Clostridium formicaceticum: BJL90_09160
Help
Entry
BJL90_09160 CDS
T05005
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
cfm
Clostridium formicaceticum
Pathway
cfm02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cfm00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
BJL90_09160
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
SLH
fn3_2
SBBP
Y_Y_Y
Pur_ac_phosph_N
Big_3_2
GspA_SrpA_N
Big_13
RGI_lyase
DUF4847
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOY76052
UniProt:
A0A1D9FL75
LinkDB
All DBs
Position
2018654..2026171
Genome browser
AA seq
2505 aa
AA seq
DB search
MKRRFSGLLILCLIVLTLYGALPSWAQDMKQEVVLNDLQMEEKIPEEIKEQMGSLQMPFI
KNEGQVKDEKVQFYAETFAGLVMVKEEGIVYLLPSEEDKKPQLLVEKFVDGESKIIEGQD
EAVTRVNYFKGQDPDQWQQNLSTYNRVSLGEVYDNIEVNLKAYGDNVEKIFIVAPGADPT
QIAIQLDGAKKIAVDEDGQLVIQTPGGALAMTAPIAYQEKEGQQIDISVSYWVEDNQYGF
RLGKYDVTKELIIDPMLASSLLGGKDKDYLTSMAVDAMGNVYITGYTYSMDMLQNASRPY
TGGNYFEWDPWTYMPPDPSDVVNPQDIFVAKLDGNLQSLLAATFIGGSESDVAETMMLGP
DGAVYIAGRTYSSGIRTYRDYLDYEDFEYDPWEWYDDEIVFELKPPTAFPTTSGTYQERF
PGTSETTTYIDSRQNSFFITRLNSNLNHIEASTFIGRGTSGTQGIYGIAFDGGGNIFVTG
TTNSDAYPTTSGAYDTTFNDDGANAFVSKLNKDLTTLQASTFLGGGGGLYNGTALRLDGT
EAKDIVVDTAGSVYITGSTTDKNFPIIGGYQSQFNNGRSDTSKDAFVAKLSNNLQNLQAS
TYLGGQSYDVGVALAVDAGGRIFVTGQTMSQDFPVSQDAYQDTIIGQYHDIFVTKLDQNL
NQMLASTLLGGSMREDVYAIALDTDNVYVVGSTSSSNYPTTDGSQDGMGENILISKLDKE
LRNLRASTLIGGAGLYDSGNDTGKGIVVQNGKVYIAGQTSSRNYPVTEGAYIRLPQTSRM
GDTDVFVTILKDTLTHARVTEVTTNLFNQTFGIGEEIPIKIKFNANVYVQGEGKPELKLN
AGDEAVATYISGSGSNTLEFLYTVQAGDQAEVLNYVATDSLQLEDCFLEDAGGDLIEAVL
PDPNSREALASRSIKINTVAPSIVKVTSPKADGTYGADNEIPIEIIFSEAVKVTGVPELI
LNTEPERVATYTSGSGTSTLTFTYLVQEEDSVENLNYKATDSLQLEEGSITDLMNNAANL
TLPDPLSEESLGGNKSIMIDNYAPRATVVTSSLEDGSYGVGGVIPIQITFSEAVNVAGTP
RLALNTVPQRYANYSSGSGTTVLTFEYTIQSGDNTIIAENNPQKIALNYKTVEDLILNYG
TEIGTITGVDKDNHVILTLPKPDSAAALAGSKSIIVDNKAPQYKSLTTDEKTYTTYGAGT
TLHINITFDEAVYVTGTPFLELNTTPDRSAVYASGSGTDTLKFIYTIQEGDAAAGELDYL
TTDSLKLGVEGSIKDAVGHDADLRLPWSSSLISGGDLKRRYIKIDAIVPTWGEDSWLEAT
NIGETSLTLNWSKTASDNIKVEAYNLYQDTNLIATIKGTAFTSPATTYNVMDLTPAKEYT
FHVEAVDAAGNESSNGPSTVAVTDGGTSGEDKEAPIWVDNSGLTVSEVGVRSLTLHWDKE
DVTDNVMVTGFNIYQDDQQIPVATVDSNTTSYKVMGLKSYTEYTFRVEAIDAAGNESTNG
PRITRKTEIPDLTVRGGKVKTEQEYLLADLLKLDIDENFPSQSVSAPILWQKYSTVNDFG
TSRRYAAEGVRISYLLEAAGVEPGYGKVTFYSTDASPLSLTEEQINAEKYYFPASGEAIL
VEPMLAYLSTDTSGAVEPNFANMMPHTLRLFFGQNNAGEVLNSYYKKNIYLIVVGDAEGT
TEDDEAPTWPTGSKLTASNITDTSVDLSWTLAEDNVEVTDYKIFKGAELMTTVTGSVYAY
NVTGLTAGTDYTFKVEAGDAAGNWSSDGPSISVKTAAAPPTADKEVPTWPSGNLTASNVT
QTGLTLTWSGAQDNVGVTNYKIFKGAELMATVTGSVYVYDLTGLTAGTDYTFKVEAGDAA
GNWSSDGPSVTVTTVPTTSNVTLVLSTDSAVVGENVTASGTADPDIWITIKIIDAAENIL
YFDAVKSDANGNYSNTFKVPITIPGRLTVVAGYGSNVANASLMIRETTPSDHEAPTWPSG
NLTVSNVTQTGLTLTWNGAQDNVDITNYRIFKDAELIATVTGSVYAYNVTGLTAGTDYTF
KVEAGDAAGNWSSDGPSISVKTAAAPPTADKEAPTWPLGNLTASNVTQTGLTLTWNAAND
