Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-189: F543_6970
Help
Entry
F543_6970 CDS
T03018
Name
(GenBank) Leukotoxin
KO
K11005
hemolysin A
Organism
btrh
Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-189
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
btrh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
btrh02000
]
F543_6970
02042 Bacterial toxins [BR:
btrh02042
]
F543_6970
Transporters [BR:
btrh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
F543_6970
Bacterial toxins [BR:
btrh02042
]
Type II toxins: Membrane damaging toxins
Pore-forming toxins, RTX
F543_6970
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RTX
RTX_C
HemolysinCabind
HCBP_related
Chlorosome_CsmC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG83561
LinkDB
All DBs
Position
660823..663690
Genome browser
AA seq
955 aa
AA seq
DB search
MGTKLTLSTLSNGIRSTLTATRGGLNRAGQSLTQAGQTLKNGAKKIILYIPKDYKYDSGS
GNGLQDLVKAAEELGIEVQKEEGNDIAKAQTSLGTIQNVLGLTERGIVLSAPQLDKLLQK
NKVGQALGSSESIAQNFSQAKTVLSGVQSILGSVLAGMDLDEALQNESDQLTLAKAGLEL
TNSLIENIANSVQTLDAFSEQISQFGSKLQNVKGLGALGDKLKNIGGLDKAGLGLDVISG
LLSGATAALVLADKDASTAKKVGAGFELANQVVGNITKAVSSYILAQRVAAGLSSTGPVA
ALIASTVALAISPLSFAGIADKFDRAKSLENYAERFKKLGYEGDSLLAEYQHGTGTIDAS
VTAINTALAAIAGGVSAAAAGSVVASPIALLVSGITGVISTILQYSKQAMFEHVANKIHN
KIVEWEKNNGGKNYFENGYDARYLANLQDNMKFLLNLNKELQAERVIAITQQQWDSNIGD
LAGISRLGEKVLSGKAYVDAFEEGQHLKADKLVQLDSAKGIIDVSNTGEAKTQHILFRTP
LLTPGTEKRERVQTGKYEYITKLHINRVDSWQIKDGAASSTFDLTNVVQRIGVELDHAEN
VIKTKETKIVATLGDGDDNVFVGSGTTEIDGGEGYDRVHYSRGNYGALTIDATKETEQGS
YTVNRFVESGKALHEVTSTHTALVGNREEKIEYRHSNNQHHAGYYTKDTLKAVEEIIGTS
HNDIFKGSKFNDAFNGGDGVDTIDGNDGNDRLFGGKGDDIIDGGNGDDFIDGGKGNDLLH
GGKGDDIFVHRQGDGNDSITESEGNDKLSFSDSNLKDLTFEKVNHHLVITNTKQEKVTIQ
NWFREAEFAKTIQNYVATRDDKIEEIIGQNGERITSKQVDELIEKGNGKIAQSELTKVVD
NYQLLKYSRDASNSLDKLISSASAFTSSNDSRNVLASPTSMLDPSLSSIQFARAA
NT seq
2868 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaactaaactaaccctatcaaccttatcaaatggaataagaagtactttaactgca
acaagaggcggcttaaatagagcagggcagtcattaacccaagctggacagactttaaaa
aacggagctaaaaaaatcattctctatataccaaaagattacaaatatgattcaggtagt
ggtaatggattacaagatttggttaaagctgctgaagagttaggtattgaggtacagaaa
gaagaaggcaatgatattgctaaagcccaaactagtttgggaacaattcaaaatgtattg
ggtttaactgaacgtggtattgtattatccgcaccacaacttgataagctattgcaaaaa
aataaagtaggtcaagcattaggttcatctgaaagcattgcgcaaaattttagccaagca
aaaacagtattatctggagttcaatcaattctaggatctgtattagctggtatggattta
gacgaagcattgcagaatgagagcgatcaacttactctggctaaagctggtttagagtta
