Campylobacter fetus subsp. testudinum 03-427: CFT03427_1115
Help
Entry
CFT03427_1115 CDS
T02899
Name
(GenBank) autotransporter domain protein
Organism
camp
Campylobacter fetus subsp. testudinum 03-427
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGZ81974
LinkDB
All DBs
Position
complement(1134282..1138457)
Genome browser
AA seq
1391 aa
AA seq
DB search
MSDTSGATHKLLLATSLVLINSLFAGEIVTYDYSGGGSTPGTAPSTITINGVQLSNAIAP
SDKSPSDNVVTILSTDSSDVNYAFGGYSKSENVENNTVNISGGTIGKDIYGGHSQIGSAN
LNTVNISGGTINKFVYGSFSNSRSANLNTINISGGDIRENIYGGYSEIKSGSANSNTVNI
SGGTISKNVIGGHSYSGSATKNTVTISGNPTFEANTIIVGGHKDSGSGDVTTDNTLNIKT
SKLNVKNIANFEFINFYLFDDASKSSSILNLTSTSNTDISASKLSIGLMDNGNTPDLKVG
DQIILIGKSSDSYTGIPNTVADDSLYKFDISKDGNNIIATLKNEVLVYNPENAEFKGVIH
KSNTTPGTITINTHDIDNTIAPNSASPSDNVISIYSTNNDVEYIYGGYGDGKSTTTSNNV
VNLYGGVIKFDIYGGYAAGNDNKANSNTINISGGTIERDILGGFSISGTATNNTINISGN
PTFGDTVIHGGFAGSGDATTGNTLNIKTSNLSVKDIINFKNINFYLDNGIKADDTLLTLS
GIGPTDISSSNITVGVKQGDTPTLKVGEEITLINRSNNTINLPANMMNSAIADMNSSYTF
TLGGAPKDTTTADISKLVAVFGVTTYNPGNVAAANGTIYYSNTALASGSIKPNGLNDNIV
NIYSTSSKVDNVFGGYSDTQNVERNTVNIYGGTIDDIYGGSGSYLVNLNTVNISGGTISG
NIYGGDSTSGSSDSNTVNIYDGTIGKNVFGGSSTSGSSDSNTVNIYDGTIGKNIYGGYSY
SGSSSVNLNTINISGGIINNNIFGGYSDSGSANLNTINISGGTINHDIYGGNSSSGSANL
NTINISGGTISGNIYGGNSSSGSSNLNTITISGNPTSGNPTFGTDTIIYGGNKGSTGNTL
NIKTSNLEVKDIANFEFINFYLDKSIKANDTLLTLSDDTKTGPTDLSNSKIGVGAIRGDT
PVLSSNDKIILIDKPNGSLISPNDMSNNMQVMQGISNSYEFTLSTVNSGGDIKQIVASLT
PPSTPVIIPPPPYVPPTPITPVEPKPPVEPEVPVIPTEPDPAEPVIEPEVPVQPVTPYTI
NEKQKAVLEGGFVSSLMLNNSNQALESGLQDMSQALNASGANETSIGNTNVSSTRNKTGS
HVDVKSISLLVGFAKKANDSFMYSAFFEAGFGNYDSYNNFSTGDIKGSGDSSYYGFGVLS
KFDMINNYYFENSLRVGQIKSDFSSDDFGIATPISSSFDSKRYYIGAHIGLGKVINLNNS
SNLDIYTKVFYTRVDSEDITMSTNDRFRLDAINSVSAKLGFLYNYELKENLSLYSGASFS
KEFNAEAKGRNISYNYDLDSPSMKGNTRSLEAGIKLKPISNNDKLSLDLGIVGLVGKSEG
VSGKFGFKWKL
NT seq
4176 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgacacgtcaggagcaacccataaactacttttagctacaagtttagttttgata
aacagcctatttgccggtgaaattgtgacttatgattattctgggggggggtcgacccct
ggtactgctccaagcactattacaattaatggagttcaactttctaacgctatagctcca
agcgataaaagtcctagcgataacgttgtaaccatacttagcaccgacagctcagatgta
aattatgcttttggtggatactccaagagtgaaaacgtagaaaacaacactgtaaatata
tctggtggaactataggaaaggatatctatggaggtcatagccagatcggttcagcaaat
ttaaataccgtaaatatctctggtggaactataaataaatttgtatatggtagttttagc
aattcacgttcagcaaatttaaataccataaacatctcaggtggagatatacgtgaaaat
atctatggtggttatagcgagatcaaatcgggttcagcaaattcaaatactgtaaatata
tctggtggaactataagtaaaaatgtcattggcggtcatagctattcaggttcagcaacc
aaaaacactgtaactatctctggaaatcctacttttgaagctaacaccataatcgtcggc
gggcataaagatagcggtagtggagacgtaaccacagacaacactctaaacataaaaact
tcaaaattgaatgttaaaaatatagcaaattttgagtttataaatttctatctctttgat
gatgcaagtaaaagcagttctatactaaatttaactagtacttcaaatactgatatatca
gcttctaagctatctataggacttatggacaatggaaacactcctgatctaaaagtaggt
gaccagataatcctcataggcaaatcaagcgatagttatacaggaattccaaatacagtc
gcagatgatagtttatataaatttgatatcagcaaagacggtaacaatataatcgctacc
ttaaaaaacgaagtattggtttataatcctgaaaatgcagagttcaaaggagtaatacat
aaatcaaataccactccagggacgattacaattaatacgcatgatattgataacactata
gctccaaatagtgcaagtcctagtgataacgttataagtatatatagtacaaataatgat
