Chryseobacterium camelliae: PFY12_05795
Help
Entry
PFY12_05795 CDS
T08762
Name
(GenBank) SpvB/TcaC N-terminal domain-containing protein
Organism
ccab
Chryseobacterium camelliae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
SpvB
FG-GAP_3
FG-GAP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBV61634
LinkDB
All DBs
Position
complement(1248233..1254892)
Genome browser
AA seq
2219 aa
AA seq
DB search
MKLFSSFILSLCSVMGFSQTLLYQAESTTRTVQDPQRVVLTQGFHATSSVSNPFIAKIGP
GTENPGGGPVDSGAGATNPSGTAAPAGQSFHDTKGNIAVTAAGQLQFTLPIATPLGIRDI
TPKIDLVYNSGSVNGIAGYGWNISGISNILRIGRTIENDNDVKNIQIDYTDYYSLNGQRL
ILKSGEYGKDGAEYVTEKYSNIRIKSIGNIPNWKQPEYWEVTFEDGSQAWYGGTGSGWND
ATNRLSFNIVKWKDPQGNIVNYSYEQENNISIIKSITWGGNEMLGTSSFNEINFNYIDKS
VFEGAYINGAGTLFSQTKTLKDIIVKTDGNQFKKYSIDYTNNGTAYQFIEKITEYNSANE
QANPVFFEYPQMNSTLVHGMNTGTETTFDNIRFTGDFNGDAYLDFVMTDGTVKFGAFNDS
FNIIQSNKYFSSNAIVVNTILDEDGQVFNGNGIVQYENGKVTGYVFKNNTFVKVFEKEIF
DISTCTSQPGGEGCTTTVGILKEGDVNGDGISDVFISLKQRVCQFVQIPGCSDVDPISPA
SDGENIIKPPLCQQLECNTYELGNFIVDLKNSNNPLSTYTLDAGVYENSYTDQKYMDVDG
DGKIDIINVSNTNYTIFEFVKINPNQYLKKIKFSGNLEETKGNEFPVLFGDFNGDGKLDF
TVPITEGKIGKDDWRFYIGTGKSFNTFFKPDFLMYKNESTQNNGAWLRFSRTMYSISDLN
SDGKSDIVQVHAYSNLISNARAIGVVVNSIMSKGMMYNLWDIDFEQQNIYTFPPPGTYSP
GATIDDLSIYQPITNVIRANNNYYNVFLFRKDNVLRIKAPTGVDDLKRIKSINQGGVKTY
INYLEMVSDNSNNSFFYKKIRNEYYPYFSLQRADRAYAVSQLLREGNKQDFRYRGMTGHM
QGKGMIGFHQSARSSWYADGFENTKVWSGVEIDPLLDGIPVKEWSIRTNTESQIFPADIS
ENNTQLLSFKSTIYQTDKLLNGQIVTTVNDIDKPKVVTATVPKNSLSKDFLTNTFTISSI
TYGDYYLPSQSISNINNGYAISTSTFDYFNNFSGVGAGYFVGRIKSKNDLVQAYNDIKSA
KQEYIYENNLLKTLKTWNRDNTGYLLETYGYDSWGNITQKLIGNSIDPQTQTSQAEYDSK
GRFIIKATDNLGLITQIEYNDWGQIKKQTDPLNNTLVNTYDAWGKLLTSKTNLGGTTTYQ
YERDNSLNITVTQYDPDGDVSKKYTNKLGQDYKVSTKSFNQGQFVSSTTEYDVLGRKNKE
SEPYFEGQNPTQWNVIAYDDSVFPAKVTATAFNGKQLETSVSGLTTSVKELNGYGRTTSK
TADALGNVINSIDKGGTIAFSYNAAGEQIKAQYEGNSVITKYDVWGRKSEFNDPLNGVYK
YEYNGLGQPKKIISPKGTKEYIYNTLGQLKNQNEISTTDGGQATDKKITLTYDNKGRIIS
KTGTSKGKAFSSDILYDPQGRLLSSSENSNDKYYIQKGITYDDKGRVISYEKQLYSLGVM
TKVQIENVYSSWNGELYQAKDKNSGKVLWQLTETNTRGQVLTSKLGSATVINIYDPNGFL
SSVNHSSQLKPSILQISYSFDAIKNELKSRTTGGDFTIAESFDYDDNNRLVNWTNPVTGV
KPLLNRNIYDTKGRILENDQVGKMKYENAAKIYQPTSMILNSEGVQNYTNDLIQSIAYNE
NNDPVFIDGMKGDVAFQYGLTSMRQRVTYGGNFAAAEEGKFTKFYNEDGSFEVVKDNNTG
KEKHVLYIGGTPYESNIIFIKNYDEIVGSYKFLHKDYIGSILAISDEAGNKLEQRHFDAW
GNFTHLQIGNGAIITDKNIINNTLLLIERGYTSHEHFGEVGIIHMNGRLYDPLLRRFLNA
DENIQDIFNTQNYNKYGYVLNNPLMYSDPNGEFVWVVVGAVIGAWVTGAKANGTWNPLKW
