Bartonella sp. A1379B: BA1379B_012740
Help
Entry
BA1379B_012740 CDS
T05185
Name
(GenBank) autotransporter secretion inner membrane proteinTamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
bara
Bartonella sp. A1379B
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
bara00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
bara02000
]
BA1379B_012740
Transporters [BR:
bara02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
BA1379B_012740
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX19073
LinkDB
All DBs
Position
1453576..1458228
Genome browser
AA seq
1550 aa
AA seq
DB search
MKKMWYLRFFLFGFSLLMMLSFVFVQRGNSFAGEEIENDRSWLVSFIERKLSTPNRQIRL
HNVQGALSSQASIDTITISDNKGIWLKINNAKIDWNRLALLRGHVKINQLSAEKIIFLRK
PQNSSSISFFEADQFSIPKLSMAIFVNTLMVEYLTFEKDIFGFVSDVSLKGHLTLSNDEL
DTNIEFQRLDELGYFSILTKISKNDRTAKIDIIADEPQNGIIANILELEKRPALNLSIKG
NGTFDDLVIMLNLKANQQPILGGNFTLVEAAEGHSLITNLDGTIGRLMPVQSQYRSFFES
NFALKAKVTMTNEGAMHLNHMTLQGDTIDVVANAEIANDGFLRRLFVDGKIAFDKEKAST
RLPRLKTQTHIDNLALTVDYGRKGQQTWKGRLAVHHLSNDNIHIRDAVFDMGGVSENLDN
LVSRHVGIQINGMLQGITRIKDGFAEDLNQPVYIHLDTDILSGKPMSIHDFSVKAQDFSI
WLKGQMDRFIFKGDLGVKAQTLAPLGLLNGQSFSGGADIKAKGNFNLIKGTFDLKFLGTT
DNAKIGRAAVDHLLKGELFLSGDIARNRIGLIVNDFHLKNQFANLKADGYFGRESAEMDF
SAQISNLSLLDPRMDGSATIKGAARGHNSLITISTKAQIVEAFLVGKKLQNTIFNMNVLM
DNTSPVSPYLTGFIEGEGTFSEKPLQLSAVFNNTDHIWKLQGINIKGGNARITGDITQTF
ERFLKGNLHIDADDISTLSALFLQKGSGKVKGDFIFDERNNQQIANLKANVNNFILAKNE
IKKLAIQADIFNPFGAIQFKGSVNAEHIRTPFMMVNHLNAQALNNDGQTVFNVQAVLHND
TDAKLSGRVITEGLFEDVKQKVELETIDVKQVGLHAALLKPVTILFDKNGITMNKLGISV
NEGEIVLSGNIQDTLNLHLKMSAVPATLANLWKSDLDAAGTLTGDIMVHGSFTKPEIIYD
VRGQELMIAPLQEKKIKPFTFSAKGKAVNQALLLSAELSGDGLQVQAQGKVPLDKSNFDL
HVSLKNFPAHLVNGFIKGEPFGGEVVGKVDVGGDWKSLSTHFDLTSQNLTVMTHKGPESM
NMNIRGFYKKSIFHIEHMVASGAKDLDLSVNGQISLNNSKVELHVRGMMPLSFMNQFVAE
RGAHVAGIVKIESTISGALPQPQLKGHFSVSNGHFLDTQTNLELDNIRFEGKLNGDHVIL
ENAYASSYGGSLSASGRISNDLQTDLVIHLDHAHYNDGSMIFATLTGEMTVTGYFLRDLV
VGGDVTIEKAELLIPDNFKNAAFLNLKHKNLIAPIQKTLERANVKTYGHNQDVSEESSSV
IRLDVKINAHNKFFVRGRGVDAELGGSINLKGPLQGMRPVGELQMIRGRFDILSQRLNFD
KGQVSFNGNLNPTVYFITNNNNGDIRVNVIVKGTIDNLDIQFSSQPVLPQDEVLARLIFN
RSLNELSPFQIVQLTAAAAELAGASNTSLLNTLRSHIGLDDLDVVVDKKGNTGLRVGRYI
HSNIYLGFEAGSNGTTKGTINLDISRHLKAKGAIGSEENTSFGLFYEKDY
NT seq
4653 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatgtggtatttgaggttttttttatttggattttctcttttgatgatgctc
tcttttgtctttgttcaaagaggaaattcattcgccggagaggaaatagaaaatgatcgt
