Colwellia sp. MT41: CMT41_14900
Help
Entry
CMT41_14900 CDS
T04159
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
com
Colwellia sp. MT41
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
com00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
com02000
]
CMT41_14900
Transporters [BR:
com02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CMT41_14900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
EMC7_beta-sandw
Collagen
TSP3_bac
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALO35866
UniProt:
A0A0S2JIM3
LinkDB
All DBs
Position
complement(3506938..3517068)
Genome browser
AA seq
3376 aa
AA seq
DB search
MNGFIKPIFVSLFFFLLSACGGDTETEKPAPEQAPIETPIENSKKYSVAMSYQILESVVG
CLNGGVEIKTGIDENGNGFLDNSEVDNTNIVCHGTNGSDGTNGSGGTNGSDGTNGSDGTN
GSDGTNGSDGTNGTNSLLKIVDEPAGQICLYGGIHINVGLDANNNGVLDLEEVSQSATVC
YPFAPNAPPSEEPTVELATIKGNIALSSLSKSIKSFRASRAVLTKSGTNSITTSKVTESN
VTLVLAPSSIAVNATNSDASELAMLSSPIEIIVDADGNYEIQVPAGTDYSLILNDRQSGT
GVKLENIAVQQGETITLDISANEILPTGSVRLKVASLLTGYALEAAKITLVELATDKLTT
VEGLQEFTDLPAGTYHLSINHSDYVSKHIAFVVTSNEATDLQTIELNNKKGSASGQVSSP
SALDLSNILVYARASDNSVYSTFTNSSGTFTFPALPVAEGYRFIVVSNLFDSAKSNDITI
LRNQTTIVETFELAERKANTGSITGYIKYADKLAQLEHSGIIIAIEGTDKEAISSRDGSF
IINGLAAGTYQLNFTEANHQSVSASVKVTSGTVNNLEIIELASLNGSLSGTVVDHNDQPL
SNVTLILHESGQTTVSDVSGNFIFINHPIGTYTLIANNQGYGTQQVEVLLSQDQTTALNN
NIQLTPYNFNGTVSLGSDKSDHSAVTISLSGTGLSEQSNVDGSFAFSAIQPGNYQLLFSR
SGYKSQAISVVISEDSNELGYTINMQPMLGVVNGQASIDNRVDHSGIQVSIIGTEYTAFT
DSTGKWSMGMALGNYSGGIRYQKDFYTEQVNSQTITVTENGQFTVAPVKLLQNNANITLN
VGAANTCSGELIVFVQGVSGLADGFSGNLSVSVHGEVNQALPLGEYQFSIYCTDSGWETN
NFNLVLSNEHDSYPLGDVNLRQSFIIINDGDAYTNNQLVSLSLGNTDAVEMRITDGLSDS
GWIAFESLYDHTLSVGNGLKTVTVQFKDINNVELASVTDTIQLDTFLNITYFQQSGATTQ
GDLLHLELSLAQELGATVTVTIPGLVQNLPLLDNGFGGDITPNDGIYERDFYIDTPIDLN
LAAVATVTDISGNTATVNSNSNVVLNTAPSIKNLVISSNIAMGEMTLRFSTDEPATANIA
YGNDLASLSNNLDVSTTLHNSHSITLNGLSANSMTYFRIAVADSANNTNELTGQGKLAPP
AVTGLAAYPGSNEVGLIWHKAQNAASYRVYRSDDGGNVFTLVNAETVISERYYVDALASN
DINYSYRVTAIDTDGNESENSDAVTVTPKVTLAGPTEIAGGLIDANTVWLKSRSPYNISA
NVKVKKDIQLLLLPGTELAFTQADLSIYLSGTMSALGQADNLVKLSAFDSGNSNYSGALI
YEQGNNVESTFNYTELNYIKTYYDYANAYERPHYLVPISLQNSVVNIFSNYNYANFYIKS
VSDSSVHLLGYGSGSSSYAVRINTVKNVIFTSSAFGAEGDIINNVQNGVRITNVVDSTLD
YIALYADNGSIDNSEFINATISNASSLSNSTITNSTIVGNGYSSLRASGNTLINTQISLP
GDNTRLTMRYNILDSSSTVSAKFLDISHNYWGSTDLAAITAQTGYSPDQSQNTHLYPIIT
SSDLYIADWDNDTIPDYLDYDNDNDGYSDLQEDWSSDPLYGSIYSPLDANSHPSTAKDND
MDGLADSEDLDDDNDGLADSDELIRLTDKFLADSDGDGINDGNEVSYKYNPLDKNNFPLM
