Chondrus crispus (carragheen): CHC_T00008809001
Help
Entry
CHC_T00008809001 CDS
T02916
Name
(RefSeq) Sel1-repeat containing protein
Organism
ccp
Chondrus crispus (carragheen)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sel1
TPR-S
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
17324199
NCBI-ProteinID:
XP_005716483
UniProt:
R7QEZ2
LinkDB
All DBs
AA seq
1374 aa
AA seq
DB search
MVTKIGELMDCGLALMAGGQVRFMVEKDERWEKRCIGPETTETGAFLNGDEVCTDEIESK
SNGVFTTHVRLEEARLAYQFGVPLQEFEHVEQTLTFMGHSLESLRTRLGGWVKGNEDAQA
RAWRPVLFKSGERKTMWEKVGGLSAELSQTVCERGEKCVLKDRGVQSRLVWELQNIVREG
MCGAEGCPSAIRAVALCLLSFPAIEVTRMEGGIGGAGEQQRSREAGEVEIKQGESCVTLV
LGSGEEAQDQTGRIKTVELTITAMCAPQQTKLDVRLQYTSEHVHEVSVRLRRGENGAEGV
FEWEWWRDAAMGRMEGLKRWQENHEMEAVEFRTSRLPIDSGLRIVDSAVRESGHEFVTWA
GWEPFRTKHCKLEVESEKLLVEFAVTRQPGSLAVRNKKIYYSVDRMVGRRRSVGYAEAKR
ESIRDGCLIVREALIEGTRVVESGTALSNQTEDTKDVIRKAENLIGGGHENFGRAIFLLK
VAALERNDIGALCTCVELLRKGGPTGMHAGRTSNLREAAQMIKVFFHAKLHTSLTSTSTR
GDDGFEKLFDLFAKLVMEQSCDGVIVDLFVDALEDAIEFDVAGNLRKFHAWIRKAIVCSR
KWNQLDKLANFSDLAVGNGGDVKSREAKGDGAGKEAFFSEGKVTECDDMTYDLVGKALLE
RMISEYATLSSREGIWIVLGTAGQGAPWCARERQYAGSQDENSSGHAMNSLGVLFQLGAR
GVGRDAPQAKLLYETAIEENENCKAMYNLAFLLKQGAEGVERDAVRSMELYERAIEKGED
VDAMVNLGVLLKEGAEGVERNAVRSMGLYERAIEKGDDVGAMVNLGNLLSEGGEGVERDA
VRCMELYERAIEKGDHVGAMVNLGVLLEEGAEGVERDAVRCMELYERAIEKGEHVGAMVN
LAILLSEGGDGVERDAVRSMELYERAIEKGEDVRAMVNLGNLLKQGAEGVERDAVRSMEL
YERAIEKGEHVGAMVNLGNLLSEGAEGVERDAVRCMELYERAIEKGDHVGAMVNLGNLLK
QGAEGVERDAVRCMELYERAIEKGDHVVPMVNLGVLLQQGAEGVERDAVRSMELYERAIE
KGEHVDAMYNLGVLLSEGAKGVERDAVRSMELYERAIEKSEHVGAMVNLAILLQQGAEGV
ERDAVRSMELYERAIEKGEHVGAMYNLGLLLKQGAEGVERDAVRSMELYERAIEKGDDVD
AMVNLGVLLEEGAEGVERDAVRCMELYERAIEKGEHVGAMVNLAILLEEGAEGVERDAVR
AVALYDRAMAKGNSGNATCYLAMTLRDGAEGVERNAVRAVELFEMDIKERKQSKSMVCLG
DMLRDGADGVARDTDRAIQLYEMAVEEDNNAEAVAQLAALQRDRSDSSTRDEGE
NT seq
4125 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgacgaagatcggagagctgatggattgcgggctggcactgatggccgggggtcag
gtacgatttatggttgagaaagatgagcgttgggagaagcgctgtattggaccagagacg
acagagactggagcatttttgaacggtgacgaggtatgcacggatgaaattgaatcgaaa
agtaatggtgtatttacaacgcatgtgcggttagaagaagcgaggcttgcatatcagttt
ggtgtaccactgcaagagtttgaacatgtagagcagacgctgactttcatgggtcattct
cttgaaagcctacgaacaagactcggaggatgggtgaagggaaacgaagatgcacaggcc
agggcttggagacctgttttgtttaaaagtggagaaaggaaaacaatgtgggagaaagtc
gggggtctgtctgcagagctgtcacaaacggtttgtgagagaggtgagaaatgtgttctg
aaagatcgtggggtccaatcgcggttggtatgggagttgcaaaacattgttcgagaggga
atgtgtggagctgaagggtgcccgagtgcgatacgggcagtggcactatgcctacttagt
ttccctgcgatcgaagtgacaaggatggaaggtgggattggaggggctggggagcaacag
aggtcgagggaagcgggagaagtggagatcaagcaaggagagagctgtgtgactctcgta
ttgggaagcggggaagaagcacaagaccagacgggcaggatcaagacggttgagttgacc
ataacggcgatgtgcgccccgcaacagactaagctcgatgttcgactccagtacacaagc
gagcatgtgcatgaagtgagtgtacggttacgtcgtggggaaaatggtgcagagggggtg
ttcgagtgggagtggtggcgagatgcggcgatggggcgcatggagggcctaaagcgatgg
caagagaatcacgaaatggaagcagtggaattccgtacgtctagactcccaatagactct
ggtttgcggattgtggattcagcggtaagggagagtgggcatgagtttgtgacgtgggcg
ggatgggaaccgttccgaacgaaacattgcaaacttgaagttgagagtgagaaactgctg
gtggagtttgccgtgacacggcagccagggtcccttgctgtgagaaacaagaaaatatat
