Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark): 122540385
Help
Entry
122540385 CDS
T08871
Name
(RefSeq) multiple epidermal growth factor-like domains protein 6 isoform X1
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
cpla
Chiloscyllium plagiosum (whitespotted bambooshark)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cpla00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
cpla04990
]
122540385
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
cpla04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
122540385
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
FXa_inhibition
cEGF
EGF_CA
hEGF
EGF_2
JAG1-like_EGF2
EGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122540385
NCBI-ProteinID:
XP_043531981
LinkDB
All DBs
Position
34:29611769..30042497
Genome browser
AA seq
1599 aa
AA seq
DB search
MDQVSASVCMLFVTVTSAMSSGTLQSHMPNVCAEREVMMIGHRQPCVQAFTRMVKVWKQG
CERQKWCVGQERRTAYYTAYRQVYSMDFKVVLKCCPGWIQLNNEAGCLYPICSYGVCFNG
GKCIEGMSQLCHCPQGFQGPRCQYDVNECEENNGECEGQCRNTIGSFYCKCLEGLKLKAD
GKTCEDVDECQVHNGGCQHKCINTQESHYCECKPGFRLHTDGRTCIGVHSCSIGNGGCEH
DCVQLSVAHYQCKCRHNYQLKKDGKHCELKNPCTDKNGSCMHKCHNYNGVAKCECHPGYG
LSHDAKGCEDIDECMIGLADCSHGCLNTRGTFSCVCNAGYELGSDGKQCYRIEMEIVNSC
ELNNGGCSHHCRHTTDGPLCSCNQGFHLDADQKTCVDVDECDVGTGCCQQDCFNTPGGYE
CGCHAGYRLSLDGCTCDDVDECTAENDICEHTCQNTDGSFQCFCNIGYKLEEDRKSCAPL
DDPVEALNGRPEFGRLLPEVSFYLGEELTELFDEDNEETGEGEARGEFTLSQSFVCWDGS
FGHDCSLLCEDCRNGGTCNEARDGCICPEGWTGILCNQTCPEGTFGKNCSFLCKCKNGAT
CDPLTGKCRCPPGVGGEMCEDGCPKGLYGKTCNKKCNCANNGRCHRIYGACLCDPGLYGR
FCHLPCPKWTYGPGCSNVCRCDQRNTLECSRKDGSCICKPGYHGNTCQKACDHGYYGIGC
NTKCNCSVGVSCDHVTGDCEILCPKGYRGRNCSQECASNKFGVNCLQTCDCGGAPCDSVT
GKCSCPPGKTGPGCKKECQAGHWGQACKGICPICENNGTCNKKTGQCTCPPGFTGKLCQT
SCPAGQFGLGCQMRCACENQGQCHPVTGHCTCSPGWTGHNCRRACDAGRWGPNCVNTCDC
RNSDGSCNSVTGQCICEAGFTGQRCDQKCPEGSYGPGCRYRCQCENEGACDHVSGACNCT
AGWLGMFCERACPHGFYGMECRQMCDCLNGAHCNHVTGICSCLPGWIGLNCNQSCPEHSF
GENCSQSCHCLNGASCDHVTGQCSCLPGWTGTTCQRACSAGFYGANCLQRCICRNGGTCD
HVTGHCTCPLGWTGVACELECTPGKYGLDCQLLCDCLNGGLCDRQSGNCTCQPGWLGDKC
ETPCPTGTYGEFCEEYCNCEHGASCHHVTGNCQCTRGWRGRRCEKACWPGYYGDDCVQRC
NCSPNTPCNHVTGECGCPPGFTGNGCEQTCLPGTYGQNCNQVCQCSAQNQQCHPVSGECI
CALGYHGDNCNLRCPDGRYGSNCAQLCQCLNRGLCETVTGTCICPPGYVGADCNQTCPTG
YYGMDCSAACSCGEGAKCDHVTGRCICPAGRIGSQCQHVCPKGRFGQGCQYICTCKNGGL
CNPVDGSCSCGLGWTGALCGQECPLGKFGANCQLDCACQNNGTCNRVTGYCQCARGYYGN
NCEHACPLGFHGPNCQHLCDCRNKAACHPVTGQCLCSAGYHGDYCEKECEEGQYGEQCQQ
KCDCEGGAPCEATTGKCLCPPGKTGRRCDVDCQTNRYGPSCSLNCRCSNNARCDSRNGHC
TCLYGWTGPTCEEGGPPKPPHHLQPESHGNVASDKSSRS
NT seq
