Acetivibrio clariflavus: Clocl_1543
Help
Entry
Clocl_1543 CDS
T01661
Name
(GenBank) beta-1,4-xylanase
Organism
ccl
Acetivibrio clariflavus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM9_1
Glyco_hydro_10
SLH
CBM_4_9
Esterase
MukF_M
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEV68181
UniProt:
G8M263
LinkDB
All DBs
Position
1772414..1777759
Genome browser
AA seq
1781 aa
AA seq
DB search
MVLKKGFTKFLSFTLSCAMFFSMMTSVKLPALAADTEVVNLVNNGDMEDGTNWWYPNGTG
ECSIESVSDEKHGGNFSLKVTGRTDAWNGAAQNLVNSLAQKPVAGREYYAAAWVMFNEGD
APENVEFVLSMRTTKDNANPVFENIASLKVKKGEWTLIEGNHRIPGDSLVDKDVHLYMET
RGESGKYVDFYLDDVVFIPLEDDVINYDFDPTLTPLRSVWDEYFPLGIAVRPDQVESEVY
SEYIKHHYSGLVAENCMKPEAIQPKEGVFTFDDADKVANFAKENDITLRMHTLVWHSQVP
DWFFEDPDDPTKPATGEKLLERMKTHIDTTMEHFHSIGVQIDTYDVVNEVISDGEGLRDS
KWKQIVGDADGDGFEDDYILAAFRYAFQKANELGDDKVKFCINDYSIESNTKKLDTMYEL
VQRILEVAEEEGISKDRIVVGFQMHINMYGPSIGQIRKSLEKFEGMGVKVQVTELDVSVY
KSSDEPAKAPTEEILLQQAKTYKDLFNVFKELSERGLLDSVTLWGGDDRSSWLNDFPVQN
RGDYPLLFDKNLKAKPAYIALTDPDSLPVYRQQIIAVKGTPDIGTDYVDKLWYTISFTDI
NQVVYTSVDKADVNTVGIKLMWDEDNLYILSQVKDNTPNAKDSLEIFLDTDLDNSGDIKH
FILSRNNDEIEDIAYYVKSSDDGYTVQAAISIADLNPKKEMKFGIDFRVNDYDSEGNLSS
QVVWNDYKNELVEDNFGYVVLDKNAKLLNVKYGTPEIDGEIDDIWVSAEEAKTDVWVSGT
KGSTAKFRTLWDENYLYVLAEVTDRLLTKKSANAYEQDSVEIFIDQNNAKTTYYEEDDSQ
IRINYDNEVTFDHGKLEGFVSATSLTETGYIVEAAVPFTAISPEVGDVLGFDLQVNNDED
GDGVRDSVSIWCDPSGQSWQNVSGLGNIILDEEKATAKLPVDENGLDSAGRMVAYFGTPI
VDGIVDEIWNEAQVVNPQIRVGNPLATATFRALWDDYGLYVLAEVKDSDMTLEPSNPYEQ
DSLEIFMDENNDKTVDYGIDDLHLRVNYDNYQTADYGSAERFYTKTSKTEDGYIIEARIE
FKSKPSNGKVMGFDLQINDGKGTSRIGTINIFDATGNAWQDTTKFGEIVLAGKAKGAKTG
LNPYNLLNLIITAKNLDYSIYKNKEVVFDAIKVAEEVLAKEDVTQEEIDEQYNAIKEAIG
KLELTDEAANEKWFKPVPDEYRGESDKPGTIERLEYQTDNYGDELTTKYLNVYLPYGYDP
DDKDKKYNILYLMHGGGEDENLIFGGPGESKELKRIIDNMIAKGDIEPLIVVTPTFNGGE
NNLGENVAKFYKELMKDIIPLVESKYNTYAEDTTLEAIKASREHRAFGGFSMGSVCTWYT
YINCLDYIKYYIPLSGDCWALNRDASSENAKATAELLADVARESGYTPQDYKLFCATGSA
DIAYPNMKPQIDELKKLTDVFIYSSDPTKGNLYFMVCEGGTHAWNFVNQYIYNILPDLFV
DTIVEPTPTPTPTETPTETPTPAPSEVPTETPTPAPTATSTSGSGKGGSGSGGSGGGSKP
ATSTPTATPTSTPTTEPTATPTPTTSVDVTPVPTTTEENNETIPSAGFSDISNHWAKEFI
LNLVLKNILKGYEDGTIRPDNNISRAELVTMVIRAMGLTPSENPVLDFADKDSIPSWAAG
YVALAKEHGIVSGYEDNTFRANKECTREEAVTIIMNAFKLGESNNELKFTDAKDISSWAY
KYVAKAVEEGIINGYPDNTFRPRKNITRAEIITILYNCLNK
NT seq
5346 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttttaaagaaaggctttaccaagtttttgagctttacgctgtcatgtgctatgttt
tttagcatgatgacaagtgttaagctgccagcattagcagccgacactgaggtcgtaaat
ctcgtcaacaatggagacatggaggacggaacaaactggtggtatcctaatggtactggt
gaatgttctatagaatctgtgtctgacgagaaacatggcggtaatttcagtttaaaggta
acaggcagaacagatgcttggaatggtgctgctcaaaaccttgttaatagcttggcacaa
