Saccharobesus litoralis: C2869_22315
Help
Entry
C2869_22315 CDS
T05408
Name
(GenBank) pectate lyase
KO
K01728
pectate lyase [EC:
4.2.2.2
]
Organism
cate
Saccharobesus litoralis
Pathway
cate00040
Pentose and glucuronate interconversions
cate01100
Metabolic pathways
cate02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cate00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
C2869_22315
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
C2869_22315
Enzymes [BR:
cate01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.2 pectate lyase
C2869_22315
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pectate_lyase_4
Pectinesterase
Laminin_G_1
Laminin_G_3
DUF6250
3keto-disac_hyd
Laminin_G_2
DUF6618
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWB69237
UniProt:
A0A2S0VYD9
LinkDB
All DBs
Position
unnamed1:complement(175539..181739)
Genome browser
AA seq
2066 aa
AA seq
DB search
MKYKLSILSSVIGAALVTGCGFESEQNVSDIEVTSLKGTFLDNTVAGINYRRTNINGEVI
EGVTADDGTYDYVRGETIEFYVGEVSLPIVPAKSIITPLSFFKTDNPHAENVANVARFLQ
SLDSDADPSNGISIYASAAAVAKVNNDSNGQPLTADAFFSQSADSFAAAVETWLAQATDN
TRSKLVSYDEAIEHFVGVLGSELGEYKPQAFDPALLTGEISNVFADKGMVNVQVFTFTPD
EEGASAGQFSLTQADDAVVSGRYQLNSSRQVLTLQEIAADQVVNSHYFVSLASNSDQTEY
SLCYASQDDLATGTGIQTLISQCETENEQRINKFVLNSDAVATTVEAMTEIASTIGLPEP
ALLEEFELSSVNEFFSSNYKRLGESLSSGALYFKTGGTIELVDGQLVLAGDRFSIGNTTP
DVATTSADTKGTGIYNLSEGFTISFDVIDHGGAGSLNIYADNNTTSSGNSMHGGDSKFIG
LSINDENLPKGQRFEYSHPGFAATTNSFLQLRTDSKGSITIDNLRIETVAGEVVKEAYEP
QTFSCSNEPSLYFCDDFASGSLDNWDIFATDGNTSGPEGVFDVLDANGNQVMRYTAGSLG
GVLTTVKDSALANVPDGDYFVEAKIRPRQNGTTASKHLYLLGRYVDAQNWYAGGLNMQNS
PASTQAEIATKIADSLSRPVQKKQAFVLGERDATDDGIWYTVRLSMSGSDLTLYVNGEEK
GTYTDSNFTAKGLAGIYTYNRSFELDDFKIGAASEKPISIATDLNDNVLNAGVNGDSISF
NVNALMGDGSAETVTVHSGDGDIAKVSIDGAVVTVTPLEEGQTTIYLVSSSDPSIYHPVD
IVVAPQFVDSSTDYGDLSGKLTPAIDESSAYIDTLLTLEFDSAPTLGEKGLVRIFNASTN
EMVDELNVAGDVDTITSERDDKFRTLQYQSVYVDGNKLVIKPHHGVLEYQTNYYVVIGND
VVVNTQLNGIDFDGLGSASMWSFTTKAIAPTGTNIIVDDNGTDADFRTLQGAMAYAMQDK
NSAMTIWLRDGIYTELLYLRDKHNLTIQGESRDNTIVQYANYEGLNGGSSGRPVFLVEGS
DNLVLNNFTLKNSHMRTGSGDQAETIYFNGPGRRLVANNMNFISEQDTLQLKGYVWIYNS
LVSGNVDFIWGYPEAALFENSEIRTIGRSEKAPDDSEGGYILQARVQEDFKDNAGFVFLN
NDFTSGVGPKGNGVLDNSTFIARSSGSDSYYDNVLLINNKLGSHINTSGWATQSTTGGEQ
PDPNPTQASATMGWREFASMDLTGSALDLTGRDPAASVLTTAPYSSRAEVFAKFGDAGWD
PQPLAAPDFTQIPSDTPTVAAPAAGDGGFAGDSFTLNGGEGGTVVTVATGTALVAAIDSA
KKANTALTIYVDGTITAANTGNTTRNIAIKDINNVSIIGVANRGKLSGIGFQIERAQNII