GNISGKTIDNSNVNSEGVVYIAGREVFNDMMDNGVTIEAVNLTDVTVSAGTSLMIDSDTS
VTFTNSLLAGDDANVITIRSTGAGNGSINFSNTKVKFANIKVAINLNVYNGSVIEHSDLS
INKNWGFNNSGQITESYIKADYWNNTGSIEASFISGNYLENQGTITNSYINSSGFNNYKD
INHSYINSVNTQNNSQINGSVIDYLSAYNDASTILNSDVRLNNPQTMNVFFDGVYLSLGY
GGQFYSGYGAPLDQIGDGVAETVFAVEINDGAGMSTQTWTVDGINNPRSAPNFPDVVFKP
YLEANGIWSPKNVGAWWDMNNANTFPDSDPSINIGTISGQVQLGGFSNHSGVTVEILNTS
LATVTDAEGNWSIRLPARDYANGISFTKSHIQTITKDRSYTVAAMQDTDIGILDMAQATA
TVTGVLAIDEATDYTLATITANKNGQSTVINPSAAGVFTFDTLALGDYSFAVTYPNGSWE
TVSHTLSLSAGTMKYTLPVTHVRNSFVYINDGAAYTNSTAVSLAITNANATNMVVTENSV
AFPSEIFSTTKSITLSTGDGEKLIQVDFTDIDSNALTAATSTIILDTQVSLTSLTLSTVT
TMGDTLHIALTANETSGLATVTIPGLFTNLALYDDGSHGDTVADDGVYEVDYFIASAEDI
TATATANFVDRASNTDTITSASSMTIATSPTISDLLVQSNNGNLVISFNTDELVTATINY
GTAVDNLDQSMTISASEQLEHIIELAAVEGQTIYFTVTTDDGVTLVTEFTSAGLLAEAAV
TGLNISAGNGEVGLVWSKQDHATAYRIYRSDDSNSFTELAEITAATPYYVDTSVYNEQAY
SYRVTWVDVDGAESDQSNSVIATASIDNAGATELNGGVIAVNEIWLASRSPYIITGNMLI
KSSATLSLMPGTEIEFNGAKRHIMVQGNIMAYGSADALVKISTDPVYNYSDGENGNQSAI
IYDTANNAASEFNYTELNYLQVYKDYSDSGNRENNLVPLSLLNSVVNGYFGSTANFYITS
SQNSIINEYGYGYGYYGHNGLRINAINNVTFNKLDRYSGEPSTTSNYIARIDSATNSTFN
GAKFYFSNGSIGNSTFNNATAERASTITNTTFANSKITGSSSLRLTDSELTNSHITLTGD
YTRLTMHYSLLDTDSTVSANLLDISHNYWGSTDLTAIAQQTGYSPDQANNTHLYPIITSS
SLYLADWDLDGIPDYLDYDNDNDGYSDLQEDWESDPVYGAIFNPLDDTSYPSTATDNDMD
GLTDADDLDDDNDGLLDTDEVGYGTDPFLADSDGDGVNDGDEVRYNYDPLDKNNFPLMGN
ISGKTIDNSNASSDGVVYLVGYEYSDGMSVQPVQLTNVIVSAGTSIMINKDTRVTFNDSV
IAGTADNIVTIRSSGAGNGSFNLSNTQVNFANVKLALSWNIDGNSIVARSDLSLNTYGYN
NGTITDSFITSNSNWYNNGVIAHSYISGGYFNNQSQGMIKFSIINLNTNAAVYNQGSINN
SYVSNMTYQQGNGTITDSIIDKLWSGSDNSQVINSDIQFDSTNGNFPMFFDNSFIADSSG
STFYDGYGSPVDQLGDGVAATVFNLNGYNYTVDGINNPRSTKNFPNGVDDIWTPQGVGAL
WDANAVDPTLFPEPIL
NT seq
10131 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacggatttatcaagcctatatttgtttctttattcttttttttactatctgcttgt
ggtggagacactgaaacggaaaaaccggctccagaacaagccccaatagaaaccccaata
gaaaactcaaaaaaatattcagtagcaatgagttaccaaattttagagtctgttgttggc
tgtcttaatggcggtgttgaaatcaagacaggaatagatgaaaacggtaatggcttttta
gataactcagaagtagacaatacaaacattgtttgtcatggcactaacggttcagatggc
actaacggttcaggtggcactaacggttcagatggcactaacggttcagacggaactaac
ggttcagatggcactaacggttcagacggaactaacggcacaaatagccttcttaaaatt
gttgatgagcctgcaggccaaatttgtctctatggtggcatacacattaatgttggttta
gatgctaataataatggagtccttgatcttgaggaagtttcacagtctgcaaccgtttgt
tatccctttgcaccaaatgctccacctagtgaagaaccaacagttgaattagcaaccata
aaaggcaatatcgccttatcaagtctctcaaaatcaattaaaagctttagagcctcaaga
