Colwellia sp. Arc7-635: EKO29_07955
Help
Entry
EKO29_07955 CDS
T06022
Symbol
pulA
Name
(GenBank) pullulanase-type alpha-1,6-glucosidase
KO
K01200
pullulanase [EC:
3.2.1.41
]
Organism
cov
Colwellia sp. Arc7-635
Pathway
cov00500
Starch and sucrose metabolism
cov01100
Metabolic pathways
cov01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Module
cov_M00855
Glycogen degradation, glycogen => glucose-6P
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cov00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
EKO29_07955 (pulA)
Enzymes [BR:
cov01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.41 pullulanase
EKO29_07955 (pulA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pullul_strch_C
Pullulanase_N2
PUD
CBM_48
Pullulanase_Ins
AMPK1_CBM
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZQ83953
UniProt:
A0A3Q9G866
LinkDB
All DBs
Position
1811312..1815409
Genome browser
AA seq
1365 aa
AA seq
DB search
MSLSKKPILLPTLLFTLLLMLLTAPFSYAAWENTIETEFSYSPRPIYDRINNQYLSVVSL
TNQSSTTITGPFRVFIPTRSHQVRNMDGNDNGVPYVNLSIDELGAGASHKFTLQLELKRA
LIAFELINKVEVIAPSTGLELNDDQIAIFYQRADGNYDGWGLHLWNGEGCGNYASPTTDS
AHFNQWPSPYPVDGVHPEYGGYYILSVEPGADCYNFIIHKGNDKALGANNSRFEPAKATQ
GQQAFTFNGYPDIWYTPVTTRPIFLDGARVHWLDTSTLLWSTDVNNADSYRLYYSADAGI
EVISQALLNGLPYKTLTNKDANASYYQQNPHLNGFKGFTLDIDDAKAKQLVKNQLLVVAL
DQQGNLLDATRVQSPRLLDYLYTRNSLDADEASLGLNYQNGQVTASVWAPTASQVAIKIY
NAAKQEVTSQPMTVDEATGIWSYSMEKSAVDRLYYRYQLTVFHPLTSKMEDLTVTDPYSV
GLSTNGRYSQFVDLSDDELKPQGWDNHVVPTIANFEDSIIYEGHIRDFSALDQSTSTENR
GKYLAFTEANSLPMQHLQQLQEAGLTHFHVLPANDIASIEEDPSKRVDVTDTVADLCQLN
ANAPVCGVENGNTVLLDVLKGYDPSTTEAQALVEAMRRFDGFNWGYDPQHFAAPEGSYAS
NADGVSRIIEMRAMNQALHETGLRVVLDVVYNHAASSGLYDNSVLDKVVPGYYHRLNEYS
GAIETSTCCENTATEHRMMAKLMNDSLVSFAKNFGFDGFRFDLMGHIPKQAILDARDAVL
AVDADSYFYGEGWNFGEVANNRRFEQASQLNMAGSEIGTYSDRQRDAVRSAALFNDGGSL
GEQDVIRIGLVGNIDSYQFVAASGNYLSTYDYQWNGQPAGYSSDPADTVNYVSKHDNETL
WDQLQYNLPAQMSLSDKVRVQNIALSLPLLSQGIPFLQMGSDLIRSKSMDRNTYDAGDWF
NRIDFTQAQSNWNIGLPLAQDNQSKWSTISGISANTNNAFGAQEINLTSALFKEFINIRA
TSKLFRLTTAEQVSNRIKFHNVGTEQRQGLVVMSLDDGLGLTDLDPANDAIVVLFNGTSS
EQSFSVTNATNFELHQNQINSADTRVQSASFSDGNFVVPALTTAVFVKPQSEVQGFGLSA
LPPYDTNTIYLRGAMNNWDTSLPFTYIGNDKYRLAADLTQGEYQFKVADGSFSTANIGGG
FNMPIAQAASLTNGGDNLTLNLIADGQYLFELDASDRQSPSLLITPDDPLAIPAPFGDAV
IYLRGLMNEWDTTRPLTYQGKGIYSGSYQISGGQHSLKIADVDWGGTGGANLGGAHNIAL
GVGVELTPSANDNLSLTLINTKTLAFVLDANDINKPRLTISEIIE
NT seq
4098 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttgtctaaaaaacctatattgctaccaaccctattattcacgctattattgatg
ttactgacagcaccttttagttatgctgcatgggagaatactattgaaactgagtttagt
tattctcctcgccccatttatgaccgtattaataaccaatatttgtctgttgttagtctt
accaatcaaagtagcacaacaataacgggcccattccgagttttcattccaaccagaagc
caccaagtacgcaatatggatggtaatgataatggtgttccttatgtcaatttgtcgatt
gacgaattaggtgcaggtgccagccataaatttactttacagcttgaactcaaacgtgca
cttattgcttttgaattaatcaataaagtagaagtgatagcccctagtacagggcttgaa
ttaaacgacgatcaaattgccattttttatcaacgcgcagatggcaactacgatggttgg
ggattacacctatggaatggtgaaggctgtggcaattatgccagtccgaccactgacagt
gctcattttaatcagtggccatctccatacccggttgacggtgtacacccagaatatggc
ggctattatattcttagcgtagagcctggtgccgattgctataacttcatcattcataaa
ggcaatgacaaagcgctgggtgctaataatagtcgtttcgagccggcaaaagctacacaa
ggccagcaagcatttacctttaatggctaccctgatatctggtatacaccagtaaccact
cgacctatttttcttgatggcgcgcgcgttcattggttagacaccagtacgctattatgg
tcaaccgatgtcaacaatgccgatagttatcgtttatattattcagcagatgccggtatt
