Chryseobacterium nepalense: M0D58_05345
Help
Entry
M0D58_05345 CDS
T08142
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
cnp
Chryseobacterium nepalense
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
VWA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPQ76978
LinkDB
All DBs
Position
complement(1261750..1264989)
Genome browser
AA seq
1079 aa
AA seq
DB search
MNTKLNNVTTQYRKFNENQALTEGQLNEFIDYFEDQDRMSRTRLSGVGLACGFESIYLSP
LSLSGSEILMEELPQMQKLDLVDYDSVVISQGAGVTTDGDIITLRKKGSTSSEVAINFDA
NSYKYYKSYTDEVEYKHFRIGNKQIPLLELITQEEYNLIPNGGGFRNVKELGNTIYNKVI
ILYLESYSNDETPCQDADCDNNGAEQVSNLKVLLADSDAVLNLISSGDAKDTIYKAHHTY
QLLFDTLPKLEAKRVILDKSIVRPSDLKMRFQNAFSTVTQLSDGFNKIADVFNINLNFSG
QALIDKLTSVLYPAETPRLEDYQYRYDLLKDLIDTYNEIKGLILHLDAECCPDINSFPKH
LLLGRVGASLELGEDTLYRHSFYHSPVTTTEDENYERVIMLANRFVQKINGFQSYIGPVK
ITPSNQYVRLGDKAIPYYYNVDSLLLNKWNYEKTKTDRETYNLSYHTGNLAGDDFIQDPL
SYNIDDNDFYRIEGHIGMPYRTAMQNINDIKTKYGLAFDVIALVLQKGETPVEPDKETVS
IDDLRKHLISISSDISREKSDSRNTLLTISKLDEKLKLLNKAEFSKEGEGVTVVRQDPKK
DDVVSELLSEFLDRKSGLEHLAGVEHGGTFVLLYWSEANNQVLADFSLPYLCCSKEKPNI
PPIAKDDKASCLIGQSVTIPVLDNDYDADNDALTVIKKSNPSHGSVILNSNGTFKYTHDG
SANLEDSFTYCVNDGRDDSNIATVFITVKSPPVAVNDHASVANNEHVDIAVKDNDYDLGN
TPLSVIIDTQPAYGTATLRPDGKIRYTHNGSNTLLDSFTYHINDGELDSNIATVTVRIGP
PPCNSGMDVVFIFDYTASMGGQIEAAKTGAGSIITTIQNQSSPNPYRLGIVLADETNSRT
NSGYSSAAAYTSLPAAQRFVNTGIGSKYQWITAMEVMSENNVSTFTSQLGKINNPTGGLS
LGWGEGGPEPTDMALSRVVEHDFAGAFRNGVAKYVIIITDIVPGGNDDTANGLDVTEINR
LKTVCLSKSIKVIVLGAGVEQQIEGKYIWKELANGTGGSWNTSYNASAIQTAIINGCGG
NT seq
3240 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataccaaattaaataacgtaacaacccaatatagaaagttcaacgaaaatcaggcg
ttaactgaagggcaactaaacgaatttatagattattttgaggatcaggacaggatgtcc
agaacccgtttgagcggagttggattggcttgcggctttgaatctatttacctcagtcct
ctttcgctttcaggttctgaaattctcatggaggaacttcctcagatgcagaaactggat
ctggtggattatgatagcgttgtgatttctcaaggagcaggagttaccacagacggggat
attattacattgcgtaaaaaaggaagcacttcttctgaggttgccataaattttgacgct
aacagctacaaatattataaaagttatacggatgaagtagaatataaacatttccgtatc
ggcaataagcagatccctcttttagaattaattacacaggaagaatataatctgattcct
aatggcggtggtttcagaaatgtaaaagaattaggtaataccatttacaacaaagttatt
atcctgtatctggaaagctattctaatgatgaaacgccatgtcaggacgcagattgcgat
aataacggtgccgagcaggtttctaatcttaaagtgcttttggcagactctgatgcggtg
cttaatctgatctcttcgggggatgcaaaagatactatttataaagctcatcatacatat
cagttgctttttgatacgctgcctaaattagaggctaaaagagtcattcttgataaaagc
attgtaagaccttcagatcttaaaatgaggttccagaacgcattcagtaccgttacccag
cttagtgacggttttaataaaattgctgatgttttcaatataaatctcaatttcagtggc