gcagttttaactaagtctggtacaaatagtataacaaccagtaaagttacagagagtaat
gtaacccttgttttagcaccttcttctattgcagttaacgcaaccaatagtgatgcaagt
gaactggcaatgttaagctcaccaattgagataatagttgatgcagatggcaattatgag
attcaggttcctgctggtacggattattctctcatcctcaatgatagacaaagtggaacg
ggagttaagcttgaaaatatagctgtacagcaaggcgaaactatcacccttgatatatct
gcgaatgaaatacttcctactggtagcgtaagactcaaagttgctagcttattaacaggc
tatgcattagaagcagcaaaaataactttagttgaattagcaactgataaactcaccaca
gttgaagggctacaggagtttactgatttacctgcaggtacttatcacctatcaattaac
catagtgattacgtaagtaaacatattgcttttgttgtaacttcaaatgaagcgacagac
ttgcaaacgatagaattaaataataaaaaaggtagtgcatcaggtcaagtttcttcgcca
tctgctcttgatttgtctaatattcttgtttacgcaagagcatcagataatagtgtttat
tctacttttaccaacagcagtggtactttcaccttccctgcgttacctgtagcggaagga
tatcgctttattgtggtatcaaacctttttgacagtgccaaaagtaatgacattactatc
ttgcgtaatcaaacaacaatcgttgaaacttttgaattagccgaacgtaaagcgaataca
gggagcataacgggttatattaaatatgctgataaattagcacaattagaacactctggt
attatcatagcgattgagggaacggataaagaagcgattagctctcgggatggctctttt
atcatcaatggattagctgctggcacttaccagttaaactttaccgaagcaaatcatcaa
tcggtttcagcaagcgttaaagttacttcaggtacggtaaataacttagaaattattgag
ttagcgagtttaaatggctctttatcaggtaccgttgttgaccataatgaccaaccactt
agcaatgttaccttaatattacatgagtcaggtcaaaccaccgtttcagatgtcagtggt
aactttatttttatcaaccatcctattggtacttatactttgattgccaataatcaaggt
tatggaacgcaacaagttgaagtacttcttagccaagatcaaacaaccgctcttaacaat
aacattcaattaacgccttataactttaacggtaccgttagtttaggcagtgataaaagc
gaccacagtgcggtcactatctcattatctggcacgggtttatctgaacaaagtaatgtc
gatggttcatttgcattttcggccattcaaccaggaaattatcaattactgttttctcgt
agtggttataaatcacaagcgatcagtgtagtaatttcagaagacagtaatgaattaggt
tacaccattaatatgcagcctatgttgggagtagtaaacgggcaagcatccattgataat
cgggttgaccattcaggaattcaagtaagtatcattggtaccgaatacaccgcatttacc
gatagtacaggcaaatggtcgatgggcatggcgctaggtaattacagtggtggcattcgt
taccaaaaggatttttacactgagcaagttaattcacaaaccataaccgttactgaaaat
ggccaatttactgtagctcccgttaaattattacaaaacaacgccaatatcacattgaat
gttggcgcagcgaatacttgttcaggagagttaatcgtatttgtacaaggcgttagtggt
ttagcagacggtttttctggaaatttgtctgttagtgtacatggcgaggtgaatcaagca
ctgccattaggtgaataccagtttagtatttattgtactgatagtggttgggaaactaat
aactttaaccttgtgctgtcaaatgaacatgacagttatccgcttggtgatgttaattta
cgccaaagctttattattattaacgatggcgatgcatatactaataatcagctagtatct
ctttcattgggtaatactgatgcggttgaaatgcgcattactgacggcttaagtgatagt
ggatggatagcctttgaaagtttatatgatcatacactttcagtgggtaatggtcttaaa
acagttactgttcaatttaaagatattaataatgtcgaactagcatctgttaccgatacc
attcaactcgatacttttttaaatattacttactttcagcaaagtggcgccactacccaa
