KEGG   Caldicellulosiruptor morganii: OTK00_000773
Entry
OTK00_000773      CDS       T08774                                 
Name
(GenBank) right-handed parallel beta-helix repeat-containing protein
Organism
cmor  Caldicellulosiruptor morganii
SSDB
Motif
Pfam: RGL11_C CBM_3 RGI_lyase Beta_helix FG-GAP_3 FG-GAP
Other DBs
NCBI-ProteinID: WAM34558
LinkDB
Position
821143..826188
AA seq 1681 aa
MFVKKKRRINVYLALIIFVVNIVLFNGQVNINKNNLAMAATESQIEKLNRGLIAVKVTNG
VFLSWRMFGSDPANIGFNIYRNGVKITKTPIQDSTNYIDADGTTGSRYYVRAVINGVEVE
QSEEVSVLNNNYIEIKLNKPANSPLGASYSPNDASVGDLDGDGEYEIVLKWDPSDSKDNS
QSGYTSNVYLDAYKLNGKFLWRIDLGKNIRAGAHYTQFIVYDLDGDGKAEVVCKTADGTI
DGRGNVIGDPNADWRNSSGYILSGPEYLTVFEGATGRALKTVNYIPPRGNVSSWGDSYGN
RVDRFLAAVAYLDGKRPSLIMCRGYYTKTYIVAWNWQNGELTKLWQFDTGETNDGYRDDY
EGQGNHNLSVADVDNDGKDEIIYGAMAVDDNGAPLYTTKLGHGDAMHVTDIDPDRPGLEV
WQCHEGSTGASLRDARTGQILVRVLTSGDCGRALAADVDPRYKGLEMWAAGISIRDCKGN
VISSATPPINFAIWWDGDLGRELLDKTYIYKWDYNNNKTNTIFTASGCSSNNGTKATPCL
SADILGDWREEVIFRTSDDSAIRIYTTTTLTNYKIPTLMHNRQYRESIAWQNVAYNQPPH
LSFYLGYETNINEIYKYFEGYGDQTSNPSPTPTPTATATATPRPTSTATPTPTPTPTATI
TSTPAPTSTATPTPTPTPTVTVTPTPTPTPTPTGAPGTGSGFKVLYKNNETSASAASIRP
WFKIVNGGSSSVDLSRVKIRYWYTVDGDKPQSAVCDWAQIGASNVTFNFVKLSSGVSGAD
YYLEVGFSSGAGQLQPGKDTGDIQVRFNKNDWSNYNQADDWSWMQSMTNYGENTKVTLYV
DGVLVWGQEPGGATPAPTSTATPTPTPTVTSTPTSTPTPTPTATPTPTVSVTPTPAPTAS
PVGGSYWTPSDSYGALKVWYANGNLSSTTNVLNPKIKIENVGTTAVDLSRVKVRYWYTID
GEATQSVSVASSINPAYIDVKFVKLGANAGGADYYVEIGFKSGAGVLAAGQSTKEIRLSI
QKSSGSYNQSNDYSVRSVTSYIENEKVTGYIDDVLVWGKEPSKNAQIKVWYANGIISSTT
NVLNPKIKIENVGTTAVDLSRVKVRYWYTIDGEATQSVSVASSINPAYIDVKFVKLGSNA
GGADYYVEVGFKSGAGVLAAGQSTKEIRLSIQKSSGSYNQSNDYSVRSANSYIENEKVTG
YIDDAIVWGKEPSRGTKPAGGVTPTPAPTPTATPTPTPTTTPTPTSVSSSTPTPTATPTP
TSTPIQSATPTPTQTPAVTPTPTPTAVPTPAPTPVPGENAIYVAPEGNQNNPGTIDKPTT
LEKAIAIVKPGQVIYMRGGTYKYSVQITIGRDNNGTSSARKCIYAFPNERPILDFSSQPY
GNVDSNPRGLQINGSYWHIKGLEIMGAADNGIFVGGNYNIIEQCEIHHNRDSGLQIGRYS
SSATKDEWPSYNLILNCTSHDNMDPDNGEDADGFACKLTVGPGNVFKGCVSYFNVDDGWD
LYTKTDTGPIGEVLIEDCVAFSNGQTSDGSATSNSDGNGFKLGGSNIKVNHTVRRCIAFN
NKKHGFTYNSNPGSITLENCTGYNNGLKVSARNFYFGEGTHVLKNCLSYKEGASSDVISG
TVVNSVLWSNGKAVKPNGQLVTDNDFYSLTPTITRDNDGSLNLGDFLKPKPGSGLEGIGA
R
NT seq 5046 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttgtaaagaaaaagagaagaataaatgtgtatttagcattaattatttttgttgtc
aatattgtcttatttaatggacaggtaaatataaacaaaaataatttagcaatggcagca
actgaaagtcaaattgagaagttaaatcgaggactgatagctgttaaagtgacaaatgga
gtatttttgagctggagaatgtttgggtcagatccagcaaatattgggtttaatatttac
aggaatggagtgaagataactaaaacacctattcaggacagcacaaattacattgatgct