actaactcattgattgagaatattgctaattcagtacaaacacttgatgcctttagtgag
caaatcagtcaatttggttctaaattacaaaatgtaaaaggtctaggagctttaggggat
aaactcaaaaatatcggtggacttgataaagctggtcttggtttagatgtcatttcgggt
ttattatcaggtgcgactgcagcacttgttcttgctgataaagatgcttcaacagctaaa
aaggtaggagcaggctttgagttagcaaatcaagtagttggtaatattacgaaagcagtt
tcttcatatattttggctcagcgtgttgcagcaggattatcctctacgggccctgttgct
gctttaatagcctcaactgttgcacttgctatcagtccattatcgtttgcgggtattgct
gataaatttgatcgagcaaaaagtttagaaaactatgctgaacgttttaaaaaattaggt
tatgaaggtgatagcttattagctgaatatcaacatggtacagggactattgatgcatcc
gtcactgcaatcaatacagcattagctgctattgctggtggtgtgtctgctgctgccgct
ggctctgtggttgcttcccctatcgctttactagtatcgggtattactggtgtcatttct
acgattttacaatattctaagcaggcaatgtttgaacatgtggcgaataaaattcataat
aaaattgtagaatgggaaaagaataatggtggtaaaaactactttgaaaatggttacgat
gcccgttatcttgcgaatttacaagataatatgaaattcttattgaacttaaataaagaa
ttacaagccgagcgtgtaattgcaattactcagcaacaatgggatagtaatataggtgat
ttagctggtatcagtcgtctaggtgaaaaagtacttagcgggaaagcctatgttgatgcc
tttgaagaaggtcaacatcttaaagcggataaattagtgcaattagattctgcgaaaggg
attattgatgttagtaacactggagaagcgaaaacacagcatattttattccggacaccg
ttattaactccgggaacagaaaaacgcgagcgagtgcagacgggtaaatatgagtatatt
actaaacttcatattaaccgagtagatagctggcaaattaaagatggcgcagcgagctca
acatttgatttaacgaatgtcgttcagcgaattggtgttgagttggatcatgctgagaat
gttattaaaaccaaagaaacgaagattgttgcaacattaggtgatggcgatgacaatgta
tttgttggctcaggtactacagaaattgatggtggtgaaggttacgaccgagttcactat
agccgcggaaactatggtgctttaactattgatgcaaccaaagagaccgagcaaggtagt
tataccgtaaatcgtttcgtagaaagcggtaaagcattacacgaagtgacttcaactcac
accgcattagtgggcaaccgtgaagaaaaaattgaatatcgtcatagcaataaccagcac
catgccggttattacaccaaagataccttgaaagctgttgaagaaattatcggtacatca
cataacgatatttttaaaggtagtaagttcaatgatgcctttaatggtggtgatggtgtc
gatactattgacggtaacgacggcaatgaccgcttatttggtggtaaaggcgatgatatt
atcgatggtggaaatggtgatgactttatcgatggcggtaaaggcaatgacctattacac
ggcggtaaaggtgatgatattttcgttcaccgtcaaggcgatggtaatgattcaattact
gaatcggaaggtaatgataaattatcattctctgactcaaatctaaaagatttaaccttt
gagaaagtaaatcaccaccttgtgattactaataccaagcaggaaaaagtcaccattcaa
aactggttccgtgaagcagagtttgcaaaaacaattcaaaattatgttgcaacaagagac
gataaaattgaagagattatcggtcaaaatggtgaacggattacctcgaagcaagtggat
gaacttatcgaaaaaggtaacggtaaaatcgctcagagtgaactgacaaaagttgtggat
aactatcaattactcaaatatagccgagatgcatcaaacagtttagataagttaatctca
tctgcaagtgcatttacctcgtctaatgattcgagaaatgtattagcgagcccaacttca
atgttggatccgagtttatcttctattcaatttgctagagcagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