ggtgatttacttcatcttgagttgagtttagcgcaagagctgggcgcaacggttacagta
accatacccggtttagtacaaaacttaccgctacttgataatggttttggtggcgatatt
acgcctaacgacggcatttatgaacgagatttttacatcgatacgccaatagatttaaac
ctagctgcggtagcaactgttacagatatatctggtaataccgctacggtaaactctaac
agtaatgttgttttaaatactgcgcctagtattaaaaacttagtcattagctctaatatt
gccatgggcgaaatgactctgcgtttttctaccgatgaaccggcaacggcaaacattgct
tatggtaatgatttagctagtttatctaataatttagacgttagtactacgctgcataat
agccatagcatcactcttaacggtttgtctgctaacagcatgacctattttcgtattgca
gtggccgatagtgctaataataccaacgagttaacaggtcaaggaaagctagcacctcct
gccgtaacaggattagccgcatacccaggtagtaatgaagtaggcttaatttggcataaa
gcacaaaatgcggcgagttatcgggtttatcgttcagatgacggtggtaatgttttcacc
ttagttaacgcagaaaccgtgatctcagaacgttattatgttgatgcgctggcaagcaac
gatattaattatagttatcgggttactgcgatagatacagacggtaacgaaagcgagaac
agtgatgctgtaacggtaacacccaaagtaacattagcagggccaacagaaattgctggc
ggtttaattgatgctaataccgtgtggttgaaatcacgctcaccttataatatcagcgcc
aatgtgaaagtgaaaaaagacattcaattactattattgcctggaactgagcttgccttt
acccaagcagatttaagtatctacttatctggcaccatgtctgcattaggccaagcagat
aaccttgttaagctatccgcttttgattctggcaattcaaattattcaggcgctttaatt
tatgagcaaggcaataatgttgaaagtacatttaattatactgagttaaattatattaaa
acgtattatgattatgccaatgcttatgaacgaccacattacttggtgcctatttcatta
caaaatagcgttgtaaatattttttcaaactacaattatgcaaatttctatattaaaagt
gtaagtgattcaagtgtgcacttattgggttatggctcaggtagtagttcatatgcagtt
cgaataaacacagttaaaaatgtgatctttactagttcagcctttggtgctgaaggtgac
atcattaataatgtacaaaatggtgtccgtataaccaatgttgtggattcaactttggat
tatattgctctttatgctgacaatggctcaattgataatagcgaatttatcaatgcaact
atcagcaatgctagctcgttaagcaatagtacaataaccaatagtactattgtcggtaat
ggttactcttcgctacgtgcaagcggcaatacactgatcaatacacaaatcagtttgccg
ggggacaatacccgcctaacaatgcgctacaacattttagatagcagctctacggtcagt
gcaaaattcctcgatatatctcataactattggggcagtactgatcttgcagcgataacg
gcgcaaacaggttatagcccagatcaaagccaaaatacccacctttatcctattatcact
tcaagtgacttatatattgctgattgggataacgatactatcccagattatcttgattat
gataatgacaacgatggttatagtgatctgcaagaagattggtcttcagatccgttatac
ggcagtatttacagccctctagacgcaaattctcatccatcaacagcaaaggataatgat
atggatgggctagcggatagtgaagatctagatgatgataatgacggtttagctgacagt
gatgagttaatccgattaaccgataagtttttagccgatagtgacggtgacggtattaac
gacggtaacgaagttagctataaatataatccactagataaaaacaacttcccattaatg
ggtaatatcagtggtaaaaccattgataactcaaatgtaaacagtgaaggggtggtttat
attgccggtagagaagtatttaatgacatgatggataatggggtaacaattgaagcggtg
aacttaaccgatgttactgtcagtgctggtacttcattgatgattgatagcgatacctct