tcatggcttgtttcttttattgaacgtaaactttccacacctaatcgacaaattcgtttg
cataatgtccagggggcattatcttcacaggcgtctattgatacaattactataagtgat
aacaaaggtatttggcttaaaattaacaatgctaagatcgattggaatcgtttagcttta
ctgcgaggacatgttaaaattaatcagctttcagcagaaaaaattatatttttacgtaaa
ccacaaaattcctcctcaatttccttttttgaagctgatcagttttccatacctaaattg
tctatggcaatttttgtgaatacattgatggttgagtatctgacctttgaaaaagacatt
tttggctttgtttctgatgtatcattaaaagggcatttaaccttaagtaatgatgagctg
gatactaatatagaatttcaacgtttagatgaattaggttatttttctatcttaacaaaa
atatccaaaaacgatcgtacagctaaaattgatattattgctgatgaaccacaaaatggt
attatagctaatattcttgagcttgaaaagcgtcctgcattaaacctctccattaaaggt
aatggaacttttgatgatttggttattatgcttaatttaaaagctaatcagcaacctatt
ttggggggaaattttactctcgtagaggctgcagaaggtcatagtctcataacaaattta
gatggaacaattggtcgtttaatgcctgttcaatctcaatatcgtagtttctttgaatct
aattttgctttaaaagcaaaagtaacgatgacgaacgaaggtgcaatgcatcttaatcat
atgactcttcaaggcgatacaattgatgttgtagctaatgctgaaatagcgaatgatgga
tttttacgacgtctttttgttgatggcaaaatagcttttgataaagaaaaagcatcaact
cgtttaccacggctaaagacacaaacacacatagataatcttgctttaacagttgattat
ggccgtaaaggacaacaaacttggaaagggcggcttgctgtacatcatttgagcaatgac
aatattcatattcgtgatgctgtttttgatatggggggtgtgagtgaaaatcttgataat
ttagtttctcgtcatgtaggtattcagattaatggtatgcttcagggaattacaaggatt
aaggatggttttgcagaagatttaaatcaaccagtttatatacatcttgatacggatatt
ctttctggaaaaccaatgtcaatccatgattttagtgttaaagctcaggatttttctatt
tggttaaaaggacaaatggatcgttttatttttaaaggagatcttggtgtaaaagcacaa
acattagcacctttgggtttgttgaatggacagtcattttctggtggtgcggatattaaa
gcaaaaggaaattttaatttaattaaagggacttttgatcttaaatttttaggcacaact
gacaatgctaaaataggaagggcagcagttgatcatttattaaagggagaactttttctt
tcaggtgatattgcgcggaatagaataggtttaatcgttaatgatttccatttaaaaaat
cagtttgccaatctaaaagctgatggctattttggcagagaaagcgctgaaatggatttt
tctgctcaaatatctaatctttctctgttagatccaagaatggatggatctgctacaatt
aaaggcgctgctagaggacataatagtcttataacaatcagtacaaaggctcaaattgtt
gaagcctttttggttggtaaaaaacttcaaaatacaatattcaatatgaatgtgcttatg
gataatacatcaccagtttccccctatttaacgggttttatagaaggagaagggactttt
tctgagaaaccattacagctatctgctgtttttaacaataccgatcatatctggaagctt
cagggtatcaatattaaaggaggtaatgcacgtataaccggtgatattactcaaactttt
gaacgttttttgaaaggaaatttgcatattgatgcggacgatatttcaactctttctgca
ttatttttgcaaaaaggaagtgggaaggtaaagggcgactttatttttgatgaaagaaat
aaccaacagatagcaaatttaaaagctaatgttaataattttatacttgcaaaaaatgaa
ataaaaaaattggctatacaagctgatatattcaacccttttggcgcgatacaatttaaa
