Colwellia psychrerythraea: CPS_0806
Help
Entry
CPS_0806 CDS
T00258
Name
(RefSeq) putative membrane protein
KO
K07003
uncharacterized protein
Organism
cps
Colwellia psychrerythraea
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cps00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
CPS_0806
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LolA_like
MMPL
DUF1329
Sterol-sensing
Patched
SecD_SecF
CEP209_CC5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ24806
UniProt:
Q488G0
LinkDB
All DBs
Position
821993..825244
Genome browser
AA seq
1083 aa
AA seq
DB search
MNSVPKPLFASRLAGIIVKYPKSTVFISLLLMIVLLSALPTLYKDTRADAFLAEDNPALV
YRNKVKEQFGLSDPIVVAVINKSDHGVFNPGSLNLVNWLSEEVSALENINADRVTSLATE
NNITGSAEGMAVDPFFDEYPDTQQVADKIWRQVSDFPIYMGNLVAKNGQATLIVAELNDE
ALVEATYQEILALVEKAPKTLGDKIYVAGEGAIAGYLGSYIDADAQRLNPLAGLIITIII
LLAFRRVSPGILSNVIIAASVLMTLSIMALNDVAFFVITNALPVILIGISVADSIHIYSH
YFELQAKSPNRDKKEIIVETFEEMWRPITLTTLTTIAGFLGLYFAAYMPPFKYFGLFTAV
GVAIAWLYSLVFLPASLAIIQPSASKGMTKLAQNNQVDKLSKMMMSLGKVTLGNARMVIA
IFMVIIVSGIYAATFLTVNEDRIATFHPSEPIFKADTAINKFLNGTYNLDIVIEANENEG
LFEPVNLQKMQALQNYALTLTNVQGATSIIDYLKQMNRSLNGGSKASYQLPQQKELIAQY
FLIYSASSDPTDFEEEVDYDYRVANMRLNLNKGSYQDTKDVVLQLEAYIKENFKNSDLTA
MVSGRVTVNYHWIKDLGESHFVGLGISLFLVWAVSALLFGSLSAAIFAIIPVMSSILLVY
ATMVILKINLGIGTSMFASVAIGLGVDFAIHTIDRLKSLYRKTNGDWDKTLADFYPSTGR
ALFLNYLAIALGFGVLISSKVVPLTNFGTIVVIAVTTSFLASLSLLPALIKVFKPRFISD
VIPEVSTDVATNDPNSKQPVMARKWLRISSIIVAVATLGGLAITNQGHAAIIDMNTLEPM
AVVANINAVDDGEYVSRDLVMTLKDKRGKVRVRETKAYRKHYENEKRTILFYRKPTNVKG
TSFLTFDYQDAKKDDDQWLYLPALRKVRRISASDRGDYFLGTDFTYEDMKLEGKLDVTDL
DFTVLNAETLNIVDDNSYQSLLMSGTPKNTTIAKELGYSRTEFWVDTKSWLIIKAKYWDL
KGKLLKTLVSRDIRLVDDIYTRHEMTMKNSKTGHQTTFSFSHVNYKTLVKDSLFSKRAMK
QGK
NT seq
3252 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattctgtacccaaaccattatttgccagccggttggcaggcattattgttaaatac
ccaaaatctactgtttttattagtttactgctgatgatcgtgttgttaagtgcattaccg
acattatataaagatactcgtgcagatgcatttcttgctgaagataaccccgcattagtg
tatcgaaataaagtaaaagaacagtttggcttaagcgacccaatcgttgttgctgttatt
aataaatcggatcatggcgtttttaatcctggttcattaaatttggttaattggttaagt
gaagaagtttctgccttggagaatatcaatgcagaccgagtaaccagcttggcaaccgaa
aataatattaccggctctgcagaaggaatggctgttgatcccttctttgatgaatatcct
gatacccagcaagttgctgataagatttggcgacaagtctcagattttccaatttatatg
ggaaatttggtggctaaaaatggtcaggcgacccttattgttgcggagctaaatgatgag
gcgttggttgaagcaacctatcaagagattctagcgcttgttgaaaaagcccctaaaacg
ctaggtgataaaatttatgtggcaggtgaaggggctattgccggttacttaggaagttat
attgatgcggacgcccagcgtttaaatccgttggctggtcttattatcaccatcattatt
ttactcgcttttaggcgtgtcagtccaggcatattgtctaatgttattattgccgcgtcg