IRNLTIHEVPASFGDAIGIEGDDNTPTRHIWIDHNELYGSLTVGKDDYDGLIDSKAGASH
ITVSYNYIHDHWKTMLNGSSDDDAGDRFITYHHNYFANINSRVPLFRYGYGHLYNNYFYN
IAGSAINSRMGAQLLIENNLFENVKNAIVSLASREKGYWYARGNSFVNVSYSSDSSFGST
EDSYSLSGDITGTYDDVPYDYSSHLLDINDVKAHVLTHAGVGKIDQSNDTIPALDGSGQP
GGNDGSGNTGGTTGAVDLSQGLVEDFAAADTATFFSNAYKTSAKDTNTALYHSYNDGDKV
ENGQLTMANARLTIGSLDGYSADTNQTDQPNGLFDFSHGATISFKLVAVSSYDNSKGTAD
QNKEKSLQIYIDNNTTGSANSLHQGASRIFKKKVSELTDPNDNQVGQTITIKTDLGTATS
FIQIRAEDGVEAVIDDLVITPTAPPVTNSVSEDFSATDSATFFSSSYAAQANDSSHALYV
KTGGSVEITNGQLVLGGDKGGRFTIGDTLGMVNGNLEVVATNGNTNPTGVFDFSQGVIVT
FDLIAIQQLDDADKSLIVYLDNNTSKSAESIHGGDSKKTVGKVALLSQNLGKQTIEFDIG
TATSFIQLRTESNVVATIDNLVITAK
NT seq
6201 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatataaattatcgattttaagcagtgtcattggcgctgcattagtaacaggttgt
ggctttgagtctgaacaaaatgtatcagacattgaagtgacgagcttaaaaggcacattt
ttagataacacagtggcaggcatcaattatcgtcgcaccaatattaatggtgaggtaatt
gaaggcgtgacagcggatgatggcacatacgattatgtgcgtggcgaaacgattgagttt
tacgtaggtgaggttagcttgcctatcgtgccggctaaatccattattacgccgctaagc
ttttttaaaacagataacccacacgcggaaaatgtcgcaaacgtcgcgcgttttttacag
tcgctcgacagtgatgctgatccaagtaatggtattagtatttacgccagcgcagcggca
gtggctaaagtgaataatgatagcaatggccaaccattaacggccgacgcgttttttagt
caatcagctgacagttttgctgctgcagtagaaacttggctagcgcaagccaccgacaat
actcgcagtaagttggtgtcgtacgacgaagctattgagcactttgttggcgtgctaggt
agtgaactaggtgaatacaaacctcaagcgtttgatccggcgttattaacgggtgaaatt
agcaatgtatttgctgataaaggcatggtaaatgttcaagttttcacctttaccccagat
gaagaaggcgccagtgcagggcaatttagtttaacgcaggccgacgacgccgtcgtttct
gggcgttatcaattaaacagcagccgccaagtattaacattgcaagagattgccgcggat
caagtggttaatagtcactattttgtgtctttagccagcaatagtgatcaaacggaatac
agtttgtgttatgcctcgcaagatgatttagcaacgggcacaggcattcaaaccttgatc
agccagtgcgaaactgaaaacgagcagcgcattaacaagtttgtgctaaacagtgatgcc
gtagcaacaactgttgaagccatgacagagatcgcctctactattggcttacctgaacct
gcgttactggaagagtttgaattaagtagcgttaatgagtttttctcgtctaactataaa
cgtcttggcgagtcgttaagctctggcgcgttgtattttaaaaccggtggcaccattgaa
ttagttgacggccaattagtgttggcgggcgatcgtttttctataggtaataccacgcca
gatgtggctactacctcggccgataccaaaggcacgggtatttataacttaagcgaaggc
tttaccattagctttgatgtaattgatcacggcggtgcgggtagcttaaatatctatgcc
gataacaacaccacgagttcgggtaattcaatgcatggcggcgactctaagtttattggc
ttgtcgattaacgacgagaacttgccaaaggggcaacgctttgaatatagccacccaggc
tttgctgccacaaccaactcattcttgcaattgcgtaccgacagtaagggtagtatcact
attgacaacttacggatcgaaacggttgctggtgaagtggttaaagaagcctacgagcca
