Bacteroides stercoris: K6V31_12460
Help
Entry
K6V31_12460 CDS
T07883
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
bste
Bacteroides stercoris
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
STN
CarboxypepD_reg
DUF5780
CooC_C
AglB_L1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UBE40622
LinkDB
All DBs
Position
2989855..2993274
Genome browser
AA seq
1139 aa
AA seq
DB search
MEKDSPFSFTGRRCIVALMCIFVTTLVYAQQQKISVSIKELPLKEAINQIAEKASMNVAY
SKEFVDTNRKVSLEVKDTEVNRALTLLLKGTNIGFRFLDDSILFYNKEYQNKTEPVEPQE
SRKELYVKGKVTDENAEAIIGATVSVKGATTGTITDINGQYSIKVPYGSTLRYSYVGYRE
ESVMAKETTVNVVMKEDAVSLEDVVVVGYGVQKKVNVTGAVSMVKAEAIENRPITNVTTG
LQGLLPGVSIVASSGQPGAVPNINIRGTGTINSSTAPLILIDGVAGGDINLLNPSDIESV
SVLKDAASSAIYGARAANGVILVTTKKGEKKERVEFQYNGYAGFQTPTALPELVNGREYM
ELSNEAMSAAGFSKPYTQEAFDKYDSGLYPNEYSNTDWVDEIYKSRAFQTGHNVSARGGS
EKTGFFMSYGYLDQDGLVVGDGYSSKRHNARISVNTEVYDRLKLTGQMSYVDFYKKDLGY
SGTSGVFRLSQRMSPLLPVKWQVPDENGRMVDSENWSYGSVRNPLQVAYESGTEERKTRV
LNGIFNADLKIIDGLNAGMQYSANIYTRQVDEFNPKMLSYYSDGSPLKANEDAKDYISQS
HLDVMTQTLQFTLNFNKTIGRHELGTLLGFSQEWESRSTLGATRDNVMVEDIHVISAGMI
NFMNSGTKDEWALRSYFGRVNYAFDGKYLFEANLRADGTSRFAKGNRWGYFPSFSAGWNF
SREKFMEFATPVLSSGKLRASWGELGNQNIPGNYYPYLSPIITEESYPIGASNTPVMGLW
QNKIGNPDIKWETIRMLNFGMDLSFLNNRLNVDFDWYKKENIDALVRPDVPAIVGVPSSN
VGYVNLGKIDVKGWELNLSWRDKIGNVNYNLGFNLSDARNKITDLGGTPESLTSTASGSY
RRVGDPIGAFYGYLTDGLAQVYDFESVNTTTGKYQKPKFPLVASQNGIVQPGDIKYRDIS
GPDGAPDGVVDDYDKVVFGDRDPHYTYAIKGGLEWKGIDFSFYLQGVGKVAGYLEDEARH
AFINDYSIPKKEHLDRWTPMNPNASYPRLYQSQEHNRLFSDYWKEDASYLRLKNIQIGYR
FPARMVAPLGINSLRVYASADNLFTKTDYFGAYDPEVRTTSGDVYPQVKTYVFGLSVIF
NT seq
3420 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaagattctcctttttcattcaccggtagaaggtgtattgtagctctaatgtgc
atatttgtcacaactcttgtttatgcacagcagcaaaaaatatcggttagtatcaaagag
cttcctcttaaagaagctatcaatcagatagcggagaaggcttcgatgaatgtagcctat
agtaaagaatttgtggatacgaataggaaagtgtcattggaggtaaaagacacagaggtg
aacagagcactgactcttttgctgaaagggactaacatcggattccgtttcctggatgac
agtattttgttttataataaagaatatcaaaataaaacagaacctgtcgagccgcaggag
agtaggaaggaactatacgtgaaaggtaaggtaactgacgagaatgcggaagcgattatc
ggggctaccgtatcggtaaaaggagcaactactggtacaatcaccgatatcaatggtcag
tattccatcaaagtgccttatggaagcactcttcgctattcatacgtgggctaccgtgaa
gaaagcgtcatggcgaaagaaacgacagtaaatgtggtgatgaaagaggatgctgtcagc
ctggaagatgtagtcgttgtaggttatggtgtgcaaaagaaggtaaatgtaacaggtgcc
gtatctatggtcaaagcggaggctatcgagaacagacctattactaacgtaactacgggc
ttgcaaggattgcttcccggagttagtatcgttgcctcttcgggacagccgggtgctgtg
cccaatatcaacattcgtggtacaggaactatcaatagtagtacagcgcctttaattttg
attgatggggtagccgggggagacatcaacttattgaatccttcggatatcgaaagcgta
tcagtgttgaaagatgccgcgtcatctgctatttatggagcgcgtgccgccaacggtgtt
