Chryseobacterium oryzae: MTP08_08600
Help
Entry
MTP08_08600 CDS
T08538
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
corz
Chryseobacterium oryzae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
fn3
Por_Secre_tail
Pur_ac_phosph_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOE37132
LinkDB
All DBs
Position
complement(1863983..1867690)
Genome browser
AA seq
1235 aa
AA seq
DB search
MKKLLLTCMLALSVGVYAQVGPPTAVNPNANNGYGFSQTSGTYTPLSANRTVWQSGSALS
TDGISSLVTIPSFKYNGKTYNSVYISNNGFVTFGATSSLASTTTGLSTDSSAPNTIEGAI
AGFSANLVNANTTTSEIAYETVGSKFVVQFTDLKVSGGSSSQLLNFQIQLDSSNNSIAIV
YGTCASGSATATGQVGLKGAEASDLNNRTGADWTSTAVGTSTTSTVTFGTTGGVTIPASG
LTFNYSPGTWLAAPTTYATIPFTENFSNWVNGNSTADLPNATYWRTWPSRGDNSWRASDI
TDSGFTSASGWSGVGGSSTVSAPAVTPAARFHSYNCLYVSGYMDLYVNLSGNSGDRLLTF
NYLNTSGTDILQVQLSTDGGNTFTNIGSSIGVQDTWATKDFVLPSVSSTAILRFLATGDN
GGSDIYVDNVNISINTTPPACTTITAPLNNATGVALAPTISWTSSVGTTSYKINLGTTPG
GTDILNSFDVGNVITYTIPSTTPLLYGKLYYVKVLPSNSYGTAIGCTEFSFTTKNLNCPS
VSAPSSSATNVSLTPTFTWTAVTDATGYKLTIGTTPGGNNILNAFDLGNVTTYTLPTSLT
IGTKYYYTLNAYNSYNSSLSCTERSFTTAGCATVSAPASAATGVSLTPTFTWAAVTGVTG
YKLNIGTTSGGTDVLNAFDVGNVTTYTLPNSLALGTKYYYTLNSYNSTSTTPGCSERTFT
TLTACPSVSAPASAATGVSVTPTFTWAASANATGYKITIGTTSGGNDVLNAFDVGNVLTY
TLPTPLNNGLKYFYTINGYNATSTSLGCSERNFTTVVTCFVPTALAITPSSVTTSGATAT
WTAPSTVPSNGYEVYYSSSSTAPTFTTPLNATNSVTSLTTSAPISGLSPSTAYYVWVRSV
CNGPDRSSWTSVATFVTLCQPPALLSTTGTTVCPGNTATLSATAESGATITWYDAATAGT
VLGTGLTYTTPVLSTTTNYYASAKSNGVSGDVGPVNPSALSSISATSYDVTTYYQIFDVT
VPTTLVSIDVFPTAAVGANSAIEIRNSAGVTLINIPYTVTVTGGNTAQTIVLNYPLSVGT
GYRIGQGTGVAINLNRNTEGANYPYTSSAINVTGNNFSLGTNYWYYIYNWKFSSSCEGPR
QMVTATVSSVGCLGTSEAVAKESIQVYPNPFTDVLNISDIKNVKSISVMDVAGRLVKSFE
KPTANLQLSELSSGMYLVVLHMNDGTKQTVKAIKK
NT seq
3708 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaacttttactaacgtgcatgttagctctcagcgttggagtatatgcacaggta
ggaccacctactgcggtaaatccaaatgctaacaatggttatggattttcgcaaacatct
ggtacctacacgccgctttcggcaaatcgaactgtttggcagtctggatctgccctttcc
actgatggtatttctagtttggtaacaataccatcttttaagtataatgggaagacttac
aattctgtctatattagcaacaatgggtttgttacttttggagcaacgtctagtttagct
tcaactacgacaggtctttccactgattcgtctgctccaaataccatagaaggtgcaata
gcaggtttttctgccaatttagtaaatgctaatactacaacttccgaaattgcttatgaa
acagttggttctaaatttgtagtacaatttacagatcttaaagtaagcggaggttcttct
tctcaattacttaattttcagattcaattagattcgtcaaataattctattgctattgtt
tatggaacttgtgcttcgggaagtgcaactgcaacaggacaggttggattaaagggagcg
gaagcatctgatcttaataataggaccggggcagattggacctcaacagcagttggtaca
tcaacaacttctacagtaacatttggaactactggaggagttacgataccagcatctgga
ctaacgtttaattatagcccaggaacttggttagctgctccaactacctatgcaaccatt
ccttttaccgaaaatttttctaactgggtaaatggtaactctactgcagacttgccaaat
gcaacctattggagaacttggccttcaagaggtgataattcttggagagcgagtgatatt
accgatagtggttttacaagtgcttcaggatggagtggtgttggaggatcttcaacagtt
tctgcacctgcagtaacaccagctgccagattccattcttataactgcttatatgtatct
