Caldivirga maquilingensis: Cmaq_0900
Help
Entry
Cmaq_0900 CDS
T00611
Name
(GenBank) Beta-galactosidase
Organism
cma
Caldivirga maquilingensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_35
BetaGal_gal-bd
Glyco_hydro_42
BetaGal_ABD2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABW01734
UniProt:
A8MD78
LinkDB
All DBs
Position
complement(941026..943704)
Genome browser
AA seq
892 aa
AA seq
DB search
MLLCGEMHYFRVPRGLWEDRLLKIKRAGLNCLNTYFAWNYHEVEPGVFDFSGEKDVDVYL
SKAEELGLKIIARVGPYICSEWDNGGHPDWLLSRGLVPRSLDSSYWPYAERWLRVILPIV
VKHQEPNGGVDIVQLENEYFWGDAPLHMKLAELARQVGVTAKLYTNVNRYVRNTVYTDAL
DLYPSPWDLNSVIWSIKDLLETQGGRPKILEYEGGWFSVIHRPLPTSRGSFPPDWTRILL
ATALAYGSDVVSFYMFHGGTNFGYWTGRWITTTYDYEASIREWGELSERYYKVKLITPLA
EFIDGSETEGESYDNGKLLVIRRKGDLRLKFYINNTETDWIDGDVKVPARGVKVIPSNLS
VKGATISETNLSLLTVRDGDVLLYGNAGEEFKIRLKGGLVKSCLGVEYRTEGDSIVLSGK
VPGELNGCLIEGKGNVRVLILSELFASRTWIMNDYYVPSNVYLIRDGNYNSLLIEAKEGV
NVLYLPFKSSKGRYIPELDLTRIELNVNVEQPNVSITQVTKGSVSIKPILKISDIKPLEE
LGLFKHGLYIYDTKLNASGLIGFIAHDYAAVINNGRVTANGFIYIKTNANAGDLRIVVES
TGHPNDGTIPFFTGLQSPVLINQVGSIKVDSWEYGILDLSSRLKPGIATNYSHTMVINKE
IKEYLPKVKWVKSISDLGKPNNAVIYYRGRIHLNEARHVILRISKADQWAAMVIFINGEE
VYRGHGDEPFETTVYGGLRSGDVEVVIALLRYGIKEINSTPGNVEIDLWGGIINDYSLSI
MELGEARDSVKLPLIISEPSTIKLKFTVNKPSDTNAPLNVELSGRIHALIYLNGILIGRY
YPGDSQSMFYLPEPYLSEENELTILATPVESNATVNVTFKPYMVTRIINLTL
NT seq
2679 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcctatgtggtgaaatgcattacttcagggtccctaggggtctttgggaagatagg
ctgcttaagattaagagggctgggttaaactgcttaaacacctacttcgcttggaattac
catgaggttgaaccaggggtatttgacttctccggggagaaggacgttgacgtgtactta
agtaaggctgaggagcttggccttaagataattgccagggttggaccctatatatgttcg
gaatgggataatggtggacaccctgactggttactgagtaggggattggtgcctaggagc
cttgactcatcctactggccttacgctgagaggtggcttagggtaatattacccattgtt
gttaagcatcaggaacctaatggtggtgttgatattgttcaattggagaacgagtacttc
tggggtgatgcaccactccacatgaagctagctgagttagctaggcaggttggtgttact
gctaagctgtacactaatgttaataggtatgttaggaacacagtgtacactgatgccttg
gatctttacccaagcccatgggacctaaactcagtaatatggagtattaaggatctcctg
gaaacccagggtggtaggcctaagatacttgagtatgagggtgggtggttctcggttatt
cataggccattaccaacatcaaggggtagtttcccacctgactggactaggatactttta
gcaacggcattagcctatggttcagatgttgtaagcttctacatgttccatgggggcact
aatttcggttactggactggtagatggataaccactacttatgattatgaggcttcaatt
agggagtggggtgaattaagtgaaaggtactataaggttaagttaattacaccactggct
gaattcattgatggtagtgaaacagagggtgaatcatacgataacggtaagctattagtt
attaggcgtaagggtgacttaaggttaaagttctacattaacaacactgagactgattgg
attgatggtgatgttaaggttccagcaaggggtgttaaggttattccaagtaacttaagc
gttaagggtgctacaattagtgaaacaaacctaagcctactgaccgttagggatggtgat
gtgttactttacggtaatgccggtgaggaattcaaaattaggcttaagggtggcttagtt
aaatcatgcctaggtgttgagtatcgtactgaaggcgactcaatagtgctgagcggtaag
gtgccgggtgaattaaatggttgcttaattgagggtaaaggtaatgttagagtgttgatt
ctaagtgaattattcgcatccagaacctggataatgaatgattactatgttccatcaaat
gtatacttaattagggatggtaactacaactcactgttaattgaggctaaggagggtgtt
aacgtgctttacctaccctttaagtcaagtaagggtaggtacattcctgaactggactta
accaggattgaacttaacgttaatgttgagcaacctaacgtatccataacccaggtgact
aaaggctcagtgagtattaaacctattcttaaaattagtgatattaagccccttgaggaa
ttaggcttgtttaagcatggattatacatctacgacaccaagcttaacgcaagtggatta
ataggcttcatagcccacgattacgccgcagtaattaataatggtagggttacggcaaac
ggcttcatatacattaaaaccaatgctaacgccggtgacttgaggatagtggttgagtca
acaggtcaccctaatgatggcaccataccgttcttcaccggtttacagtcaccagtctta
attaatcaagtcggtagtattaaggttgattcatgggaatacggtatacttgacttatcc
agtagacttaagcccggtatagcaaccaattacagtcacaccatggtgattaataaggag
attaaggagtacttacctaaggttaagtgggttaagagcattagtgacttaggtaaacca
aataatgcggttatttactataggggtagaattcatttaaatgaggcgaggcatgtaatt
cttaggatcagtaaagccgatcagtgggccgcaatggtgattttcattaatggggaagag
gtctataggggtcatggcgatgaaccattcgaaaccacggtatacggtggtttaagaagc
ggtgacgttgaagtagttattgcattactaagatacggcattaaggagattaattcaacc
ccagggaatgttgagattgatttatggggcggcatcattaatgactacagcttaagcatt
atggagttaggtgaggcaagggatagcgttaaattaccgttaatcataagtgagccatca
accattaagcttaagttcacggtcaataaaccaagtgatactaatgcaccacttaacgtt
gagttgagtgggaggatccacgcattaatatacttgaacggtatattaatcggcaggtat
tatccaggcgattcacaaagcatgttctacttacctgaaccatacttaagtgaggagaat
gaattaaccatattagccacaccggttgaaagcaatgccacagtgaatgtaacgtttaag
ccctacatggtgacgaggattattaacctaactctatga
DBGET
integrated database retrieval system