aaaccggtagccggaagggaatactatgcagctgcctgggttatgtttaatgagggtgat
gcacctgaaaatgttgaatttgtattgagtatgagaactacaaaggataatgcgaatcct
gtatttgaaaatatagcaagtctaaaggtaaaaaagggagaatggactttaatcgaaggt
aatcacagaattccaggagattcacttgttgataaagatgttcatctctatatggaaact
agaggagaaagtggaaaatatgtagatttttatttggatgatgtggtatttataccatta
gaagacgatgttataaactatgattttgatccgactttaacaccgcttcgcagtgtatgg
gatgaatatttcccgttaggtattgctgtaagacctgatcaggttgaatcagaagtatac
agcgaatatatcaaacaccactactccggtttggttgcagaaaactgcatgaaaccagaa
gctatacaacctaaagaaggtgtatttacatttgatgatgcagataaagtagctaatttt
gcaaaagaaaatgatattactttgagaatgcatacccttgtatggcatagtcaggttccc
gattggttctttgaagatcccgatgatccaaccaagccagctacaggggaaaagttattg
gaaagaatgaaaactcatatcgatactactatggagcatttccattctataggtgttcaa
atagatacatacgatgttgtaaatgaagttatctccgatggtgaaggacttagagattca
aaatggaagcaaatagttggagatgctgatggagacggatttgaagatgattatatcctt
gctgctttcagatatgcattccaaaaagctaatgaattaggtgatgataaggtaaaattc
tgtataaatgattacagtattgagtcaaatactaaaaaacttgatactatgtatgaatta
gttcaaagaatactcgaagtagctgaagaagaaggtatatcaaaagacagaatagttgtt
ggtttccagatgcatattaacatgtacggaccttcaatcggacagattagaaaatcacta
gagaaatttgaaggtatgggagttaaagttcaggtaaccgagcttgacgtttcagtttac
aaatccagtgatgaacctgcaaaagcacctactgaggaaatattattgcagcaagctaag
acatacaaagacttgtttaatgttttcaaagaattgtccgaaagaggacttttagactca
gttacattgtggggaggcgacgacagatcgtcatggctgaatgacttccctgttcaaaac
agaggagattatccgctcttgttcgataaaaatctcaaagcaaaacctgcttacatagca
ttaaccgatcctgacagtttaccggtttacagacagcagataattgctgtaaaaggcaca
cctgatataggaactgattatgttgataaattatggtatactatttcttttactgatata
aatcaagttgtatatacttcggtagacaaagctgatgttaacacagtaggaattaaattg
atgtgggatgaagacaatctctacatactttcacaagtgaaagataatacacctaatgca
aaggacagtctggaaatattcctggacactgatcttgacaattccggtgatattaagcat
tttattctgagcagaaacaatgatgagattgaagatattgcttactatgtgaaatcaagc
gatgacggttatacagttcaagcagctatttctatagcagatttgaatcctaaaaaagaa
atgaaatttggaattgatttcagagttaatgattatgattccgaaggcaatttatcatca
caagtggtatggaatgattacaaaaatgaactggttgaagataatttcgggtatgttgtg
ctcgataaaaatgcaaaacttctgaacgtgaaatatggaactcctgaaattgacggtgaa
attgacgatatttgggtaagtgctgaagaagctaagacagatgtttgggtaagcggcaca
aagggttcaacagctaaattcagaactttatgggatgaaaattacctatatgttctggca
gaagtaacagatcgtctgttgactaagaagagtgctaatgcttatgaacaggattctgta
gagatatttatagatcaaaacaatgccaaaacaacttattatgaagaagatgattcccag
ataagaataaattatgacaatgaagttacatttgatcatggaaaacttgaaggatttgtt
tcagctactagcctaactgaaaccggatatattgtggaagcagcagtaccatttactgct
ataagtccggaagtaggagatgttttaggctttgacctccaggttaacaatgatgaagat
ggcgacggagttcgtgacagcgttagcatatggtgtgatccgtcaggacaatcatggcag
aatgtatcaggccttggaaatataattcttgatgaagaaaaggctactgctaaattacct
gtagatgaaaacggtttggattcagctggaagaatggttgcttattttggaacacctatt