gttactttcactaacagtctgcttgccggtgacgatgccaatgttattactattcgctcc
acaggtgcaggtaatggcagtattaattttagcaatacaaaagttaagtttgcaaacatt
aaggttgccatcaatttaaatgtttacaacggttcggtaattgaacatagtgatttaagt
attaataaaaactggggtttcaataatagcggacaaattacggaaagttatattaaagcg
gattattggaataataccggttctattgaagccagttttatttcaggaaactaccttgag
aaccaagggactattactaatagttatatcaattccagtggtttcaataattataaagat
attaatcatagttatattaatagcgtaaatactcaaaataactctcaaatcaatggctct
gtaattgattatttatctgcttataatgacgcttcaaccattttaaattcagatgtccgc
ctaaataatccacaaacaatgaatgtgttttttgatggcgtatatttatcgcttggttat
ggaggtcagttctacagcggttatggtgcgccacttgaccaaattggtgacggtgtcgcc
gaaactgtttttgcagttgaaataaatgatggtgctggcatgtctacacaaacgtggacc
gttgatggtatcaacaaccctcgttcagcccctaacttcccggatgtagtattcaaacct
tacctagaagccaatggcatttggtcacctaaaaatgtcggtgcttggtgggatatgaat
aacgccaatactttccctgatagcgacccttcaattaatattggcaccatctcaggtcaa
gttcaattaggcggctttagcaatcactcgggcgtaactgttgaaatactcaatacctca
ttagcaaccgtaaccgatgctgaaggtaactggtcaattcgtttaccagcgcgtgattat
gctaacggtattagctttactaaatcacatattcaaaccataactaaagaccgctcttat
acggtagcagctatgcaagataccgacattggtattctagatatggcacaagcaacagca
accgtaacaggagtgttagccattgatgaagcgaccgactatacccttgccaccatcaca
gctaataaaaatggacaaagcactgttattaacccaagtgccgcgggtgtatttactttt
gatacactagcacttggtgattatagctttgcggttacttaccctaatggtagttgggaa
acggtttctcatacattatcgttaagtgcaggtacaatgaaatataccttacctgtaaca
catgttcgtaacagctttgtttatattaacgatggcgcagcttatacaaattcaaccgcc
gtatcgcttgctataacgaatgctaacgcaacgaatatggttgttactgaaaattcagtc
gcttttccatctgaaatatttagtacaacaaaatcaatcaccttaagtactggcgatggt
gaaaaactgattcaagttgattttactgacattgacagcaatgcattaacggctgcaact
agtactattatactggatacccaagtatcgttaaccagcttaacgctctcaaccgttacc
accatgggcgatacacttcatatagccttaacggctaacgaaaccagtggtttagcaaca
gttaccatacctgggttattcactaatttagcgctttatgatgatggctctcatggcgat
acagtagctgatgatggtgtttatgaagttgattactttattgcttctgctgaagatatc
acagctacagcgactgctaattttgttgatagagcatcaaatacagacactattactagt
gcgtccagcatgactattgcgacttcaccaaccattagtgatcttttagtacaatcaaat
aatggcaacctagtgattagctttaataccgatgagcttgttaccgcaacaataaattat
ggcactgctgttgataacttagatcaatcaatgactatctcagctagtgaacaacttgag
cacattattgagttagctgcagtagaagggcaaaccatttactttacggtgactactgac
gatggtgtgactttggtgaccgaatttaccagtgcaggcttattagctgaagcagcggtg
actggtttaaatatttcagcgggtaatggtgaggttggtttagtttggtctaaacaagac
catgcaactgcctaccgtatttaccgctctgatgattcaaacagctttactgaactagca
gaaataacggctgccacaccttattatgttgatactagcgtgtataacgaacaggcttat
agctatcgtgttacttgggtagatgttgatggcgctgaaagcgatcaaagtaactctgtc
