Caldicellulosiruptor morganii: OTK00_002182
Help
Entry
OTK00_002182 CDS
T08774
Name
(GenBank) endo-1,4-beta-xylanase
Organism
cmor
Caldicellulosiruptor morganii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_48
Glyco_hydro_10
CBM_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAM33660
LinkDB
All DBs
Position
complement(2199452..2204314)
Genome browser
AA seq
1620 aa
AA seq
DB search
MKKRVLRFVSRLILAVFIMSISLVGSMSYFPVKTEAAPDWSIPSLCESYKNDFKIGVAIP
ARCLSNDTDKRMVLKHFNSITAENEMKPESLLAGQTSTGLSYRFSTADTFVNFANTNNIG
IRGHTLVWHNQTPDWFFRNSSGQMLSKDALLARLKQYIYDVVGRYKGKVYAWDVVNEAID
ENQPDGYRRSTWYQICGPEYIEKAFIWAHEADPNAKLFYNDYNTEISKKRDFIYNMVKNL
KSKGVPIHGIGMQSHINVNWPSVSEIENSIKLFSSIPGIEIHITELDMSLYNYGSNENYS
TPPQDLLQKQAQKYKDIFTMLRKYKGIVTCVTFWGLKDDYSWLNSSSKRDWPLLFFEDYS
AKPAYWSVIEAAGASASPSPTSTVTPTPTTTATPRPTSTATPTPTPTPTGAPGTGSGLKV
LYKNNETSASAASIRPWFKIVNGGSSSVDLSRVKIRYWYTVDGDKPQSAVCDWAQIGASN
VTFKFVKLSSAVSGADYYLEVGFSSGAGQLQPGKDTGDIQVRFNKNDWSNYNQADDWSWM
QSMTNYGENTKVTLYVDGVLVWGQEPGGATPAPTSTATPTPTPTVTSTPTPTPTPTATAT
PRPTSTPTPTPTPTVSVMPTPAPTASPAGGSYWTPSESYGALKVWYANGNLSSTTNVLNP
KIKIENVGTTAVDLSRVKVRYWYTIDGEATQNVSVASSINPAYIDVKFVKLRANAGGADY
YVEVGFKSGAGVLAAGQSTKEIRLSIQKGSGSYNQSNDYSVRSANSYIENEKVTGYIDDV
LVWGKEPSRNAQIKVWYANGNLSSTTNVLNPKIKIENVGTTAVDLSRVKVRYWYTIDGEA
TQSVSVASSINPAYIDVKFVKLGANVGGADYYVEIGFKSGAGVLAAGQSTKEIRLSIQKS
SGSYNQSNDYSVRSVTSYIENEKVTGYIDDAIVWGKEPSRGTKPAGGVTPTPAPTPTATP
TPTPTITPTPTPTPTATTTPTPTPTPTSSSGLGVYGQRFMWLWNKIHDPANGYFNQDGIP
YHSVETLICEAPDYGHLTTSEAFSYYVWLEAVYGKLTGDWSKFKTAWDTLEKYMIPSAED
QPMGGYNPSKPATYAGEWETPDKYPSPLEFDVPVGQDPLHSELVNTYGTQMMYGMHWLMD
VDNWYGYGRRGDGVSRASFINTFQRGPEESVWETVPHPSWETFKWGGPNGFLDLFIKDQN
YAKQWRYTNAPDADARAIQATYWAKEWAKQQGKLNEISSYVAKAAKMGDYLRYAMFDKYF
KPLGCQDKYAAGATGYGSAHYLLSWYYAWGGALDGTWSWKIGCSHAHFGYQNPMAAWVLA
NDSDIKPKSPNGANDWAKSLKRQVEFYRWLQSAEGAIAGGATNSWNGRYEKYPAGTATFY
GMAYEPNPVYHDPGSNTWFGFQAWSMQRVAEYYYVTGDRDAGALLEKWVSWVKSVVKLNS
DGTFAIPSTLDWSGQPDTWNGTYTGNPNLHVKVVDYGTDLGITASLANALLYYSAATKKY
GVFDEAAKNLAKELLDRMWNLYRDDKGLSAPEKRGDYKRFFEQEVYIPAGWTGKMPNGDV
IKSGVKFIDIRSKYKQDPDWQKLVSAYNAGQAPEFRYHRFWAQCDIAIANATYEILFGNQ
NT seq
4863 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagagagttttaaggtttgtttcccggctcatactggcagtgtttattatgagc
ataagcttagtgggatcaatgagttattttcctgtaaagaccgaagctgcacctgactgg
agtataccgagtttatgcgagagttataagaatgattttaagataggagtagcgatacct
gcgagatgtttgagcaatgatacggacaagcgaatggtattgaagcattttaacagtatt
