Caldicellulosiruptor diazotrophicus: CaldiYA01_06900
Help
Entry
CaldiYA01_06900 CDS
T08057
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cdia
Caldicellulosiruptor diazotrophicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Guanylate_cyc
TPR_12
TPR_MalT
TPR_8
TPR_2
TPR_19
TPR_7
DZR
ANAPC3
zinc_ribbon_2
TPR_6
TPR_1
zf-ribbon_3
DUF357
NMD3
zinc_ribbon_15
YfdX
DUF5667
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCS80730
LinkDB
All DBs
Position
complement(757267..760743)
Genome browser
AA seq
1158 aa
AA seq
DB search
MFCFNCGNKLQEKFVSSCIVCGIKFDKYCANCNYPVPSFANFCPNCGSFISKSQEYSKTE
ELKKLAIMFADVSDFTKLSEKFSPDELRNLINEFFEYILRPVYNFNGIVDKFIGDCALII
FGLKDSPIDAPLKSVQCALEMIKLSQEFSKTKNINLFLSVGINYGFVMVGKIGGFFEKDY
TVLGDVVNTAQRLQTAAPPNTIYVSESIYRETYENIEYSGPIELNLKNKSKVVKCYIPKK
VNEQVEYNHIIEVLLHNYTSNVIDRIISKDSDFLVLLSSDNCGKHFIINIIMRHLDKSNI
RYYYISLSERYAQKPFYLLSLLILKILNVNYEDSLIIKKNRLISFAEYLFKENLKMAEKC
YNYLSLILHLDLSSDFKEFISYMTPEDIMFELFEVITFFLKKVFETEFSVVIIENLNLAD
KESLDFIVSFISQQQSKPFFIFSTNTELRNFPENYYIRVNELSIENIKKAVQIYFNTKEV
DNESLRLLIDISEGKLDYLLETLKWLEVNKFYIVLNDIFKIVLSEKNIESIKTNIILNKI
FHVENEILDFLKIAAVYGFRFSSRIIFNILQPSKEPSYLITQAQKLNLIKFVDSVYNSNF
PDKIYQFVEPEIVKILLELIPLHIRKNLHLKIATTIEKIVSKEDLAIYYETLFYHYKEAG
NFLKGANYLFELAMQYKKRQLINYALKYLYKLLDEIKNINVEDAITLYTSIIEQLASSEK
NLGNYEAAISHYTKLLNLYKTDEEKFLLEAEICECYILQSNFEKAKTYLNKLKENYVFEG
NIKKSRILYLLCLYKSYIGEPDLQYYINQLEITLKENDDFEQLAQILNIVSYSVYAFTGE
SKKAFLYLKKALNYANKSKNLLLKAKILTNIGTLYYEEGKSSEAIKYMFDAFELSKILSN
RHLQLILLNNIGIINFEKGVLGKALESFLKALSYADEWKLFYEECVSYLNLGELYLEKGD
IIESYNSFSQSLDLANKFNFISEKALSLIGLAKVMLEKGNLSAANDLLNEVAKIISDSKE
NRIELEYILAKTKLDLLKNKVDNAILVIEKAIAITEQLKNPLHKIKTLRMYSTVLRHKGE
YISALKNLKVCEKLANQIESSLELAKIYYDIANTYIVLGNEKEFDETIKLAHFWAEKIDS
EHNIKSLIDTLLKQSKRG
NT seq
3477 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttctgttttaactgtggaaacaagttacaagaaaaattcgttagcagttgcattgta
tgtggtataaaatttgacaagtactgtgcaaattgtaattatccagtcccttcttttgct
aatttttgcccaaactgtggcagttttatttcaaaatcacaggaatattctaaaacagaa
gaacttaaaaaattagctataatgtttgctgatgtttcggatttcacaaaactttctgaa
aagttttctcctgatgaacttagaaacttgataaatgaattttttgaatatattttaaga
ccggtttacaattttaatggaattgtagataaatttataggtgattgtgccctcattatt
tttggactaaaagattctccaattgacgcaccattaaaaagtgtccagtgtgcgcttgaa
atgataaagttatcacaagaattttcaaaaactaaaaatattaatctttttctttctgtt
ggaataaattatggttttgttatggtgggaaagattggcggattttttgaaaaggactat
actgttttaggtgacgttgtgaatactgctcagagacttcaaactgctgctccaccaaat
acaatttatgtatcagagagtatttatagagaaacatatgaaaatatagaatattctggc
ccaattgagctaaatttaaaaaacaaatctaaagttgtgaaatgttatattcctaaaaaa
gttaatgaacaagttgaatataaccacatcattgaggtattgttgcacaactacacatca
aatgttattgacagaattatttcaaaagattctgattttttagtattattatcttctgat
aactgtggaaagcattttattatcaatattataatgagacatttagataaaagtaatata