NIDVIAYKIYQNGSFIATVDGITTTYTVSGLSSGTNYTFKVEAGDAAGNWSTDGPSVTVK
TTTASSGGSGGGGGGSSTPKEPISTSTSTNTEVSVNPAKGATINLTENIHIVIPANALKE
TNPVSVSIKKVEIPPKASSDATLISDVYEFTVGGKKSYIFASNVKITLTFDPSAIGTDEE
PAMFYYDEAQQKWINIGGEVSESTITAEVDHFTKFAVFAVEKEGSLAVVAPQLETLKDIT
GHWGEDNIKKLVDLQVINGYPDGSFKPDGTITRAEFATMLVKAFEFDSNDEKVFKDTANH
WAKDYVSKAATFGIVSGYDADSFGPDDLITREQMTVMIVKAAKLAVVKEESTFADERNIS
QWAKEAVTTAVKHDIMKGYPDHTVKPQGSATRAEAVTVIIKALKL
NT seq
7518 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgcagattttctggtttgctaattctgtgtttgattgtgctgacactctatgga
gcattaccatcttgggcacaggatatgaagcaggaagttgttttaaatgatcttcaaatg
gaagaaaaaattccagaagagataaaggagcaaatggggagcttacaaatgcctttcatc
aaaaatgaagggcaggtgaaggacgaaaaggttcaattttatgcagaaacatttgctggc
ttagtgatggtgaaggaggaaggcattgtctatctactaccatcagaagaagataaaaaa
cctcagctacttgtagagaagtttgttgatggtgaatccaagataattgaaggccaggat
gaagctgttacaagagttaattattttaaagggcaagatccagaccagtggcaacagaat
ttgtcaacctacaatcgtgtcagtctaggagaagtatatgataatatcgaggtaaattta
aaggcctatggtgacaatgtggaaaagatttttattgtagcaccgggggcagaccccaca
caaattgccatacagcttgatggggcaaaaaagatagctgttgatgaagatgggcaattg
gtcatccaaacccctggtggtgcactggcgatgactgctcccatagcctatcaggaaaaa
gaaggacaacagatagatatatctgtatcctactgggtagaggacaaccagtatggcttt
cgtttaggaaaatatgatgttacgaaggagctcattattgatcctatgctggcttctagt
cttttgggaggaaaagataaggattatttaaccagtatggcggttgatgccatgggaaat
gtttatataacgggctatacttattcaatggatatgttgcaaaatgccagtagaccctat
acaggaggaaattactttgaatgggacccatggacatatatgccaccagaccccagtgat
gtggtgaatccccaagatatctttgttgccaagttagatggaaatttacaaagtttatta
gctgctacttttatcggtggaagtgaaagtgatgtagctgagacgatgatgttagggcca
gatggtgcagtttatattgcaggaagaacttactcgtctggtattagaacctatagagat
tatttagattatgaggacttcgagtatgatccctgggaatggtatgacgatgaaattgta
tttgagcttaaaccacctacagcttttcctactaccagtggtacttaccaagaaaggttc
ccaggaacaagtgaaacaaccacatatattgactcaagacaaaatagtttttttatcaca
cgattaaatagtaatcttaatcacattgaagcatctacctttattgggaggggaacaagc
ggtacacaagggatttatggcattgcatttgatggcggtggaaatatctttgttacggga
acaaccaattcagatgcataccctacaacttctggagcttatgatactacctttaatgat
gatggtgcgaatgcctttgtttctaaattgaacaaagacttaacgactttacaagcttct
accttcttaggaggtggcggtggtttatataatggtactgctttaagattagatggtaca
gaggcaaaggacattgtggtagatacagcaggaagcgtctatatcactggttccactacg
gataaaaactttcctattatagggggatatcaaagtcaatttaacaatggaagaagtgat
acatcaaaggacgcttttgtggctaaattaagcaacaaccttcagaacctgcaggcgtct
acctatctgggagggcaaagttatgatgtaggcgttgctttagctgtggatgcagggggc
aggatatttgttactggacaaacaatgtcacaggattttcctgtttctcaagatgcctat
caagacacaattattggccagtatcatgacatatttgtgacgaaattagatcaaaacctc
aaccaaatgttagcgtcaacattactggggggtagcatgagggaagatgtttatgctatt
gctttggatacagataatgtttatgtggtaggctccacatcatcatcgaactatcctact
accgatggttcacaggatggtatgggtgaaaacatcttgattagtaagttagacaaagag
ttaagaaatcttcgagcttcaaccctcatcggtggggcaggattgtatgatagtggcaat