caggcgcttattgataaactgacttccgtattatatcctgcggaaactccaagactggag
gattatcagtaccgctatgatctgctgaaagatttaattgatacttacaatgaaataaag
gggcttattttgcatcttgatgcagaatgctgcccggatatcaattcatttccgaaacac
cttttgctgggccgtgtaggagcatcactggaattaggggaggataccctttaccgtcac
agtttctaccactcaccggtaaccacaacagaggatgaaaattatgaaagagtgattatg
cttgccaatcgttttgtgcagaaaatcaatggatttcagtcttatatcggacctgttaaa
attactccttccaatcagtatgtcagattaggtgataaagctattccgtactattataat
gtcgacagcttgttgttgaataaatggaactatgaaaaaactaaaaccgacagggaaact
tacaacctaagttatcatacgggaaatcttgcaggtgatgattttattcaggatccttta
agttataatattgatgataatgatttctacagaatcgaaggtcatattggaatgccatac
agaaccgcgatgcagaacatcaatgatatcaaaacaaaatacggattggcttttgatgta
atcgcgttggttttgcaaaaaggggaaactcccgttgagccggataaagaaaccgtatcc
attgatgacctgagaaaacatctaatatcaatttcctccgatatcagcagggaaaaaagc
gattcgcgaaatacccttctcacaatctcaaaactggatgaaaaattaaaactgcttaat
aaagctgagttttccaaagaaggagaaggtgttactgtagtaaggcaggatcctaaaaaa
gatgatgtagtaagtgaacttttaagtgagttcttagaccgaaaatcaggtttggaacat
cttgccggtgtagaacacggaggtacatttgtattgctgtactggtcggaagccaacaac
caggttctggcagatttctctttaccttacctgtgctgctcaaaagaaaagcctaatatt
ccgccaattgccaaagacgacaaagcttcatgcctgatcggacaatctgtaacaatacct
gttttagataatgattatgatgcggataatgatgcactcaccgtaattaaaaaatcaaat
ccttcacatggatcagtaatattgaacagcaatggaacattcaaatatacccatgatggt
tctgctaatcttgaagactcattcacgtattgtgttaatgacggcagagatgatagtaat
attgctacggtatttattacggttaaatctcctccggtagctgtaaacgaccatgcttcc
gtagcaaataacgaacatgtggacattgctgttaaagataatgattacgatttaggaaat
acaccgttatccgttattatagacactcagccggcttacggaacagcaacactgagacct
gatggcaaaatcagatatactcataacggatcaaacactcttttagattcctttacctat
catataaatgatggcgaattagacagtaacatagcaacagtaactgtcagaattggtccg
ccaccatgtaattcaggtatggatgtagttttcatatttgattatacggcgagtatggga
ggtcagattgaggctgctaaaaccggagcgggtagtattataacaacaatacagaatcag
tcgtctcctaatccatacagattgggtatcgtactggcggatgaaacaaattccagaaca
aattcgggctatagctcagcagcggcatacacaagcctgccggcagcccagagatttgtt
aatacgggaattggttcaaaataccagtggattacggcaatggaggttatgtcagaaaat
aatgtttccacatttaccagtcagcttggtaaaattaataatcctaccggaggccttagc
ctcggatggggagagggaggtccggaacctaccgatatggcattaagcagagtggtagag
catgatttcgccggtgcattcagaaatggcgtggccaaatatgtgatcattataacagat
attgtacctggaggtaatgatgatactgcaaacggactggatgtaacagaaattaacagg
ctgaaaacagtttgcctttccaagtccatcaaggtaattgtgctgggagctggcgtagag
cagcagatagaaggaaaatacatctggaaagagcttgccaacggaaccggaggttcatgg
aacaccagctacaatgcaagtgctattcaaactgcaattataaatggttgtggaggttaa
DBGET
integrated database retrieval system