Bartonella sp. Raccoon60: Bra60_013860
Help
Entry
Bra60_013860 CDS
T05326
Name
(GenBank) autotransporter secretion inner membrane proteinTamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
barr
Bartonella sp. Raccoon60
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
barr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
barr02000
]
Bra60_013860
Transporters [BR:
barr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Bra60_013860
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQX27354
LinkDB
All DBs
Position
1527351..1532006
Genome browser
AA seq
1551 aa
AA seq
DB search
MKKMWYLRFFLFGFSLLMMLSFVFVQRGNSFAGEEIENDRSWLVSFIERKLSAPNRQIRL
HNVQGALSSQASIDTITISDNKGIWLKINNAKIDWNRLALLRGHVKINQFSAEKIIFLRK
PQNSSSISFFEADQFSIPKLSMAIFVNTLMVECLTFEKDIFGFVSDVSLKGHLTLSNDEL
DTNIEFQRLDELGYFSILTKISKNDRTAKIDIIADEPQNGIIANILELEKRPALNLSIKG
NGTFDDLVIMLNLKANQQPILEGNFTLVEAAEGHSLITNLDGTIGRLMPVQSQYRSFFES
NFALKAKVTMTNEGAMHLNHMTLQGDTIDVVANAEIANDGFLRRLFVDGKIAFDKEKAST
RLPRLKTQTHIDNLALTVDYGRKGQQTWKGRLAVHHLSNDNIHIRDAVFDMGGVSENLDN
LVSRHVGIQINGMLQGITRIKDGFAEDLNQPVYIHLDTDILSGKPMSIHDFSVKAQDFSI
WLKGQMDRFIFKGDLGVKAQTLAPLGLLNGQSFSGGADIKAKGNFNLIKGTFDLKFLGTT
DNAKIGRAAVDHLLKGELFLSGDIARNRIGLIVNDFHLKNQFANLKADGYFGRESAEMDF
SAQISNLSLLDPRMDGSATIKGAARGHNSLITISAKAQIVEAFLVGKKLQNTIFNMNVLM
DNTSPVSSYLTGFIEGEGTFSEKPLQLSAVFNNADHIWKLQGINIKGGNARITGDITQTF
ERFLKGNLHIDADDISTLSALFLQKGSGKVKGDFIFDERNNQQIANLKANVNNFILAKNE
IKKLAIQADIFNPFGAIQFKGSVNAEHIRTPFMMVNHLNAQALNNDGQTVFNVQAVLHND
TDAKLSGRVITEGLFEDVKQKVELETIDVKQVGLHAALLKPVTILFDKNGITMNKLGISV
NEGEIVLSGNIQDTLNLHLKMSAVPATLANLWKSDLDAAGTLTGDIMVHGSFTKPEIIYD
VRGQELMIAPLQEKKIKPFTFSAKGKAVNQALLLSAELSGDGLQVQAQGKVPLDKSNFDL
HVSLKNFPAHLVNGFIKGEPFGGEVVGKVDVGGDWKSLSTHFDLTSQNLTVMTHKGPESM
NMNIRGFYKKSIFHIEHMVASGAKDLDLSVNGQISLNNSKVELHVRGMMPLSFMNQFVAE
RGAHVAGIVKIESTISGALPQPQLKGHFSVSNGHFLDTQTNLELDNIRFEGKLNGDHVIL
ENAYASSSYGGSLSASGRISNDLQTDLVIHLDRAHYNDGFMIFATLTGEMTVTGYFLRDL
VVGGDVTIEKAELLIPDNFKNAAFLNLKHKNLIAPIQKTLERANVKTYGHNQDVSEESSS
VIRLDVKINAHNKFFVRGRGVDAELGGSINLKGPLQGMRPVGELQMIRGRFDILSQRLNF
DKGQVSFNGNLNPTVYFITNNNNGDIRVNVIVKGTIDNLDIQFSSQPVLPQDEVLARLIF
NRSLNELSPFQIVQLTAAAAELAGASNTSLLNTLRSHIGLDDLDVVVDKKGNTGLRVGRY
IHSNIYLGFEAGSNGTTKGTINLDISRHLKAKGAIGSEENTSFGLFYEKDY
NT seq
4656 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatgtggtatttgaggttttttttatttggattttctcttttgatgatgctc
tcttttgtctttgttcaaagaggaaattcattcgccggagaggaaatagaaaatgatcgt
