Calothrix sp. NIES-2098: NIES2098_66020
Help
Entry
NIES2098_66020 CDS
T08374
Name
(GenBank) WD-40 repeat-containing protein
Organism
caln
Calothrix sp. NIES-2098
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHASE2
nSTAND1
TPR_12
RsgA_GTPase
AAA_16
TPR_9
TPR_17
MFD_D3
P4Ha_N
NB-ARC
DUF4485
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAY13407
LinkDB
All DBs
Position
complement(7906269..7911152)
Genome browser
AA seq
1627 aa
AA seq
DB search
MSEQQINNDRSLQQLAWAIQASVGQFKLILAKCNYLQQRDRLIARLQEISAVKISVLVLK
PSQRTLYTAIREECGDDIQALTILGLEKLQDLPQMLIAANQVREEFRKNLPFPIVLWVND
EIHTQMMQLAPDLESWATTKKFAITINELTNFLQQTASQLFDNILNINLELIAEIQSAWQ
ELQVWTQDLTPELKANCDFVLGLVAYINKNLDAAIEHYNQSWDYWQTNNDFERQGKILTQ
ITICYYEKARADDRNHPYVRNHEAVDAAFDSIAATFRVSAVNQETITNYLQQTIAAFQAA
QRPDLIANSLDQFGIILRYLEDWQQLKTLAQQALIVHEAENNTLKISQDYSFLAETELAQ
QHWQPAQKLAETALKFLSTTHQPVPLELSPINVIAHQQKLLLIIAQAQDNLAQCQAAINN
LEQARKLSITDNDPQLYLSILANLHSIYFEQKQYLKAFDAKLEARSIEQQFGLRAFIGAG
RLQATKQLDTQVLAALQIDNQDNIAPEIAASGRQLDVERVIERIGRPDYKLIVIHGQSGV
GKSSLVNAGLIPALKRKAIGVQDNLVVAIRVYTNWVEELGRVLQDREDKGDKERSRSAGF
RRSELRRDKGELRRRNSGSEGDNSGFLPDSSSSEGESSSSEHDTPSFLLDNPSSEHDNPS
FLLDTPSSEHDNPSFLLDNPSSEHDNPSFLPETPSSEHDNPSFLPETPSSEPQTSPSPLS
SRSSDRRFPPFRLLSLSPLSPLSPSPPVLLAQLRNNEQRNLRTVLIFDQFEEFFFVYPEP
KQRRQFFEFLGECLNILSVKVILSLRVDYLHYLLECNRLASLKIIGNDILSNNVLYELGN
FSPDDAKAIIQRLTQNTSFYLEPALIDKLVQDLAGEVGEVRPIELQVIGAQLQTENITTL
AKYQELGGNAKEELVKRYLAEVVDDCGVENQQAAELLLYLLTDEKGTRPLKTRTELERDL
QALVADVAADSNKLDLILEIFVKSGLVVLLPENPADRYQLVHDYLAAFIRQQQEPKLKQV
MAELEEERKQRKISEDKLLIFEQRQQANQTLSIAQARAKQEALPRKIFPDWKEIFGAITF
ICIIIILRSLGLLQLLELAGLDQLFLLRPKEPVDERIVIVEINEPDITKLKQWPINDEIL
SNVLIKIKQQKPIAIGLDIYRDLPLDPGHQKLVKVFETTPNLIGVQKVSESSNSFSVGSP
PELRKRNQVGANDFPLDKDAKIRRALLYAGLKDGSNLESFGLKLALLYLQPQGITEKPAA
NNPNYLQLGKGIFPYFETNDGGYVGANAGSYQILLNYRGTINRFPVVSINDVLENRISQN
LMRGKIVLIGATSESLNDLFWTPYSSKIFGTPERMPGVAIHANLISQILSSALEGRPQIK
TLSEPIEWLWILVWSIVWSIVGSTLVVTSLYWQQKYSRLPLILLIANNTSSIVIVGGCGC
LLGGSYLAFLSGWWLRFVPSILSLVGSVIITAIINKILTKNRLEKFQFPRTLELIFEICS
TNPVVGCLSIEYLITATQKPEITTQSLSSIAVSALASCKNPDEIAPMVLFTCDKAVTQAP
NNCKIRDSRGIARALTGDYQGAILDFEAYIAQTKDKDSRARRQRWVKDLKADKNPFTDDE
LKRLRNQ
NT seq
4884 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgaacagcagataaataacgatcgctctttgcaacaattagcttgggcaattcaa
gcttctgtcggacagtttaagctgattttggcaaagtgtaattatctgcaacagcgcgat
cgcttaattgccagattacaggaaatctctgctgtcaagattagcgttttagtactcaaa
ccatcacaaaggacactttacaccgccattcgtgaggaatgtggggatgatatccaagct