DYGATWGKIAMGAAIGAFSGGVGAAAGSAALAASGVTGGVLGGVIAGGVGGAVGGALSGG
LTAAVFGENILTGTLTGLASGAIGGAVVGGIAGGVSQAISNARVANTNIGAKGNIWTGKT
VAEGRNPWAFKNMPKNSPPTPTSTPTPTVSKVIVGEMDGQIQKTVGYNINPQTEEVTPIT
EWGDYKLTPGQEEVIVYRNFGWNELASIKAQRGFSIHPNQFQGKQFWVGESGMKMWTNSR
FAKPFTAKIKIPKSFVTPGNKNYIFMESDMIIDGFPGGTVLPSNLEKFNSAMKIEWIRY
NT seq
6660 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattattttcatcatttatactgtcgttgtgttcagtcatgggcttttcacagacc
ttactgtatcaggcagaaagtacgacccgaacggttcaggatccgcagagggtagtttta
acacagggatttcacgcaacctcaagtgtttcaaatcctttcatcgctaagattggcccc
ggcacggaaaacccgggaggaggtcctgtagattctggagctggagcgactaacccatcg
gggacagcagcgcctgctggacaaagttttcatgatacaaaagggaatattgcagtaact
gctgccggacaattacaatttacattacctatagcaactccattaggaataagagatata
actccaaaaatcgatctcgtttataatagtggttctgtaaatggaatagcggggtatgga
tggaatatatctgggattagtaatattctaaggattggacgtacaattgaaaacgataat
gatgtaaaaaatattcaaatagactatactgattactatagtttaaatggacaaaggtta
attcttaagtctggagaatatggaaaagatggtgctgaatacgttactgagaaatattct
aatataagaattaaatctattggtaatataccgaattggaaacaaccagaatattgggag
gttacttttgaagatggttcgcaggcttggtatggaggaactggttccggctggaatgat
gctacaaatagattaagtttcaatattgtaaaatggaaagatcctcaaggaaatattgta
aattatagttatgaacaagaaaacaatattagtattattaaatctattacttggggagga
aatgaaatgttaggtacatcctcttttaatgaaattaattttaactatattgataaaagt
gtatttgaaggagcatatataaatggcgctggtacattgttttcacaaacaaaaacttta
aaagatattattgtaaaaacagatggtaatcaatttaagaaatattcaatagattatact
aataatggtactgcataccaatttattgaaaaaataactgaatataattcggctaacgaa
caagcaaatccagtctttttcgagtacccgcaaatgaactcaactttagtgcatggtatg
aatacaggtactgaaacaacatttgataatatcaggtttactggcgatttcaatggtgac
gcttatctggattttgtaatgaccgatgggactgtgaaatttggagctttcaatgatagt
tttaatattattcaatctaataaatattttagttcaaatgctattgttgtcaatactata
ttagatgaagacggacaagtatttaatggtaatgggatagttcaatatgaaaatggaaaa
gttacagggtatgtttttaagaataatacatttgtaaaagtatttgaaaaagaaatcttt
gacatttccacttgtacttcccagcctggaggagaggggtgtactacaacggtaggtatt
ttgaaagaaggggatgttaatggagatggaatatctgatgtattcatttcattaaaacaa
agggtttgtcaatttgtacaaattccaggttgttctgatgtagatcctatctctcctgct
tctgatggtgagaatattattaagcctcctttatgtcaacaattagaatgcaatacatat
gagctaggtaattttattgttgatttgaaaaattccaataatccgctgtctacttacaca
ctggatgcgggagtctacgaaaattcctatactgatcaaaagtatatggatgtggatgga
gatggcaaaatagatattataaacgtttcaaatactaattacactatatttgaatttgta
aagataaatcctaaccaatacttaaaaaaaataaagttttcagggaatcttgaagaaact
aaaggtaatgaattccctgttttatttggggattttaatggagatggcaagcttgatttt
