Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke): 112525846
Help
Entry
112525846 CDS
T05604
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ccav
Cynara cardunculus var. scolymus (artichoke)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PUF
NABP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112525846
NCBI-ProteinID:
XP_024991905
LinkDB
All DBs
Position
LG 13:complement(11755310..11761744)
Genome browser
AA seq
946 aa
AA seq
DB search
MITDSYSKMMSDIGMRSMVSNNEELGLLMREKRRQEVAGNTNMTSSSDREMELNMYRSGS
APPTVEGSLNAVAGLFDGGGNGLSAEFGGISEEELRSDPAYLSYYYANVNLNPRLPPPLL
SKEDWRFSQRLHSGGGGGNGSSAIGDRRNMNRDDDNNTRSLFATQLGFTGNKAENTGLTE
SRKPQGGGSTAEWGGNGLIGLPSLGLGSRQKSIAEIIQDDISQAASGSRHPSRPTSRNTF
DNNVDLSDSHFAHSYASALGASMSRSTTPDPQLMARAASPRIPAVGRGRISSLDKRNVSG
INGPSDLVTGFSGMSLSANDMVDEENHLQARIENTPQLGKSSYPYMGKADLGNPSLLADA
QGSPVNSYMKGPTNGAGGSPQYQNLDSPSSSFYGGYMMNPASPTMMANQLGGVNLPPIFD
NAAIAAAMGASAMDSRAMGGGFALGPNMLTAELQNLGRVGNHSPNGLQVPLMDPLYLQNL
RSSEYAAALNDATIDRELLALQKAYLAGLLSPQKSPYGLNHGYYGNSAYGLGMSYPGSPL
GSPLLPNSAIGSGSPVRHGERSLRFPSGIRNLVGGESFASSLLDEFKSNKTKCFELSEIA
GHVVEFSADQYGSRFIQQKLETATTEDKDMVFHEIMPQALSLMTDVFGNYVIQKFFEHGN
ATQIRELADQLTGHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVNLDQQTKMVAELDGHVMRCVRDQNG
NHVIQKCIECVPEDAIHFIISTFYDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCCNPKTQSIVMDEI
LKSICMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERTSIIEQLTGQIVQMSQQKFASNVVEKCLTFG
TPEERQILVTEMLGTTDENEPLQVMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQLELILNRIKVHLNA
LKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIGTLAGYAAAAAAAATAATATN
NT seq
2841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcactgatagttattcgaagatgatgtccgatattggaatgcgatcgatggtttca
aacaacgaggagttagggttgttgatgagggagaagcggagacaagaggttgctggtaac
actaacatgacgagtagcagtgatcgagaaatggagcttaatatgtaccgtagtggttca
gctccgcccacggtggaaggatccttgaatgcggttgccggattgtttgacggtggtgga
aatggtctgtcggcggagtttggcggcatttcggaggaagagttgaggtctgatccggct
tacctctcgtattactatgccaatgtgaatctgaacccacgcctcccgccgccgctgttg
tccaaggaggattggcggttttctcagcgactgcacagcggcggcggtggtggaaacggc
agttctgctattggggaccggaggaacatgaatagagatgatgacaataataccaggtca
ttattcgccactcaactggggtttactggaaacaaagcagagaatactggactcactgag
tcaaggaagcctcagggcggtggcagcacagcggagtggggcggcaatgggcttatcggg
ctaccaagcttggggctcgggagtaggcaaaaaagcattgcagagatcattcaggatgat
ataagtcaggctgcatctggttctaggcacccatcccgtccaaccagccgtaacacattt
gacaacaatgttgacctttctgattctcattttgctcatagttacgcttcggctctgggt
gcatctatgtctagaagtaccacacctgaccctcagctcatggctagagcagctagtcct
cgaattcctgctgttgggagagggaggattagttctctggataagagaaatgtgagcggt
attaacggaccttcagatctagtgactggtttttccggaatgagtctttctgccaacgat
atggtggatgaagagaatcatttgcaggcccgaattgaaaacactccccaattggggaaa
agttcatatccctatatgggcaaagctgatcttgggaacccatctttgttagctgatgca
caagggtcgccggtgaattcgtacatgaaagggcccaccaacggtgccggaggttctcct
cagtaccagaatcttgatagtccaagttcatctttttatggtggttatatgatgaatcct
gcatcaccaaccatgatggcaaaccagcttggcggtgtaaatttgccgcctatatttgac
aatgctgcaattgcagcagcaatgggtgcctccgccatggactctagagcaatgggtggt
gggtttgctttaggacctaatatgttaaccgcagagctgcaaaatcttggtagagttggc
aatcacagcccaaatggtcttcaggtgccacttatggacccgttgtatcttcaaaactta
cgatcaagtgaatacgctgcagctctgaatgatgcaacaatcgatagggaattactggcg
cttcagaaagcttatctggctggtttgctatctcctcagaagtctccttacggtcttaac
catggttactatggtaattctgcatatggccttgggatgtcgtatcccggaagcccattg
ggcagtcctcttctgcccaactctgctattggatccggaagtcctgttagacacggtgaa
cggagcttgcggtttccttccgggattcgtaacttagttggaggtgaaagctttgcatcc
tctttgctagacgagttcaagagcaataaaaccaagtgttttgagctctcggaaattgca
ggccatgttgttgaattcagtgccgatcaatatgggagtcgtttcatccaacagaagctt
gaaaccgctacaacagaagataaagacatggtgttccatgaaattatgcctcaagctctt
tcactgatgactgatgtattcggtaattatgtgatccagaagttttttgaacatggaaat
gctactcaaataagagaactggctgaccagctcaccgggcatgttctaacgcttagtctt
cagatgtatggttgccgggttatccaaaaggctattgaggttgttaaccttgaccaacaa
acaaaaatggttgcggagcttgatggtcatgttatgcgttgtgttcgtgatcaaaatggg
aatcatgtcatccaaaagtgtattgaatgcgtgccggaagatgctattcatttcatcatc
tcgacattttatgatcaagtcgtgacgttatcaacccatccctatggttgtcgtgttata
cagagagtcttggagcattgctgcaaccctaaaacgcaaagcatagttatggatgaaatc
ttgaaatccatttgcatgctggcacaagatcaatatggaaattatgttgttcagcatgta
ttggaacatggaaagccacacgagcgaacatctattatagagcaattaaccgggcagata
gttcagatgagccaacaaaagtttgcctccaatgttgttgaaaagtgtctgacttttggt
accccggaggaacgccagatcctggtgacggagatgctaggcaccaccgatgaaaatgaa
ccccttcaggtgatgatgaaagatcagtttgctaattacgttgtgcagaaagtgctggag
acatgtgatgatcagcaactcgagctgattcttaatcgtattaaggttcatctgaatgct
ctaaagaaatatacttacggaaagcatattgttgcccgtgtcgagaaacttgttgctgct
ggagaaaggaggatcgggacactggccggatatgctgccgcggccgctgctgctgctact
gctgctactgctaccaattag
DBGET
integrated database retrieval system