ttaacgatcctggggttagaaaaattgcaagatttgccccaaatgttgattgctgctaat
caggtgcgggaggagtttcgtaaaaatctccccttcccgattgtgttgtgggttaacgat
gaaattcacacacaaatgatgcaattagcaccggatttagagagttgggcaaccaccaaa
aaatttgcgattactattaatgaattaactaattttcttcaacagacagcatcacaatta
tttgacaatattttaaatatcaatttagaacttattgcagaaattcaatcagcttggcaa
gaattacaagtctggacacaagatttaacacctgagttaaaagcgaactgtgattttgtc
ttaggcttagttgcatatatcaataaaaatcttgatgcggcgattgagcattacaatcaa
agctgggattattggcagacaaataatgattttgagcgtcaaggaaaaatacttacacaa
attactatttgctattacgaaaaagcgagagcagatgacagaaatcacccctatgttaga
aatcatgaggcggtggatgcagcgtttgatagtatagccgcaacctttagagtgtcggcg
gtgaatcaggaaacaattaccaattatcttcagcaaactattgccgcatttcaagccgcc
caacgccccgatttaattgccaattctctagatcaattcggcattattctgaggtattta
gaagattggcaacaactcaaaactttagctcaacaggctttaattgttcatgaagccgag
aataatactctaaaaatatctcaggattatagctttttagcagaaacagaattagcacag
cagcactggcaaccagcccaaaaattagccgaaacagcattaaaattcttatctacgact
catcagcccgtaccactggaattatcgccgataaatgtcatcgctcatcagcaaaagtta
ttattaatcatcgcccaagcacaagataatttagcacaatgtcaagcggcaattaataat
ttagaacaagctagaaaattaagtattacagacaacgaccctcagctttacttgagtatt
ctcgctaatttacacagcatatattttgagcaaaagcaatatcttaaagcatttgatgcc
aaactagaagcccgttccatcgagcagcaatttggtttgcgggcgtttattggtgcaggg
agattacaagcgacaaaacagttagatacccaagttttagcagcgttacaaattgataat
caagataatattgccccagaaatcgccgcatctggccgtcaattggatgtagaacgggta
atagaacgcatcggtcgcccggattataaattaatcgtcattcatgggcaatcgggtgta
ggtaaaagttccttagttaatgcgggactgattccggctttgaaacggaaagcgattggt
gtgcaagataatttagtcgttgctattcgcgtgtataccaactgggtggaagagttgggg
cgagtgttgcaggacagggaggacaagggagacaaggagagaagtcggagcgccggcttc
cggcgatctgaacttcggagggacaagggggagttaagacgtagaaattcgggttctgaa
ggcgataattctggttttttacctgacagttcgagttctgaaggcgaaagttcgagttcg
gaacacgacactccgagctttttactcgacaatccaagttcggaacacgacaatccaagc
tttttactcgacactccgagttcggaacacgacaatccaagctttttactcgacaatccg
agttcggaacatgacaatccaagctttttacccgaaactccgagttcggaacatgacaat
ccaagctttttacccgaaactccgagttccgaacctcaaacttccccttctcccctgtct
tcccgaagttctgatcggaggtttcctccgttcagacttctctccttgtctcccttgtcc
cccttgtccccctcaccacccgtccttctcgctcaactgcgaaacaacgaacaacgcaac
ctgcgaactgtactaattttcgaccaatttgaagaatttttcttcgtttacccagaacca
aaacaaagacggcagttttttgagttcctgggagaatgtcttaatatcctctctgtaaaa
gtgattttgtcactgcgggtagattacttgcattatttgctggaatgcaatcgccttgcg
agtctgaagattattggcaatgatattctcagcaataatgtgctttatgagttggggaat
ttttcgcccgatgatgctaaggcaattattcagcgcttaacccagaatactagcttttat