4800 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaccaagtgtcagcgagtgtctgcatgttgttcgttactgtgacctcagctatgagt
tcgggaacactccagagtcacatgcccaatgtttgtgcagagagggaggtgatgatgatt
ggccacaggcagccatgtgttcaggccttcactcggatggttaaagtctggaaacaaggg
tgtgaaagacagaagtggtgcgtgggacaagagagaaggactgcatactatacagcatac
agacaggtttacagtatggactttaaggtggtcttgaagtgttgtccagggtggatacaa
ctcaacaatgaagctggatgtctctaccccatttgcagttatggtgtatgctttaatggt
ggcaagtgtattgagggaatgtcacagttgtgccactgcccacagggtttccaaggtcct
cgttgccagtatgatgtgaatgaatgtgaagagaacaatggagaatgtgaaggtcaatgc
cgtaataccatcggtagtttctactgcaagtgtctggagggtttgaagttgaaagctgat
gggaaaacctgtgaagacgtggatgagtgccaagtccataacggaggttgtcagcacaag
tgcataaatacccaggaatcccattactgtgagtgtaaaccagggttccggcttcacact
gatgggcgtacctgcattggtgtccactcatgctcgattggtaatggaggttgtgagcat
gactgtgttcaactgtcggtagcacactaccagtgtaagtgtcggcacaactatcagctg
aagaaagatggaaagcactgtgaactgaagaatccatgtacagataagaatggtagctgt
atgcacaagtgccataactacaatggagtcgccaagtgtgagtgtcacccaggatacgga
ttgtctcatgatgccaaaggatgcgaagatattgacgagtgcatgattggattagctgat
tgttcgcatggatgcctcaacacacgtggaacattttcctgtgtctgtaacgcaggctat
gagctgggttctgatgggaagcagtgttaccggattgagatggagatcgtcaacagttgt
gaattaaataatggtggatgttcccatcactgtcgccacacaacggatggtccactatgc
agctgtaatcaaggctttcacctggatgctgatcagaagacttgtgtagatgtagatgag
tgtgatgttggtactggctgctgtcaacaggattgcttcaatacacctggtggatatgag
tgtggttgtcatgcaggttatcggctcagtctggacggctgcacatgtgatgatgttgat
gaatgcaccgcagagaatgacatttgcgagcacacctgccagaatacagatggctctttc
cagtgtttctgcaacattgggtataaactggaggaggatcgaaagagctgtgcacctcta
gatgacccagtggaggcactcaatggccggcctgaatttggaaggctccttcctgaggtg
agcttctaccttggagaagaattgaccgagttatttgatgaggacaatgaagaaactggg
gaaggggaagcacgaggagaattcaccctgtcacagagctttgtgtgctgggacgggagc
tttggacatgactgcagcttgttgtgtgaagactgtaggaatggtggcacctgcaacgag
gcacgtgatggatgtatttgcccagagggttggactggaatcttgtgtaaccagacctgc
ccagaaggaacatttggcaaaaattgcagcttcctgtgtaagtgtaagaatggtgcaaca
tgcgatccactgactggaaaatgccgctgtcctccaggagtgggtggcgagatgtgtgag
gatgggtgccccaaaggactatatggaaagacctgcaacaagaaatgcaattgtgccaac
aatgggcgttgccaccgtatctatggagcctgtctctgcgatcctggcctctatggacgc
ttctgtcacttaccttgtccaaagtggacctacgggcctggctgttcgaatgtgtgtcga
tgtgaccaacgcaacacactggaatgtagccgcaaggacggaagctgcatttgcaaacct
ggttatcatggtaatacttgccagaaagcctgtgatcatggctattatggaattggatgc
aacaccaaatgtaactgctcagtcggtgtttcctgtgaccatgtgactggcgattgcgag
attctgtgtcctaagggatatcgtggaaggaactgcagtcaagaatgtgccagtaacaag
tttggagtgaattgtctgcagacctgtgactgtggaggagccccatgtgacagtgtgact
gggaaatgcagctgcccgcctggaaaaacgggccctggctgtaagaaagagtgccaagcg