ggatacatggatttatacgtaaatctttcgggaaattctggcgatagacttttaacattt
aattaccttaatacttcaggaactgatattttacaagttcaattatctacggatggcgga
aatacttttacgaatattggttcttctataggagttcaggatacgtgggctaccaaagat
tttgttttaccttcggtaagtagtactgcgattttaagatttttggcaactggagataat
ggtggcagtgatatctatgtggataatgtaaatatatcaataaataccactcctcctgca
tgtacaactattacagctcctcttaataatgctactggagttgctcttgctcctacaata
agttggacttcatctgttgggacaacttcttacaaaataaatcttggaacgactcctgga
ggtactgatattcttaatagttttgatgtgggtaatgtaattacttatacaatacctagt
acaactccattattgtatggtaaattatactatgtaaaagttttaccaagcaattcatat
ggtacagctataggatgtacagaattttcttttacaactaaaaacttaaattgtccttct
gtaagtgcgccttcatcttctgctacaaatgtttcgcttactccaacttttacatggaca
gctgtaactgatgctacaggttataagttaacaataggtacaactccaggtggtaataat
attcttaatgctttcgatttggggaatgttacaacatatacattgccaacatctttaact
attgggacaaagtattattataccttaaatgcttataattcttataattcttcattaagt
tgtacggaaagaagctttactacagctggttgtgcaacagtaagtgctcctgcttcagct
gcaactggggtatctttaacgccaacatttacttgggctgctgttacaggagttacaggt
tataaattaaatattggaactacatctggaggaactgatgttttaaatgcattcgatgta
ggtaacgtaacaacttataccttgccaaattctttggctctaggaacaaaatactattat
actttaaatagctacaatagtacaagtactactcccggttgttctgaaagaacatttact
actttaacggcttgtccaagtgtaagtgctcctgcttcagcagcaacaggagtttctgtt
actcctacttttacgtgggcagcgagtgctaatgcaactggatataagattacaattgga
actacttctggtggtaatgatgttttaaatgcttttgatgtaggtaatgttcttacttat
actttaccaacgcctttaaataatggtttaaaatatttttatacaattaatggatataat
gcaacaagtacctctttaggatgttctgaaaggaatttcacaactgtagttacttgtttt
gttcctactgctttggcaataactccttcaagtgttacaacgtctggagctactgcaact
tggactgctccttctacagttccatctaatggatatgaggtgtattatagttcttcgagt
acagcaccgacatttacaactcctttaaatgcgacaaactcagtaacctctttaacaact
tcagccccaataagtggattatctccttctacagcatattacgtttgggtaagatcggtg
tgtaatggtcctgatagaagttcttggacttcagtagcaacttttgtaacattatgtcaa
cctccagctttgctttctactacaggaacaacggtttgtcctggtaatacagcaactctt
tcagcaactgcagaaagtggagctactatcacatggtatgatgcagcgactgcaggtaca
gttttaggtacgggattaacatatactacgccagttttatcaacgactactaattattat
gcttcagctaaatctaatggagtgtcaggtgatgtaggtcctgtaaatccaagtgcatta
tcaagcatcagtgcaacaagttatgatgttacaacatactatcaaatattcgatgttacc
gtaccaaccactttagtaagtattgatgtatttcctacagctgctgtaggagctaattct
gcaatcgaaattcgtaatagtgcaggtgtaacattaattaatattccttataccgttaca
gtgactggaggtaatactgcacagacaattgtgttaaattacccattatctgtaggtaca
gggtatagaattggtcagggaacaggtgtggcaattaatttaaatagaaatacggagggt
gctaattacccatacacatcatctgcaattaacgtaactggtaataatttcagtttagga
acaaattactggtattatatatataattggaaattctcaagttcttgtgaaggtccaaga
caaatggttacagctactgttagttctgtaggatgtttaggtacttctgaagctgttgct
aaagaaagtattcaagtatatccaaacccatttactgatgtgttgaatatttcagacatt
aaaaatgtgaaatctatttctgtgatggatgttgctggaagattggtaaaatctttcgaa
aaaccaacagctaatcttcagttaagcgaattgagttctggaatgtatttggttgttctt
catatgaatgacggtactaagcaaactgtaaaagcaattaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system