tcatggcttgtttcttttattgaacgtaaactttccgcacctaatcgacaaattcgtttg
cataatgtccagggggcattatcttcacaggcgtctattgatacaattactataagtgat
aacaaaggtatttggcttaaaattaacaatgctaagatcgattggaatcgtttagcttta
ctgcgaggacatgttaaaattaatcagttttcagcagaaaaaattatatttttacgtaaa
ccacaaaattcctcctcaatttccttttttgaagctgatcagttttccatacctaaattg
tctatggcaatttttgtgaatacattgatggttgagtgtctgacctttgaaaaagacatt
tttggctttgtttctgatgtatcattaaaagggcatttaaccttaagtaatgatgagctg
gatactaatatagaatttcaacgtttagatgaattaggttatttttctatcttaacaaaa
atatccaaaaacgatcgtacagctaaaattgatattattgctgatgaaccacaaaatggt
attatagctaatattcttgagcttgaaaagcgtcctgcattaaacctctccattaaaggt
aatggaacttttgatgatttggttattatgcttaatttaaaagctaatcagcaacctatt
ttggagggaaattttactctcgtagaggctgcagaaggtcatagtctcataacaaattta
gatggaacaattggtcgtttaatgcctgttcaatctcaatatcgtagtttctttgaatct
aattttgctttaaaagcaaaagtaacgatgacaaacgaaggtgcaatgcatcttaatcat
atgactcttcaaggcgatacaattgatgttgtagctaatgctgaaatagcgaatgatgga
tttttacgacgtctttttgttgatggcaaaatagcttttgataaagaaaaagcatcaact
cgcttaccacggctaaagacacaaacacacatagataatcttgctttaacagttgattat
ggccgtaaaggacaacaaacttggaaagggcggcttgctgtacatcatttgagcaatgac
aatattcatattcgtgatgctgtttttgatatggggggtgtgagtgaaaatcttgataat
ttagtttctcgtcatgtaggtattcagattaatggtatgcttcagggaattacaaggatt
aaggatggttttgcagaagatttaaatcaaccagtttatatacatcttgatacggatatt
ctttctggaaaaccaatgtcaatccatgattttagtgttaaagctcaggatttttctatt
tggttaaaaggacaaatggatcgttttatttttaaaggagatcttggtgtaaaagcacaa
acattagcacctttgggtttgttgaatggacagtcattttctggtggtgcggatattaaa
gcaaaaggaaattttaatttaattaaagggacttttgatcttaaatttttaggcacaact
gacaatgctaaaataggaagggcagcagttgatcatttattaaagggagaactttttctt
tcaggtgatattgcgcggaatagaataggtttaatcgttaatgatttccatttaaaaaat
cagtttgccaatctaaaagctgatggctattttggcagagaaagcgctgaaatggatttt
tctgctcaaatatctaatctttctctgttagatccaagaatggatggatctgctacaatt
aaaggcgctgctagaggacataatagtcttataacaatcagtgcaaaggctcaaattgtt
gaagcctttttggttggtaaaaaacttcaaaatacaatattcaatatgaatgtgcttatg
gataatacatcaccagtttcctcctatttaacgggttttatagaaggagaagggactttt
tctgagaaaccattacagctatctgctgtttttaacaatgccgatcatatctggaagctt
cagggtatcaatattaaaggaggtaatgcacgtataaccggtgatattactcaaactttt
gaacgttttttgaaaggaaatttgcatattgatgcggacgatatttcaactctttctgca
ttatttttgcaaaaagggagtgggaaagtaaagggcgactttatttttgatgaaagaaat
aaccaacagatagcaaatttaaaagctaatgttaataattttatacttgcaaaaaatgaa
ataaaaaaattggctatacaagctgatatattcaacccttttggcgcgatacaatttaaa