acagcagagaatgagatgaagcctgaaagtttattggcagggcagacaagcactggattg
agttacagatttagcacagctgatacgtttgttaactttgcaaacacgaacaatataggg
attagagggcatacactggtatggcacaatcaaacacctgattggttttttagaaacagc
agtgggcagatgttatcgaaagatgcactgttagcgaggctgaagcaatacatttatgat
gttgttggtaggtataagggtaaggtatatgcatgggatgttgtaaatgaggctatagat
gagaaccagcctgatggatacagacgctcgacatggtatcaaatctgtggtccggagtat
atagagaaggcattcatatgggcgcatgaagccgatccgaatgcgaagctgttttataac
gactataatacagagatatcgaagaagagagatttcatttacaacatggtaaagaattta
aaatccaagggtgtgccgattcatggtatagggatgcagagccatataaatgtgaactgg
ccatcggtgagcgagatagagaacagtataaagttgttcagttcgatacctgggattgag
attcacataacagagcttgacatgagtttatacaactatggatcaaatgagaattattca
acaccacctcaggatttgcttcagaagcaggcacagaagtataaagacatatttacaatg
ctgaggaaatacaaaggtattgtaacatgtgttacattctggggtttgaaggatgattat
tcatggctgaactcatccagcaagagggattggccgctgttgttctttgaggattacagt
gcaaagccggcgtactggtcggtgattgaggcagcgggtgcaagtgcatctccaagccca
acatcaacagttaccccaactcctacaacgacagcaacgccaaggccgacatccacagca
acaccgacaccaacccctacaccgacgggtgcgcctggtacaggaagtggattgaaggta
ctgtacaagaacaatgagacgagtgcgagtgcggcatcaataaggccatggtttaagata
gtgaatggaggcagcagcagtgttgatcttagcagggttaagataagatactggtacacg
gtggatggtgacaagccgcagagtgcggtatgtgactgggcacagataggagcaagcaat
gtgacattcaagtttgtgaagctgagcagcgctgtgagtggagcggattattacttggag
gtagggtttagcagtggagctgggcagctgcagcctggaaaggacacaggggatatacag
gtaaggtttaacaagaatgactggagcaattacaatcaggcagacgactggtcatggatg
cagagcatgacgaattatggagaaaatacgaaggtaacgctgtatgtagatggagttctg
gtatgggggcaggagccgggaggagcgacacctgcaccgacaagcacagcaacaccaacg
ccaacgccgacagtaacatcgacaccaactccaacacctacacctacagcgacagcaacg
ccaaggccgacatccacaccaacgccgaccccgacaccgacagtgagtgtaatgccaaca
ccagcaccgacggcatcaccggcaggtgggagttactggacaccgagtgagagttacggt
gcgctgaaggtatggtatgcgaatggtaatttgagtagtacgacgaatgtattgaatccg
aagataaagatagagaatgtagggacgacggcggtagatcttagcagggttaaggtaaga
tactggtacacgatagatggagaggcgacgcagaatgtaagtgtagcaagcagcataaat
cctgcatatatagatgtgaagtttgtgaagcttagggcgaatgcaggcggagcggactat
tatgtagaggtaggttttaagagtggagcaggtgttttggcagcgggtcagagcacgaag
gagataaggctaagcatacagaagggcagcggcagctacaatcagtcgaatgactattcg
gtaaggagtgcaaatagctatatagagaacgagaaggtaacagggtatatagatgatgta
cttgtatggggcaaagagccgagcaggaacgcccagatcaaggtatggtatgcgaatggt
aatttgagcagcacgacgaatgtattgaatccgaagataaagatagagaatgtagggacg
acggcggtagatcttagcagggttaaggtaagatactggtacacgatagatggagaggcg
acacagagtgtaagtgtagcaagcagcataaatcctgcatatatagatgtgaagtttgtg