ggtcactgggggcaggcctgcaaggggatttgccctatctgtgagaacaatggaacctgc
aataagaagactgggcagtgtacctgcccaccaggattcacagggaaactatgtcagacc
tcatgccctgcaggccaatttggcctgggctgtcagatgcgatgtgcatgtgagaaccag
ggtcaatgccatccagtgacagggcattgcacctgttctccaggatggactggccataac
tgcaggagagcctgtgatgccggacggtggggtccaaattgtgtgaacacctgtgactgc
aggaacagtgatgggagctgcaacagtgtcacaggacagtgcatctgtgaggcaggtttt
actggtcagcgctgtgatcagaagtgccctgaagggagttatggaccaggctgtcgatac
aggtgtcagtgtgagaatgaaggtgcttgtgaccatgtgagtggagcctgtaactgtaca
gcaggctggcttggaatgttctgtgaacgagcttgtccacatgggttttacggcatggag
tgtcgtcagatgtgtgattgcctcaatggtgcacattgtaaccatgtaacggggatctgc
tcatgtcttcctggctggattggattgaactgcaatcagtcatgcccagaacattcattt
ggggagaactgcagccagtcttgtcattgtctaaatggtgccagctgtgatcatgtgacc
ggtcagtgcagctgtcttcctggctggacgggaaccacatgtcagagagcatgttcagcc
ggtttctatggtgccaattgcttgcaaaggtgcatctgtcgtaatggtggaacatgtgat
catgtgactggtcactgtacatgcccattaggatggacgggagtagcgtgtgagctggaa
tgtactcccggaaagtatggtctggactgccaactgctgtgtgactgcctgaacgggggg
ctgtgtgatcgtcagagtgggaactgtacctgccagccagggtggttaggtgacaaatgt
gaaaccccttgtcccacgggtacttatggagagttctgtgaggaatattgcaactgtgag
catggagcatcatgtcaccatgtgacaggaaactgccagtgcaccaggggatggagaggg
agacgatgcgagaaagcttgttggcctggctactatggtgacgattgtgtgcagcggtgt
aactgttcccccaacaccccctgcaaccatgtgacaggtgaatgtggctgccctccagga
tttacaggcaatgggtgtgaacagacctgcctcccgggtacttatggacagaactgtaac
caggtgtgccagtgttcagctcaaaaccaacagtgccacccagtgagtggagaatgcatc
tgtgcacttggttaccatggagacaactgcaacctgagatgtccagatgggaggtacgga
tccaactgcgcccagctgtgtcaatgtttgaacagaggcctgtgcgaaacagtgactggg
acatgtatctgtccacctgggtatgtcggagctgactgtaatcagacctgtcccactgga
tactacgggatggattgctctgcagcctgttcctgtggtgaaggtgcaaagtgtgaccac
gtgactggaagatgtatctgtccagcaggcaggattggttcccagtgccaacatgtgtgt
cctaaaggcaggttcggtcagggatgccaatatatctgtacgtgcaagaatggaggattg
tgcaacccagttgacggttcgtgttcctgtggtctaggctggactggggccctatgtgga
caagagtgtccccttgggaaatttggtgcaaactgccagctggactgtgcatgccaaaat
aatggcacctgtaatcgggtaaccggatactgccagtgtgccagagggtactacgggaac
aactgtgagcatgcgtgcccccttggatttcatggaccaaactgtcagcatttgtgtgac
tgcagaaacaaagcagcctgtcaccctgtaactggccaatgcctgtgttcggctggttac
catggagactactgtgagaaagaatgtgaggaagggcagtacggggagcaatgtcagcag
aagtgtgactgcgagggaggtgcaccttgtgaagcaactacaggaaaatgcctctgtccg
ccagggaaaaccggtaggaggtgtgatgttgattgtcaaactaatcgttatggccccagc
tgctctttgaactgcagatgttccaataatgctcgctgtgactcccggaacggacactgc
acctgcttgtatggttggactgggcctacctgtgaagaaggaggacctcccaagccacca
catcacctgcaacctgaatcccacggcaacgtggcatcagacaaatcatcaagatcatag
DBGET
integrated database retrieval system
