Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii: BVwin_11880
Help
Entry
BVwin_11880 CDS
T02470
Name
(GenBank) autotransporter
Organism
bvn
Bartonella vinsonii subsp. berkhoffii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGF76278
LinkDB
All DBs
Position
complement(1399258..1402374)
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MIKVFRNHAYLCIITTAILSLLQNGITVGASANKRSDTSYKITVTPLFSKYFSNSPDIIS
RFVKEETFGYNILRGSNKVLKGESGERGSSSLGSENLSLNNGAGVLSGHTDYQSLNGERG
DNGYAYIKYDQLRRKLILYDGGLYYLCDGCGMHTINEGFDGVYEITNKNVSRYLSNSTAV
MVKGTDTKVHGKNITVSSQVPGRIFQYGVSVTEKGNVVLKSLSIKNAQVALHASDGIIEV
DGGTISESQMAVQAIGTSTNVILNKVKIETNSGKASLYSYDGAEIKMKDGSIEFMDSHGV
SSTLDGKVSFDNVTITGKSSKDKSHAVFLMDVGGSVNFKGTISAMNVHGILSENTVNTFN
SVPLPEHLLKRNRMAEVNLASSSVTVNGETSYGIYFRGEKPGEKFESRENLEEEKNTPRL
EAVNIRRTTFSVPDSIALYSTDGTYGVVNLMQSTLSGRSLLRAERGALVKVLASASTLEG
RASVDDRSTAELYLGAGSTWILKQKQERDSRESGLTNDSSVSFLLLMNESSVKFKKLKSS
STYDYQILHIGDGTGTVYKAQDGAHIYLNTYLNEGGSHGNQKTDRVLIHGDVEGTTTVHV
RSMPGSPGGYTGNGGNNQGISIIQVSGMANQNSFQLDGGYVTAQHLPYQYMLYAYGPESD
LGEAYPDQRLVKGDGKFWDFRLENRYIKPSPEPRPEPGPRPGPSPEPTPPPRPDSGVKAV
VPQVPTYLLLPNALFHTGLMHVGNQGKRLEALRIASGGLLKSDENPAFFVGGYGGSHRYV
SNLSALEYGYGGELDYNAIEAGILLKTIEGESSSTSFGVIGTYERLSLQPLDVEQSQKSA
FDKWSVTAYGGLRCDTDFYVDGLLSYGLFKGDVHTLARGKTATLKGKPLSASVTVGKMFM
IGYEGFVVGPQVQVVYQHLHFDKTRDIDDFNIDMGKLDQWVARVGGRLTKTLSATDEARV
VSFYSKLYLSHGLGDKKFVHFKDAFQLGAFGSSLEAGLGFNAKLSQKFALHGDLSYQHKL
TKAGFSGASFSGGVRYQF
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaagtgtttagaaatcatgcgtatttatgtattatcacaacggctattctttct
ctcctacaaaatggaataacggttggtgcaagtgcaaacaagagaagtgatacgtcttat
aagatcaccgttactcctctgttttctaagtatttctctaattcacctgatataatttct
cgttttgtgaaggaggagacgtttggttataatattcttcgcggaagtaataaggttctt
aaaggagaaagcggagagagggggtctagtagtttaggatctgagaatctctctttaaac
aacggagcaggtgtgcttagtgggcatactgattatcagagtttgaacggggagagggga
gataatggatatgcttatattaaatatgatcaactccgtaggaaattgatattatatgat
ggaggtttatattatctgtgcgatggatgcggaatgcacacaattaacgaaggatttgat
ggggtttatgagattacgaacaagaatgtttcccgatatctctctaattctactgctgtt
atggtaaaggggacggatacgaaagttcatggaaaaaatataactgttagcagtcaggtt
cctggtcgaatctttcaatatggtgtgtctgtaacagagaaaggcaatgttgttttgaaa
tcgctaagcatcaagaatgcgcaggtagctcttcatgctagtgatggaataattgaggtg
gatggtgggactattagtgaaagtcaaatggctgttcaagcaataggaacttcgacgaat
gttattttaaacaaagtaaagattgaaacaaatagtggaaaggcaagcctttatagttat