ggttctgttaatgcagaacatattcggacaccctttatgatggtcaatcatttgaatgct
caagctttgaataacgatggacaaactgtttttaatgttcaagcagtgctacataatgat
acagatgcaaagctttctggacgcgttataacagagggattatttgaagatgtgaaacaa
aaagtggagcttgaaactatagatgtgaaacaagttggtctgcatgcagcattacttaaa
ccagtgaccatcctctttgataaaaatggaataacgatgaataagttaggaatttctgtc
aatgaaggtgaaatcgtgctttcaggcaacattcaagatactcttaatttgcatcttaaa
atgagtgctgtgcctgctacattagcgaatctttggaagtcagatcttgatgctgccggg
actttaacaggagatattatggtccatggaagttttacaaagcctgagataatctatgat
gtaaggggccaagagttaatgattgctcctttgcaagaaaagaaaataaagccttttact
ttttctgctaagggtaaagcagtcaatcaggctcttcttttatctgctgagctaagcgga
gatggattgcaggtgcaagcacaaggaaaagtccctctagataagagcaattttgattta
catgttagtctaaaaaattttcctgcacatttggtcaatggttttatcaagggagagcct
tttgggggagaagtggttggtaaggttgatgttggcggagattggaagagtttgtctacc
cattttgacctcactagtcaaaatttgacagtcatgactcataaaggaccagagtcgatg
aatatgaatatccgtggtttttataaaaaatcaatatttcatattgagcatatggtagca
tcgggcgccaaggatttggatctttctgttaatggacaaatttctttgaataattcaaaa
gttgaattgcatgttagaggcatgatgcctcttagttttatgaatcaatttgtagctgag
cgtggtgcgcatgtagcgggaatagtaaaaatagagagcactatcagtggtgcattgcct
cagccacaattaaaaggacatttttctgtatctaatggtcactttttagatacacaaaca
aatttagaattggataatataaggtttgaaggcaaactaaatggcgatcatgtgatttta
gagaatgcttatgcttcttcttcttatggagggtctctttctgcttcaggtcgcatttct
aatgatttgcagactgatctagtgattcatctcgatcgtgcccattataatgacgggttt
atgatttttgcgacattaacaggcgaaatgacagtaactggttattttttgcgtgatctt
gttgttggtggtgatgtcacaattgaaaaagcagagcttcttattcctgataattttaaa
aatgcagcatttttaaatcttaaacataagaacttaatcgcaccgattcaaaaaacactt
gaacgagctaatgttaaaacttatggtcataatcaagatgtttctgaagagtcttcttct
gttatccggttagatgtaaaaattaatgcacacaacaaattttttgtgcgtggtcgaggg
gttgatgctgaattaggaggaagcattaatttaaaaggccctttgcagggtatgcgtcca
gttggtgaattacaaatgattcgcggaaggtttgatattctttcacaacgtctcaatttc
gataaaggacaggtaagctttaacggtaatcttaatcctactgtttattttattaccaac
aataataatggtgatattcgtgttaatgtaatagtaaaaggaacaattgataatcttgat
attcagttttcttcacaacctgttttaccacaggatgaggtattggcgcgtttgattttc
aatcgctctcttaacgaattatcgccatttcaaattgttcagcttacagcagcagctgct
gagcttgctggtgcttctaacacatctttattgaatactttacgatcccatattggtctc
gatgatcttgatgttgttgttgataaaaaaggcaacacaggtttacgtgttggacgctat
atacattctaatatttacttgggttttgaggcgggatcgaatggaacaacgaaaggaaca
attaatttggatatttcacgtcatcttaaagctaaaggggctataggaagtgaagaaaat
acgagttttggtttgttctatgaaaaagattattaa
DBGET
integrated database retrieval system
