Clostridium cellulovorans: Clocel_0168
Help
Entry
Clocel_0168 CDS
T01294
Name
(GenBank) Sigma 54 interacting domain protein
Organism
ccb
Clostridium cellulovorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
zf-CHC2
AAA_22
FtsK_SpoIIIE
AAA_29
AAA_16
G-alpha
nSTAND3
TniB
DUF5906
DAP3
UvrD-helicase
ABC_tran
AAA_7
CAF1C_H4-bd
RsgA_GTPase
RNA_helicase
RuvB_N
DUF6371
AAA_5
Toprim
Mg_chelatase
DUF3987
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADL49956
UniProt:
D9SNT5
LinkDB
All DBs
Position
252556..255114
Genome browser
AA seq
852 aa
AA seq
DB search
MEIQDIDLRQLIETETGERFSNQGYICCPFHKEKTPSLSVKFFPDRNKQRFMCWGCTEQG
DALDFIMKYRNLDYKAARKYLGMENKKSENQLQEEIIREYITWQIEKTEHKKGYKLLGLF
PFTDENNKVIYYKAKLLRSDGTKETPYYHIEGNKVINKRGAEEVPYNLSKVISGINQQKT
IIFVEGEKDANTVNSVLRGMNFVATSIKGCKDLSILKNRGPMSIYVIGDTGRAGEQYKLH
IYDEFISEAREFKFINLPGLKSLGDNKDVTDWIEDGHAKEELLMALERSLDLKNQRDLQQ
DSKGIYRVYWDKKQEDYIRLYITDFQLLEAKRITFVDDETEGITMVFKSCTGGIIERTGL
ATVFDDIKSFKNFLGTLDLSFRSTDIKDLTELKSWVNKYWALENDEIYSGSKFIRKDNQL
MLITKDGTITANGVNSRVRADKSGYVDLICKELISKEELNELRGKLFKFATFDKTITIIG
TVLNNLAVVQNEEAKEKLHHLLLVGESGSGKSTILSNVIAAVLNYPAADIKSIGLITTFA
LIKDLSDGNYPIIFDEFKPSALDKNKVQKLSEAFRNLYDRTTVSRGDKTLKTRGFRFTSP
IIVAGEESYPNGEKALVERSAIVYLSKGQRTSEHTIAMEWIKSNENILNKFGRSIIDVIL
NLSVDSYKNIRTMVSEFFPELNNRPLATAVNIATGMEILNLLLVKHGFPKILGYEKYIKQ
NIGEEILDGDNEAKSTVEQMLVLYNNMIEDGRAYDYKNVVIDRADGLFIRTSEMLNQIHM
FVNQVGAAEVIPLKLRDFKKQAEKSGYFTKTAAKQIKIDRKPVRFDEYNKEKMRQLQMYS
IVKPTEIEEYDY
NT seq
2559 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagatacaagacatagatttaagacaattaattgagacagagactggggaaagattt
agtaatcagggctacatatgctgtcccttccataaagagaagacaccttcattaagtgtg
aagtttttcccagatagaaataagcaaagatttatgtgttggggctgcacagagcagggg
gatgctcttgattttattatgaaatacagaaacttagattataaggcggctcggaagtat
ttaggtatggagaataagaagtccgaaaatcagcttcaagaagaaataataagggaatac
ataacttggcagattgagaagacggaacacaagaaggggtataagcttttgggcttattt
ccttttaccgatgaaaataataaggtcatctactataaagccaagcttcttagaagtgat
ggaacaaaagaaactccttactaccatatagaaggaaataaggtaataaacaaacgggga
gcggaggaggtaccatataatctgagcaaagttatcagtggtatcaatcagcagaaaaca
ataatctttgttgagggtgaaaaggatgctaataccgttaattcagttttaaggggcatg
aattttgtggcaacttcaataaaaggctgtaaggatctttccatattaaaaaaccgagga
cctatgagtatatatgtaatcggtgatacaggaagggctggcgaacaatataagttacat
atttatgatgaatttatttctgaggcaagggaatttaagtttatcaatttaccagggctg
aagagtcttggggacaacaaggatgttactgattggatagaagatgggcatgctaaagag
gagttgctgatggctttggaacgaagcttagacctcaagaatcaaagggatttacaacaa
gattctaagggcatctatagggtttattgggataaaaaacaggaagactacataaggctt
tatattacagattttcagctgcttgaggctaaaaggataacctttgttgatgatgaaacc
gagggtataacgatggtttttaaaagttgtactggaggaattattgaaagaacaggacta
gcaacagtctttgatgatattaaaagttttaaaaattttctagggaccttagatttatcc
tttaggagtacagatatcaaggaccttacagagttaaagagctgggttaataaatattgg
gctttagaaaatgatgaaatttattctggttcaaaatttataaggaaagataatcagctt
atgttaataacaaaggatggaacaattacggcaaatggagtcaactcaagagtcagggcg
gacaaaagcggttatgtggacttaatatgtaaggaacttatcagcaaggaagaattaaat
gaactaagggggaagttatttaagtttgctacctttgataaaactataactataataggg
acagtccttaacaacctggctgtggttcaaaatgaagaggcaaaggaaaagcttcatcac
ttattacttgtaggtgagagtggttctggtaaatctacaatcctatcaaatgttatagca
gcagtattaaactatccagctgcggacataaaatccatagggcttataacgacttttgca
ttaatcaaggatttaagtgatggaaactatcctataatttttgatgagtttaaaccaagt
gctttagataaaaataaagtccaaaagctcagcgaagcctttagaaatctttatgatagg
acaacggtatcaagaggagataagactcttaaaactagaggttttagatttactagtcct
attatagtggctggagaggagtcttatcctaatggtgaaaaagctttggttgagagaagt
gcaatcgtgtatttaagcaaaggtcaaagaacctcagagcatacaatagctatggaatgg
attaaaagcaatgaaaatatacttaataaatttggacgttcaattatagatgtaatactt
aacttgtccgtggacagctataaaaatataagaactatggtcagcgagttcttcccagag
ttaaataatagaccccttgctacagcagttaatattgctactggcatggagatattaaat
ctattactagtaaagcatggatttccaaagatcctaggctatgaaaagtacataaaacaa
aatattggtgaagaaatcttagatggagataatgaagcaaagagcaccgttgaacagatg
ctggttttatataacaacatgatagaagatggacgagcctatgactacaagaatgtagtg
attgatagagctgatgggctttttataaggacctcagagatgttaaatcagattcatatg
tttgtaaatcaagtaggagctgcggaggttattccgctgaagttaagggattttaaaaag
caggcggagaagtcaggatattttacaaagacagcggcaaaacaaataaagatcgataga
aaacctgtaaggtttgatgaatacaataaagaaaagatgagacagcttcagatgtattct
atcgtgaaacctacagaaatagaagagtatgactattga
DBGET
integrated database retrieval system