aggtactattatatcagtttatcagaaagatatgcgcagaaacctttttatcttttatcg
ttattaattttaaaaatactaaatgtaaattatgaagattctctaattataaagaaaaat
aggcttatatcatttgcagagtatttatttaaagaaaatctcaagatggccgaaaaatgt
tataactatctttcacttattcttcacttagatctcagtagtgattttaaagaattcatt
tcttatatgacaccagaggatattatgtttgaactttttgaagttattacctttttttta
aaaaaggtttttgaaacagagttttctgttgttataattgaaaatctaaatctggcagat
aaagaatcattagattttatcgttagttttatatcacaacaacaaagtaagccatttttt
atcttctcaacaaacactgaattaagaaattttccagaaaattactacatcagagtcaat
gaattgtcaattgaaaatatcaaaaaggcagttcaaatttattttaatacaaaagaagtt
gataatgaatcattgagattactcatagatatatctgaaggcaaattagactatctctta
gaaacattgaaatggttagaagtaaacaaattttatatagtattgaatgatatttttaaa
attgttctttccgaaaaaaatatagaaagcattaagactaatattattctcaacaagatt
tttcacgttgaaaacgaaatattggattttttaaaaattgcagccgtttatggtttcaga
ttcagtagcaggataatatttaatatacttcaaccttcaaaggaaccttcatatttaata
actcaagcacaaaagttaaatctcatcaaatttgtagatagtgtatataactccaatttt
ccagacaaaatataccaatttgttgaaccagaaattgtaaaaatacttcttgagttgatt
ccattacacattaggaaaaacttgcacctgaaaattgcgaccaccatcgaaaaaatagtg
tctaaggaagacttagcaatttattatgagacattgttttatcattacaaagaagcagga
aattttcttaaaggtgcaaattacctttttgagcttgcaatgcagtacaaaaaaagacag
ctaataaattatgctttaaaatacctctataagttacttgacgagattaaaaacattaat
gttgaagatgcaataactctttatacttccattatagaacaacttgcaagttcagaaaaa
aacttaggaaattatgaagcagccatttcgcactatactaaacttcttaatctttacaaa
acagatgaagaaaaatttttattagaagctgaaatttgtgaatgttatatcctccaaagt
aactttgaaaaagcaaaaacctatttaaacaaattaaaagaaaactatgtttttgaagga
aacattaagaaaagtagaatattataccttttatgtctttataaaagctacattggcgaa
cctgatttgcaatattatataaaccagcttgaaataacattaaaggaaaatgatgatttt
gaacaacttgcacagattttaaatattgtctcttattctgtctatgcatttactggtgag
tcaaaaaaggcatttctttatcttaaaaaggctttaaactatgcaaataagtcaaaaaac
ttattgcttaaagcaaaaatccttacaaatattggaacactttactatgaagaaggcaaa
tcatcagaagcaataaaatatatgtttgatgcatttgagctttctaagattttatctaac
cgtcaccttcagttgattttgttaaacaatattggaataataaatttcgaaaaaggagtt
ttgggaaaagccttagaatcattcttaaaagctttatcatatgcggatgaatggaaactc
ttttatgaagaatgtgtgtcttatcttaatcttggtgaattgtatcttgaaaaaggagat
atcatagaaagttataactccttttcacagagtttagacctagcaaataaattcaatttt
atctcagaaaaagctttatctttaatcggacttgcaaaagtaatgcttgaaaaaggtaat
ctctccgctgcaaatgacctgctaaatgaagttgcaaaaattatatctgatagcaaagaa
aataggattgagcttgagtatattcttgccaaaactaaactagacctcttaaaaaataag
gtcgataatgctattttggttattgaaaaagcaattgcaataaccgaacaattaaaaaat
ccattacataaaataaaaactttgagaatgtactcaaccgttctaagacacaagggagaa
tatataagcgctcttaaaaaccttaaagtttgtgagaaacttgcaaatcaaatagagtca
tctttagaacttgcaaagatatattatgatattgcaaacacttatattgttttaggaaac
gaaaaagagtttgatgaaacaataaaattagcacatttctgggctgaaaagattgatagt
gaacataatataaaatcattaattgatactcttttgaaacaaagcaaaagaggctga
DBGET
integrated database retrieval system
