Caldicellulosiruptor naganoensis: OTJ99_000851
Help
Entry
OTJ99_000851 CDS
T08720
Name
(GenBank) endo-1,4-beta-xylanase
Organism
cnag
Caldicellulosiruptor naganoensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_10
CBM_4_9
Cellulase
CBM_3
Arch_flagellin
Polysacc_lyase-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAM32320
LinkDB
All DBs
Position
907406..912130
Genome browser
AA seq
1574 aa
AA seq
DB search
MKTKKATNRITSVLIILTFLFNILIGISLFQENVNAETYALDFEEENETISYFAYGGSNI
TIDENDAYNGKKSIKVTNRNSIWSGVAVDVKNIIKNGTTWVISGYVKHNNQKPVAFGISA
VYDDGSGVKNALLGEVVAVPNYWKKIVGRWNPNLNNVKKLVIVIHTIVESRIDFNVDCIR
IMDENSYLSGGVIHSTGFESGTTEGWQARGSGVTIKADSSVAYSGKYSLYVSGRTSNWHG
AQIPVDTILKQGKVYKISVWVYQNSGSTQKMSLTMQRRFATDSTTSYENLIYNKDVPNNT
WVELSGSYSVPEGVTVNELILYVEAQNASLSFWVDELKIYDSSKLAEPEWEIPNLVEKYR
DDFRIGVAFGNTSLASEMEKKLILKHFNSITPENEMKPSELLINENTYNFSKADSFVNFA
ISNNMTIRGHTLVWHQQTPDWFFKDSNGNTLSKDALLSRLKQYIYDVVGRYKGKVYAWDV
VNEAIDEGQSDGYRRSNWYNICGPEYIEKAFIWAHEADPNAKLFYNDYNTENSQKRQFIY
NLIKSLKEKGVPIHGVGLQCHINLDWPSISEIENTIKLFSSIPGIEIHITELDMSFYQWG
SSTNYAVPPRELLIKQAQRYKELFDLFKKYKNVVTNVTFWGLKDDYSWLSKNYGKKDYPL
LFDENYMSKYAFWSLIDPSIVPTTTTLPTPPEIQLPTLTPTPTASVTPTPTVTPTPTVTV
TPTPTPTPTPTVTATPTPTPTPVSTPATSGQIKVLYANKETNSTTNTIRPWLKVVNTGSS
SIDLSRVTIRYWYTVDGDKAQSAVSDWAQIGASNVTFKFVKLSSSVSGADYYLEIGFKSG
AGQLQPGKDTGEIQIRFNKSDWSNYNQGNDWSWIQSMTSYGENMKVTAYIDGVLVWGQEP
SGATPAPTVTVAPTPTPTVTPTPTPTVTPTPTPTPTPTPVSTPATSGQIKVLYANKETNS
TTNTIRPWLKVVNTGSSSIDLSRVTIRYWYTVDGDKAQSAVSDWAQIGASNVTFKFVKLS
SSVNGADYYLEIGFKSGAGQLQPGKDTGEIQIRFNKSDWSNYNQGNDWSWLQSMTSYGEN
VKVTAYIDGVLVWGQEPTGATAAPIATPTPTPAPTATPTPTSTPTPTPTAAPTITPTPTI
TATPAPTPAPTSTPAYLDDTNDDWLYVSGNKIVDKDGRPVWLTGVNWFGYNTGTNVFDGV
WSCNLKSTLAEIANRGFNLLRVPISAELILNWSQGIYPKPNINYYVNPELEGKNSLEVFD
IVVQTCKEVGLKIMLDIHSIKTDAMGHIYPVWYDEKFTPEDFYKACEWITNRYKNDDTII
AFDLKNEPHGKPWQDTTFAKWDNSTDINNWKYAAETCAKRILNINPNLLIVIEGIEAYPK
DDVTWTSKSSSDYYSTWWGGNLRGVRKYPINLGKYQNKVVYSPHDYGPSVYQQPWFYPGF
TKESLLQDCWRPNWAYIMEENIAPLLIGEWGGHLDGADNEKWMKYLRDYIIENHIHHTFW
CFNANSGDTGGLVGYDFTTWDEKKYSFLKPALWQDSQGRFVGLDHKRPLGTNGKNINITT
YYNNNEPEPVPATK
NT seq
4725 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacgaaaaaggcaactaatagaattacgtcggtattaataatactaacgttttta
tttaatatattaataggtattagcctatttcaagagaatgtaaatgcagaaacatatgca
ttggactttgaagaagaaaatgaaacaatttcatattttgcgtacggtggttcaaatatt
acgattgacgaaaacgacgcatataatggaaagaaaagtattaaagttacaaacaggaat
