Clostridium sporogenes: CLSPO_c17080
Help
Entry
CLSPO_c17080 CDS
T03905
Name
(GenBank) putative UDP-glucose 4-epimerase
Organism
cld
Clostridium sporogenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Epimerase
GDP_Man_Dehyd
3Beta_HSD
RmlD_sub_bind
Polysacc_synt_2
NAD_binding_4
adh_short
NAD_binding_10
Sacchrp_dh_NADP
adh_short_C2
Nuf2_DHR10-like
DUF4118
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC62428
UniProt:
A0A7U4LMW2
LinkDB
All DBs
Position
1880369..1882555
Genome browser
AA seq
728 aa
AA seq
DB search
MRVLVTGGYGFIGSHVVERFAKEGYEVFIIDNMSSGKLENVNCKHKFYKFDVEDKRCEFV
FKNNNFDIVVHLAAQINVITSLKDPFLDTKTNILGLVNMLELSTKYKVKKFIFASSAAIY
GNNENIPLTEREIAEPLSPYGISKYVGEGYCKKWNEIYNLDTICFRFSNVYGPRQGIIGE
GGVVSIFMDNITKDQEITLNGDGEQTRDFIYVSDLTDALFKAAESNISSGVYNLSTNSRS
SLNNLIKILNNLKNIKGIIKKEDRKGDIKHSSLDNTKIKKALGWIPMVSLEQGIKNTFDW
YSTNYKVEESNTEKKKLKYDDKIKKCIPYIENIALFILIIVLTTFKNGEYLENTMDLKLA
YIFIIGLTHGRNQTIIATTLTSILVTVENILRGRSVFTLPLDTNFAFKIGMYILVGVIIS
YIFERYLKKEQSQKRIVESLKDEYDLLQNIYNEILEEKSVLQDQVVNSENSFGKIYGIIK
KLDSLESQYVYSEAVEVIEKILKVGDASIYSMDKNNKYLRLIVRKGKNDINMPKTITLDY
LKEAKTNIFNGELFVNKNLHRDIPMFISPINDQHGTPIALIMINSVKFERLTLHFINLIN
VVTGLIKAAILKAYKYEEAIRDKRYIENTPILKREFFENIKNIKKDEMEKNKSEFIMLKV
KNKDKDINSLSHLIFKTIRQSDYIGMTSHDDLVLILSNASKSDSGLIVERLNEKGIQAEE
YNEEYLYV
NT seq
2187 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagttttggtaactggaggatatggctttattgggtcacatgtagtagaaaggttt
gcaaaggaaggatatgaagtatttatcattgataatatgtcttcaggaaaacttgaaaat
gtgaattgtaaacataaattttataaatttgatgttgaagataaaagatgtgaatttgtt
tttaagaacaataactttgatattgtggttcatttagctgcgcaaattaatgtaataacc
tctttaaaagacccgtttttagatactaaaacaaatattttaggtttggttaatatgctt
gaattatctacaaagtataaggttaagaaatttatttttgcttcttcagcagcaatttat
ggtaataatgaaaatatacctcttacagaaagagagatagccgagccgttatcaccttat
ggtataagtaaatatgtgggagaagggtattgtaaaaaatggaatgaaatatataattta
gatactatttgttttagattttcaaatgtatatggaccaagacaaggaattataggagaa
ggtggagttgtttccatttttatggataatataactaaagatcaagaaattactttaaat
ggtgatggagagcaaacaagagattttatttatgtatcagatttaacagatgcattattt
aaagcagctgaaagtaatatttcttctggagtgtataatctttctactaatagtaggtca
agcttaaataatttaattaaaatattaaacaatttaaaaaatataaagggcattattaaa
aaagaagatagaaaaggagatattaaacattccagtttagataacacaaagataaagaaa
gcactgggatggatacctatggtttcactagaacaaggtataaaaaatacatttgattgg
tattcaactaattataaagttgaagaaagcaatacggaaaaaaaaaagttaaaatatgat
gataaaataaaaaaatgtataccctatattgaaaatatagcattatttattctaataata
gttttgactacttttaaaaatggagaatatcttgaaaatactatggatttaaaacttgct
tatatttttataataggattaacacatggaagaaatcaaacaataattgcaactacatta
actagcattttagttactgttgaaaatattttaaggggaaggtctgtttttacgttacct
ctagatactaattttgcttttaaaattggtatgtatatattagttggggttattattagt
tatatttttgaaagatatttgaaaaaagagcagtctcaaaagagaattgttgagtcttta
aaagatgagtatgatttattacaaaatatatataatgaaatacttgaagaaaagtcagtt
ctgcaagatcaagttgtaaattcagaaaatagctttggaaagatatatggaattattaag
aaattagatagcttggaatcacagtatgtttatagtgaggcagttgaagtaatcgaaaag
attttgaaggtaggggatgcatcaatatactcaatggataaaaacaataaatatttaaga
ttaattgttagaaaggggaagaatgatattaatatgcctaagacaattacattagattat
ttaaaagaagcaaaaactaatatatttaatggtgaattgtttgtaaataaaaatcttcat
agggatattccaatgtttatttctccaataaatgatcagcatggtactccgattgcttta
ataatgattaattcggttaagtttgaaagattaacattgcattttataaatttgataaat
gtggttacaggcttaattaaagcagctattttaaaggcatataaatatgaagaagctata
agagataaaagatatatagaaaatacgcctattttaaagagagagttctttgaaaatata
aaaaatattaaaaaagatgaaatggagaagaataaatcagagtttattatgttaaaagtt
aaaaataaagataaagatattaatagtttatctcatttaatatttaagacaattaggcaa
agtgattatataggaatgacgtcacatgatgacttagttttgattttatcaaatgcttct
aaatctgatagtggcttaatagtagaaagattaaatgaaaaaggtatacaagctgaagaa
tataatgaggagtacctatatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system