gaagttatcagtcaagcgctactgaatggcttaccttataaaacattgaccaacaaagat
gctaacgctagttactatcaacaaaaccctcacttgaacggctttaaaggttttacgtta
gatattgatgatgccaaagcaaaacagttggttaaaaatcaattactggtcgtcgcttta
gatcaacaaggtaatttactcgatgcaacacgtgtgcaatcgccgcgtttactagattat
ttgtatacccgtaacagcttagacgctgatgaggcgagcttaggccttaactatcaaaac
ggccaagtcacagcatcagtttgggctccgacggcaagccaagtggcgataaaaatttat
aatgccgcgaagcaggaagtaacgagtcagccaatgactgtcgatgaagcgacagggatt
tggtcttatagcatggagaaatcggctgttgatcgcctttattaccgctatcaattaact
gtatttcatccactgaccagtaaaatggaagatttaaccgttacagatccctattctgtc
ggtttatctaccaatggccgatatagtcaatttgttgatttaagtgatgatgaattaaag
ccacaaggttgggataatcatgtggtaccgacaatagcgaactttgaagatagtattatt
tatgaaggtcatattcgtgactttagtgccctagaccaaagcacaagtacagagaaccgc
ggaaaataccttgcttttaccgaagcaaattctttacctatgcaacatttacaacagcta
caggaagcagggctaacgcattttcatgttttacctgccaacgatattgcttcaatagaa
gaagacccaagcaaacgtgttgatgttactgatacggtcgcagatttatgtcaacttaac
gccaatgccccggtatgtggtgttgaaaatggcaatactgtattacttgatgttttaaaa
ggttatgacccaagtacaactgaagcacaagcattggttgaagcaatgcgccgttttgat
ggttttaactggggttacgacccacaacattttgctgcgcctgaaggtagttatgcttca
aacgctgatggtgttagtcgcattattgaaatgcgtgcaatgaaccaagcactgcatgaa
acaggactacgcgtagtgcttgatgttgtttacaatcatgcagcttcatctggcctttat
gataattctgttttagataaagttgtaccgggttattaccacagattaaatgaatatagc
ggtgcgattgaaacatcaacgtgttgtgagaataccgcaaccgagcatcggatgatggct
aaattaatgaatgattccttagtcagctttgccaaaaactttggttttgacggctttaga
tttgatttaatgggacatattcctaagcaagctattcttgatgcaagagatgccgtatta
gccgtagatgccgatagttatttttatggtgaaggttggaatttcggtgaagttgccaat
aaccgccgctttgaacaagcttcacagcttaatatggctggcagcgaaataggtacatac
tctgaccgacaacgtgacgctgttcgcagtgctgctttgtttaatgacggtggcagttta
ggtgagcaagatgttatccgtattggtttagtcggtaatattgatagttatcagtttgtt
gctgctagtggcaattatttatctacctatgattatcaatggaacggtcaacctgcaggt
tacagcagtgatcctgcggataccgtcaattatgtatctaagcatgacaatgaaacctta
tgggatcagctgcaatacaatctaccggcccaaatgagccttagcgataaagtgcgtgtg
caaaatattgcgctttctttaccgctattaagccaaggtattccatttttacaaatgggc
tcagatttaattcgctcaaaatcaatggatagaaatacctatgatgctggtgattggttt
aaccgtattgatttcactcaagcacaaagcaattggaatattggcttaccgttagcccaa
gacaaccaaagtaaatggtcaaccattagtggtatcagtgccaacacgaacaatgctttt
ggcgcgcaagaaatcaacttaaccagtgctttatttaaagagtttatcaatattagagca
accagtaagttatttagattaaccaccgcagagcaagtatctaatcgtattaagtttcac
aatgttggtacagagcagcgccaaggtttagtcgtgatgagtttggatgatggattaggg
ctaactgatctggaccctgcaaacgatgccattgtggtgttatttaatggtactagcagc
gagcagtcatttagcgttactaatgcgactaactttgaactacatcaaaatcagataaac
tcggctgatactcgagtgcaaagcgctagttttagtgatggtaactttgttgtacccgca
ttaacgactgccgtatttgtgaaaccacagagtgaagtgcaaggttttggtttatcggca
ttgccgccttatgacaccaacaccatttatttacgtggcgccatgaataactgggatact
tctttacctttcacttatatcggtaatgataaataccgcttggctgctgacttaactcaa
ggtgaataccagttcaaagttgctgacggtagtttttcaacggcaaatatcggtggcggt
tttaatatgcctatcgctcaagcagctagtttaactaacggaggtgataatttaacccta
aaccttattgctgatggtcagtatctttttgaattagacgccagcgacagacaaagccca
agtttattgataacaccggatgatccgctagcaatacccgcacctttcggtgacgcggtt
atttacttacgaggtttaatgaatgaatgggacactactcgcccgttaacctatcaaggt
aagggtatttatagtggcagttatcaaattagcggtggtcagcattcgttaaaaattgct
gatgttgattggggcggaaccggtggtgctaatttaggcggagcacacaatatcgcgcta
ggtgttggcgttgagctaaccccaagcgctaatgacaatctctcattaacgcttattaac
accaagacattggcttttgtactagatgccaatgacatcaataaaccacggttaacgata
agtgaaataatagaataa
DBGET
integrated database retrieval system