caaacctttagctgtagtaatgagcctagcctgtatttttgtgatgactttgccagcggc
tcgttagacaactgggacatttttgctacagacggcaatactagtggcccagaaggtgtg
tttgatgtactggatgcgaacggtaatcaagtgatgcgttacacggcgggcagtttaggc
ggtgtattaaccacggtgaaagacagtgcgttagctaatgtaccagatggagattacttt
gttgaagctaagatccgccctagacaaaacggcaccacggccagtaagcatttgtacttg
cttggtcgttatgttgatgctcaaaactggtacgccggtggcttaaatatgcaaaacagc
ccagcgtcgacccaagcggaaatcgcgactaaaatcgctgattctttgtcacgtccggtg
cagaaaaagcaagcatttgtgttaggtgagcgagatgctactgatgatggtatttggtac
acagtgcgtttatccatgtcaggtagtgacttaactttatatgttaatggtgaagaaaaa
ggcacgtataccgacagcaatttcaccgctaaaggcttagcgggtatatacacctataac
cgctcgtttgaattagacgattttaaaattggcgcagcgagtgaaaagcccatttcgatc
gccactgatttgaatgacaatgtgctgaatgccggtgttaatggcgatagcattagcttt
aacgtaaatgcgttaatgggtgatggctcagctgaaaccgtcacagtgcattctggcgac
ggcgacattgccaaagtgagcattgatggcgcagtggttacggttacgccgttagaagaa
gggcaaaccactatttacttggtgtcgtctagcgatccgtcaatatatcatcctgttgat
attgttgtggcgccgcagtttgtcgactcaagcaccgactatggggatttaagcggtaaa
ttaacgcctgccatcgacgagagcagcgcgtacattgataccctattaaccctagaattt
gatagcgcgccaaccctaggtgaaaaaggcttagtgcgtattttcaatgccagcacgaac
gagatggtggacgaacttaatgttgccggtgatgttgacactattacctctgagcgtgac
gataagttccgtacattgcagtatcagtcggtttatgttgacggcaataaattagtgatc
aaaccgcatcatggtgtgcttgagtatcaaacaaactactatgtggtgatcggcaatgat
gtggtagtcaatacccagcttaacggtatcgactttgatggtttaggcagtgcgagcatg
tggtcgtttaccactaaggccattgcaccaactggcaccaatatcattgtagacgataac
ggcactgacgctgattttagaaccttgcaaggcgcgatggcttacgccatgcaagataaa
aacagcgcgatgaccatttggttacgcgacggtatttacacagaacttttatacttgcgt
gataagcataatttaaccattcaaggtgaaagtcgcgacaataccattgtccagtacgct
aactacgaagggttaaatggcggttcgagtggtcgtcctgtgttcttggtagaaggatca
gataatctagtactcaacaactttaccctgaaaaacagccatatgcgcaccggctcaggt
gatcaagctgaaaccatttactttaatggtccgggtcgtcgcttagtggcaaataacatg
aactttattagtgagcaagataccttgcagctgaaagggtatgtgtggatctataacagt
cttgtatcaggcaatgtcgactttatttggggttacccagaagccgcattgtttgaaaat
agcgaaattcgcaccattggccgctcagaaaaagcaccagacgatagtgaaggtggttat
attttacaagcgcgagtacaagaagactttaaagataacgccggttttgttttcttaaac
aacgattttactagtggtgttgggccaaaaggcaacggtgtgcttgataactcaacgttt
attgcgcgcagtagtggcagtgacagttattatgacaatgtactactgatcaataataag
ttagggtcgcacattaatacctctggttgggcgacgcaaagcactactggtggtgagcaa
ccggatccaaacccaactcaagcgagcgcgacaatgggctggcgtgaatttgccagtatg
gatttaaccggcagcgcgttagatttaacaggccgtgatccagccgctagcgtattaacc
actgcaccttatagctcgcgtgctgaggtttttgctaaatttggcgacgcaggttgggat