tacagtgtcgaccgtatggtgggaaggagacgctctgtcgggtatgcagaagcaaagcgt
gagtcgatccgtgatgggtgtctcattgtgagagaagcacttatagaaggcacgagggtt
gtggaaagtggcacggcgctgtcgaaccagactgaagacaccaaggacgtgattcgtaag
gccgagaatctgattggcggaggacatgaaaatttcgggcgggccatttttctgctcaag
gtagcggcactggagaggaatgacattggcgctctgtgcacatgtgtggagcttttgagg
aaaggggggccgacagggatgcatgcggggaggacatcgaacttgagagaagcggcgcaa
atgatcaaagtgttctttcatgctaagttgcatacaagcttgacatctacgtcaacacgc
ggtgacgatgggtttgagaagttgtttgatttgtttgcaaagctagtgatggagcagagt
tgtgatggagtgatcgtggatttgttcgtagatgcgctcgaagatgcgattgagtttgac
gtggccggaaaccttcgaaaatttcatgcatggatacgaaaagcgattgtgtgttcccgg
aaatggaatcagttggacaagcttgccaatttttcggacttggcggttggaaatggcggg
gatgtgaagtcgagggaggcaaaaggtgatggtgctggaaaggaggcctttttctccgaa
ggaaaggtgaccgagtgtgacgatatgacgtatgatcttgttggcaaggctttactggaa
cgcatgataagcgaatacgcgacgttgtcttcaagagaaggaatttggattgtgctgggt
actgccggacagggggctccttggtgtgcgagagagagacaatatgcgggaagtcaggat
gagaattcaagcggacacgccatgaatagccttggagttcttttccagctaggggcacga
ggggtgggtcgtgacgctccacaagccaaacttctatacgagactgcgatcgaagagaat
gaaaactgtaaggcgatgtataacctcgcttttttgctgaaacaaggtgccgaaggagta
gagcgtgacgcagtgcgatctatggagctgtatgagcgcgctatcgagaagggtgaggac
gtcgatgcaatggtgaacctgggtgttttgctgaaagaaggtgccgaaggagtagagcgt
aacgccgtgcgatctatgggcctgtatgagcgcgctatcgagaagggtgacgacgtcggt
gccatggtgaatctcggtaatttgctctcagaaggtggggaaggagtagagcgtgacgca
gtgcgatgtatggagctgtatgagcgcgcaatcgagaagggtgaccacgtcggtgcaatg
gtgaacctgggtgttttgctcgaagaaggtgccgaaggagtagagcgtgacgcagtgcga
tgtatggagctgtatgagcgcgctatcgagaagggtgagcacgtcggtgccatggtgaat
ctcgctattttgctctcagaaggtggggatggagtagagcgtgacgcagtgcgatctatg
gagctgtatgagcgcgctatcgagaagggtgaggacgtccgtgccatggtgaatctcggt
aatttgctgaaacaaggagccgaaggagtagagcgtgacgcagtgcgatctatggagctg
tatgagcgcgctatcgagaagggtgagcacgtcggtgccatggtgaatctcggtaatttg
ctctcagaaggtgccgaaggagtagaacgtgacgcagtgcgatgtatggagctgtatgag
cgcgctattgagaagggtgaccacgtcggtgccatggtgaatctcggtaatttgctgaaa
caaggagccgaaggagtagagcgtgacgcagtgcgatgtatggagctgtatgagcgcgct
atcgagaagggtgaccacgtcgtgccaatggtgaacttgggtgttttgctgcaacaaggt
gccgaaggagtagagcgtgacgcagtgcgatctatggagctgtatgagcgcgctatcgag
aagggtgagcacgtcgatgcgatgtacaacctcggtgttttgctctcagaaggtgccaaa
ggagtagagcgtgacgcagtgcgatctatggagctgtatgagcgcgctattgagaagagt
gagcacgtcggtgccatggtgaatctcgctattttgctgcaacaaggtgccgaaggagta
gagcgtgacgcagtgcgatctatggagctgtatgagcgcgctatcgagaagggtgagcac
gtcggtgcgatgtataacctcggtcttttgctgaaacaaggtgccgaaggagtagagcgt
gacgcagtgcgatctatggagctgtatgagcgcgctatcgagaagggtgacgacgtcgat
gcaatggtgaacctgggtgttttgctcgaagaaggtgccgaaggagtagagcgtgacgca
gtgcgatgtatggagctgtatgagcgcgctatcgagaagggtgagcacgtcggtgctatg
gtgaatctcgctattttgctcgaagaaggtgccgaaggagtagagcgtgacgcggtgcgc
gccgtggcattgtatgatcgtgcaatggcgaaaggaaattccggtaacgcgacttgctat
cttgcgatgacgttaagggacggggcggaaggggtggagcgcaatgcggtgcgtgcggtg
gagctgtttgagatggacatcaaggaacggaagcagagcaagtcaatggtgtgtcttgga
gacatgttgcgggacggggcggacggggtggcccgcgacacggatcgggcgatacagttg
tacgagatggcggtcgaggaagacaacaacgcggaggcggtagcccaacttgcggcgttg
cagcgggacagatcagacagcagtacgcgggacgagggtgagtga
DBGET
integrated database retrieval system