gatacgggaaaaggcatcgtggtgcaaaatggtaaggtttatattgctggacaaacctct
tcccgtaactatccagtgacagaaggtgcttatattcgtttgcctcagaccagtagaatg
ggggacacagatgtttttgttactatattaaaggatactttaacacatgcccgtgttact
gaggtgacaacgaatctttttaatcaaacctttggcataggtgaagagatccctatcaaa
attaaatttaatgcaaatgtctatgttcaaggagaaggtaaaccagaactaaagcttaat
gctggcgatgaggctgtagccacctacatcagcggctcaggaagtaacaccttggagttc
ttgtatacagtacaggcaggagatcaagcagaagtattaaactatgttgctacagattct
ctgcagctggaggattgtttcctcgaggatgccggtggagatcttatagaagcagttctt
ccagatcctaattctcgagaagctttagcttctagaagcataaagatcaatacagttgct
cctagcatagtaaaggttacttctcctaaagcagatggtacctatggtgcagataatgag
attccgattgaaattatctttagcgaagctgtaaaagttacaggcgtacctgagttaata
ctcaatacagaacctgagagggtggctacttatacaagtggctcaggcaccagtacacta
acttttacttatttagttcaagaagaagatagtgtagaaaacttgaattataaagcaaca
gattctctgcagttagaagaaggaagtatcactgatttaatgaacaatgcagctaatttg
acacttccagatcctctttcagaggaatctttaggtggtaataaaagtattatgatcgac
aattatgctcctcgtgctacagtggtaacatcttcattagaggatggaagctatggtgtg
ggaggggtgattcctattcaaatcacctttagcgaagctgtaaatgttgcgggaacccct
cgattggctttgaatacagtaccacagcgttatgccaattatagtagtggttctggaaca
acggtgttgacctttgaatatacgattcaaagtggtgataataccatcatcgccgaaaat
aaccctcagaaaatagcattgaactacaagacagtagaagatttgattttgaactatggc
acggaaataggtacaatcactggcgttgataaagacaatcatgttattttaacgctgcca
aagcctgatagtgctgctgcattagccggtagcaaaagtattatcgtcgataacaaggca
ccacaatacaaaagcttgaccacagatgaaaaaacatataccacctatggtgctggtaca
acccttcacatcaatataacctttgatgaagcggtttatgtgacaggaacacctttccta
gaactgaatacaaccccagaccgcagtgcagtttatgcatctggtagtggtacagatacc
ttgaagtttatctataccattcaagagggtgacgcagcagcaggtgagctagattacctt
actacagattcattaaagctaggggtagaaggcagtattaaagatgctgtaggacatgat
gctgatttaagacttccctggagtagtagcttgatatctggcggagacttaaaaagaaga
tatataaaaatagatgctatagtacctacttggggtgaagacagctggttggaagcaacc
aacatcggagagaccagcctcacattaaactggagtaaaacagcaagtgacaatattaag
gttgaagcctataatctttaccaagatactaacttgatcgctacgataaaaggtactgca
tttaccagccctgccactacttataatgtaatggatttaacaccggcaaaagaatatacc
ttccatgtggaggctgtagatgcggcaggaaatgaaagcagcaatggtcctagtactgtt
gcggtcacagatggagggacatcgggagaagacaaggaagcaccaatttgggtagacaac
agtggattgaccgtttctgaagtaggtgtacgcagtttaactttacactgggataaagag
gatgtaaccgataatgtgatggtaactggatttaatatttaccaggatgaccaacagata
ccggtagccacagtcgattccaacacaacgagttataaagttatgggcttaaagtcatat
acagaatatactttccgtgtggaagccatagatgcggcaggaaatgagagtactaacggt
ccacgtataacacggaagacagagattcctgatctgactgttagaggaggcaaggtaaaa
acagagcaagagtatttgctggcagatttattgaaattggatattgatgaaaactttcca
tctcaatctgtatcagcgcctattctatggcaaaaatattctacagtaaatgattttggc
accagcagacgctatgctgctgaaggggtaagaatatcttatttacttgaagcggcaggg
gttgaaccaggttatggtaaggtaactttctattccacggatgctagtccattatcattg
acagaagaacagattaacgcagaaaaatattattttcctgcctcaggagaagctatatta
gtagaaccgatgctggcttatctatctacagatacatcaggtgcagtggagccaaacttt