attcttgtaacgactaaaaaaggagaaaagaaagaacgggtagaattccaatataacgga
tatgccggcttccagactcccacagcattgcccgaacttgtcaacggaagggagtatatg
gaactttccaatgaagctatgagtgctgccggattttccaagccctatacacaggaggct
ttcgataaatatgattcgggactgtatcctaacgaatattccaatactgattgggttgat
gaaatatacaaaagccgggcttttcagacaggacataatgtgagtgcacggggtggaagc
gagaaaaccggatttttcatgtcgtatggttacttggatcaggatggactggttgtaggt
gacggatacagttccaaaagacataatgcgcgtatcagtgtaaacacggaggtgtatgat
cgtctgaaactgaccgggcagatgagttatgtcgatttctataagaaggacttaggctat
agcggcacatcaggagtgttccgcctgtcacagcgtatgtctccgttactacccgtcaag
tggcaggttcctgatgagaatggccggatggtggatagtgagaactggtcgtacggttcg
gtacgtaaccccttgcaggtagcctatgagtcgggaacggaagaacggaaaacccgggtg
ctcaatggaatattcaatgcagatcttaaaattatagacggactgaacgcaggtatgcag
tattctgctaatatatatacccgtcaggtggatgagtttaatccgaagatgttgtcttat
tattcggacggtagtccgttgaaagcaaatgaagatgccaaggactatatctcacaaagc
catctcgatgttatgacccagacgttgcagttcaccttgaactttaataaaacaataggg
cgccatgagttgggaacattgttgggattttcgcaagaatgggaaagcagaagcacgctg
ggtgctacgcgtgataatgtgatggttgaggatattcacgttattagtgccggtatgatt
aattttatgaatagcggaacaaaagacgagtgggctttgcgttcttactttggtcgtgtc
aactatgcttttgacggcaaatacctgtttgaagccaatctgcgtgccgatggaacttca
aggtttgccaaaggcaatcgttggggatattttccgtcattctcggcaggatggaacttt
tcacgtgaaaaattcatggagttcgctactccggtattgagctcgggtaagctgcgtgct
tcctggggtgagttgggaaatcaaaacattcccggtaattactatccttatttgtcgcct
atcataaccgaagagtcctatcctatcggagcttctaatacacctgttatggggctttgg
caaaacaagatcggtaatcccgacattaagtgggaaaccatccgcatgcttaatttcgga
atggatcttagttttttgaacaatagactgaatgtggacttcgattggtataagaaagaa
aatatcgatgcattggttcgtcccgatgtcccggctattgtcggggttcctagtagtaat
gtaggttatgtcaaccttggtaagattgatgtcaaaggatgggaacttaatctgtcatgg
cgtgataagatcggaaatgtaaattacaatctcgggttcaatctgtcggacgcccgtaat
aaaattaccgatttgggtgggactccggagtctctgaccagtacggcttccggttcgtat
cgtcgggtaggtgatccgataggtgctttctatggttatctgaccgatgggctggcacaa
gtgtatgacttcgaatcagtgaatacaactacaggtaagtaccagaaaccgaagtttcct
cttgttgcatcacaaaacggcattgtacagcccggagacattaagtaccgggacatcagt
ggtcctgacggtgctcccgacggggtagttgatgactacgataaagtggtgttcggtgat
agagatcctcattatacttatgcaatcaaaggtggtttggaatggaaaggcatcgacttc
agtttctatttgcaaggagtaggcaaagttgccggttaccttgaggatgaggctcggcat
gcgtttatcaatgactactcgatccctaaaaaagagcatcttgacagatggacgcctatg
aatccaaatgcttcttatcccagactttatcagtcgcaggagcacaacaggctcttcagt
gattactggaaagaggatgcatcgtacttgcgcctgaagaatattcagataggttatcgt
tttcctgcccgaatggtggcacctcttggcattaatagtcttagagtatatgcttcggca
gataacttgtttactaaaaccgattacttcggagcttatgaccctgaagtgaggaccacc
agcggagatgtctatccgcaagtaaaaacctatgtttttggattatcagtaatattctaa
DBGET
integrated database retrieval system