ggttctgttaatgcagaacatattcggacaccctttatgatggtcaatcatttgaatgct
caagctttgaataacgatggacaaactgtttttaatgttcaagcagtgctacataatgat
acagatgcaaagctttctggacgcgttataacagagggattatttgaagatgtgaaacaa
aaagtggagcttgaaactatagatgtgaaacaagttggtctgcatgcagcattacttaaa
ccagtgaccatcctctttgataaaaatggaataacgatgaataagttaggaatttctgtc
aatgaaggtgaaatcgtgctttcaggcaatattcaagatactcttaatttgcatcttaaa
atgagtgctgtgcctgctacattagcgaatctttggaagtcagatcttgatgctgccggg
actttaacaggagatattatggtccatggaagttttacaaagcctgagataatctatgat
gtaaggggccaagagttaatgattgctcctttgcaagaaaagaaaataaagccttttact
ttttctgctaagggtaaagcagtcaatcaagctcttcttttatctgctgagctaagcgga
gatggattgcaagtgcaagcacaaggaaaagtccctctagataagagcaattttgattta
catgttagtctaaaaaattttcctgcacatttggtcaatggttttatcaagggagagcct
tttgggggagaagtggttggtaaggttgatgttggcggagattggaagagtttgtctacc
cattttgacctcactagtcaaaatttgacagtcatgactcataaaggaccagagtcgatg
aatatgaatatccgtggtttttataaaaaatcaatatttcatattgagcatatggtagca
tcgggcgccaaggatttggatctttctgttaatggacaaatttctttgaataattcaaaa
gttgaattgcatgttagaggcatgatgcctcttagttttatgaatcaatttgtagctgag
cgtggtgcgcatgtagcgggaatagtaaaaatagagagcactatcagtggtgcattgcct
cagccacaattaaaaggacatttttctgtatctaatggtcactttttagatacacaaaca
aatttagaattggataatataaggtttgaaggcaaactaaatggcgatcatgtgatttta
gagaatgcttatgcttcttcttatggagggtctctttctgcttcaggtcgcatttctaat
gatttgcagactgatctagtgattcatctcgatcatgcccattataatgacgggtctatg
atttttgcgacattaacaggcgaaatgacagtaactggttattttttgcgtgatcttgtt
gttggtggtgatgtcacaattgaaaaagcagagcttcttattcctgataattttaaaaat
gcagcatttttaaatcttaaacataagaacttaatcgcaccgattcaaaaaacacttgaa
cgagctaatgttaaaacttatggtcataatcaagatgtttctgaagagtcttcttctgtt
atccggttagatgtaaaaattaatgcacacaacaaattttttgtgcgtggtcgaggggtt
gatgctgaattaggaggaagcattaatttaaaaggccctttgcagggtatgcgtccagtt
ggtgaattacaaatgattcgcggaaggtttgatattctttcacaacgtctcaatttcgat
aaaggacaggtaagttttaacggtaatcttaatcctactgtttattttattaccaacaat
aataatggtgatattcgtgttaatgtaatagtaaaaggaacaattgataatcttgatatt
cagttttcttcacaacctgttttaccacaggatgaggtattggcgcgtttgattttcaat
cgctctcttaacgaattatcgccatttcaaattgttcagcttacagcagcagctgctgag
cttgctggtgcttctaacacatctttattgaatactttacgatcccatattggtctcgat
gatcttgatgttgttgttgataaaaaaggcaacacaggtttacgtgttggacgctatata
cattctaatatttacttgggttttgaggcgggatcgaatggaacaacgaaaggaacaatt
aatttggatatttcacgtcatcttaaagctaaaggggctataggaagtgaagaaaatacg
agttttggtttgttctatgaaaaagattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