ccgcaaccattagctgcacctgactttacgcaaattcctagtgatacaccaacagtagcc
gcacctgctgcaggagacggtggatttgctggtgatagttttaccttaaacggtggtgaa
ggtggcactgtggttacggtggcaaccggtacggcgttagttgctgctattgatagtgcg
aaaaaagccaacacggcgttgaccatttatgttgatggcactatcacagcagccaataca
ggaaataccacgcgtaacatcgctattaaagacattaacaatgtgtcgataatcggtgtt
gcgaaccgcggtaaattatccggtatcggttttcaaattgagcgtgcgcaaaacattatt
attcgtaacctaactattcacgaagtacccgccagttttggtgatgcaattggtatagaa
ggggatgataatacgccaacgcgtcatatttggattgaccacaatgaattgtatggttca
ttaaccgtaggtaaagacgattacgatggattaatcgacagtaaagctggcgctagtcat
attactgtgtcgtataactacattcatgatcattggaaaactatgctaaatggttcatct
gatgatgatgcgggtgatcgttttatcacttatcaccacaactattttgccaacattaac
tcgcgggtacctttattccgttacggttatggccatttgtataacaactatttttataat
attgccggctctgcgatcaactcacgtatgggtgcgcaattattaattgaaaataacctg
tttgaaaatgttaaaaacgccattgtctcgcttgcttcgcgtgaaaaaggctactggtat
gcgcgtggcaatagttttgttaacgtatcgtatagctcggatagtagctttggcagcaca
gaagatagctatagcttatcgggggatattaccggtacttatgatgatgttccttatgac
tatagcagccatttattagacataaatgatgttaaagctcatgtgttaacccatgcgggc
gtaggtaaaattgatcagtcgaatgatactattccggcactggatggttctggtcagcca
gggggtaatgatggttctggtaatacaggcggaaccacaggcgcagttgatttgagccaa
ggcttagttgaagactttgccgcggctgatacagcaactttcttttctaacgcttataaa
acgtcagcaaaagataccaatacggctttgtatcattcttacaatgatggcgacaaagtg
gaaaatggccaattgaccatggccaacgctcggttaacgattggtagtcttgacggatat
tcagccgacaccaaccaaaccgatcagcctaatggcttgttcgatttcagccacggtgca
acgattagctttaagttggttgccgtgagcagttatgacaatagcaaaggcacggctgat
cagaataaagaaaagtcgttgcagatctacattgacaataacaccacgggcagtgctaac
tcgttgcatcagggcgcgtcacggatctttaagaaaaaggtcagtgagttaacggatcca
aatgataatcaggttggtcaaactattaccattaaaactgatttgggtacggcaacttca
tttattcagatccgtgctgaagatggtgttgaagctgtgatagacgatttagttatcaca
cccactgcgcctcctgtgactaacagtgtaagtgaagacttttcggcaactgacagtgcg
actttctttagttcaagctacgccgcacaagctaacgacagttcacatgccttgtacgtg
aagacgggtggttcagttgagatcaccaatgggcagctagtattaggcggtgataaaggc
ggccgatttaccataggtgatacgctgggtatggttaacggtaatttagaggtcgtagcg
acaaacggtaatactaacccgactggtgtttttgattttagccaaggggtgattgtgacg
tttgatttgatcgccattcaacaattggatgacgctgataaatctttaattgtttatctt
gataacaatacgtcaaaaagtgcggaatcaattcatggtggcgactcgaaaaagaccgtg
ggtaaagtggcattgttgtcgcaaaacttaggtaagcagacgatagagtttgatattggc
acagccacttctttcattcagctgcgtactgaaagcaatgtggtggcaaccatagataat
ttagtgattaccgctaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system