gatggaacaaccggttcgagatattatgtaagagcagtaataaatggggtagaggtagaa
caatctgaagaagtaagtgtgcttaataacaattatattgaaattaaattaaataaacca
gcgaattctccccttggtgcttcatattcgccaaatgatgcaagtgtgggcgatttggat
ggtgatggagaatatgagattgttttaaaatgggatccaagtgattcaaaggacaactcg
caatctggatatacaagcaatgtgtatttagacgcttacaaattaaatggcaaattttta
tggagaattgatttgggtaaaaatataagagcaggggcacattatacacaatttatagta
tatgatttagatggtgacggaaaagcagaggttgtatgtaaaacggctgatgggacaata
gatggacggggaaatgttataggtgatcctaatgctgattggagaaattcaagtggttac
attttatcaggtcctgaatatttgacagtatttgaaggtgcaacaggaagggcattgaaa
actgttaattatattcctccgcggggaaatgtttcatcatggggagattcatatgggaac
agagttgatagatttttggctgcagtggcttatctggatgggaaaaggccaagtcttatt
atgtgccgaggatattatacaaagacatatatagttgcctggaattggcaaaatggcgag
ttaacaaagttatggcaatttgatacaggtgaaactaatgatggatacagagatgattat
gaaggacaggggaatcataatctgagtgtagctgatgttgacaatgacggtaaagacgag
atcatttatggtgcgatggcagtagatgataatggagctccactgtatacaaccaaattg
gggcatggggatgccatgcacgtaactgatattgatccggacagacctggattggaagtc
tggcaatgtcatgaaggaagcacaggagctagtttgcgtgatgcaagaacagggcagata
ctggtgagagttttgacatctggagattgtggacgtgcattggcggcagacgttgatccg
aggtataaggggttagaaatgtgggcagcagggataagtattagagattgtaagggaaat
gtaatcagcagtgcgacaccaccaattaactttgcaatttggtgggatggagatttagga
agagaattattagataagacatatatttacaaatgggattataacaataacaaaacaaac
acaatatttacagcaagtgggtgttcatctaataatggtacaaaagcaacaccatgcttg
agtgcggacatacttggagattggagagaagaggttatatttagaaccagtgatgacagt
gctatcaggatatatacaactacgactttgacaaattataagattcctacacttatgcac
aacagacaatacagggagtccatagcatggcagaatgtagcatataatcaaccgccacat
ctaagtttttatttgggatatgagacaaacataaatgaaatatacaaatattttgaggga
tacggtgaccaaacaagtaacccatcaccaactccaacaccaacggctacagcaacagca
acgccaaggccaacatccacagcaacgccaacgcctacaccgactccaacagcaactatt
acatccacacctgcaccaacatcgacagcaacaccaaccccgaccccaacaccgacggtg
acagttaccccaacaccaacgccaaccccgacaccgacgggtgcacctggtacgggaagt
ggatttaaggtactgtacaagaacaatgagacgagtgcgagtgcggcatcaataaggcca
tggtttaagatagtgaatggaggcagcagcagtgttgatcttagcagggttaagataaga
tactggtacacggtggatggtgacaagccgcagagtgcggtatgtgactgggcacagata
ggagcaagcaatgtgacattcaactttgtgaagctgagcagcggagtgagtggagcggat
tattacttagaggtagggtttagcagtggagctgggcagctgcagcctggaaaggacaca
ggggatatacaggtaaggtttaacaagaatgactggagcaattacaatcaggcagacgac
tggtcatggatgcagagcatgacgaattatggagagaatacgaaggtaacgctgtatgta
gatggagttctggtatgggggcaggagccgggaggagcgacacctgcaccgacaagcaca
gcaacaccaacgccaacgccgacagtaacatcaacaccaacttcaacacctacacctaca
ccgacagcgaccccgacaccgacagtgagtgtaacgccaacaccggcaccgacggcatca