tcaatatggagcggtgtggctgttgatgttaagaacattattaaaaatggaaccacatgg
gtgatatcaggatatgtaaagcacaacaatcaaaaaccagtcgctttcggcatttctgca
gtttatgatgatggaagtggagtaaaaaatgctctattaggcgaggttgtagcggtacca
aattattggaaaaagattgttggcaggtggaatccaaatttaaataatgtaaaaaaattg
gtaattgtgatacacactattgtggaaagtagaatagatttcaatgttgactgtattcgt
ataatggacgagaacagctatttgtcaggtggagtaatacattccactggatttgaaagc
ggtacaactgagggatggcaggcaaggggaagtggtgtaacaataaaggctgacagttca
gttgcgtattctggtaagtacagtctgtacgtaagtgggcgtacatctaattggcatgga
gcacaaattcctgttgacactattttgaagcaagggaaagtatataagataagcgtttgg
gtatatcagaacagcggttctacacaaaagatgtcattgactatgcaaaggagatttgca
actgattctacaacaagttatgaaaacttgatatataacaaggatgtaccaaataatact
tgggttgaactcagtggaagttattcagttccagaaggtgttactgtaaatgagttaata
ctgtatgtagaagctcaaaatgcaagtttatcattctgggttgatgaattaaaaatatat
gattcatctaagttagctgaacctgaatgggagatacctaacttagttgagaaatacaga
gatgattttagaattggagttgcttttggaaatacaagccttgcttcggagatggaaaag
aagcttattttaaaacatttcaacagcattacaccagagaatgaaatgaaaccttctgag
ttgttaataaatgaaaatacgtacaattttagcaaagcagattcatttgtgaattttgcg
ataagcaataacatgacaataagaggtcatacacttgtatggcatcagcagacacccgat
tggttttttaaagactctaatggaaatacattgagtaaagacgcattgcttagcagatta
aaacagtatatttacgatgtggttggaaggtacaaaggcaaggtttatgcttgggatgtg
gtgaatgaagctatagatgagggtcaaagtgatggatacagaagatctaattggtataac
atatgtggacctgaatatattgagaaggcatttatatgggcacatgaagcagatcctaat
gcaaaattgttttacaacgattacaatacagaaaatagccaaaagagacagtttatatac
aacctgatcaagagtttgaaagaaaaaggagttccaattcatggagtgggtttacagtgt
cacataaatttagattggccgtcaattagtgagatagagaatacaataaagttgtttagc
tcaatacctggcatagagattcacattacagagcttgatatgagtttttatcagtggggg
tcaagcactaattatgctgtccctccaagagagttgcttattaagcaagcccagagatat
aaagaattgtttgatttattcaaaaaatataagaatgtagtcacaaatgttacgttttgg
ggattaaaggatgattattcatggctaagcaaaaactacggaaagaaagattatccgttg
ctatttgatgaaaactatatgtccaaatatgctttttggagtttgatagatccatctata
gttcctacaaccacaactttaccaactccgccagagattcaacttccaacattaacccca
acgccaactgcaagcgtgactccgaccccgacagtgacacctacgccgacagtaacagta
acaccaactccaacgccaacaccgacaccgacagtaacagcaacaccaacaccgacaccg
acacctgttagcacacctgcgacaagcggacagataaaggtactgtatgctaacaaggag
acaaacagcacgacaaacacgataaggccatggttgaaggtagtgaacacgggaagcagc
agcatagatttgagcagggtaacgataaggtactggtacacggtagatggagacaaggca
cagagtgcggtatcagattgggcacagataggagcaagcaatgtaacattcaagtttgtg
aagctgagcagtagcgtaagtggagcggactattacttggagataggatttaagagtgga