gttgacggtatagtagatgaaatatggaatgaagcacaagtggttaatccgcaaattaga
gttggaaatcctcttgccacagctacatttagggctctatgggatgattatggtttatat
gttcttgcagaagtaaaagacagtgatatgactttagaaccatcaaatccatatgagcag
gattcattggaaatatttatggacgaaaacaatgataaaactgtagattacggcattgat
gatttacacttaagagttaactatgataattatcagactgcagactatggaagtgcagaa
agattttacactaagacttcaaaaacagaagatggttatattatagaagcaagaattgag
tttaaatccaaaccttccaacggaaaagttatgggatttgatttacagataaacgatgga
aaaggtactagcagaatcggtactattaatatttttgatgctacaggcaacgcatggcaa
gatactacgaaatttggagaaattgtacttgctggtaaagcaaaaggtgcaaaaacagga
ttgaatccttacaatttgctcaacctgattattactgcaaaaaatcttgattatagcata
tacaaaaataaagaagtagtttttgatgctataaaagttgctgaagaagttctggcaaaa
gaagatgttactcaagaagaaatcgatgaacaatataatgctattaaagaagctataggc
aagctggagttaaccgatgaagctgctaatgagaaatggttcaaacctgttcctgatgag
tatagaggagaaagcgacaaaccgggtacaatcgagagattggagtatcaaacagataat
tatggagacgaattgactacaaaatatcttaatgtttatctcccttatggttatgatcct
gatgacaaggataagaagtataatattttatacttaatgcatggtggcggcgaagatgaa
aatcttatattcggtggtcctggtgaaagcaaagaactgaaaagaataattgacaacatg
attgctaaaggagatatcgaaccgcttattgtagttacacctactttcaatggcggagaa
aataatttgggagaaaatgtagcaaaattctataaggaattaatgaaagatattattcct
ttagttgaatcaaaatacaacacttatgcagaggacacaactctagaagcaataaaggct
tccagggaacacagagcctttggcggattctctatgggatcagtatgtacttggtataca
tatattaactgcctcgattatatcaagtattacattccattaagcggtgactgttgggca
ttaaatagggatgccagcagcgaaaatgcaaaggcaacagcagagttactggcagatgtt
gcaagagaatccggttatacaccacaggattataagttgttctgtgctacaggtagcgca
gatattgcatatcctaacatgaaaccgcaaatagatgaattgaaaaaattaactgatgta
ttcatctattcttccgatccgacaaaaggaaacctttactttatggtatgcgaaggcggt
acacatgcttggaattttgtaaatcaatatatttacaatatattgcctgatttattcgta
gatacaattgtagaacctactcctacaccaacaccaaccgaaacaccaactgaaacacca
acaccagcgccaagtgaagtgccaactgaaacaccaacaccagcaccaactgcaacatca
acttcaggaagcggtaaaggcggttctggctccggtggttctggtggaggctcaaaacca
gctacatcaacaccgactgcaacacctacttcaacaccaactacagaaccaactgcaaca
cctactccaactacatctgtagatgtaacaccggtgcctactacaacagaagaaaataat
gagacaattccatcagctggctttagtgatatatccaatcactgggcaaaggaattcata
ttgaatttggtattaaagaatatcttaaaaggatatgaagatggtacaataagacctgac
aataatatttcaagagctgaacttgtaaccatggtaataagagctatgggcttaactcca
tctgaaaatcctgttttggattttgccgacaaagatagtattccttcatgggcagcagga
tatgtagcacttgctaaagaacacggcattgtatcgggatatgaggacaatacattcaga
gctaataaggaatgtaccagagaagaagcagtaaccattatcatgaatgcctttaaactt
ggagaatcgaataatgagcttaaatttacagatgcaaaagatatttcaagttgggcttat
aaatatgtagcaaaagcagttgaggaaggaatcatcaatggatatcctgacaatacattc
agaccgcgtaaaaatataaccagagctgaaataattactatattgtacaactgcttgaat
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system