Chrysoperla carnea: 123292856
Help
Entry
123292856 CDS
T09255
Name
(RefSeq) protein artichoke
Organism
ccrn
Chrysoperla carnea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRR_1
LRR_9
LRR_6
Sigma70_r4
L_protein_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
123292856
NCBI-ProteinID:
XP_044729507
LinkDB
All DBs
Position
1:102001373..102007109
Genome browser
AA seq
1522 aa
AA seq
DB search
MELIFRLKIHLSILNTSQWFLHNFIWFLLIKSWISLPNTSGGFIAECPAQELILPCRCLT
RGNEYQIWCSHSELSNVLDGLKSIGKLITNPIDELILENNNLPSLPGRFFLPIRVMRLML
RNNYLQRVSSGWLTGLENTLMELYMVEPDLRSFPMDSLDQLRQLEAVTIKSNLMKRAPYF
SGLPRLRYIQIESTSLVELSPRNFKMLPSLEKLHITGSEHLTRLESNVLEDLPQLNIVNI
SFNAINWVHPRAFSRLPNLVELHLIGNQITDAGMIGRGTRDLQSLTTLRLDYNNIDKIGE
ASFVDIPALRDLYLSYNQITDIHHGAFHQTPQLRMLNLNHNLVRHVHPESFLQHSGSGLE
ELWLIDNDISHVSELRSLLDALPRLIFLDMSYNFLQDIPFGALRGHPTLERLHLNHNKIQ
MVEREAFTAMPALRELRLKNNSLSNLLDGPLWNLPALKGLDLSQNYFKRIEPRLLMNLPS
LRRLDLSENQLGIIDPASFLETPALEHVNISHNVLTTLHPATFRHLMHLYEIDVSHNRLV
EFVPGLPRGIENLHMSRNQITSLPLSPSPDLDLPSLRMLDISRNGIAKIQSGSFRTLPQL
RRLNLGKNSLQTLENSCLEGLTRLEVLDLHDNRLMLLHPQCLREKRELRELNLSGNHLEM
LVPEVLQDTEHLKKLDVSNNRLTEIMSGTFQNTRELKSFDCSYNSLTQLPPSIRNLKNLE
VLDLTNNRLRYLQPETLSSLAALTELKISRNRISELRQRAFDNLSNLKILELQDNEIDNI
EPLAINSLPNLTALKLGKNKLRILPDNVFRDLTSLETAELQENQLQNIADTAFNNVPHIL
LLNLSSNQIHNLDDAGLRSIRSLEVLDLSNNKLRRIDNSNMAKMEWLVELKMDNNKICTI
QGAPFNGMPRLRVLSLRNNLMSYIPEYTVKRLRSSIAVLDIEGNPISCSCPMLWMRAWLE
EASELGPRCSDGTYLREMRLSRQDCSNTEQQKQIAVSPECESEIVDSNLYGTSQVFSPYT
SIKDSTSQLGQNTAPSPEESDYFYDEYVDYPYNETSILAIEQNNSIYNNENKATPVPIIT
SSEKISSHFIPGDTPTIYAEPKKNSSNQQNFVQNDLSKYPSPSQSGFTFFGMPLPALNLG
SLWGSGRKADRKYGLVNTSRGNGRVQMYPEYYGGSNHVHKQYTINPLPEKYPPTVPDVQT
GGFVPMLPGSGGFTPMIPSSNKTEKNSTMEMNLYKNQHDFINTEISNTSDSKLTKRGPHF
IGSDKNSDQDLNKVIKNNKVTITKLDYKPTFIAPGANVSEIVTERTIISTTPELTNKKSF
STIVHSTTQPTIIENVSKSEFIKGPPSSPKNIIEEIEKNVTNFSIDEIVTTKPFNDEWET
NTENDFTKASSNESPSPLSALLIPGGQHPQQYKPPVGKPTITKVELASIRNISTTEKPTL
IDSFFTNDDLSKDETTTVKVIPSNGDGSMSWYFKNYNQTNLEPYIGPGHETHSLSVNNLS
VQLNVPYNFLIILTVITINLYR
NT seq
4569 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagttaatatttcgattaaaaattcacttatccattttaaatacttcgcaatggttc
cttcacaattttatatggtttttattgataaaatcatggatttctttaccaaatacaagt
ggtggatttattgctgaatgtccagcacaagaattgatattaccatgtagatgtcttaca
cgaggaaatgaataccaaatttggtgttcgcactcggaattatcgaatgttttagatggc
ttaaaatcaattggcaaattaataactaatccaattgatgaattaattttagaaaataat
aatttaccttcgttgcctgggcgtttttttcttcctattcgcgtaatgcgattgatgctt
cgaaacaattacttgcaaagagtttcttccggatggttaacagggttagaaaatacatta
atggaattatacatggtggagccggatttacgcagttttccaatggactcgttggaccag
ttacgacaattagaagcagttactatcaaatcaaatctaatgaaacgtgcaccatatttt
agtggattaccccgcttacgttacattcaaatagaatcaacatcactggttgaattatca
ccacggaatttcaaaatgctaccttcattagaaaaattacacatcacaggcagtgaacat
ttaacacgattagaatcaaacgttctcgaagatttaccacaattaaatatagtaaacata
tcatttaatgctattaattgggtacatccacgggcgttttcacgactaccgaatcttgtg
gaacttcatttaattggtaaccaaattaccgatgctggaatgattggtcgtggtacaaga
gatttacaatcgttgactacgttacgtttagattacaataatattgacaaaattggcgaa
gcatcattcgttgatattcccgctctacgtgatttgtatttatcatataatcaaatcaca
gatattcatcatggagcgttccatcaaacaccacaattacggatgttaaatttaaaccat
aatttggtacggcatgtacatccagaatcatttttacaacattctggtagtggattagaa
gaattatggttaatcgacaacgatataagtcatgttagtgagttacgatcacttttagat
gcacttccacgattaattttcttggatatgagctacaatttcttacaagatataccgttt
ggtgctctacgaggtcatccaactttagaacgattacatttaaatcataataaaattcaa
atggttgaacgagaagcttttactgcaatgccagccttacgagagttgagattaaaaaat