gcggggcagttgcagcctgggaaggacacaggagagatacagataaggtttaacaagagt
gactggagcaattacaatcaggggaatgactggtcatggatacagagcatgacgagttat
ggagagaatatgaaggtaacggcgtatatagatggggtgctggtatggggtcaggagccg
agtggagcgacacctgcaccgacagtgacggttgcaccgacaccaacaccgacagtgaca
ccaacaccgacaccgacagtaacaccaactccaacgccaacaccgacaccgacacctgtt
agcacacctgcgacaagcggacagataaaggtactgtatgctaacaaggagacaaacagc
acgacaaacacgataaggccatggttgaaggtagtgaacacgggaagcagtagcatagat
ttgagcagggtaacgataaggtactggtacacggtggatggagacaaggcacagagtgcg
gtatcagattgggcacagataggagcaagcaatgtaacattcaagtttgtgaagctgagc
agtagcgtaaatggagcggactattacttggagataggatttaagagtggagcggggcag
ttgcagcctggtaaagacacgggagagatacagataaggtttaacaagagtgactggagc
aattacaatcaggggaatgactggtcatggttgcagagcatgacgagttatggagagaat
gtgaaggtaacggcgtatatagatggggtgctggtatggggtcaggagccgacgggagcg
actgcagcaccaatagcgacaccaacacctactccagcacctacagcaaccccaacccca
acatcgacaccgacgccaacaccaacagctgctccaacaatcacgccaactccaacaatc
acagctaccccggctccaactcccgcaccaacatcaacaccggcatatttggacgatacg
aacgatgactggctctatgtaagcggaaacaagattgttgataaagacggcagacctgtt
tggctaacaggcgtgaactggttcggttacaatacaggaacgaatgtattcgatggtgtt
tggagttgtaatctcaaaagtactcttgcagaaatagcaaatagaggctttaacttgttg
agagtaccaatctctgcagagttgattctgaactggtcacaaggtatttatccaaagccc
aacataaactactacgtaaatccagagcttgaaggcaaaaacagtctggaagtatttgac
atagtagtacaaacatgtaaagaagttggtttaaaaattatgttggatattcacagcata
aaaacagacgcaatgggacatatatatccagtatggtatgatgaaaaatttactccagag
gatttttataaggcgtgcgagtggattacaaatagatataaaaatgatgacactattata
gcttttgacttaaaaaatgagccacatggaaagccatggcaagatacaacatttgcgaaa
tgggataattcaacagatataaataattggaaatatgcagctgaaacatgtgcaaaacgt
atactgaatataaatccaaaccttctaattgtaattgaaggaatcgaagcctatccaaag
gacgacgttacatggacatcaaaatcctccagcgactactattcaacatggtggggcggt
aacttgcgaggtgttagaaaatatcctattaatctgggtaaatatcaaaataaagtagta
tattcaccacatgattacgggccatctgtttaccagcagccgtggttttatccagggttc
acaaaagagtctttactacaagattgttggcgtccgaattgggcgtacattatggaagaa
aacattgcgcctcttctgataggtgagtggggtggtcatctggatggagccgataacgaa
aagtggatgaagtatctacgagattatatcatagaaaatcatattcatcacacattttgg
tgctttaatgctaactcaggtgacactggaggattggttggatacgattttacgacatgg
gatgagaaaaagtactcatttttgaaaccggctctttggcaagacagtcaaggtaggttt
gttggattagatcacaagcgacccttaggtacaaatgggaaaaacattaatattacaaca
tattacaacaataatgaaccagagccagttccagctacaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system