Chryseobacterium nepalense: M0D58_04585
Help
Entry
M0D58_04585 CDS
T08142
Name
(GenBank) fibronectin type III domain-containing protein
Organism
cnp
Chryseobacterium nepalense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
fn3
Por_Secre_tail
Pur_ac_phosph_N
TSP3_bac
Laminin_G_2
PhoD_N
Pectate_lyase_4
Pentaxin
LytB_SH3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPQ76829
LinkDB
All DBs
Position
complement(1079772..1082771)
Genome browser
AA seq
999 aa
AA seq
DB search
MIKSLLPKHTLTALLFCGLTYSTFDLQAQTLAFPEATGFGRFTTGARGATNPQVYLVTNL
NDSGPGSFRDAVSQPGRFVIFKVGGIVNLQSIVAVAANTTIAGQTAPGEGIVFLGPRVSF
TGANNTIARYLRIRYGGTSQNQDASGIANGANIILDHMTFTWGTDEVFSVNWDNNGTAPD
NITIQNSIIGQGMHRHNHSAGGLMQPPPGGKISLIGNLYICNKTRNNKIKGINEFVNNVV
YNWGNYGNTYGHTQSGEAYIMGGDSAGSSFANIINNYFIGGPNTSNTVTTPFSVGNANFN
LYGSGNYFDNNKNGLLDGSLVPQDLTGYPVGDPTAILSAPYDYPVKNPALSAQEAYDNIV
SRVGASYPRRDQVDNLMISDLQSKGTTATYVYVQTDLANQFGFTNGGAGHVYGAPAPLDT
DNDGMPDAWEDAHGTDKNVFDALEVSATNAPYLNIEVYINGLPTTTAPDFIIPPTNLNFT
NAVTTGNPAVSSLTVNWNDNATNETGYVLERSDNGTNFSVIATLGANTTTYNETGLTPDT
QYYYRVKAVNASESSVYTSNASVTTPPIPSPPTKAINPVPANGNTGAELNSGNLLLKWNG
STNTTTYSVYFGTDPGNLSNIGTVSYSASPSYQLNNLNPATNYYWRVDATNTLGTATGDV
WSFRALTQTLVGSWPFTEAPSSGTQIADVTSFANHGTLNTSYDNANVRVPGKENYALDLA
TAPNNIYIASIPHQDQILFNANSFTVSYWMKAPASMIPSSSSTSLYVLCKGSITANASTG
ATGKRFNVEIKGGQLRFAIDDNVTKKEITSPIANYFTNNWVHVVIQRDVIAHKIRIYTNG
ILSSEGDETAVTGIGESSDFIIGNIGELEFQATANASAPYKGAFDELKMYNYALTAAEVY
SLYNQAVLSNDEFSISKNMGTVYPNPVKDQLSIKLPEYKKSSLTATVIDMTGKIIFKEKI
NANGNGVFNFNIASRKVAGNYILNVSGENLNSNFKIVVQ
NT seq
3000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataaaatcattactacctaaacacacccttacggccttactgttttgcggattaacc
tattccacatttgatttacaggcacagacattagcctttccggaagctaccggttttgga
agatttacgacaggagcgagaggtgctaccaatccccaggtttatttagttaccaactta
aatgacagtggaccgggctcattccgtgatgcagtgagccagccgggaagatttgtcatc
ttcaaagtgggaggtattgtgaatttacagtccattgttgctgttgcggccaacacaacg
attgccggacagaccgctcccggagagggaattgtgtttttgggaccgagagtatccttt
acaggagccaataataccattgcaagatatctcagaatccgttacggagggacttctcaa
aaccaggatgcctcaggaattgccaacggagcaaatatcattttggatcacatgactttt
acctggggcacggacgaagttttctcggtgaactgggataataacggcacagcgcctgat
aatataacgattcagaattctattatcggtcagggaatgcaccgtcacaatcattctgcc
ggcggactgatgcagcctccaccgggaggtaaaataagcctgatcggaaatttatacatc
tgcaacaagacgcgtaataataaaataaaaggcattaatgagtttgtaaacaatgtggtg
tacaactggggcaattacggaaatacctatgggcatacccaatccggagaagcttacatc