aagcttggggcgaatgtaggcggagcggactattatgtagagatagggtttaagagtgga
gcaggtgttttggcagcaggtcagagcacgaaggagataaggctaagcatacagaagagc
agtggcagctacaatcagtcaaatgactattcggtaagaagtgtgacgagctatatagag
aacgagaaggtaacagggtatatagatgatgcgatagtatggggtaaagagccgagcagg
ggtacaaagccggcgggtggagtgacaccgacaccggcgccgacgccgacggcaactcct
actccgacacctacaatcacaccaaccccgacaccgacgccgacagcaacaactacccca
acacctactccgacaccgacatcgagcagtggacttggtgtatacgggcagaggtttatg
tggttgtggaacaagatacatgatccggcaaacggctattttaaccaggacgggatacca
tatcattcagtggagacattgatatgtgaggcacctgattatggacatttgacgacaagt
gaagcattttcgtactatgtatggcttgaggcggtatatgggaagttgacaggtgactgg
agcaagttcaagacggcatgggatacgcttgagaagtatatgataccatcagcagaggat
cagccgatgggaggatacaatccgagcaagccagcgacatatgcaggagaatgggagaca
ccggacaagtatccatcaccgcttgagtttgacgtaccggttgggcaggatcctttgcac
agtgagctggttaacacatatggtacacagatgatgtatgggatgcactggttgatggac
gtagacaactggtatggatatggcaggagaggagatggagtaagcagagcatcatttatc
aacacgttccagagagggccggaggagtctgtatgggagacagtgccacatccgagctgg
gagacatttaagtggggcggaccgaatggatttttggatctgtttatcaaggatcagaat
tatgcgaagcaatggagatatactaatgcaccggatgcagatgcgagggcaatacaggcg
acatactgggcgaaggaatgggcaaagcaacagggcaagctcaatgagataagcagctat
gtagcgaaggcagcgaagatgggcgactatttgaggtatgcgatgtttgacaagtatttc
aagccattggggtgccaggacaagtacgcagctggtgcaacaggatatggaagtgcgcac
tatctgctgtcatggtactatgcatggggaggagctcttgacgggacatggtcgtggaag
ataggttgtagccatgcgcactttggatatcaaaatccgatggcagcatgggtgttggct
aatgatagtgatattaagccgaagtcaccgaacggggcgaatgactgggcgaagagcttg
aagaggcaggtagaattttacagatggctgcaatcagctgagggagcgatagcaggcgga
gcgaccaattcatggaatggtagatatgagaagtatccggcagggacagcgacattttat
ggtatggcatatgagccgaacccggtataccatgatcctggcagcaacacatggtttgga
ttccaggcatggtcgatgcagagggtagcagagtactactatgtaacaggagacagggat
gcaggagcattgcttgagaagtgggtaagctgggtaaagagtgtagtgaagcttaacagt
gatggtacatttgcgataccgtcgacacttgactggagcggtcagccggatacatggaat
gggacatatacgggcaatccaaatctgcatgtgaaggtagtggattatggaacagattta
ggaataactgcatcacttgcgaatgcgcttttgtactacagtgcggcgacgaagaagtac
ggagtatttgatgaagcagcgaagaatttggcgaaagagctgcttgacaggatgtggaac
ttatacagggatgacaaaggtttgtcggcacccgagaagagaggggattacaagaggttc
tttgagcaagaggtatacattccagcgggctggacagggaagatgccgaacggggatgta
ataaagagtggagtgaagtttatagacataaggagcaagtacaaacaggatcctgactgg
cagaagctggtttcagcatacaatgccgggcaggcaccggagttcaggtatcacagattc
tgggcacagtgtgacatagcaatcgccaatgcaacatatgaaatcctgttcggtaatcag
taa
DBGET
integrated database retrieval system