ttagaacctgcgttaattgataagctagttcaagatttagctggggaagtgggagaagta
cgcccgattgaattgcaggtgataggggcgcaattgcaaaccgagaatattacaactttg
gcgaagtatcaagaattagggggtaacgctaaagaagaattagtgaagcgctacttagca
gaggtggttgatgactgcggtgtagagaatcaacaagcggcggaattgttgctgtatttg
ctcactgatgaaaaagggactcgccccctgaagactcgtactgaactagaacgggattta
caagcattagtggcagatgtcgccgcagatagcaataaattagatttgatcttagagatt
tttgtcaaatctggcttagttgttttattaccagaaaaccccgcagaccgttatcaattg
gtgcatgattatttagccgcctttatccgccagcaacaggaaccgaagttaaagcaggta
atggctgaactggaagaagaaagaaaacaaagaaaaatcagtgaagataagctcctcatt
tttgaacaacggcaacaggctaaccaaacactttctattgctcaagcaagagcaaaacaa
gaagctttacctcgcaaaatttttcctgattggaaagaaatatttggagccataacattt
atctgcataattataatcttgcgctctttagggttattacagttgttagaattggcaggt
ttggatcaattgtttcttttacgtccaaaagagcctgttgatgagcgtattgttatagtt
gagattaatgaaccagacatcaccaaattgaagcagtggccgatcaatgatgaaatactt
tctaatgtcttaattaagatcaagcagcaaaaacctatagcaataggtcttgatatttat
cgagacttacctttggatcccggccatcaaaaattagtaaaagtatttgagactacgccc
aacttgattggggtacaaaaggtatctgaaagttctaatagtttttctgttggttcgcct
cccgaactcaggaaaagaaatcaagtaggagcgaatgattttcccttagataaagatgcc
aaaatccgtcgagcattgctatacgcaggtttgaaagatggtagcaatcttgaaagcttt
gggctgaaattagcattattgtatttgcaacctcaaggaattactgaaaaacccgcagca
aataatcccaactatttgcagttgggtaaaggtatttttccttattttgaaactaatgat
ggtggttacgtgggggcaaatgcgggtagttaccaaatactcttaaactaccgagggaca
attaatcgtttcccagtagtatctataaatgatgtgttagagaatcggatttcacaaaac
ttgatgcgaggaaagattgttttaattggtgctacatctgaaagtttgaacgatcttttt
tggacaccttatagcagtaagatatttggtacgccagaacgtatgcctggtgtcgcaatt
catgcgaatttgattagtcaaattttgagttcggctttggagggtcgtccacaaatcaaa
actttatctgaaccgatagagtggttgtggattttagtttggtcaatagtatggtcaata
gtagggtcaacactagttgttacttcgttgtattggcaacaaaaatatagtagattgcct
ttaattcttttaatcgctaataatactagtagtatcgtcattgtaggtggctgtggctgt
ttgctgggaggaagttacctagcttttctttctggttggtggttacgattcgtaccttca
attctttcgctagtgggttctgtaattatcacagcaattattaataaaatactaaccaag
aatagattagaaaaatttcaatttccccgtactcttgagttaatttttgagatttgttct
acaaatcctgttgtcggttgtttatcaattgagtacttgattactgcaactcaaaagcca
gaaattactactcaatctctaagtagtatcgctgtaagcgctttggccagttgcaaaaat
ccagatgaaatagcacctatggtgttatttacctgtgacaaagcagttactcaagcacca
aataattgcaaaattcgtgatagtcgtggtatcgctagggcgctaacaggcgattaccaa
ggggcaattttagattttgaagcctacatcgcccagactaaagataaagatagcagagct
agacggcaacgctgggtaaaagacctcaaagcagataaaaatcctttcacagatgatgaa
ctgaaacgcttgcggaatcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