gacggtgcagaaattaaaatgaaagacgggtcaatagaattcatggatagtcatggggtt
tcttcaacgctagatggcaaggtatcttttgataatgttaccatcacgggaaagagtagt
aaagataaaagtcatgctgtttttttaatggatgtaggtggttctgttaattttaagggt
actattagtgctatgaatgtccatggcatattatcagaaaatacagtcaatacttttaat
tctgttccgttacctgagcatttattaaagcgtaatcgtatggcggaggttaatcttgca
tcctcttctgttacagtgaacggagagacatcatacggtatatattttcgaggagaaaag
ccgggcgaaaaattcgagagtagagaaaatctagaggaggaaaaaaatacacctagattg
gaggctgttaatataagaagaacgactttttcggttccagacagtatagctctttatagt
actgatggtacttatggtgttgttaatttaatgcaaagtaccctttcagggcgttcattg
ttaagagctgagaggggggctttggtgaaagttttagccagtgcctctacccttgagggg
agagcctctgttgatgatcgttctaccgctgagctctatttgggtgctggttcgacatgg
attttaaaacaaaaacaagagagagattcgcgtgaatctggtcttacaaatgattcatct
gtttcatttttgctccttatgaatgaaagttccgttaagtttaaaaaactgaaatcatct
tcaacttatgattatcaaatactccatattggagatggaacgggcaccgtttataaggcg
caagatggggcgcatatttatttgaacacatatctgaacgagggtggttcgcatggtaat
caaaagaccgatcgtgttttaatacatggtgatgttgagggaacaacaacagtccatgtg
cgcagtatgccaggaagtccaggaggatacacgggaaatggtggaaataaccaaggtatt
tcaatcattcaggtttctggaatggcaaatcaaaattcttttcagttggatggcggttat
gttacggcgcagcatttaccttatcagtatatgctctatgcttatggcccagaatccgat
ttaggggaagcatatcccgatcaaagattagttaaaggtgatggaaaattttgggatttt
cgcctcgaaaatagatatattaagccttctcctgaacctcgtcctgagccagggcctcgt
cctggaccgtctccggaaccaactccgccacctcgccctgattcgggagttaaagcggtt
gtaccgcaagttcctacttatctgcttttgccgaatgccttgtttcataccggtttgatg
catgttggcaatcaaggtaagcggttagaagctttgagaattgcttctggagggctattg
aaaagtgatgaaaaccctgccttttttgtgggcggttatggtggtagtcatcgttatgtt
tcaaacctttctgcgcttgaatatggttatggaggtgagcttgattataatgcaatcgaa
gcaggtattttactgaaaacaatcgagggtgaatctagtagcacctcttttggggttata
ggaacttatgagagactttctttgcaacctttagatgttgaacaaagccaaaaaagtgct
tttgataaatggtcagttacagcttatggcggtctgcggtgtgatacggatttttatgtg
gatggtcttttatcctatggtttgtttaagggtgatgtccatactcttgcacggggcaaa
acagcaacattaaagggaaaacctctcagtgcttctgtgactgttggtaaaatgtttatg
atagggtatgaaggctttgttgttggtccgcaggttcaggttgtttatcaacatctccac
tttgataagacccgtgatattgatgactttaatatcgatatggggaaacttgatcaatgg
gtggcacgtgttggtggacggctaaccaagacgcttagtgcaaccgatgaggcacgtgtt
gtttccttttatagtaagctttacctttcgcatggattgggagataagaaatttgtgcac
tttaaagatgctttccagttaggagcttttggttcttccctagaagcgggattgggcttt
aatgctaagttatctcaaaaatttgcccttcatggtgatttgagttatcaacataaactg
accaaggctggtttttctggagctagtttttctgggggagtgcgttatcagttctag
DBGET
integrated database retrieval system