gttgagtatatctatggtggttatggcgatggaaagagcacaacaacaagcaataacgtt
gtaaatctttatggcggagttataaaatttgatatctatggcggttacgctgctggtaac
gataacaaggcaaattcaaatactataaatatctctggtggaactatagaaagggatatc
cttggtggttttagcatttcaggtactgcaactaacaacaccataaatatctctggaaat
cctacttttggcgataccgtaatccacggtggatttgcaggtagtggagacgcaaccaca
ggcaacactctaaacataaaaacttcaaatttgagtgttaaagatataataaactttaag
aatataaacttttatttagataatggtataaaagcagatgatactttactaactttaagt
ggtataggacctacagatatctcaagttcaaatataacagtaggagtaaaacaaggtgat
actccaacactaaaagtaggtgaggagataactcttataaatagatcaaacaacactata
aatttacctgcaaatatgatgaattcagctatcgcagatatgaatagttcatatacattt
actcttggaggagcaccaaaagatacaactactgctgatataagcaaactagttgctgtt
tttggtgttacgacttacaatccaggaaatgtagcagctgcaaatggaactatatattac
tcgaatacagctctagcaagtggtagtataaagccaaatggtcttaatgataatatagta
aatatatatagtacaagttcaaaagttgataacgtctttggcggatactctgatactcaa
aacgtagaaagaaataccgtaaatatctatggaggaactatagatgatatctatggtggt
agcggttcatatttagtaaatttaaataccgtaaatatctctggtggaactataagtgga
aatatctatggcggtgatagtacttctggttcatcagattcaaatactgtaaatatctat
gacggaactataggtaaaaatgtctttggcggtagtagtacttctggttcatcagattca
aatactgtaaatatctatgacggaactataggtaaaaatatctatggcggttatagttat
agtggttcaagttcagtaaatttaaataccataaatatctcaggtggaattataaataac
aatatttttggcggttatagcgatagtggttcagcaaatttaaataccataaatatatct
ggtggaactataaatcacgatatctatggtggtaatagcagttcaggttcagcaaattta
aataccataaatatatctggtggaactataagtggaaatatctatggtggtaatagcagt
tcaggttcatcaaatttaaatactataactatctctggaaatcctacttctggaaatccg
acttttggaactgataccataatctacggtggaaataaaggctccacaggcaacactcta
aatataaaaacttcaaatttagaagttaaagatatagcaaattttgagtttataaatttc
tatttagataaaagtataaaagcaaatgatactttactaactttaagtgatgatacaaaa
acaggacctacagatttatcaaactcaaaaataggagtaggagcgataaggggagatact
ccagttttaagctcaaatgataagataattcttatagataaaccaaatggaagcttaatt
tcacctaatgatatgagcaataatatgcaagtaatgcaaggtataagcaactcatatgaa
tttactcttagcactgttaatagtggtggtgatataaaacagatagtagcttctttaact
ccaccctccacgccagtaataattcctcctcctccttatgtacctccaacacctataact
ccagtagaacccaaacctccagtagaacctgaagttccagtaatcccaactgaaccagat
ccagctgaacctgtgatagaacctgaagttccagtccagccagtaactccttatactata
aatgaaaaacaaaaagcagtacttgaaggaggatttgtaagttctcttatgctaaataac
agcaatcaagccttagaatcaggactacaagatatgagccaagctctcaatgctagtggt
gcaaatgaaacaagcataggaaatactaatgtaagctccactagaaataaaacaggctct
cacgtagatgtaaaaagtataagcttactagtaggatttgctaaaaaagcaaacgatagc
tttatgtatagtgcgttttttgaagctggatttggtaactatgatagttataataacttt
agcactggagatataaaaggaagtggtgatagctcatactatggatttggagttttaagt
aaatttgatatgataaataactactactttgaaaactctcttagagtaggtcagataaaa
agcgactttagtagtgatgactttggtatagctactcctattagttctagttttgattct
aagagatactatataggagctcatataggactaggtaaggtaataaatttaaataactca
tcaaatttagatatctatacaaaggtattttatacaagagttgatagtgaagatataact
atgagcacaaacgatagatttagacttgatgctataaactcagtttctgctaaactaggc
tttttgtataactatgaactaaaagagaacttaagtttatatagtggagcttctttttct
aaagagtttaacgcagaagccaaaggacgaaatatcagctataactatgacttagactct
ccaagtatgaaaggaaatacaagaagtctagaagcaggtataaaactaaaacctataagc
aataacgataaactaagtcttgacttaggaattgtaggcttagtaggtaaaagcgaggga
gtgagtggtaagtttggatttaaatggaagttgtga
DBGET
integrated database retrieval system