acggtgccaattactgaaggtaaaattggaaaggatgactggagattttatattgggaca
ggaaaaagttttaatacattttttaaaccggattttttaatgtataaaaacgagtctact
caaaataatggagcttggttgagatttagtaggacaatgtattctatatctgatttaaat
tcggatggaaaatccgatatagtacaagttcatgcttattcaaatttaataagtaatgca
agagcaataggagttgttgtaaattcaataatgtccaaaggaatgatgtataacttatgg
gatatagattttgaacaacagaatatctatacatttcctccgccaggtacttattcacca
ggagcgacaattgatgatttgtctatatatcagccgattacaaatgttatcagagcgaat
aataactattataatgtctttttatttagaaaagataatgtccttagaattaaagctcct
acaggggttgatgatttaaaaagaataaaatcaataaatcaaggaggagttaaaacatac
attaattatctggaaatggtttcagataattctaataattcttttttctataaaaaaata
agaaatgagtattacccttatttctctttacagagagcagacagagcatatgctgtatca
caacttttaagagaaggaaacaaacaggatttccggtatagaggaatgactgggcacatg
cagggaaaaggaatgattggatttcatcaatctgcacgttcttcatggtacgctgatggc
tttgaaaatactaaagtttggtcaggagtagaaattgatcctcttttggatggtattccg
gtaaaagaatggtcaattagaaccaataccgaatcgcaaatctttcctgcagatatatct
gaaaataatacacagttattaagttttaaatctacaatttaccaaactgataaattgtta
aatgggcagattgtaactacggttaacgatattgacaaaccaaaagttgtaacggcaaca
gttcctaaaaactcattaagtaaagattttttaaccaatacatttacaataagttcgatt
acttatggagattattatctgccctctcagagtatttcgaatattaataatgggtatgca
atatcgacttctacttttgattatttcaataatttttctggtgtaggagcaggttacttt
gtggggcgtatcaaatccaagaatgacctggtacaggcatataatgatatcaaatctgca
aaacaagaatatatctatgaaaataatcttttaaaaacattaaaaacctggaatagggat
aatacagggtatttgctggagacttatggttatgatagttggggaaatatcactcaaaaa
ttaatcggcaatagtatagatcctcaaacccagacttctcaagcagagtatgattctaaa
gggaggtttattatcaaagcaacggataatttaggactaattactcaaatcgaatataat
gattggggacagataaaaaaacaaaccgatccgttaaacaatacccttgtcaatacctac
gatgcttgggggaaattgttaacctctaaaacaaacttaggaggtacaacgacttaccaa
tatgagagagataacagtttaaatattactgttacgcaatatgatccggacggtgatgtt
tcaaaaaaatatactaataaactgggacaagattataaagtttccaccaagtcatttaat
caaggtcaattcgtttcttcaacaacagaatatgatgtcttaggaagaaaaaataaagaa
tctgaaccttattttgaaggacaaaatccaacccaatggaatgtaattgcttatgatgat
tctgtatttcctgccaaagtaacagctacggcttttaacggtaaacagttggaaacttca
gtttcaggtttaacgacaagtgtaaaagagttgaatgggtatggaagaacaacttcaaaa
actgccgatgctttagggaatgtgataaacagtattgataagggaggaacaattgctttt
tcatataatgctgcaggagaacaaatcaaagcgcaatacgaaggaaacagtgtgattacc
aaatatgatgtatgggggagaaaatcggaattcaatgatcccttgaacggagtatataaa
tatgaatataacggattaggacagcctaaaaagataattagtcccaaaggaaccaaggaa
tatatctataatactctgggacagcttaaaaaccagaacgaaatctctactaccgatggc
gggcaggcaacagataaaaagattaccctcacttatgataataaagggagaataatttca
aaaaccggaacttcaaaaggaaaagcttttagttctgatatattgtacgatcctcaggga
