata
gctagattaaatgcaacaagtatcaaagatattttagttaagcaagcaggaattattgaa
actgtaaattcatcttcattagctggaagaaaaagtatctctattcgaggtcttgattca
agttatacattaattttaattgatggtaagaaaataagtccaacagatgcttatattgga
catagtgattttcaatattcatgggttcctgttaatatgattgaaagaattgagattata
aaagggccaaaaagttctatttatggttcacaagctatcggtggagtgataaatattatc
acaaaaaaagatactaaaaaaatttatggagaaatagatattcaatctggtttctcttct
gctgaaaaaggtggagacgaagagaatattagtgcaaatataggtggaaatatttctgat
aaactttttatgtttgttggtgcgaataaatataatagagattatacagtaggttctgaa
attacaggatttgatcatacatacatggaaggtattgataatgaaagtgcaaatatcaaa
ctccaatataattttgatgatacacaaagtatttatacttcatatataaaaggtgaagaa
aaaagagaactagaagactatccagaatattataatttgaaaagagatatatatagtatt
ggctataaaaaaagttttgaaaaaatatcttttgatatagattattctaaaacaaaatta
gattcaaaatataaaggaggttcatcatctactatgaactatattactaaacttactaat
gattctttaaaagcagaagcaaaagttacagcactaaaatataatgatattgttttaggg
gctgaaacatcaaaagagactcatgatagagaatacccaatgactggtcaatcaaaatgg
aattttgagtctaaaactaatgcttattatattcaagatgaaatagaactaggaaacttt
atcttcactcttggtggaagatatgatgataatgaaaaatatggaaatgaattttcatca
aatattggttcaatatataaaatagatgataaccaaagattaaaattaaactatggagaa
ggatttaaagctccccttttaactcaaggttcaagtggatatatttctatgggtattcaa
ggtaatgataatctaaaagcagaaacttcaaaatcttatgaactagcttatgaattatat
ggaaataatactacatttaaagcatctgtatttaaaacagatttagaaaatatgattaaa
tcggaaggacatggaacagggtcaaaatatgtaaatgttgatgaagcagaagctaaagga
tttgaactaagtattaattatgatattacagaagatcatcaaataaatacaaattatact
tatgttaaaacagaaaataaacaaataggaaaagatttaacttataaacctgaacacaca
tttaatattggtttaacttctaaattagcttggggtatatcatcttatataagtgcaaac
tatctaggagaacaatatgttgatgaagctaatttagaaaaagttggtggttatacaatt
ttaaatactcaaatttctaaagaacttactaaaaatttaaccgcaagaattggtgttgat
aatattactgataaagattttgaagatgccaatccttatgtattaaaaagaagacttgct
tatgtaggattaaactataaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system