gccaatatgatgccccatacattgcgtttgttcttcggacagaataatgctggggaagtt
ctaaacagttattataagaaaaatatttaccttatcgttgttggtgacgcagaaggaaca
acagaagatgatgaggcgccaacttggcctacaggcagcaaactgacagcttctaatatc
actgataccagtgtagacttgagctggacacttgcagaagataatgtagaggtaacagat
tacaagatattcaaaggcgctgaattaatgacaactgtcacaggttcagtgtatgcctat
aatgtaactggcctaactgcaggcactgattatacctttaaggtagaagcaggggatgcg
gcaggtaactggagtagtgatggccctagtatttcagtaaaaacagcagcagcacctcca
acagcagacaaagaagtaccaacttggccttcaggcaacttaactgcttctaatgtaaca
caaactggattgacattaacttggagtggagcacaggataatgtaggggtgacaaattac
aaaatatttaaaggtgctgaattaatggcaactgtcacaggttcagtatatgtctatgat
ttaaccggtttaactgcaggcactgactatacctttaaggtagaagcaggggatgcggca
ggtaactggagcagtgatggtcctagtgttactgttaccacagttcctacaacttctaat
gttactctagtcttaagtacagatagtgcggttgtaggagaaaacgtaaccgcctctggc
acagctgatccagatatctggatcaccataaaaataattgacgctgctgaaaacattctc
tattttgatgcagtaaaatccgacgctaatggaaactacagtaatacctttaaggtaccc
attactataccgggaagattgacagttgtggcaggttatggaagcaatgtcgccaatgca
agcttaatgataagggaaacaacaccatccgaccatgaagcaccaacttggccttcaggc
aatttaaccgtttctaatgtgacacaaactggattgacattaacttggaatggcgcacag
gataatgtagacataacaaattacaggatattcaaagatgctgaattaattgcaactgtt
acaggctcagtatacgcttataatgtaactggtttaacagcaggcacagattataccttt
aaggtagaagcaggggatgcggcaggtaactggagtagtgatggccctagtatttcagta
aaaacagcagcagcacctccaacagcagacaaagaagcaccgacttggcctttaggcaac
ttaactgcttctaatgtaacacaaactggattgacattaacctggaatgctgcaaatgat
aatatagatgtgattgcttataaaatatatcaaaacggttcttttatagctacagtagat
ggtatcactactacatacaccgtcagtgggcttagcagtggtacaaactatacctttaaa
gtagaagcaggggatgcagccggcaattggagtaccgatggccctagcgttactgtaaaa
acaacaactgcttccagtggtggcagtggtggaggtggcggcggttctagcacgcctaaa
gaacctatctccacatctacttctacaaacacagaagtatccgtaaatcctgccaaggga
gctacaataaatttaacagaaaacattcatattgtgatacctgcaaatgctttaaaggaa
acgaatcctgttagcgttagcatcaagaaggtagaaatacctccaaaggcttctagcgat
gctacattaatcagtgatgtatatgagtttacagtgggaggcaaaaaatcctatattttt
gccagcaatgtgaagataacattgacatttgatccaagtgctataggaactgatgaagaa
ccagctatgttctattatgatgaagctcaacaaaaatggatcaatataggtggagaggta
tcggagtccacaatcactgcagaagtagaccattttactaagtttgctgtatttgcagta
gaaaaagaaggtagcttagcggtagtagcacctcagttagagacactaaaagatatcact
ggacactggggagaggataatatcaaaaagttagttgatttacaagtaatcaacggttat
ccagatggtagctttaaacctgatggtactatcactagggcagaatttgctaccatgttg
gtgaaagcgtttgaatttgatagtaatgatgaaaaagtatttaaagatacagctaaccat
tgggcaaaagactatgtatctaaagcagccacatttggtattgtcagtggttatgatgct
gacagttttgggccggacgacttgattacccgtgagcaaatgacggtaatgattgttaag
gcagctaaactggccgtagtaaaagaagaaagtacttttgcagacgagagaaatatttct
cagtgggcgaaggaggctgttactacagctgtaaagcatgacattatgaagggatatcct
gatcatactgtcaaacctcaaggcagtgctactagagctgaagctgttacagttattatc
aaggctctaaagttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system