atgggcggggattctgcgggaagttctttcgcgaatatcatcaataattattttattgga
ggacctaatacaagcaatacagtaactacccctttcagcgtcgggaatgctaattttaac
ctctatggttccggaaattatttcgataataataagaatggattactcgatggttccctg
gttcctcaggatttaacgggctatccggtcggtgaccctacagcgatattaagtgctcct
tatgattatccggtgaaaaaccctgcattaagtgcccaggaagcatacgacaatattgtt
tccagagtgggagcatcttatccaagacgtgaccaggtggataatttaatgatttcagac
ttgcagtcgaaaggaactaccgctacctatgtttatgtgcagactgatttagccaaccaa
tttggttttaccaatggaggggcaggacacgtttatggcgcaccggctcctttggatacc
gataatgacggaatgccggatgcgtgggaagatgcccatggaactgataaaaatgttttc
gacgctctggaagtaagtgctaccaatgcaccatatctgaatattgaagtttacattaac
ggtttacccactacaacggctccggattttattattccgccaaccaatctgaatttcacc
aatgcagtgacaacaggaaatcctgctgtaagctctctaacggttaactggaatgataat
gccacgaacgaaacaggttatgttttggaacgttcagacaacgggacaaatttttcggtg
attgcgacattaggtgcgaatacaacaacatataacgaaactgggttaaccccagatacg
cagtattactacagggtaaaagcagtcaatgcttcagagtcttctgtatacacttcaaat
gcttcagtaacaacaccgccaattccttcaccgccgacaaaagcaatcaatcccgttcct
gcaaatggaaataccggtgcagaattaaacagcggaaatctgcttttaaaatggaatgga
agcacaaatacaacaacatattccgtttatttcggaacagatccgggaaatttaagtaat
atcggaacggtctcttacagcgcttcaccttcttatcagttaaacaaccttaatcctgca
acgaattattattggagagtagatgctacgaatactttgggtactgcgacaggtgatgta
tggtcttttcgtgcattaacacagacactggtcggaagctggcctttcacagaagcgcct
tcgtcagggacacagattgcagatgtgacatcttttgccaatcatggaacgttaaatact
tcctatgataatgccaatgtacgggttcccggaaaagaaaattatgccctggatcttgct
acagctccaaacaatatctacattgcaagcattcctcaccaggatcagattttatttaat
gctaattcttttacggtttcttactggatgaaagcaccggcgagcatgattccgtcttct
tcctctacaagtttatacgttctttgcaaaggttctataacggctaatgcttctacagga
gctaccggaaaacgctttaatgtagaaatcaaaggggggcagctccgttttgcaattgac
gataatgtcactaaaaaagaaattacctcacccatcgctaattattttaccaataattgg
gtgcatgttgtgatccagcgtgatgttattgctcataaaataagaatttataccaatggt
attttaagttccgaaggagatgaaacggctgttacaggaattggtgagtctagtgatttt
atcatcggaaatatcggtgagctggaatttcaggcgactgccaatgcttctgctccatat
aaaggtgcctttgatgagcttaaaatgtacaactatgcattaacagcggcggaagtttat
tcactatataaccaggctgtattgagtaatgatgaattcagcatcagcaaaaatatggga
acggtgtatccgaatcctgtaaaagaccagctgtccatcaaacttcctgagtataagaaa
tccagccttaccgcgaccgttattgatatgacgggaaaaatcatctttaaagaaaagatt
aatgctaatggaaatggcgtatttaattttaatattgcaagcagaaaggttgcaggaaat
tatattctgaatgtttccggggagaacttaaatagcaattttaaaattgttgttcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