aattcgctttcgaatttattggatggtcctttatggaatttacctgcactaaaaggacta
gatttatcacaaaattattttaaacggatagagccacgtttgttaatgaacttaccatcg
ttaagacgattggatttaagtgaaaatcaacttggaatcattgatcccgcttcattttta
gaaacgccagccttagaacacgttaatatatcgcataatgttttaacaacgttacatcca
gcaacgtttcgacatttaatgcatctatacgagattgatgtcagtcataatcgtttagtg
gaatttgtacccggcttaccaagaggaattgaaaatttacatatgtcacggaatcaaatc
acaagtttaccgttatcaccatcaccagatttagatttaccttccttaagaatgttagat
atatcaagaaatggtattgcgaaaattcaatcaggttcatttcgaactttaccacaattg
agacgattaaacttgggtaaaaattcattacaaacgctagaaaacagttgcttagaaggt
ttaactcgcttagaagttttagatttacatgacaatcgattaatgttattacatccacaa
tgtttacgagaaaaacgagaactaagagaattaaatttgagtggtaatcatttagaaatg
ttagttccagaagtcttacaagatacagaacatttaaaaaaattggatgttagcaataat
cggttaacggaaattatgtcaggaacatttcaaaataccagagaactgaaaagttttgat
tgttcctacaattcacttacacaattaccaccatcaattcgaaatttaaaaaatctagaa
gttcttgatctcaccaacaatcgattacgttatttacagccagaaactttaagtagttta
gcggcattaacagaattaaaaatatcacgtaatcgtatatccgaactacgacaacgtgct
tttgataatttgtcaaatttaaaaattcttgaattacaagacaatgaaatcgataatatt
gaaccattagcaataaattcattaccaaatttaacagcattaaaattaggtaaaaataaa
ttacggatattaccggataatgtatttcgcgatttaacatcgttagaaactgctgaatta
caagaaaatcaattacaaaatattgctgacacagcgtttaataatgttccacatatatta
ctgttaaacttgagctcaaatcaaatccataacttagatgatgctggtttgagaagtatt
cgatctttagaagtactagatttaagtaataacaaattacgacgtatagataattcaaat
atggcaaaaatggaatggttagtagaattaaaaatggataataataaaatttgtacaatt
caaggtgcaccatttaatggaatgccacgattacgtgtattaagtttacgaaataatctt
atgtcatacataccagaatatacagtgaaacgattacgaagtagtatagctgtattagac
atcgaaggaaatccaatttcttgtagttgtcctatgttatggatgcgtgcttggttagaa
gaagcatctgaacttggtccgcgttgttcagatggaacatatttacgcgaaatgcgttta
tcacgacaagattgttcaaatactgaacaacagaaacaaattgctgttagtccagaatgt
gaatcggaaattgttgattcaaatctttatggaacatctcaagtattttctccgtacacc
agtatcaaagatagtacttcacaattaggacaaaatactgctccttccccagaagaaagt
gattatttctatgatgaatacgtcgattatccatacaatgagactagcattcttgctatc
gaacaaaataatagtatttataataatgagaacaaagcaactccagttccgattataact
tcctcagaaaagatatcgtcgcattttattccaggtgatactccaactatctacgcagaa
cctaaaaaaaattcttcaaatcaacaaaattttgtacaaaatgatctcagcaaatatcca
tcaccaagtcaaagtggttttactttcttcggtatgccattaccagcactgaatttagga
tctttatggggttctggtcgaaaagctgatcgtaaatatggccttgttaatacttcacgg
ggaaatggtcgagttcaaatgtatccagagtattatggtggatcaaatcatgtacacaag
caatatacaattaatccactaccagaaaaatatccaccaacagttcctgatgtacaaact
ggaggatttgtaccaatgttacctgggtctggaggatttacaccaatgataccaagttca
aataaaactgagaaaaattcaacaatggaaatgaatttatataaaaatcaacacgatttt
attaatacagaaatatcgaatacatctgatagtaaattaacaaaacgtggtcctcatttt
ataggatctgataaaaattctgatcaagatttaaataaagttattaaaaataataaagta
acaatcacaaaattagattataaaccgacctttattgcgcctggtgctaatgtatcggaa
attgtaactgaacgaactataatatcgaccacgcctgaacttaccaataagaaaagtttt
tccacaatagtccattctactacacagccaacaatcattgaaaatgtatcaaaatcagaa
tttattaaagggccaccgtcttcaccaaagaatataatcgaagaaatagaaaaaaatgtc
acgaatttttcgatagatgagattgtcacaacaaaaccttttaatgatgaatgggaaaca
aatacagaaaatgattttacaaaagcatcatcaaatgaaagtccaagtccattgtctgct
ttgttaattccaggtggacaacatcctcaacaatataaaccaccagtgggtaaacctaca
atcaccaaagttgagttagcaagcattcgaaatatttctacaactgaaaaaccaacatta
attgatagttttttcacaaatgatgatttatctaaagatgaaacaactactgtaaaagtt
ataccaagtaatggagatggttcaatgagttggtattttaaaaattataaccaaacgaat
ttggaaccgtatattggaccaggacatgaaactcatagtttaagtgtaaataatttaagt
gtgcaattaaatgttccgtataattttttaattatattaactgtaattactattaatttg
tatcggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