gtattaatgaccttaagtattatggcacttaatgatgttgctttttttgttattactaat
gcgttgccggttattcttattggtatttcagtcgcagattccattcatatctacagtcat
tactttgagttacaagctaagtccccaaatagagataagaaagaaattattgtcgaaacc
tttgaagaaatgtggcgtcctattacgttaaccacattgacaactattgcgggtttttta
ggattatattttgccgcgtacatgcctccatttaaatattttggtctattcaccgcggta
ggtgttgccattgcttggctttattcattggtttttttaccagcgtcattggccattatt
caaccctcggcaagtaaaggcatgactaaattagctcagaataaccaagtggataaacta
tccaaaatgatgatgtctttagggaaagtcacgttaggtaatgcaagaatggttattgct
atttttatggtcatcatcgtatccggtatttacgcagcgacttttctaacggtaaatgaa
gatagaatagcaacttttcaccccagtgaaccaatattcaaagcggatacagccatcaat
aaatttttaaatggtacctataatttagatattgttattgaagcgaatgagaatgaaggg
ttatttgagccggtaaatttacagaagatgcaggcattacaaaattacgcgctaacgcta
accaacgtgcagggcgcaacttcgataatagattatttaaagcaaatgaatcgctcgtta
aacggtggtagcaaagcaagttatcaattaccgcaacagaaagaattgattgctcaatat
ttcttaatttattctgcttcatcagatcccacagatttcgaagaagaagttgattacgac
taccgggtcgccaatatgcgtttaaatttaaataaaggcagttatcaagatactaaagat
gtggttcttcaactagaagcttatataaaagaaaacttcaaaaatagtgatttaaccgca
atggttagtggtcgagttacggttaattatcactggataaaagatttgggtgaaagccac
ttcgttggcttgggcatttcattatttttagtttgggcggtgtcggcactattatttggc
tcactatcggctgccatatttgccattattccggtgatgagttccattttattggtctat
gccactatggtgatactaaagataaaccttggcataggcacttctatgtttgcgtctgtt
gccattggcttaggtgtcgattttgctattcatacgatagacagattaaaaagcttatat
cgaaaaactaacggtgattgggataaaaccttggctgacttctatccgtctacagggcgt
gcacttttcttaaactatttagctatcgcactgggttttggggtgttgatatcgagtaaa
gttgtaccattaactaacttcggtactatcgtggttattgctgttaccaccagtttcctt
gctagtttgagtttacttccagcattgatcaaagtatttaaaccacgttttataagtgat
gttatccctgaggtaagtactgatgttgctactaatgatcctaattcaaaacaacccgtt
atggcgagaaagtggctacgaatctcaagtattattgtcgcagttgccacacttggtggg
ttagccattactaatcagggccatgcagcaatcattgatatgaacacgttagaacctatg
gccgtggttgccaatattaacgctgttgatgacggcgaatacgttagtcgcgaccttgtc
atgaccttaaaagataagcgcggaaaagtacgtgtacgagaaaccaaagcttatagaaag
cattatgaaaatgagaaacgtaccatcttattttatagaaaaccgacgaatgtaaagggg
acttcttttttaacgtttgattatcaagacgctaaaaaagatgatgatcaatggttatat
ttacccgccttacgtaaagttagacgaatatcggcatctgaccgtggcgactacttttta
ggtactgactttacttatgaagacatgaaacttgaaggtaaattggacgttactgactta
gattttactgtacttaacgctgaaacgttgaacatagtcgatgataattcttatcaaagt
ttattgatgtcaggcactccgaaaaataccactatcgctaaggaattgggttatagccgc
actgagttttgggtcgacacaaaaagttggttaattatcaaagcaaaatactgggacctt
aaaggcaagttacttaaaacattagtcagtcgagatattcgacttgttgatgacatctat
acccgacatgaaatgaccatgaaaaacagtaaaacgggtcaccaaacgacgttcagcttt
agtcatgttaattacaaaaccttagtaaaagacagcttgttttctaaacgcgcgatgaag
caaggaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system