agactgttgtcttcctcagaaaatagtaacgacaaatactatattcagaaaggaatcacc
tatgatgataaaggaagagtgatttcttatgaaaagcagctttactctttaggagtaatg
actaaagttcagatagagaatgtttacagctcatggaatggggaactgtatcaagctaag
gataaaaattccggaaaagtattatggcagcttaccgaaaccaatactagaggtcaggta
ctaacttctaaattggggtcagctactgttatcaatatatatgatccaaacgggtttctt
agcagtgttaatcactcctcacaattaaaaccaagcattttgcaaatttcatattcattt
gatgcaatcaaaaatgaattgaaaagcagaacaacaggaggagatttcaccattgcagaa
tcatttgattatgatgataataacagactggtaaactggactaatccggtaacaggtgtt
aaaccactattaaataggaatatttatgataccaaaggaaggattttggaaaatgaccag
gtaggaaaaatgaagtatgaaaatgcagctaagatttatcagcctacaagtatgatcttg
aatagtgaaggagttcagaattataccaatgatcttatccaaagtattgcatataatgag
aacaatgatccggtatttatagatggaatgaaaggtgatgtagcttttcaatatggttta
acaagcatgaggcaaagagtgacctatggagggaattttgcagcagcggaagaagggaaa
tttactaaattttataatgaagacggaagctttgaagttgtaaaagataataatacagga
aaagagaagcatgttctttatattggtggtaccccttatgaaagtaatattattttcatt
aaaaattatgatgaaattgttggttcttataagttcttgcacaaagactatataggaagt
attttagccatcagtgatgaagcgggaaataaactggagcagaggcattttgatgcatgg
ggtaatttcacacacttacagataggaaacggagctattattacggataaaaatataatc
aacaatacgctgttactaatagaaagaggctatacaagtcatgaacactttggggaggta
ggaattattcatatgaacggaagactatatgatccattactgagaagatttttaaatgca
gatgagaatattcaagatatattcaatacccagaattataacaaatatggatatgtactg
aataatccacttatgtactctgatcccaatggagagtttgtttgggttgttgttggagct
gtgattggagcctgggttaccggtgcgaaagcaaacggaacatggaaccctttaaaatgg
gattatggagctacatgggggaaaatagctatgggagcagctattggtgcttttagtggt
ggtgttggagctgctgctggaagtgctgctctggctgcgagtggcgtaaccggtggagtg
ctaggtggtgtaattgcaggaggtgttggtggtgcagtcggaggtgccttatcaggtggg
cttactgctgcggtgtttggagaaaatatcttaacaggtactttaacaggattagcttct
ggagctataggaggagctgttgttggggggatagcaggtggagttagtcaagcaatcagc
aatgctagagtagctaatacaaacattggagcaaaaggaaatatttggactggaaaaact
gttgctgaaggaagaaatccatgggcatttaaaaatatgcccaagaactctcctccaacc
ccaacgtctaccccaaccccaacagtttcaaaagtgattgtaggagaaatggacggtcaa
attcaaaaaactgttggatataatataaaccctcagacagaagaagtgacaccgattacc
gaatggggcgattataagctgactccaggtcaagaggaagtaatagtatacaggaatttt
ggttggaatgagttagcgtctattaaagcacaaagaggattttcaatacatccaaatcaa
ttccaaggaaagcaattctgggtaggagaatctggaatgaaaatgtggacaaattcaaga
tttgcaaaaccattcacagcaaaaattaaaataccaaagtcatttgttacaccaggtaat
aaaaattatatatttatggaatcagatatgataattgacggttttcctggaggcactgtg
cttccaagtaatttggaaaagttcaattctgcaatgaaaatagaatggattcgttattaa
DBGET
integrated database retrieval system