Cellulophaga omnivescoria: PBN93_03730
Help
Entry
PBN93_03730 CDS
T08738
Name
(GenBank) type IV pili methyl-accepting chemotaxis transducer N-terminal domain-containing protein
Organism
comn
Cellulophaga omnivescoria
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PilJ
HATPase_c
HisKA_3
PAS_9
HATPase_c_2
PAS_4
PAS_12
PAS
PAS_3
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WBU90127
LinkDB
All DBs
Position
854905..856752
Genome browser
AA seq
615 aa
AA seq
DB search
MSHKKLEKSLDNTTFLRIRKWYLLALLAIAFSIVFSQVLIQMHLNSQLNDSRVINVAGRQ
RAYSQKLVKDILLLQRATLKKERDTVLKNTKKTLDVWRISHKALQFGNDSMGIPKEDNKA
ILALLQKITPHHNAMIKAAERTIVYNTTDGFKDSIGLKENINIILKNEKIFLNLMDTIVN
KYDSISKTQLEKLKQKEHLLVAFSLLILLLEILFIFRPLSIQIRNTISKLLKSKIESEEN
TLKIEQLYQEKQNSLQELQELNFVIDNAALFASIKNNESVVFISKKFQELLGCSTQDLAK
PLSEILTTNEGQQQYLKEVLKSNRKNIRNEEIKIRTKKEQDIWLDMSIIPLHNSSKKQNI
LILCSDITERIENQQKLEQLTKQSFEDKILQRKLQASLIVEGQEEERKRIAKDIHDGIGQ
MLTALKFNIESINLENKDKTKEKIAYLKSLCTDLIKGVRTATFNLTPPELKDHGIFPALQ
KMTTELSKLTGKNILFENKTEKNIRFSSLAETNIYRVAQEAINNAIKYANANYILLSINY
NQNTLSVLIDDDGNGFDDSILNKTPKNNSEGGMGLFYMKERISYINGRLFINSTPGKGTR
VTINYKPEKTTKQQP
NT seq
1848 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcataaaaaacttgaaaaatctttagataatactacatttttaagaattagaaaa
tggtatttactagcgttattagctattgctttttcaattgtgttttctcaggtgttaata
caaatgcatttaaattcccaattaaacgactctagagttataaatgtagctggcagacaa
cgggcatatagccaaaaattagtaaaagatattttactattacaaagagcaactctaaaa
aaagaaagagatacagttctaaaaaacacaaaaaaaacattagatgtatggcgtatttct
cataaagccctacaatttggtaatgactctatgggtataccaaaagaagataacaaagcc
attttagcgttgctgcaaaaaattacaccacatcacaatgcaatgattaaggctgcagaa
cgcactattgtttataatactactgacggatttaaagattctattggcttaaaagaaaat
ataaatatcattttaaaaaatgaaaaaatatttttaaacctaatggatactattgtaaat
aagtatgatagtattagtaaaacacaacttgaaaaattaaagcaaaaagagcatttatta
gtagccttttctttactaattcttttattagagatcctatttatttttagaccactgtct
atacaaattagaaacaccataagtaaactattaaaaagtaaaattgaatctgaagaaaac
actttaaaaatagaacagctttaccaagaaaaacaaaactccctacaagaactgcaagag
cttaactttgttatagacaatgctgcactgtttgctagtattaaaaataatgaaagtgta
gtttttataagtaaaaaatttcaggagcttttaggttgtagcacacaagatttagcaaaa
ccattatctgaaatacttacaacaaatgaaggtcaacaacagtatttaaaagaggtttta
aaaagtaacagaaaaaatattagaaacgaagaaataaaaataagaacaaagaaagagcaa
gacatttggttagatatgtctataattccgctccataattcttcaaaaaagcaaaatatt
ttaattctatgttctgatattaccgagcgtatagaaaatcagcaaaaactagaacaacta
accaagcaaagttttgaagacaaaattttgcagagaaaactacaagccagtcttattgtt
gaagggcaagaagaagagcgcaaacgtatagcaaaagatatacatgatggtattggacaa
atgctaacagctcttaagtttaatattgaatctattaatttagagaacaaagataaaaca
aaggaaaaaatagcctatttaaaatcactttgcacagacttaataaagggcgtacgcaca
gctacatttaaccttactccaccggagcttaaggaccacggtatttttcctgccttgcaa
aaaatgactacagaactttctaaactaacagggaaaaatatactttttgaaaacaaaaca
gaaaaaaacattaggtttagctccttagcagaaactaacatttatagggttgcacaagaa
gcaataaacaatgctattaaatatgctaacgccaattatattttattaagtataaattac
aaccaaaatacactaagcgttttaattgatgatgacggtaatggttttgatgattctatt
ttaaacaaaacacctaaaaataatagcgaaggtggtatgggtttattttatatgaaagaa
cgaataagctacattaacggtagactttttattaactctacacctggtaaaggaacaaga
gtaactataaattacaaacccgaaaaaaccactaagcaacaaccataa
DBGET
integrated database retrieval system