Clostridium cochlearium: SAMEA4530647_0412
Help
Entry
SAMEA4530647_0412 CDS
T06756
Symbol
lytC_7
Name
(GenBank) cwp66 homolog/N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
KO
K13730
internalin A
Organism
ccoh
Clostridium cochlearium
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CW_binding_2
LRR_4
LRR_8
LRR_9
DUF2325
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SNV68379
LinkDB
All DBs
Position
1:404608..407229
Genome browser
AA seq
873 aa
AA seq
DB search
MIKSKWKKKITKALCSTFLLTTIIVQPLSAVNAAKKDDDKEKKYVRKPAKVRIYGNDRYE
TSSKIAKDGWSSSYYAIIASGENFPDSLSAVTLAKKHDAPILLTNSKSLNTNTREELTRM
KVKKVLIIGGQGSISSKVEQDIKSMGITTERLGGRDRYETSIKIAERLGNPGTLFVVTSN
HFADALSVGPIAAKKGAPIILTSKDNLSDYTKKYLYKKVFNKIYIIGDRAQISDKVASEF
EKYVKNSQTNENAVERIDTKSNSSSIYERNINVIDKFESDLNSFREIYIASGVAFADALS
VNALAAKKGAPIVIGNTSDGNLLKSFISKNYSNISTINIVGGQGVISEAYVNNIVNYIED
EEIKFTDKNMAKAVREKLGITNENQRIYKSTVKNIQTLDLSGFNIENIDGIQLFDGLKEL
NLSNNKIQDLEPLEDMFYLESLNLSGNKVEDLEPLEELHSLKYLNLSDNNVRHEDSLKKL
EYLKYLNLSKNDISYIEDFDKLTYLYYLDLSDNYNIGGLSELSDLKSLTTLKLSHTGISS
LSFLEDLKSLTELDLSQNSISSLDDLKKLDNLKTLYLNDNSITYIEDLKDLKSLEELNVW
GNDINDVEKFKKFKKLRKLTIERSLLDDDDRKQLDLISNIPHIFDKENTYNKNYDYGDVN
SGNIIENEYKDKDLEDISDEVEEFKKDNENYKRDYNPYEVIYKSNSTYGGKFTAKELLNR
EKDLQSMIGNSRYSMETRKMMQEDLEKVINQYGIINKTNRMNDKVMELEAKLNMSFDEKE
KRKARNEINYVYSDYKYDFYKNAVAECEDAMSRLKAQIGELEYSNSYSDNEKARILKGEL
TNKQIEYYVITNNLNKYDKDRSFFAAMNSFLNK
NT seq
2622 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaagtaaatggaaaaagaaaattacaaaagccctatgtagtacttttttgctt
actactattattgtacaaccattaagtgctgttaatgcagctaagaaagatgatgataaa
gaaaagaaatatgtaagaaaacctgctaaagtaagaatatatggtaacgatagatatgaa
acttcatcaaaaatagcaaaggacggatggagcagttcttattatgcaataatagcatct
ggagaaaattttcccgactcattaagtgcagttacattagctaagaaacatgatgcgcct
attttattgactaatagtaagtctttaaatacaaacacaagagaagaattaactagaatg
aaagtaaaaaaagtacttataattgggggacaggggtctatttcatctaaagtagaacaa
gatataaaatctatgggaattaccacagaaaggcttggaggaagggacagatacgaaaca
tctattaaaattgcagaaagattaggcaatccagggacgctatttgtagttacatctaat
cattttgcagatgcactatctgtaggtcctatagcagctaaaaaaggagcacctataata
ctaacttctaaagataatttatctgattacactaagaaatatctatataaaaaagtgttt
aataaaatatacataataggggacagggctcagataagtgacaaagtagctagtgaattt
gaaaagtatgtaaaaaattcacaaaccaatgaaaatgctgtggaaagaatagatactaaa
tctaatagttctagtatttatgaaagaaacataaatgtaattgataaatttgaaagtgac
ttaaattcttttagagaaatatatatagcttctggtgtcgcttttgcagatgctctttct
gtaaatgcactagcggctaaaaaaggagctcctattgtaataggaaatacatctgatgga
aatctattaaaaagttttatatctaaaaactattctaatatatctacaataaatattgta
gggggacagggcgttatatctgaggcttatgtaaacaatatagtaaattatatagaggat
gaggaaattaaatttacagataaaaatatggcaaaggctgttagagaaaagctaggtata
actaatgaaaatcaaagaatttacaaatctactgtaaagaatatacaaactttagattta
tctggttttaacatagagaatatagatggaatacaattatttgatggccttaaagaatta
aatttaagtaataataaaatacaggatttagaacctttagaagatatgttttatttagaa
agcctaaatttatcaggaaataaagtggaagatttagagcctttagaagaattacatagc
ttaaaatatttgaacttaagtgataataatgtaagacatgaagattctcttaaaaaatta
gaatatctaaaatatttaaatttaagtaaaaatgatataagttatattgaggattttgat
aaattaacttatctttactatttagatttatcagataactacaatataggtggattaagt
gaattatctgatttgaaaagtttaactactttaaaattaagtcatacaggtatatctagt
ttaagctttttagaagatttaaaatcattaacagaattggatttatcccaaaatagcata
agtagtttagatgatttaaagaagttagataatttaaaaactctatatttaaatgataat
agcataacttacatagaggatttaaaggatttgaagagtttagaggaattaaatgtatgg
ggaaatgatataaacgatgtagagaagtttaaaaagtttaagaaacttagaaaattaacc
attgagagatcattattagatgatgatgatagaaaacagttagacttaataagtaatatt
cctcatatttttgataaagagaatacttataataaaaattatgattatggggatgtaaat
tctggaaatataatagaaaacgaatataaagataaggatttagaagatatttcagatgaa
gttgaagagtttaaaaaggataatgaaaactataaacgtgattataatccttatgaagtt
atatataaatccaattccacttatggaggaaaatttacagctaaagagcttcttaaccgt
gaaaaagaccttcaatctatgataggaaattcaaggtattctatggaaactagaaaaatg
atgcaggaagatttagaaaaagtaataaatcaatatggaataattaacaaaactaataga
atgaacgacaaagtcatggaattagaagctaaacttaacatgtcctttgatgaaaaagaa
aaaagaaaagcaagaaatgaaataaactatgtgtattcagattacaaatatgatttttat
aagaatgcagttgcagaatgtgaagatgcaatgtctcgattaaaagcacaaattggagaa
ctagaatatagcaatagttatagtgataatgaaaaagctagaattttaaaaggtgaatta
acaaataagcaaatagaatactatgtgattactaataatttgaataaatacgataaagat
agaagtttttttgcagcaatgaattcttttttaaataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
