Clostridium novyi: NT01CX_2011
Help
Entry
NT01CX_2011 CDS
T00431
Name
(GenBank) helicase, putative
Organism
cno
Clostridium novyi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF3427
ResIII
Helicase_C
SWI2_SNF2
DEAD
PLDc_2
Helicase_C_2
PP_kinase_C
AAA_11
AAA_22
RsgA_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABK61235
UniProt:
A0Q0D2
LinkDB
All DBs
Position
1205628..1208522
Genome browser
AA seq
964 aa
AA seq
DB search
MKVNINEAITVDYKEIEESSIRNKDIEEKYLVDKSLITNSEKGNLLNELKKCLSECEKFY
FSVAFINFSGLQLLLDSFKELEEKGVKGKIITSTYLNFTEPKALKRIKDFNNIDLKIFVA
SNEKGFHTKAYIFENQDDYKIIIGSSNITQRALKSNVEWNVKVISKKEDKFSCNVIKEYL
ELWESTSFVDDEFLNSYNNFIQEIRKTEKKTLEFKNYEIIKPNYMQNRAISNLNRLRLQG
EDKALVVAATGTGKTYMSAFDVINYNPKRMLFLVHREDILKGAEATFRKLVKNKNKTTGF
LTGTRKDLGSDYLFSTIQSMNNNLESFKADEFEYVIIDEAHHAASPSYKKVMNYFKPKFI
LGMTATPERCDNESIFEIFDENLALEIRLSEALENELIVPFHYFGITDIEGINLEDVDIN
DISELTKRLKVNERVDFIIDKMNFYGHEGEKCRCIGFCVSIEHAKYMTEEFNKRGIKSVH
LTGENSPEEREGYIRALESEEDDLEVIFTVDIFNEGVDIPSINLVLMLRPTNSPIVFIQQ
LGRGLRKHSDKTFLTVLDFIGNHNKAFLIALALNGGRYYDKDSLKVSVAKQFQNIPGCTN
IQMDRIVQERILEQLNNENFNSMKYLKEEYLEFKKLNGGKVPYLLLDYIKYDGAPEPLRF
VSKDKTYIGFVSRIEKDKELQKLLQNETFYKILRQFSSKLPLKRIYEFSIIKYLMCNESI
NLNEAKREILKHINRVDDKSIVHALKVLNQEYDDSGQLKNNIRCFNLDNGILTVTEEFKN
IMNDKKYRVYIEDVINYGVVRYEKEFGEEYYGVPFLKLYEQYQMVDIALLSNYTKTHSSF
RGSGLLANGKDYFLFIDLHKEEDIKESINYNDKFINRHTFQWQSPNNTSQESERGKNIIY
NKERGVNLHLFIRKYKSIDRIVQPYIYIGKGDVEEFYGEKPITTILKLENKVPNGIYTEF
IEKV
NT seq
2895 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagtaaatatcaatgaggcaattacagttgattataaagaaatcgaagaatcaagt
attagaaataaggatatagaagaaaaatatttagtagataagagtcttataactaattct
gaaaaaggaaatcttttaaatgaattaaagaagtgtttaagtgaatgtgaaaagttctat
tttagtgttgcatttattaactttagtggacttcaattattactagatagttttaaggaa
ttagaggaaaaaggggtaaagggtaagattataacttccacttatcttaattttactgaa
cctaaagctttaaagagaataaaagattttaataatatagatttaaaaatatttgtagca
agtaatgaaaagggatttcatactaaggcatatatattcgaaaatcaagatgattataaa
ataattataggatcatcaaatataactcaaagagcactaaaaagtaatgttgagtggaat
gttaaggtaatatccaaaaaagaagacaagttctcttgtaatgttattaaagaatattta
gagttatgggaaagtacttcctttgtagatgatgaatttttaaatagctataataacttt
atacaagaaattagaaagacagaaaagaaaactttagagtttaaaaactatgaaataata
aaacctaattatatgcaaaatagggcaattagtaatctaaatagacttagacttcaagga
gaagataaagcacttgtagttgcagctacaggtactggaaagacatatatgtctgctttt
gatgtaattaattataatcctaaaaggatgttgtttttagtacatagagaggatatttta
aaaggtgcagaagctacttttagaaaacttgttaaaaataagaataagaccacaggtttt
ctaactggaacgagaaaagacttaggttcagattatctattttctaccattcagtctatg
aataataatttagagagttttaaagcagatgaatttgaatatgtcattatagatgaggca
catcatgcagctagtccatcatataaaaaagttatgaattattttaagcctaaatttatt
ttaggaatgactgctacaccagaaagatgtgacaatgaaagtatatttgaaatttttgat
gaaaacttagctttagaaatacgacttagtgaggcacttgaaaatgagctaatagttcca
tttcattactttggtattacagatattgaaggtattaatcttgaagatgtagatattaat
gatataagtgagttaactaaaagattaaaggttaatgaaagagttgattttataatagat
aaaatgaatttctatggacatgaaggggaaaagtgcaggtgcataggtttctgtgtaagt
attgaacatgctaaatacatgacggaggaatttaataaaagaggaataaaaagtgtacat
ttaacgggagaaaattccccagaggaaagagaaggatatataagagctctagaatcagaa
gaagatgatttagaagtcatatttactgttgatatttttaatgaaggtgtagacataccg
tctattaatttagttttaatgttaagacctacaaattcacctattgtttttattcagcag
ctaggaagaggacttagaaaacatagcgataaaacttttttaacggtactagactttata
ggaaatcacaataaagcttttttgatagcattagccttaaatggtggtagatactatgat
aaagatagcttgaaagtatctgtagctaagcaatttcagaatataccgggatgtacaaac
attcaaatggataggatagttcaagaaagaattttagaacaattaaataatgaaaacttt
aattctatgaaatatttaaaggaagaatatttagaatttaaaaagttaaatgggggaaaa
gtaccgtacttattgttagattatattaaatatgatggggcgccagaacctttaagattt
gtaagtaaagataaaacatatataggatttgtatcacgaatagagaaagataaagaatta
caaaaactattgcaaaatgagactttttataagatattaagacaattttcaagtaagttg
ccattaaaaaggatatatgaattcagtattataaagtatttaatgtgcaatgagagtata
aatttaaatgaagctaaaagagagatattaaagcacataaatcgtgtagatgataaaagt
atagtacatgctttaaaggtgttaaatcaagaatatgatgattcaggacagttgaaaaat
aatataagatgttttaatttagataatggaattttaactgttacagaagagtttaagaat
ataatgaatgataaaaaatatagagtttatatagaagatgttataaattatggcgttgta
agatatgaaaaagaatttggagaagaatactacggagtaccatttttaaagctatatgag
cagtatcaaatggtagatattgcacttttatctaattatactaagacacatagctcattt
aggggaagtgggcttttagcaaatggtaaggattactttttatttatagatctgcataaa
gaagaagatataaaagaaagtataaattacaatgacaagttcataaacaggcatacattt
caatggcaaagtcctaataatacttctcaagaatcagaaagaggaaaaaatattatatac
aataaagaaagaggagttaatctacatctatttataagaaagtataagagtatagataga
atagtacaaccttatatttacattggaaaaggagatgtagaagaattttatggtgaaaaa
cctataactacaatattaaaattagaaaataaagttccaaatgggatatatacagagttt
atagaaaaagtatag
DBGET
integrated database retrieval system