atagcaacggcatccattgataatgctggcgctaccgaactgaatggtggtgtaatagcg
gtcaatgaaatttggttagcatcacgctcaccctacattattaccggtaacatgctgatc
aaatcgtctgcaacgctaagcttaatgcccggtactgaaatagagttcaatggtgctaaa
cgtcatattatggtgcaaggtaatatcatggcttatggtagtgctgatgctttagtgaaa
atatctactgacccagtgtataattacagtgatggtgaaaatggcaatcagtcagccatt
atttatgatactgctaacaatgcagccagtgaatttaattataccgagctgaattatttg
caggtttataaagactattctgattcaggtaatagagaaaataatttagtgccactctca
cttttaaattcggttgttaatggttatttcggttcaactgcaaatttctatattacttca
agtcaaaactctataatcaatgaatatggttatggctatgggtattacgggcataacggt
ctacgaataaacgctatcaataatgtcactttcaataagctagatcgttatagcggtgaa
ccctctaccacctcaaattacatagctcgaattgatagtgccactaactccacctttaat
ggcgcaaagttttatttcagcaatggttcaattggaaacagtacctttaataatgcgaca
gctgaacgtgccagtactattactaatactaccttcgccaatagtaaaattaccggctct
tcttcattacgcttaacggacagtgaattaaccaacagccatattaccttaacaggtgat
tacacccgtttaaccatgcactatagcttgcttgatactgactcaacggtaagtgctaat
ttacttgatatttcacataattactggggtagtaccgatttaaccgctattgcccagcaa
acaggttacagtcctgatcaagctaataatacccacctttaccctattatcaccagtagc
tctttatatctggctgactgggatttagacggcattcccgattatcttgattatgataac
gacaacgatggttatagtgatttacaggaagactgggagtcggaccctgtttatggcgca
atctttaatccattagatgatacctcatacccaagtacagctaccgataacgacatggat
ggtttaaccgatgctgatgacttagatgacgacaacgatggtttattagataccgacgaa
gtaggctacggcacagatccatttttagctgacagcgatggcgatggtgttaacgatggc
gatgaagtgcgttataactatgacccacttgataaaaataacttcccgctaatgggtaat
atcagtggcaagactattgataacagtaatgccagcagtgatggtgtggtttatttggtc
ggttatgaatatagtgacggtatgtctgttcagcctgtacagttaactaatgtaatcgtt
agtgctggtacctcaattatgatcaacaaagatacccgtgtaacttttaacgatagtgtt
attgccggcactgccgacaatattgtgaccattcgcagctctggtgctggtaatggttct
ttcaatctaagcaatactcaagtgaactttgctaatgttaagttagcattaagctggaat
attgatggcaattcaattgttgctcgcagtgatttaagcttgaatacatatggatataat
aacggcactattactgacagctttatcacctctaattcaaattggtataataatggcgta
atagctcatagttatatttccggcggatattttaataatcaaagccaagggatgattaaa
ttcagtatcattaatttgaatacaaatgctgctgtttataaccaaggctcaattaataat
agctatgttagtaatatgacgtaccagcaaggtaacggcacaattactgattccattatt
gataagctgtggagtggctctgataacagccaagtgattaactctgacatccagtttgat
tcaacgaatggtaatttccctatgttttttgataatagttttattgccgattcaagcggc
agcaccttctatgacggttatggcagtcctgttgatcaattgggtgatggtgttgcagca
acggtatttaacttaaatggttataactacactgtcgatggtatcaataacccgagaagc
actaaaaacttccctaatggtgttgatgacatttggacacctcaaggtgttggtgcgcta
tgggacgccaatgcggttgatcctaccttgtttcctgaaccaatattataa
DBGET
integrated database retrieval system