ccggtaggtgggagttactggacaccgagtgacagttacggtgcgctgaaggtatggtat
gcgaatggtaatttgagcagcacgacgaatgtattgaatccgaagataaagatagagaat
gtagggacgacggcggtagatcttagcagggttaaggtaagatactggtacacgatagat
ggagaggcgacacagagtgtaagtgtagcaagcagcataaatcctgcgtatatagatgtg
aagtttgtgaagcttggggcgaatgcaggcggagcggactattatgtagagatagggttt
aagagtggagcaggtgttttggcagcaggtcagagcacgaaagagataaggctaagcata
cagaagagcagtggcagctacaatcagtcaaatgattattcggtaagaagtgtgacgagc
tatatagagaacgagaaggtaacagggtatatagatgatgtacttgtatggggtaaagag
ccgagcaagaacgcccagatcaaggtatggtatgcgaatggtattataagcagcacgacg
aatgtattgaatccgaagataaagatagagaatgtagggacgacggcggtagatcttagc
agggttaaggtaagatactggtacacgatagatggagaggcgacgcagagtgtaagtgta
gcaagcagcataaatcctgcgtatatagatgtgaagtttgtgaagcttgggtcaaatgca
ggcggagcggactattatgtagaggtagggtttaagagtggagcaggtgttttggcagcg
ggtcagagcacgaaggagataaggctaagcatacagaagagcagcggcagctacaatcag
tcaaatgactattcggtaagaagtgcaaatagctatatagagaacgagaaggtaacgggg
tatatagatgatgcgatagtatggggtaaagagccgagcaggggtacaaagccggcggga
ggagtgacaccgacaccggcaccgacgccgacggcaactcctactccgacaccgacaacc
acacctacgcccacatcggtttcatcatccactcctacacctacagcaacgccaacacct
acttcaacgcctatacagagtgcgacaccaacaccaacgcaaactccagcagtaacacct
actccaactccaacagcagttccaactcctgcaccgacgcctgttcctggtgagaatgct
atttatgtggcgccagaaggtaaccaaaataatcctggtaccattgataaaccaactaca
ttggaaaaggcaattgctattgtaaaacccggacaggtaatctacatgagaggtgggact
tataagtattctgtgcagattacaatcggaagagataataacggcacaagcagtgcaaga
aaatgcatatatgcgtttccaaatgaaagaccaatattagacttttcatctcaaccgtat
ggaaatgtagattcaaatccaagaggtttacaaattaacggaagttactggcatattaaa
gggttagaaataatgggagctgcagacaatgggatctttgttggtggtaattataatata
attgaacaatgtgaaattcatcataacagagactcaggtttgcagataggcaggtatagt
agttcagcaaccaaagatgagtggcccagttacaatttaattttgaattgtacatcacat
gataatatggatccagataacggcgaagatgcagatggttttgcatgcaaattaacagta
ggtccggggaatgtatttaagggttgtgtgtcatatttcaatgtggatgatggctgggat
ctgtacactaaaactgacacggggccaataggagaggtattaattgaagattgtgtggca
tttagcaatggacaaacatcagatgggagtgctacatctaacagtgatgggaatggtttc
aaacttggaggcagtaatataaaggtcaatcatacagtgcggagatgtattgcgtttaac
aacaagaaacatggttttacttataatagcaatcctggaagcataactttagaaaattgt
acaggatataacaacggcttgaaggtaagtgctaggaacttctattttggagaaggtacg
cacgtgctgaaaaattgcttatcatacaaagaaggtgcatcgagtgatgtaatcagcgga
acggtagttaatagtgttttatggagtaacggtaaggcggtaaagccaaatgggcagctg
gtgacagataatgacttttacagcttaacaccgaccataacgagggataatgatgggagt
ttgaatttaggagactttttaaaacccaagcctggaagtggtttggagggaataggagca
aggtga

DBGET integrated database retrieval system